More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2519 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_2742  efflux transporter, RND family, MFP subunit  99.57 
 
 		 462 aa  914    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.878273  normal  0.333603 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2447  efflux transporter, RND family, MFP subunit  94.2 
 
 		 462 aa  795    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2519  RND family efflux transporter MFP subunit  100 
 
 		 462 aa  919    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0990554 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4319  RND family efflux transporter MFP subunit  70.64 
 
 		 460 aa  624  1e-177  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0569861 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4415  RND family efflux transporter MFP subunit  66.03 
 
 		 458 aa  503  1e-141  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.553493  normal  0.934455 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4151  efflux transporter, RND family, MFP subunit  68.36 
 
 		 451 aa  504  1e-141  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0426406  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1369  membrane fusion protein MdtA  55.61 
 
 		 445 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1364  membrane fusion protein MdtA  55.22 
 
 		 442 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.284522  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2866  HlyD family secretion protein  52.49 
 
 		 576 aa  404  1e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1501  HlyD family secretion protein  57.79 
 
 		 445 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.310778  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2104  RND family efflux transporter MFP subunit  58.24 
 
 		 450 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1080  RND family efflux transporter MFP subunit  57.35 
 
 		 457 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1080  RND family efflux transporter MFP subunit  56.81 
 
 		 463 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1577  efflux transporter, RND family, MFP subunit  58.7 
 
 		 434 aa  395  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.321925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2907  RND efflux system membrane fusion protein  58.53 
 
 		 433 aa  397  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.484522  normal  0.506514 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1172  RND family efflux transporter MFP subunit  56.47 
 
 		 454 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.118061 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1198  RND family efflux transporter MFP subunit  56.47 
 
 		 457 aa  393  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.495254  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4306  HlyD family secretion protein  56.47 
 
 		 456 aa  390  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0237047  normal  0.270235 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0719  secretion protein HlyD  56.18 
 
 		 457 aa  391  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1771  RND family efflux transporter MFP subunit  58.04 
 
 		 469 aa  391  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.75905 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0170  efflux transporter, RND family, MFP subunit  51.6 
 
 		 450 aa  376  1e-103  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.736393 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2521  secretion protein HlyD  52.46 
 
 		 435 aa  371  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.770973  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4184  efflux transporter, RND family, MFP subunit  51.94 
 
 		 462 aa  365  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.267577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3604  secretion protein HlyD  51.63 
 
 		 422 aa  367  1e-100  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.105186  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4296  efflux transporter, RND family, MFP subunit  51.94 
 
 		 462 aa  365  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2753  HlyD family secretion protein  47.82 
 
 		 444 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2482  secretion protein HlyD  48.59 
 
 		 434 aa  352  7e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.179732  normal  0.227362 
 
 
-
 
NC_003296  RS03141  putative resistance transmembrane protein  54.97 
 
 		 449 aa  351  2e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.704547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0514  secretion protein HlyD  54.83 
 
 		 523 aa  350  2e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00131685  normal  0.623408 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4166  RND family efflux transporter MFP subunit  49.74 
 
 		 427 aa  347  4e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3005  efflux transporter, RND family, MFP subunit  51.58 
 
 		 455 aa  345  7e-94  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.568711  normal  0.749765 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0572  secretion protein HlyD  52.42 
 
 		 498 aa  345  1e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0544292  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2202  RND family efflux transporter MFP subunit  45.75 
 
 		 407 aa  341  2e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1332  multidrug efflux system subunit MdtA  50 
 
 		 444 aa  339  5e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.713792  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28820  secretion protein, HlyD family  45.43 
 
 		 441 aa  338  9e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.20411  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3103  multidrug efflux system subunit MdtA  49.72 
 
 		 427 aa  338  9.999999999999999e-92  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1215  multidrug efflux system subunit MdtA  49.72 
 
 		 444 aa  338  1.9999999999999998e-91  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2802  RND family efflux transporter MFP subunit  47.51 
 
 		 430 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.662741  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1206  multidrug efflux system subunit MdtA  45.22 
 
 		 419 aa  337  2.9999999999999997e-91  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0570202  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2329  RND family efflux transporter MFP subunit  48.1 
 
 		 436 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.4455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3552  multidrug efflux system subunit MdtA  47.76 
 
