More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0225 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0225  RND family efflux transporter MFP subunit  100 
 
 		 461 aa  909    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.540049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3855  RND family efflux transporter MFP subunit  59.51 
 
 		 438 aa  455  1e-127  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.336679  normal  0.260987 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4314  efflux transporter, RND family, MFP subunit  58.66 
 
 		 438 aa  457  1e-127  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.544766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4164  efflux transporter, RND family, MFP subunit  59.75 
 
 		 438 aa  456  1e-127  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.444201  normal  0.22934 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2877  RND family efflux transporter MFP subunit  58.71 
 
 		 435 aa  438  9.999999999999999e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.200442 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2692  RND family efflux transporter MFP subunit  56.11 
 
 		 424 aa  387  1e-106  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00769313  normal  0.142754 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1526  RND family efflux transporter MFP subunit  58.96 
 
 		 423 aa  378  1e-103  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.692168  normal  0.0164989 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2445  efflux transporter, RND family, MFP subunit  46.92 
 
 		 424 aa  300  5e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0377313 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2849  efflux transporter, RND family, MFP subunit  43.6 
 
 		 421 aa  263  4.999999999999999e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0325844 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2552  secretion protein HlyD  41.33 
 
 		 451 aa  247  4e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.603084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6521  RND family efflux transporter MFP subunit  38.98 
 
 		 410 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.745567  normal  0.0817001 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2071  RND efflux system membrane fusion protein  37.91 
 
 		 407 aa  230  3e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.226746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5875  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.67 
 
 		 407 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0955286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1967  RND family efflux transporter MFP subunit  39.5 
 
 		 391 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0310111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2097  RND family efflux transporter MFP subunit  39.5 
 
 		 391 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.902105  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2584  CzcB subfamily membrane fusion protein  38.28 
 
 		 409 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1955  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.58 
 
 		 400 aa  216  8e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.159137  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1436  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.7 
 
 		 393 aa  215  9.999999999999999e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3608  secretion protein HlyD  35.75 
 
 		 400 aa  213  5.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.221607  normal  0.363906 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3414  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.46 
 
 		 1462 aa  211  2e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6991  RND family efflux transporter MFP subunit  39.07 
 
 		 472 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.231557 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1502  secretion protein HlyD  39.76 
 
 		 478 aa  211  3e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.184777  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6327  RND family efflux transporter MFP subunit  39.76 
 
 		 478 aa  211  3e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0452278  normal  0.980568 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7211  RND family efflux transporter MFP subunit  40.35 
 
 		 419 aa  207  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4616  secretion protein HlyD  36.97 
 
 		 414 aa  207  4e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3361  RND efflux system membrane fusion protein  39.83 
 
 		 395 aa  204  3e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0631452  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0078  hypothetical protein  35.03 
 
 		 381 aa  203  4e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3750  secretion protein HlyD  39.14 
 
 		 401 aa  203  6e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4618  RND family efflux transporter MFP subunit  39.14 
 
 		 401 aa  203  6e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.343268  normal  0.223248 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5686  RND family efflux transporter MFP subunit  37.82 
 
 		 401 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.214167 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1392  RND efflux system membrane fusion protein  36.54 
 
 		 419 aa  195  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0449025  normal  0.0986293 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5741  RND family efflux transporter MFP subunit  38.48 
 
 		 455 aa  194  3e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.814041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4363  RND efflux system membrane fusion protein  38.12 
 
 		 467 aa  194  3e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.234106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1141  RND efflux system membrane fusion protein  39.66 
 
 		 394 aa  194  3e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.814411  normal  0.55527 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5985  RND family efflux transporter MFP subunit  38.48 
 
 		 455 aa  194  3e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5203  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.72 
 
 		 455 aa  193  6e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.755082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4651  RND family efflux transporter MFP subunit  36.34 
 
 		 402 aa  190  5.999999999999999e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.611035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2953  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.75 
 
 		 425 aa  184  3e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.104314 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4897  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.46 
 
 		 437 aa  183  6e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.51776 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3820  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.46 
 
 		 437 aa  183  6e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1727  HlyD family secretion protein  38.46 
 
 		 409 aa  183  7e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0767982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3225  RND family efflux transporter MFP subunit  38.17 
 
 		 392 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.376119  normal  0.122741 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4292  RND family efflux transporter MFP subunit  38.17 
 
 		 392 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4074  secretion protein HlyD  38.17 
 
 		 392 aa  180  4e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.119469  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4188  RND family efflux transporter MFP subunit  37.91 
 
 		 410 aa  179  7e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0941549  normal  0.890181 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3710  RND family efflux transporter MFP subunit  37.39 
 
 		 410 aa  179  8e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0567  RND family efflux transporter MFP subunit  33.52 
 
