More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C1141 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C1141  RND efflux system membrane fusion protein  100 
 
 		 394 aa  777    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.814411  normal  0.55527 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3361  RND efflux system membrane fusion protein  72.91 
 
 		 395 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0631452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2372  secretion protein HlyD  53.18 
 
 		 392 aa  410  1e-113  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.753301 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4616  secretion protein HlyD  51.95 
 
 		 414 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1955  efflux transporter, RND family, MFP subunit  52.12 
 
 		 400 aa  386  1e-106  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.159137  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3750  secretion protein HlyD  52.82 
 
 		 401 aa  386  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4618  RND family efflux transporter MFP subunit  52.82 
 
 		 401 aa  386  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.343268  normal  0.223248 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3608  secretion protein HlyD  51.62 
 
 		 400 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.221607  normal  0.363906 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5686  RND family efflux transporter MFP subunit  52.32 
 
 		 401 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.214167 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2097  RND family efflux transporter MFP subunit  53.93 
 
 		 391 aa  354  2e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.902105  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1967  RND family efflux transporter MFP subunit  53.09 
 
 		 391 aa  352  8.999999999999999e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0310111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4651  RND family efflux transporter MFP subunit  47.03 
 
 		 402 aa  313  2.9999999999999996e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.611035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3414  efflux transporter, RND family, MFP subunit  44.72 
 
 		 1462 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1392  RND efflux system membrane fusion protein  45.87 
 
 		 419 aa  301  1e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0449025  normal  0.0986293 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1502  secretion protein HlyD  48.8 
 
 		 478 aa  299  7e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.184777  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6327  RND family efflux transporter MFP subunit  48.8 
 
 		 478 aa  299  7e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0452278  normal  0.980568 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0078  hypothetical protein  42 
 
 		 381 aa  298  9e-80  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6991  RND family efflux transporter MFP subunit  48.8 
 
 		 472 aa  298  1e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.231557 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5203  efflux transporter, RND family, MFP subunit  45.07 
 
 		 455 aa  295  8e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.755082  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1436  efflux transporter, RND family, MFP subunit  51.4 
 
 		 393 aa  295  9e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4363  RND efflux system membrane fusion protein  46.95 
 
 		 467 aa  289  6e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.234106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7211  RND family efflux transporter MFP subunit  47.54 
 
 		 419 aa  278  8e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1749  secretion protein HlyD  45.77 
 
 		 398 aa  278  1e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.145441 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5741  RND family efflux transporter MFP subunit  46.19 
 
 		 455 aa  275  7e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.814041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5985  RND family efflux transporter MFP subunit  45.93 
 
 		 455 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0359  efflux transporter, RND family, MFP subunit  47.87 
 
 		 401 aa  262  8.999999999999999e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2071  RND efflux system membrane fusion protein  39.84 
 
 		 407 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.226746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2849  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.95 
 
 		 421 aa  259  8e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0325844 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6521  RND family efflux transporter MFP subunit  41.01 
 
 		 410 aa  258  1e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.745567  normal  0.0817001 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0123  RND family efflux transporter MFP subunit  38.02 
 
 		 417 aa  256  3e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.713324 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3820  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.31 
 
 		 437 aa  256  4e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4897  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.31 
 
 		 437 aa  256  4e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.51776 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4313  RND family efflux transporter MFP subunit  42.59 
 
 		 409 aa  256  5e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.583259 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2953  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.55 
 
 		 425 aa  254  2.0000000000000002e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.104314 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5875  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.32 
 
 		 407 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0955286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1727  HlyD family secretion protein  40.73 
 
 		 409 aa  252  9.000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0767982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1817  secretion protein HlyD  45.51 
 
 		 405 aa  250  3e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00656691  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3225  RND family efflux transporter MFP subunit  41.24 
 
 		 392 aa  249  5e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.376119  normal  0.122741 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3710  RND family efflux transporter MFP subunit  41.6 
 
 		 410 aa  249  5e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4292  RND family efflux transporter MFP subunit  41.24 
 
 		 392 aa  249  5e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4074  secretion protein HlyD  41.24 
 
 		 392 aa  249  7e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.119469  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4188  RND family efflux transporter MFP subunit  41.07 
 
 		 410 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0941549  normal  0.890181 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2584  CzcB subfamily membrane fusion protein  37.13 
 
 		 409 aa  244  3e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0177  hypothetical protein  34.05 
 
 		 406 aa  242  9e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2717  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.47 
 
 		 393 aa  240  4e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.374816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1276  secretion protein HlyD  33.7 
 
 		 553 aa  238  1e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02155  putative transport transmembrane protein  40.16 
 
 		 421 aa  236  4e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.58284 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2877  RND family efflux transporter MFP subunit  36.98 
 
 		 435 aa  219  8.999999999999998e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.200442 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0567  RND family efflux transporter MFP subunit  35.17 
 
