More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_4618 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_5686  RND family efflux transporter MFP subunit  98.25 
 
 		 401 aa  793    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.214167 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3750  secretion protein HlyD  100 
 
 		 401 aa  803    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4618  RND family efflux transporter MFP subunit  100 
 
 		 401 aa  803    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.343268  normal  0.223248 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2097  RND family efflux transporter MFP subunit  62.69 
 
 		 391 aa  450  1e-125  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.902105  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1967  RND family efflux transporter MFP subunit  62.44 
 
 		 391 aa  451  1e-125  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0310111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3361  RND efflux system membrane fusion protein  56.53 
 
 		 395 aa  363  3e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0631452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1141  RND efflux system membrane fusion protein  54.75 
 
 		 394 aa  355  1e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.814411  normal  0.55527 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1955  efflux transporter, RND family, MFP subunit  48.91 
 
 		 400 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.159137  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4651  RND family efflux transporter MFP subunit  48.77 
 
 		 402 aa  348  7e-95  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.611035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3608  secretion protein HlyD  46.86 
 
 		 400 aa  345  6e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.221607  normal  0.363906 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2372  secretion protein HlyD  48.65 
 
 		 392 aa  345  7e-94  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.753301 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4616  secretion protein HlyD  48.37 
 
 		 414 aa  343  4e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3414  efflux transporter, RND family, MFP subunit  48.04 
 
 		 1462 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1436  efflux transporter, RND family, MFP subunit  49.86 
 
 		 393 aa  309  5.9999999999999995e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4363  RND efflux system membrane fusion protein  48.16 
 
 		 467 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.234106  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0078  hypothetical protein  44.38 
 
 		 381 aa  298  1e-79  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7211  RND family efflux transporter MFP subunit  47.47 
 
 		 419 aa  296  5e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1392  RND efflux system membrane fusion protein  43.65 
 
 		 419 aa  291  1e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0449025  normal  0.0986293 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5203  efflux transporter, RND family, MFP subunit  44.26 
 
 		 455 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.755082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0359  efflux transporter, RND family, MFP subunit  47.77 
 
 		 401 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2849  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.92 
 
 		 421 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0325844 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0123  RND family efflux transporter MFP subunit  39.49 
 
 		 417 aa  281  2e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.713324 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1749  secretion protein HlyD  42.62 
 
 		 398 aa  281  2e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.145441 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6521  RND family efflux transporter MFP subunit  44.39 
 
 		 410 aa  277  2e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.745567  normal  0.0817001 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1817  secretion protein HlyD  45.33 
 
 		 405 aa  276  6e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00656691  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1502  secretion protein HlyD  45.28 
 
 		 478 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.184777  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6327  RND family efflux transporter MFP subunit  45.28 
 
 		 478 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0452278  normal  0.980568 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6991  RND family efflux transporter MFP subunit  45.28 
 
 		 472 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.231557 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2071  RND efflux system membrane fusion protein  40.87 
 
 		 407 aa  268  1e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.226746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5875  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.21 
 
 		 407 aa  268  2e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0955286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5741  RND family efflux transporter MFP subunit  43.1 
 
 		 455 aa  260  3e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.814041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5985  RND family efflux transporter MFP subunit  42.82 
 
 		 455 aa  259  7e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0177  hypothetical protein  37.4 
 
 		 406 aa  256  4e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2953  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.95 
 
 		 425 aa  246  4e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.104314 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3820  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.15 
 
 		 437 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4897  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.15 
 
 		 437 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.51776 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2584  CzcB subfamily membrane fusion protein  37.47 
 
 		 409 aa  243  3e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4313  RND family efflux transporter MFP subunit  40.16 
 
 		 409 aa  239  4e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.583259 
 
 
-
 
NC_003296  RS02155  putative transport transmembrane protein  40.06 
 
 		 421 aa  239  6.999999999999999e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.58284 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3710  RND family efflux transporter MFP subunit  41.46 
 
 		 410 aa  232  1e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2717  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.6 
 
 		 393 aa  231  2e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.374816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1727  HlyD family secretion protein  39.52 
 
 		 409 aa  229  6e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0767982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4188  RND family efflux transporter MFP subunit  41.69 
 
 		 410 aa  225  1e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0941549  normal  0.890181 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3225  RND family efflux transporter MFP subunit  38.9 
 
 		 392 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.376119  normal  0.122741 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4074  secretion protein HlyD  39.34 
 
 		 392 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.119469  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4292  RND family efflux transporter MFP subunit  39.34 
 
 		 392 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0567  RND family efflux transporter MFP subunit  36.99 
 
 		 424 aa  219  8.999999999999998e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1276  secretion protein HlyD  34.32 
 
 		 553 aa  218  2e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2877  RND family efflux transporter MFP subunit  35.09 
 
