More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS02155 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010678  Rpic_4897  efflux transporter, RND family, MFP subunit  83.57 
 
 		 437 aa  663    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.51776 
 
 
-
 
NC_003296  RS02155  putative transport transmembrane protein  100 
 
 		 421 aa  843    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.58284 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3820  efflux transporter, RND family, MFP subunit  83.57 
 
 		 437 aa  663    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6521  RND family efflux transporter MFP subunit  56.73 
 
 		 410 aa  412  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.745567  normal  0.0817001 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5875  efflux transporter, RND family, MFP subunit  52.84 
 
 		 407 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0955286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2071  RND efflux system membrane fusion protein  54.11 
 
 		 407 aa  398  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.226746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1727  HlyD family secretion protein  57.51 
 
 		 409 aa  384  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0767982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4188  RND family efflux transporter MFP subunit  58.73 
 
 		 410 aa  382  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0941549  normal  0.890181 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3225  RND family efflux transporter MFP subunit  57.56 
 
 		 392 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.376119  normal  0.122741 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4313  RND family efflux transporter MFP subunit  58.05 
 
 		 409 aa  380  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.583259 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2584  CzcB subfamily membrane fusion protein  53.26 
 
 		 409 aa  379  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4074  secretion protein HlyD  57.82 
 
 		 392 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.119469  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3710  RND family efflux transporter MFP subunit  58.2 
 
 		 410 aa  379  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4292  RND family efflux transporter MFP subunit  57.82 
 
 		 392 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0567  RND family efflux transporter MFP subunit  51.42 
 
 		 424 aa  352  8e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0359  efflux transporter, RND family, MFP subunit  45.69 
 
 		 401 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0078  hypothetical protein  43.02 
 
 		 381 aa  297  2e-79  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4363  RND efflux system membrane fusion protein  43.7 
 
 		 467 aa  295  1e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.234106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2097  RND family efflux transporter MFP subunit  44.25 
 
 		 391 aa  278  9e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.902105  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1967  RND family efflux transporter MFP subunit  44.25 
 
 		 391 aa  278  2e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0310111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1392  RND efflux system membrane fusion protein  41.16 
 
 		 419 aa  268  2e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0449025  normal  0.0986293 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7211  RND family efflux transporter MFP subunit  43.38 
 
 		 419 aa  266  4e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5203  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.36 
 
 		 455 aa  266  5e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.755082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1502  secretion protein HlyD  42.34 
 
 		 478 aa  265  8e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.184777  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6327  RND family efflux transporter MFP subunit  42.34 
 
 		 478 aa  265  8e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0452278  normal  0.980568 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6991  RND family efflux transporter MFP subunit  43.03 
 
 		 472 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.231557 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5985  RND family efflux transporter MFP subunit  43.1 
 
 		 455 aa  265  1e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5741  RND family efflux transporter MFP subunit  42.82 
 
 		 455 aa  264  2e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.814041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3750  secretion protein HlyD  40.06 
 
 		 401 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4618  RND family efflux transporter MFP subunit  40.06 
 
 		 401 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.343268  normal  0.223248 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5686  RND family efflux transporter MFP subunit  39.5 
 
 		 401 aa  256  4e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.214167 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1955  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.29 
 
 		 400 aa  256  6e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.159137  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2372  secretion protein HlyD  39.79 
 
 		 392 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.753301 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1749  secretion protein HlyD  37.96 
 
 		 398 aa  252  9.000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.145441 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3608  secretion protein HlyD  38.01 
 
 		 400 aa  250  3e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.221607  normal  0.363906 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1817  secretion protein HlyD  40.28 
 
 		 405 aa  245  9e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00656691  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1436  efflux transporter, RND family, MFP subunit  42.09 
 
 		 393 aa  244  1.9999999999999999e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4651  RND family efflux transporter MFP subunit  38.76 
 
 		 402 aa  239  6.999999999999999e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.611035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2552  secretion protein HlyD  34.92 
 
 		 451 aa  237  3e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.603084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3361  RND efflux system membrane fusion protein  40.46 
 
 		 395 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0631452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1141  RND efflux system membrane fusion protein  41.11 
 
 		 394 aa  233  6e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.814411  normal  0.55527 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5198  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.76 
 
 		 366 aa  229  7e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.197197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3414  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.53 
 
 		 1462 aa  227  4e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4616  secretion protein HlyD  36.15 
 
 		 414 aa  222  9e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0123  RND family efflux transporter MFP subunit  33.96 
 
 		 417 aa  218  1e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.713324 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2953  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.17 
 
 		 425 aa  218  2e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.104314 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2849  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.05 
 
