More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2717 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_2717  efflux transporter, RND family, MFP subunit  100 
 
 		 393 aa  808    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.374816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0123  RND family efflux transporter MFP subunit  56.95 
 
 		 417 aa  459  9.999999999999999e-129  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.713324 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0177  hypothetical protein  52.94 
 
 		 406 aa  434  1e-120  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1276  secretion protein HlyD  48.66 
 
 		 553 aa  369  1e-101  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2953  efflux transporter, RND family, MFP subunit  49.19 
 
 		 425 aa  365  1e-100  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.104314 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2097  RND family efflux transporter MFP subunit  39.06 
 
 		 391 aa  257  3e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.902105  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1967  RND family efflux transporter MFP subunit  38.5 
 
 		 391 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0310111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4616  secretion protein HlyD  37.23 
 
 		 414 aa  249  7e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3414  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.5 
 
 		 1462 aa  248  1e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3361  RND efflux system membrane fusion protein  39.49 
 
 		 395 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0631452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4618  RND family efflux transporter MFP subunit  35.6 
 
 		 401 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.343268  normal  0.223248 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3750  secretion protein HlyD  35.6 
 
 		 401 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5686  RND family efflux transporter MFP subunit  35.56 
 
 		 401 aa  243  3e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.214167 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3608  secretion protein HlyD  37.64 
 
 		 400 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.221607  normal  0.363906 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1955  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.77 
 
 		 400 aa  241  1e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.159137  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2372  secretion protein HlyD  36.51 
 
 		 392 aa  238  1e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.753301 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1392  RND efflux system membrane fusion protein  35.56 
 
 		 419 aa  237  3e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0449025  normal  0.0986293 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6327  RND family efflux transporter MFP subunit  37.65 
 
 		 478 aa  236  4e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0452278  normal  0.980568 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1141  RND efflux system membrane fusion protein  38.9 
 
 		 394 aa  236  4e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.814411  normal  0.55527 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1502  secretion protein HlyD  37.65 
 
 		 478 aa  236  4e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.184777  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2849  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.31 
 
 		 421 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0325844 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6991  RND family efflux transporter MFP subunit  37.65 
 
 		 472 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.231557 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5203  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.68 
 
 		 455 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.755082  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0078  hypothetical protein  35.69 
 
 		 381 aa  231  2e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5985  RND family efflux transporter MFP subunit  37.75 
 
 		 455 aa  227  3e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5741  RND family efflux transporter MFP subunit  37.75 
 
 		 455 aa  225  1e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.814041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4363  RND efflux system membrane fusion protein  35.24 
 
 		 467 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.234106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1436  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.64 
 
 		 393 aa  217  2.9999999999999998e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7211  RND family efflux transporter MFP subunit  35.98 
 
 		 419 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4651  RND family efflux transporter MFP subunit  36.41 
 
 		 402 aa  216  5.9999999999999996e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.611035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1749  secretion protein HlyD  33.24 
 
 		 398 aa  213  4.9999999999999996e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.145441 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0359  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.69 
 
 		 401 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2552  secretion protein HlyD  33.24 
 
 		 451 aa  197  2.0000000000000003e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.603084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6521  RND family efflux transporter MFP subunit  33.33 
 
 		 410 aa  197  3e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.745567  normal  0.0817001 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1817  secretion protein HlyD  33.24 
 
 		 405 aa  194  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00656691  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5198  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.98 
 
 		 366 aa  194  3e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.197197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2071  RND efflux system membrane fusion protein  32.75 
 
 		 407 aa  191  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.226746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4313  RND family efflux transporter MFP subunit  37.29 
 
 		 409 aa  190  4e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.583259 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5875  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.16 
 
 		 407 aa  186  5e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0955286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4314  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.66 
 
 		 438 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.544766  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3820  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.56 
 
 		 437 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4897  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.56 
 
 		 437 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.51776 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1727  HlyD family secretion protein  36.24 
 
 		 409 aa  184  3e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0767982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2584  CzcB subfamily membrane fusion protein  32.72 
 
 		 409 aa  184  3e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4164  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.73 
 
 		 438 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.444201  normal  0.22934 
 
 
-
 
NC_003296  RS02155  putative transport transmembrane protein  33.15 
 
 		 421 aa  182  1e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.58284 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0567  RND family efflux transporter MFP subunit  30.88 
 
 		 424 aa  182  1e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3855  RND family efflux transporter MFP subunit  31.47 
 
 		 438 aa  182  1e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.336679  normal  0.260987 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0225  RND family efflux transporter MFP subunit  33.59 
 
 		 461 aa  181  2e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.540049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3225  RND family efflux transporter MFP subunit  34.47 
 
 		 392 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.376119  normal  0.122741 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4292  RND family efflux transporter MFP subunit  34.47 
 
