More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A4363 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A4363  RND efflux system membrane fusion protein  100 
 
 		 467 aa  931    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.234106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0359  efflux transporter, RND family, MFP subunit  93.5 
 
 		 401 aa  705    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7211  RND family efflux transporter MFP subunit  53.26 
 
 		 419 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1392  RND efflux system membrane fusion protein  47.14 
 
 		 419 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0449025  normal  0.0986293 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1817  secretion protein HlyD  50.84 
 
 		 405 aa  337  2.9999999999999997e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00656691  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5203  efflux transporter, RND family, MFP subunit  48.17 
 
 		 455 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.755082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1749  secretion protein HlyD  47.22 
 
 		 398 aa  335  1e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.145441 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6327  RND family efflux transporter MFP subunit  50.99 
 
 		 478 aa  333  4e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0452278  normal  0.980568 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1502  secretion protein HlyD  50.99 
 
 		 478 aa  333  4e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.184777  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6991  RND family efflux transporter MFP subunit  50.7 
 
 		 472 aa  330  3e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.231557 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5741  RND family efflux transporter MFP subunit  51.25 
 
 		 455 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.814041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5985  RND family efflux transporter MFP subunit  50.97 
 
 		 455 aa  325  1e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2097  RND family efflux transporter MFP subunit  51.98 
 
 		 391 aa  323  3e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.902105  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1967  RND family efflux transporter MFP subunit  51.69 
 
 		 391 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0310111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3750  secretion protein HlyD  45.93 
 
 		 401 aa  311  1e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4618  RND family efflux transporter MFP subunit  45.93 
 
 		 401 aa  311  1e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.343268  normal  0.223248 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5686  RND family efflux transporter MFP subunit  45.93 
 
 		 401 aa  309  8e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.214167 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0078  hypothetical protein  48.58 
 
 		 381 aa  307  3e-82  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4897  efflux transporter, RND family, MFP subunit  43.44 
 
 		 437 aa  301  2e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.51776 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3820  efflux transporter, RND family, MFP subunit  43.44 
 
 		 437 aa  301  2e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1955  efflux transporter, RND family, MFP subunit  43.16 
 
 		 400 aa  300  3e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.159137  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3608  secretion protein HlyD  41.78 
 
 		 400 aa  297  3e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.221607  normal  0.363906 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2372  secretion protein HlyD  43.2 
 
 		 392 aa  294  2e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.753301 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1436  efflux transporter, RND family, MFP subunit  47.19 
 
 		 393 aa  292  9e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4651  RND family efflux transporter MFP subunit  45.82 
 
 		 402 aa  291  1e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.611035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5875  efflux transporter, RND family, MFP subunit  42.02 
 
 		 407 aa  289  8e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0955286  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02155  putative transport transmembrane protein  43.7 
 
 		 421 aa  287  2.9999999999999996e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.58284 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2071  RND efflux system membrane fusion protein  41.8 
 
 		 407 aa  285  9e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.226746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6521  RND family efflux transporter MFP subunit  42.48 
 
 		 410 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.745567  normal  0.0817001 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4616  secretion protein HlyD  39.49 
 
 		 414 aa  273  7e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1141  RND efflux system membrane fusion protein  46.63 
 
 		 394 aa  265  2e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.814411  normal  0.55527 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2584  CzcB subfamily membrane fusion protein  38.08 
 
 		 409 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3361  RND efflux system membrane fusion protein  44.71 
 
 		 395 aa  261  1e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0631452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3710  RND family efflux transporter MFP subunit  40.48 
 
 		 410 aa  257  4e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4313  RND family efflux transporter MFP subunit  40.05 
 
 		 409 aa  256  5e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.583259 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4188  RND family efflux transporter MFP subunit  40.38 
 
 		 410 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0941549  normal  0.890181 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2552  secretion protein HlyD  38.16 
 
 		 451 aa  254  2.0000000000000002e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.603084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1727  HlyD family secretion protein  39.22 
 
 		 409 aa  252  1e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0767982  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3414  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.99 
 
 		 1462 aa  249  1e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3225  RND family efflux transporter MFP subunit  39.89 
 
 		 392 aa  246  8e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.376119  normal  0.122741 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4074  secretion protein HlyD  39.62 
 
 		 392 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.119469  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4292  RND family efflux transporter MFP subunit  39.62 
 
 		 392 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2953  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.78 
 
 		 425 aa  238  2e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.104314 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0567  RND family efflux transporter MFP subunit  42.02 
 
 		 424 aa  238  2e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0123  RND family efflux transporter MFP subunit  34.28 
 
 		 417 aa  234  3e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.713324 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5198  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.02 
 
 		 366 aa  222  9.999999999999999e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.197197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2849  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.79 
 
 		 421 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0325844 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0177  hypothetical protein  31.2 
 