 		 421 aa  204  3e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0325844 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1276  secretion protein HlyD  32.86 
 
 		 553 aa  195  1e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0177  hypothetical protein  30.65 
 
 		 406 aa  194  2e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0225  RND family efflux transporter MFP subunit  35.7 
 
 		 461 aa  194  2e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.540049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2717  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.15 
 
 		 393 aa  194  2e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.374816  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2445  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.57 
 
 		 424 aa  190  4e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0377313 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2877  RND family efflux transporter MFP subunit  34.87 
 
 		 435 aa  184  3e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.200442 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4314  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.94 
 
 		 438 aa  177  2e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.544766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4164  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.94 
 
 		 438 aa  178  2e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.444201  normal  0.22934 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3855  RND family efflux transporter MFP subunit  35.94 
 
 		 438 aa  177  3e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.336679  normal  0.260987 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1526  RND family efflux transporter MFP subunit  36.08 
 
 		 423 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.692168  normal  0.0164989 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2692  RND family efflux transporter MFP subunit  34.62 
 
 		 424 aa  155  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00769313  normal  0.142754 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0257  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.57 
 
 		 376 aa  144  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0635655  hitchhiker  0.00588714 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2615  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.53 
 
 		 380 aa  144  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.909785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4286  RND family efflux transporter MFP subunit  28.66 
 
 		 361 aa  142  9.999999999999999e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.749975  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4014  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30 
 
 		 362 aa  133  5e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0181773  normal  0.127593 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1161  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.43 
 
 		 376 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.444348  normal  0.334679 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2582  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.38 
 
 		 379 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000000306136  normal  0.19553 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3160  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.58 
 
 		 1460 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0460  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.95 
 
 		 380 aa  126  6e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1513  secretion protein HlyD  28.7 
 
 		 404 aa  124  3e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.461504  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3539  RND family efflux transporter MFP subunit  30.09 
 
 		 392 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0266  RND family efflux transporter MFP subunit  30.99 
 
 		 375 aa  120  7e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.987776 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5230  RND family efflux transporter MFP subunit  31.02 
 
 		 405 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0639393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2657  cation or acridine efflux membrane fusion protein  27.06 
 
 		 357 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1818  RND family efflux transporter MFP subunit  31.35 
 
 		 352 aa  117  3.9999999999999997e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000224471  normal  0.900766 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1640  CmeA  25.75 
 
 		 386 aa  117  3.9999999999999997e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2106  RND family efflux transporter MFP subunit  29.32 
 
 		 408 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.553946  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3468  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.79 
 
 		 393 aa  116  6.9999999999999995e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.143252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0295  HlyD family secretion protein  30.23 
 
 		 405 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4699  RND family efflux transporter MFP subunit  30.77 
 
 		 405 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1700  secretion protein HlyD  26.82 
 
 		 417 aa  116  8.999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.696744  normal  0.370784 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5708  secretion protein HlyD  30.41 
 
 		 429 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0948  secretion protein HlyD  29.54 
 
 		 413 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.297274  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0448  secretion protein HlyD  29.39 
 
 		 388 aa  115  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.192124 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3014  secretion protein HlyD  30.89 
 
 		 405 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4918  RND family efflux transporter MFP subunit  30.89 
 
 		 405 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.890764  normal  0.731397 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5352  RND family efflux transporter MFP subunit  30.89 
 
 		 405 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.730017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0930  RND family efflux transporter MFP subunit  30.09 
 
 		 366 aa  114  3e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6072  RND family efflux transporter MFP subunit  30.41 
 
 		 399 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0105  RND family efflux transporter MFP subunit  26.79 
 
 		 348 aa  114  5e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0364  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.45 
 
 		 362 aa  113  6e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.405995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1163  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.42 
 
 		 377 aa  113  7.000000000000001e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00317162  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1721  RND family efflux transporter MFP subunit  27.63 
 
 		 431 aa  112  9e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1439  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.44 
 
 		 380 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0465471  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0454  secretion protein HlyD  26.79 
 
 		 373 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.63564  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4150  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.23 
 
 		 397 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00923789  hitchhiker  0.000000297953 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6556  RND family efflux transporter MFP subunit  29.91 
 
 		 399 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.254371  normal  0.769115 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2046  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.15 
 
 		 442 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0505  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.13 
 
 		 349 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3327  RND family efflux transporter MFP subunit  28.21 
 
 		 441 aa  111  3e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1458  RND family efflux transporter MFP subunit  28.61 
 
 		 422 aa  111  3e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.235103  hitchhiker  0.000537348 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3889  RND family efflux transporter MFP subunit  28.53 
 
 		 364 aa  110  3e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3651  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.21 
 
 		 441 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>