 		 435 aa  206  6e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.200442 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2552  secretion protein HlyD  34.18 
 
 		 451 aa  204  3e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.603084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5198  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.21 
 
 		 366 aa  203  5e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.197197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0225  RND family efflux transporter MFP subunit  37.14 
 
 		 461 aa  197  3e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.540049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4164  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.25 
 
 		 438 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.444201  normal  0.22934 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3855  RND family efflux transporter MFP subunit  32.99 
 
 		 438 aa  195  1e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.336679  normal  0.260987 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2445  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.18 
 
 		 424 aa  194  2e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0377313 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4314  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.9 
 
 		 438 aa  193  3e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.544766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2692  RND family efflux transporter MFP subunit  32.49 
 
 		 424 aa  173  5.999999999999999e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00769313  normal  0.142754 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1526  RND family efflux transporter MFP subunit  34.2 
 
 		 423 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.692168  normal  0.0164989 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0257  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.38 
 
 		 376 aa  127  5e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0635655  hitchhiker  0.00588714 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2615  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.43 
 
 		 380 aa  124  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.909785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4286  RND family efflux transporter MFP subunit  27.2 
 
 		 361 aa  118  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.749975  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4319  RND family efflux transporter MFP subunit  28.91 
 
 		 460 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0569861 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31870  putative RND efflux membrane fusion protein precursor  27.62 
 
 		 426 aa  114  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2708  RND efflux membrane fusion protein precursor  27.94 
 
 		 426 aa  114  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0286088  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1523  secretion protein HlyD  29.44 
 
 		 457 aa  113  5e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.116484 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2065  secretion protein HlyD  29.44 
 
 		 454 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.309375  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2581  hypothetical protein  27.82 
 
 		 384 aa  110  3e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0948  secretion protein HlyD  27.94 
 
 		 413 aa  110  5e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.297274  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2435  hypothetical protein  27.55 
 
 		 384 aa  110  6e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1385  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30 
 
 		 380 aa  109  7.000000000000001e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0605754  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3932  multidrug resistance protein mdtA precursor  29.27 
 
 		 473 aa  108  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.416339 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1458  RND family efflux transporter MFP subunit  29.28 
 
 		 422 aa  109  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.235103  hitchhiker  0.000537348 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14330  Secretion protein HlyD family  26.89 
 
 		 401 aa  108  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.774042  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3610  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.03 
 
 		 388 aa  107  3e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.479598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3829  secretion protein HlyD  28.12 
 
 		 387 aa  107  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.192626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2431  RND family efflux transporter MFP subunit  27.04 
 
 		 435 aa  107  3e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0638771  normal  0.904192 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2519  RND family efflux transporter MFP subunit  26.96 
 
 		 462 aa  107  4e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0990554 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1161  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.1 
 
 		 376 aa  107  4e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.444348  normal  0.334679 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2742  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.96 
 
 		 462 aa  107  5e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.878273  normal  0.333603 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1617  secretion protein HlyD  28.75 
 
 		 408 aa  106  8e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0160623  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3604  secretion protein HlyD  26.84 
 
 		 422 aa  106  9e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.105186  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03141  putative resistance transmembrane protein  25.58 
 
 		 449 aa  105  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.704547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2447  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.93 
 
 		 462 aa  105  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4415  RND family efflux transporter MFP subunit  25.16 
 
 		 458 aa  105  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.553493  normal  0.934455 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2939  RND family efflux transporter MFP subunit  26.01 
 
 		 352 aa  105  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.0067677  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1671  HlyD family secretion protein  28.75 
 
 		 408 aa  105  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4184  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.87 
 
 		 462 aa  105  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.267577  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4296  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.87 
 
 		 462 aa  105  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2684  multidrug efflux system subunit MdtA  28.03 
 
 		 411 aa  103  4e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3160  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.84 
 
 		 1460 aa  103  6e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2132  HlyD family secretion protein  29.09 
 
 		 360 aa  103  7e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.732379  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1700  secretion protein HlyD  27.11 
 
 		 417 aa  103  7e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.696744  normal  0.370784 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4151  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.75 
 
 		 451 aa  102  9e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0426406  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1178  RND family efflux transporter MFP subunit  31.44 
 
 		 390 aa  102  1e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0170  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.07 
 
 		 450 aa  102  1e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.736393 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4014  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.71 
 
 		 362 aa  102  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0181773  normal  0.127593 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2826  secretion protein HlyD  27.44 
 
 		 464 aa  101  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.45041 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2582  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.71 
 
 		 379 aa  101  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000000306136  normal  0.19553 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1596  HlyD family multidrug efflux protein  29.56 
 
 		 371 aa  101  3e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.616153  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3309  RND family efflux transporter MFP subunit  29.43 
 
 		 430 aa  100  4e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.717365 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>