More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3855 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_4164  efflux transporter, RND family, MFP subunit  99.54 
 
 		 438 aa  869    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.444201  normal  0.22934 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4314  efflux transporter, RND family, MFP subunit  91.78 
 
 		 438 aa  804    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.544766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3855  RND family efflux transporter MFP subunit  100 
 
 		 438 aa  870    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.336679  normal  0.260987 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2692  RND family efflux transporter MFP subunit  63.55 
 
 		 424 aa  476  1e-133  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00769313  normal  0.142754 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2877  RND family efflux transporter MFP subunit  56.97 
 
 		 435 aa  432  1e-120  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.200442 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0225  RND family efflux transporter MFP subunit  58.91 
 
 		 461 aa  424  1e-117  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.540049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1526  RND family efflux transporter MFP subunit  56.11 
 
 		 423 aa  387  1e-106  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.692168  normal  0.0164989 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2445  efflux transporter, RND family, MFP subunit  45.24 
 
 		 424 aa  279  8e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0377313 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2849  efflux transporter, RND family, MFP subunit  42.61 
 
 		 421 aa  246  8e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0325844 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3608  secretion protein HlyD  36.23 
 
 		 400 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.221607  normal  0.363906 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1955  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.17 
 
 		 400 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.159137  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4616  secretion protein HlyD  36.62 
 
 		 414 aa  207  4e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3414  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.06 
 
 		 1462 aa  204  2e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2552  secretion protein HlyD  33.82 
 
 		 451 aa  205  2e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.603084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1392  RND efflux system membrane fusion protein  37.82 
 
 		 419 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0449025  normal  0.0986293 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1502  secretion protein HlyD  39.94 
 
 		 478 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.184777  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6327  RND family efflux transporter MFP subunit  39.94 
 
 		 478 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0452278  normal  0.980568 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6991  RND family efflux transporter MFP subunit  39.94 
 
 		 472 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.231557 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5686  RND family efflux transporter MFP subunit  33.25 
 
 		 401 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.214167 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2071  RND efflux system membrane fusion protein  32.51 
 
 		 407 aa  195  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.226746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3750  secretion protein HlyD  32.99 
 
 		 401 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4618  RND family efflux transporter MFP subunit  32.99 
 
 		 401 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.343268  normal  0.223248 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6521  RND family efflux transporter MFP subunit  32.49 
 
 		 410 aa  195  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.745567  normal  0.0817001 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5203  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.56 
 
 		 455 aa  194  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.755082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7211  RND family efflux transporter MFP subunit  40.42 
 
 		 419 aa  194  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5875  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.16 
 
 		 407 aa  192  9e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0955286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2584  CzcB subfamily membrane fusion protein  35.14 
 
 		 409 aa  192  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1967  RND family efflux transporter MFP subunit  35.55 
 
 		 391 aa  191  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0310111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2097  RND family efflux transporter MFP subunit  35.84 
 
 		 391 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.902105  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5985  RND family efflux transporter MFP subunit  38.24 
 
 		 455 aa  187  3e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0078  hypothetical protein  33.42 
 
 		 381 aa  187  4e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5741  RND family efflux transporter MFP subunit  38.24 
 
 		 455 aa  186  5e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.814041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1436  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.99 
 
 		 393 aa  186  5e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2372  secretion protein HlyD  33.67 
 
 		 392 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.753301 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0177  hypothetical protein  32.27 
 
 		 406 aa  182  1e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4651  RND family efflux transporter MFP subunit  35.09 
 
 		 402 aa  182  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.611035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3361  RND efflux system membrane fusion protein  35.76 
 
 		 395 aa  171  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0631452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4363  RND efflux system membrane fusion protein  33.72 
 
 		 467 aa  170  5e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.234106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2717  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.96 
 
 		 393 aa  168  2e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.374816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5198  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.25 
 
 		 366 aa  167  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.197197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1727  HlyD family secretion protein  35.69 
 
 		 409 aa  166  8e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0767982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3710  RND family efflux transporter MFP subunit  36.05 
 
 		 410 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0123  RND family efflux transporter MFP subunit  31.64 
 
 		 417 aa  164  3e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.713324 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4292  RND family efflux transporter MFP subunit  35.69 
 
 		 392 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4313  RND family efflux transporter MFP subunit  35.28 
 
 		 409 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.583259 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3225  RND family efflux transporter MFP subunit  35.69 
 
 		 392 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.376119  normal  0.122741 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4074  secretion protein HlyD  35.69 
 
 		 392 aa  163  7e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.119469  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0567  RND family efflux transporter MFP subunit  33.16 
 