 		 424 aa  218  2e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0225  RND family efflux transporter MFP subunit  39.38 
 
 		 461 aa  209  5e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.540049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2552  secretion protein HlyD  35.81 
 
 		 451 aa  209  8e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.603084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5198  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.61 
 
 		 366 aa  198  1.0000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.197197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2692  RND family efflux transporter MFP subunit  38.94 
 
 		 424 aa  188  1e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00769313  normal  0.142754 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2445  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.49 
 
 		 424 aa  181  2e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0377313 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1526  RND family efflux transporter MFP subunit  37.69 
 
 		 423 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.692168  normal  0.0164989 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4314  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.34 
 
 		 438 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.544766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4164  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.76 
 
 		 438 aa  170  5e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.444201  normal  0.22934 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3855  RND family efflux transporter MFP subunit  35.47 
 
 		 438 aa  169  1e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.336679  normal  0.260987 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0257  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.98 
 
 		 376 aa  140  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0635655  hitchhiker  0.00588714 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4286  RND family efflux transporter MFP subunit  28.16 
 
 		 361 aa  134  3.9999999999999996e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.749975  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2615  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.81 
 
 		 380 aa  131  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.909785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0948  secretion protein HlyD  32.27 
 
 		 413 aa  129  6e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.297274  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1721  RND family efflux transporter MFP subunit  30.43 
 
 		 431 aa  127  3e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2582  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.06 
 
 		 379 aa  125  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000000306136  normal  0.19553 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4014  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.21 
 
 		 362 aa  124  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0181773  normal  0.127593 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1161  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.17 
 
 		 376 aa  124  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.444348  normal  0.334679 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3309  RND family efflux transporter MFP subunit  29.95 
 
 		 430 aa  120  3.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.717365 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14330  Secretion protein HlyD family  29.22 
 
 		 401 aa  116  6e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.774042  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001980  probable RND efflux membrane fusion protein  27.83 
 
 		 367 aa  112  9e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.979341  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03344  acriflavin resistance protein  28.81 
 
 		 417 aa  112  1.0000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1206  multidrug efflux system subunit MdtA  27.89 
 
 		 419 aa  110  3e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0570202  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1700  secretion protein HlyD  26.87 
 
 		 417 aa  110  4.0000000000000004e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.696744  normal  0.370784 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0907  RND efflux membrane fusion protein-related protein  30.84 
 
 		 406 aa  110  6e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2966  multidrug efflux system subunit MdtA  27.62 
 
 		 413 aa  109  7.000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.874422  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0975  RND family efflux transporter MFP subunit  31.13 
 
 		 382 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0109715 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3140  secretion protein HlyD  30.17 
 
 		 360 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.203317  normal  0.359518 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0946  RND family efflux transporter MFP subunit  30.82 
 
 		 382 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3103  multidrug efflux system subunit MdtA  27.99 
 
 		 427 aa  107  5e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1332  multidrug efflux system subunit MdtA  27.99 
 
 		 444 aa  107  5e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.713792  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1215  multidrug efflux system subunit MdtA  27.99 
 
 		 444 aa  107  5e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3552  multidrug efflux system subunit MdtA  28.7 
 
 		 413 aa  106  7e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0460  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.15 
 
 		 380 aa  105  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3160  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.36 
 
 		 1460 aa  105  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01979  multidrug efflux system, subunit A  29.8 
 
 		 415 aa  105  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4149  RND family efflux transporter MFP subunit  25.83 
 
 		 372 aa  105  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.815582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3094  putative efflux transporter  31.29 
 
 		 393 aa  105  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000031387  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01971  hypothetical protein  29.8 
 
 		 415 aa  105  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1312  multidrug efflux system subunit MdtA  27.11 
 
 		 410 aa  104  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.164615  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2591  RND family efflux transporter MFP subunit  30.42 
 
 		 463 aa  104  3e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.422822  normal  0.340429 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1361  HlyD family secretion protein  27.47 
 
 		 387 aa  103  4e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.70378  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2708  RND efflux membrane fusion protein precursor  26.91 
 
 		 426 aa  103  4e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0286088  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2742  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.18 
 
 		 462 aa  103  4e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.878273  normal  0.333603 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0372  RND family efflux transporter MFP subunit  26.33 
 
 		 372 aa  103  5e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2447  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.29 
 
 		 462 aa  103  5e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0986  multidrug efflux system subunit MdtA  29.8 
 
 		 415 aa  103  6e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.607592 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31870  putative RND efflux membrane fusion protein precursor  26.61 
 
 		 426 aa  103  6e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2519  RND family efflux transporter MFP subunit  27.18 
 
 		 462 aa  103  6e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0990554 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1582  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.8 
 
 		 415 aa  103  7e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0117238  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3467  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.04 
 
 		 376 aa  103  7e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00013135  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1178  RND family efflux transporter MFP subunit  29.67 
 
 		 390 aa  103  7e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>