 		 406 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1276  secretion protein HlyD  32.41 
 
 		 553 aa  207  4e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2717  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.03 
 
 		 393 aa  202  9.999999999999999e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.374816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0225  RND family efflux transporter MFP subunit  37.54 
 
 		 461 aa  187  3e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.540049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2877  RND family efflux transporter MFP subunit  31.68 
 
 		 435 aa  183  7e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.200442 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2445  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.33 
 
 		 424 aa  178  2e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0377313 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4164  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.22 
 
 		 438 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.444201  normal  0.22934 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4314  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.82 
 
 		 438 aa  172  7.999999999999999e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.544766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3855  RND family efflux transporter MFP subunit  31.96 
 
 		 438 aa  172  9e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.336679  normal  0.260987 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1526  RND family efflux transporter MFP subunit  33.33 
 
 		 423 aa  160  4e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.692168  normal  0.0164989 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0257  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.02 
 
 		 376 aa  159  9e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0635655  hitchhiker  0.00588714 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2692  RND family efflux transporter MFP subunit  32.34 
 
 		 424 aa  159  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00769313  normal  0.142754 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1161  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.73 
 
 		 376 aa  155  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.444348  normal  0.334679 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4014  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.81 
 
 		 362 aa  145  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0181773  normal  0.127593 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2582  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.94 
 
 		 379 aa  137  4e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000000306136  normal  0.19553 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2615  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.07 
 
 		 380 aa  137  6.0000000000000005e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.909785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4286  RND family efflux transporter MFP subunit  28.92 
 
 		 361 aa  134  3.9999999999999996e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.749975  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1700  secretion protein HlyD  27 
 
 		 417 aa  125  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.696744  normal  0.370784 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0460  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.59 
 
 		 380 aa  121  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0505  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.42 
 
 		 349 aa  113  8.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0547  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.25 
 
 		 410 aa  111  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3160  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.12 
 
 		 1460 aa  110  6e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3680  secretion protein HlyD family protein  28.07 
 
 		 405 aa  110  6e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0518  secretion protein HlyD  31.25 
 
 		 412 aa  107  5e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0551  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.25 
 
 		 411 aa  105  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.856573  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3610  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.45 
 
 		 388 aa  104  3e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.479598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0225  secretion protein HlyD  28.45 
 
 		 380 aa  104  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.34961  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4385  RND family efflux transporter MFP subunit  27.58 
 
 		 381 aa  103  5e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.912914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3492  RND family efflux transporter MFP subunit  28.93 
 
 		 405 aa  103  8e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.474299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4184  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.39 
 
 		 462 aa  100  5e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.267577  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4296  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.39 
 
 		 462 aa  100  5e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0247  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.67 
 
 		 380 aa  100  6e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2708  RND efflux membrane fusion protein precursor  26.32 
 
 		 426 aa  99.8  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0286088  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0454  secretion protein HlyD  27.11 
 
 		 373 aa  99  2e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.63564  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3468  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.75 
 
 		 393 aa  99  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.143252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31870  putative RND efflux membrane fusion protein precursor  26.05 
 
 		 426 aa  99  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03141  putative resistance transmembrane protein  28.02 
 
 		 449 aa  98.2  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.704547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00182  acriflavine resistance protein a precursor  26.15 
 
 		 381 aa  98.2  3e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0458  secretion protein HlyD  30.41 
 
 		 378 aa  97.4  4e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.217472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01755  hypothetical protein  26.78 
 
 		 378 aa  97.4  5e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3965  RND family efflux transporter MFP subunit  31.45 
 
 		 362 aa  97.1  6e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000185194 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0569  RND family efflux transporter MFP subunit  29.55 
 
 		 381 aa  97.1  6e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0948  secretion protein HlyD  26.36 
 
 		 413 aa  97.1  7e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.297274  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4212  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.97 
 
 		 381 aa  96.3  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2684  multidrug efflux system subunit MdtA  25 
 
 		 411 aa  96.3  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1209  RND family efflux transporter MFP subunit  26.99 
 
 		 381 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.421019  normal  0.31825 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4251  RND family efflux transporter MFP subunit  26.97 
 
 		 381 aa  96.3  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.397426  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1296  RND family efflux transporter MFP subunit  30.74 
 
 		 373 aa  95.9  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00794293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1421  HlyD family secretion protein  26.61 
 
 		 354 aa  95.5  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0100677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3714  RND family efflux transporter MFP subunit  28.41 
 
 		 408 aa  95.1  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.132208 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0777  RND family efflux transporter MFP subunit  25.58 
 
 		 384 aa  95.5  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1649  RND family efflux transporter MFP subunit  27.22 
 
 		 354 aa  94.7  3e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.499517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01077  HlyD family secretion protein  25.88 
 
 		 376 aa  94.7  3e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>