 		 424 aa  162  1e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4188  RND family efflux transporter MFP subunit  36.31 
 
 		 410 aa  161  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0941549  normal  0.890181 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2953  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.24 
 
 		 425 aa  160  5e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.104314 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3820  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.77 
 
 		 437 aa  159  9e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4897  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.77 
 
 		 437 aa  159  9e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.51776 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1749  secretion protein HlyD  31.43 
 
 		 398 aa  157  3e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.145441 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0359  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.03 
 
 		 401 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1817  secretion protein HlyD  33.52 
 
 		 405 aa  154  4e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00656691  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1276  secretion protein HlyD  29.79 
 
 		 553 aa  149  7e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1141  RND efflux system membrane fusion protein  35.17 
 
 		 394 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.814411  normal  0.55527 
 
 
-
 
NC_003296  RS02155  putative transport transmembrane protein  35.36 
 
 		 421 aa  145  2e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.58284 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4014  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.64 
 
 		 362 aa  138  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0181773  normal  0.127593 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0460  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.32 
 
 		 380 aa  133  6e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0257  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.32 
 
 		 376 aa  128  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0635655  hitchhiker  0.00588714 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3160  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.91 
 
 		 1460 aa  127  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1700  secretion protein HlyD  28.24 
 
 		 417 aa  126  9e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.696744  normal  0.370784 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4150  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.41 
 
 		 397 aa  116  6e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00923789  hitchhiker  0.000000297953 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1721  RND family efflux transporter MFP subunit  25.38 
 
 		 431 aa  116  7.999999999999999e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0505  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.42 
 
 		 349 aa  113  6e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1943  secretion protein HlyD  29.17 
 
 		 523 aa  110  6e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.354822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0816  RND family efflux transporter MFP subunit  30 
 
 		 385 aa  108  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2615  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.49 
 
 		 380 aa  108  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.909785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1161  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.61 
 
 		 376 aa  108  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.444348  normal  0.334679 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4286  RND family efflux transporter MFP subunit  26.82 
 
 		 361 aa  107  3e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.749975  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4563  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.41 
 
 		 426 aa  107  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0549  secretion protein HlyD  29.94 
 
 		 407 aa  104  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2582  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.96 
 
 		 379 aa  103  6e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000000306136  normal  0.19553 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1161  RND family efflux transporter MFP subunit  29.43 
 
 		 404 aa  103  7e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0203325  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2100  RND family efflux transporter MFP subunit  28.19 
 
 		 379 aa  102  1e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0493506  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2949  RND family efflux transporter MFP subunit  25.34 
 
 		 376 aa  102  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0098  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.77 
 
 		 432 aa  102  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0166  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.41 
 
 		 379 aa  102  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1385  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.03 
 
 		 380 aa  102  2e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0605754  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2665  RND family efflux transporter MFP subunit  30.46 
 
 		 386 aa  101  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4057  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.45 
 
 		 374 aa  100  7e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2519  secretion protein HlyD  30.81 
 
 		 382 aa  99.8  9e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000015375  normal  0.24357 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3297  secretion protein HlyD  28.75 
 
 		 418 aa  99  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28820  secretion protein, HlyD family  29.12 
 
 		 441 aa  97.1  6e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.20411  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4005  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.54 
 
 		 387 aa  97.1  6e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2954  RND family efflux transporter MFP subunit  26.12 
 
 		 364 aa  96.3  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000249187  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0948  secretion protein HlyD  26.58 
 
 		 413 aa  95.9  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.297274  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01077  HlyD family secretion protein  26.58 
 
 		 376 aa  95.5  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2524  RND family efflux transporter MFP subunit  26.16 
 
 		 424 aa  94.4  4e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.283395  normal  0.0763035 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2543  secretion protein HlyD  27.34 
 
 		 471 aa  93.6  6e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.467529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2374  RND family efflux transporter MFP subunit  25.81 
 
 		 395 aa  93.6  6e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.347836 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4226  RND family efflux transporter MFP subunit  25.4 
 
 		 426 aa  93.2  8e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.499264  normal  0.926991 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0830  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.86 
 
 		 390 aa  92.8  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6029  acriflavin resistance protein A  25.68 
 
 		 411 aa  92.4  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1660  RND family efflux transporter MFP subunit  30.39 
 
 		 361 aa  92.8  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0949  RND family efflux transporter MFP subunit  28.65 
 
 		 390 aa  92  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1938  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.73 
 
 		 462 aa  92  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000755017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0454  secretion protein HlyD  25.22 
 
 		 373 aa  92.4  2e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.63564  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1983  RND family efflux transporter MFP subunit  28.57 
 
 		 416 aa  91.7  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>