 		 392 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4188  RND family efflux transporter MFP subunit  36.26 
 
 		 410 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0941549  normal  0.890181 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4074  secretion protein HlyD  34.47 
 
 		 392 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.119469  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3710  RND family efflux transporter MFP subunit  35.31 
 
 		 410 aa  178  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2877  RND family efflux transporter MFP subunit  32.03 
 
 		 435 aa  173  3.9999999999999995e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.200442 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2445  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.33 
 
 		 424 aa  157  4e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0377313 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2692  RND family efflux transporter MFP subunit  32.17 
 
 		 424 aa  154  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00769313  normal  0.142754 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0257  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.66 
 
 		 376 aa  144  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0635655  hitchhiker  0.00588714 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1526  RND family efflux transporter MFP subunit  30.57 
 
 		 423 aa  136  5e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.692168  normal  0.0164989 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2615  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.45 
 
 		 380 aa  128  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.909785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2582  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.55 
 
 		 379 aa  127  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000000306136  normal  0.19553 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1161  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.1 
 
 		 376 aa  125  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.444348  normal  0.334679 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3160  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.05 
 
 		 1460 aa  123  5e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0460  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.87 
 
 		 380 aa  119  7e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4014  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.7 
 
 		 362 aa  117  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0181773  normal  0.127593 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4286  RND family efflux transporter MFP subunit  26.81 
 
 		 361 aa  117  3.9999999999999997e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.749975  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2569  secretion protein HlyD  29.43 
 
 		 462 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.103631 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3650  secretion protein HlyD  28.29 
 
 		 397 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.521212 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2902  secretion protein HlyD  27.78 
 
 		 464 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.56576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0383  RND family efflux transporter MFP subunit  24.93 
 
 		 365 aa  103  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1044  RND family efflux transporter MFP subunit  24.93 
 
 		 365 aa  103  4e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0078  RND family efflux transporter MFP subunit  24.93 
 
 		 365 aa  103  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1580  RND family efflux transporter MFP subunit  24.93 
 
 		 365 aa  103  4e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.610408  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1496  RND family efflux transporter MFP subunit  24.93 
 
 		 365 aa  103  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1201  RND family efflux transporter MFP subunit  24.93 
 
 		 365 aa  103  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0341767  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0031  RND family efflux transporter MFP subunit  24.93 
 
 		 365 aa  103  4e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0200  secretion protein HlyD  25.41 
 
 		 365 aa  103  5e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3362  RND family efflux transporter MFP subunit  28.97 
 
 		 358 aa  102  8e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1523  secretion protein HlyD  27.62 
 
 		 457 aa  102  1e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.116484 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0505  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.82 
 
 		 349 aa  102  1e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1186  RND family efflux transporter MFP subunit  26.79 
 
 		 374 aa  101  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.425099  normal  0.0297054 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1288  RND family efflux transporter MFP subunit  25.07 
 
 		 365 aa  101  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2558  secretion protein HlyD  27.97 
 
 		 451 aa  100  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0355119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3604  secretion protein HlyD  26.89 
 
 		 422 aa  100  7e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.105186  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1194  acriflavin resistance periplasmic protein  27.08 
 
 		 380 aa  99.4  9e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1809  secretion protein HlyD  26.7 
 
 		 397 aa  99  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3140  secretion protein HlyD  28 
 
 		 360 aa  99  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.203317  normal  0.359518 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1079  secretion protein HlyD  27.03 
 
 		 366 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.984606 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4297  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.08 
 
 		 397 aa  98.2  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.430357  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2684  multidrug efflux system subunit MdtA  28.01 
 
 		 411 aa  97.8  3e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0948  secretion protein HlyD  23.92 
 
 		 413 aa  97.4  4e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.297274  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4319  RND family efflux transporter MFP subunit  26.75 
 
 		 460 aa  97.1  4e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0569861 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2808  membrane fusion protein; cation efflux system protein  24.02 
 
 		 353 aa  97.1  4e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4150  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.24 
 
 		 397 aa  97.1  5e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00923789  hitchhiker  0.000000297953 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0450  RND family efflux transporter MFP subunit  26.07 
 
 		 407 aa  96.3  7e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.825026 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1159  multidrug efflux system subunit MdtA  27.11 
 
 		 415 aa  96.3  9e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3014  multidrug efflux system subunit MdtA  27.11 
 
 		 415 aa  96.3  9e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.105913 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1965  secretion protein HlyD  27.16 
 
 		 388 aa  95.5  1e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.455875 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1704  RND family efflux transporter MFP subunit  24.07 
 
 		 361 aa  95.5  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000249801  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3495  RND family efflux transporter MFP subunit  24.92 
 
 		 365 aa  94.7  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>