 		 424 aa  179  1e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1749  secretion protein HlyD  35.23 
 
 		 398 aa  178  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.145441 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4313  RND family efflux transporter MFP subunit  37.87 
 
 		 409 aa  177  3e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.583259 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5198  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.26 
 
 		 366 aa  176  9e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.197197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0359  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.83 
 
 		 401 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02155  putative transport transmembrane protein  33.93 
 
 		 421 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.58284 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2717  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.87 
 
 		 393 aa  174  3.9999999999999995e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.374816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0123  RND family efflux transporter MFP subunit  29.55 
 
 		 417 aa  173  5e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.713324 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2372  secretion protein HlyD  33.5 
 
 		 392 aa  172  7.999999999999999e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.753301 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1276  secretion protein HlyD  31.75 
 
 		 553 aa  167  5e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1817  secretion protein HlyD  34.31 
 
 		 405 aa  163  8.000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00656691  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0177  hypothetical protein  29.65 
 
 		 406 aa  161  2e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0257  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.03 
 
 		 376 aa  130  4.0000000000000003e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0635655  hitchhiker  0.00588714 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1721  RND family efflux transporter MFP subunit  28.61 
 
 		 431 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1700  secretion protein HlyD  27.68 
 
 		 417 aa  119  9e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.696744  normal  0.370784 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1161  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.4 
 
 		 376 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.444348  normal  0.334679 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4014  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.87 
 
 		 362 aa  118  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0181773  normal  0.127593 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1385  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.97 
 
 		 380 aa  117  5e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0605754  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2957  secretion protein HlyD  28.26 
 
 		 389 aa  116  7.999999999999999e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0178504  normal  0.933874 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4286  RND family efflux transporter MFP subunit  25.84 
 
 		 361 aa  115  2.0000000000000002e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.749975  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0948  secretion protein HlyD  28.24 
 
 		 413 aa  114  3e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.297274  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0460  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.29 
 
 		 380 aa  113  6e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4150  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.73 
 
 		 397 aa  113  7.000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00923789  hitchhiker  0.000000297953 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2582  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.25 
 
 		 379 aa  113  7.000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000000306136  normal  0.19553 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3531  secretion protein HlyD  28.32 
 
 		 400 aa  112  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2615  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.84 
 
 		 380 aa  109  9.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.909785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6556  RND family efflux transporter MFP subunit  27.91 
 
 		 399 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.254371  normal  0.769115 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1818  RND family efflux transporter MFP subunit  30.81 
 
 		 352 aa  108  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000224471  normal  0.900766 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0102  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.57 
 
 		 465 aa  107  3e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5708  secretion protein HlyD  28.2 
 
 		 429 aa  107  4e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0015  secretion protein, HlyD family  26.67 
 
 		 372 aa  107  4e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2644  RND family efflux transporter MFP subunit  27.46 
 
 		 385 aa  106  8e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6072  RND family efflux transporter MFP subunit  28.2 
 
 		 399 aa  106  8e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28820  secretion protein, HlyD family  28.83 
 
 		 441 aa  104  3e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.20411  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3297  secretion protein HlyD  29.75 
 
 		 418 aa  104  3e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3495  RND family efflux transporter MFP subunit  29.12 
 
 		 365 aa  104  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1983  RND family efflux transporter MFP subunit  29.67 
 
 		 416 aa  104  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2010  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.99 
 
 		 412 aa  104  4e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.2279  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1007  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.15 
 
 		 398 aa  104  4e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0975  RND family efflux transporter MFP subunit  26.65 
 
 		 382 aa  103  6e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0109715 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1389  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.98 
 
 		 374 aa  103  6e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000158934  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2586  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.5 
 
 		 388 aa  103  7e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000121955  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1965  secretion protein HlyD  25.3 
 
 		 388 aa  102  1e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.455875 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2949  RND family efflux transporter MFP subunit  25.35 
 
 		 376 aa  102  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1943  secretion protein HlyD  28.61 
 
 		 523 aa  102  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.354822  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3160  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.86 
 
 		 1460 aa  101  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0907  RND efflux membrane fusion protein-related protein  25.34 
 
 		 406 aa  101  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2802  RND family efflux transporter MFP subunit  27.66 
 
 		 430 aa  101  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.662741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2912  secretion protein HlyD  28.08 
 
 		 418 aa  101  3e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.62912 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2543  secretion protein HlyD  26.74 
 
 		 471 aa  101  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.467529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2758  secretion protein HlyD  28.57 
 
 		 385 aa  100  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.215327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0505  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.83 
 
 		 349 aa  101  4e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0946  RND family efflux transporter MFP subunit  25.79 
 
 		 382 aa  100  6e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1458  RND family efflux transporter MFP subunit  28.11 
 
 		 422 aa  100  7e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.235103  hitchhiker  0.000537348 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>