 		 413 aa  336  5e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1582  efflux transporter, RND family, MFP subunit  48.08 
 
 		 415 aa  335  9e-91  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0117238  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2216  multidrug efflux system subunit MdtA  48.08 
 
 		 415 aa  335  9e-91  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3585  efflux transporter, RND family, MFP subunit  47.38 
 
 		 435 aa  335  1e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1567  multidrug efflux system subunit MdtA  48.08 
 
 		 455 aa  335  1e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.331208 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2366  multidrug efflux system subunit MdtA  48.57 
 
 		 415 aa  334  3e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3014  multidrug efflux system subunit MdtA  48.29 
 
 		 415 aa  333  5e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.105913 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1159  multidrug efflux system subunit MdtA  48.29 
 
 		 415 aa  333  5e-90  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2186  RND family efflux transporter MFP subunit  46.77 
 
 		 435 aa  332  8e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01979  multidrug efflux system, subunit A  48.29 
 
 		 415 aa  332  9e-90  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01971  hypothetical protein  48.29 
 
 		 415 aa  332  9e-90  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0986  multidrug efflux system subunit MdtA  47.8 
 
 		 415 aa  332  1e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.607592 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2684  multidrug efflux system subunit MdtA  48.79 
 
 		 411 aa  329  5.0000000000000004e-89  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31870  putative RND efflux membrane fusion protein precursor  49.56 
 
 		 426 aa  327  3e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2708  RND efflux membrane fusion protein precursor  49.27 
 
 		 426 aa  325  1e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0286088  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2431  RND family efflux transporter MFP subunit  47.19 
 
 		 435 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0638771  normal  0.904192 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2312  multidrug efflux system subunit MdtA  48.31 
 
 		 413 aa  319  7e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2008  RND efflux system membrane fusion protein  46.02 
 
 		 446 aa  318  2e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0541376  normal  0.0158749 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2966  multidrug efflux system subunit MdtA  48.16 
 
 		 413 aa  317  3e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.874422  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2363  multidrug efflux system subunit MdtA  49.7 
 
 		 413 aa  316  5e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.67985 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2591  RND family efflux transporter MFP subunit  43.6 
 
 		 463 aa  316  5e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.422822  normal  0.340429 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2472  multidrug efflux system subunit MdtA  49.7 
 
 		 413 aa  316  6e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.957345 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2256  multidrug efflux system subunit MdtA  49.7 
 
 		 413 aa  316  7e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1312  multidrug efflux system subunit MdtA  48.61 
 
 		 410 aa  315  9.999999999999999e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.164615  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2356  multidrug efflux system subunit MdtA  49.7 
 
 		 413 aa  314  1.9999999999999998e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.413766  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2702  multidrug efflux system subunit MdtA  46.47 
 
 		 411 aa  312  1e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2826  secretion protein HlyD  47.76 
 
 		 464 aa  311  1e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.45041 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4748  efflux transporter, RND family, MFP subunit  46.06 
 
 		 409 aa  312  1e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.376199  normal  0.100184 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3309  RND family efflux transporter MFP subunit  48.06 
 
 		 430 aa  311  2e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.717365 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2829  secretion protein HlyD  48.28 
 
 		 433 aa  306  7e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1124  RND family efflux transporter MFP subunit  44.56 
 
 		 408 aa  305  9.000000000000001e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.360909 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2420  RND family efflux transporter MFP subunit  50 
 
 		 421 aa  305  1.0000000000000001e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.304256  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0732  efflux transporter, RND family, MFP subunit  44.75 
 
 		 440 aa  297  2e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2038  RND family efflux transporter MFP subunit  46.98 
 
 		 482 aa  296  8e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0373239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0742  secretion protein HlyD  47.43 
 
 		 400 aa  293  4e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.460648 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3608  efflux transporter, RND family, MFP subunit  44.39 
 
 		 445 aa  292  1e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.704164  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2569  secretion protein HlyD  41.19 
 
 		 462 aa  286  4e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.103631 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2256  RND family efflux transporter MFP subunit  48.19 
 
 		 538 aa  286  5e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0589481 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1231  efflux transporter, RND family, MFP subunit  44.34 
 
 		 426 aa  286  8e-76  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3610  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.16 
 
 		 388 aa  283  4.0000000000000003e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.479598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2902  secretion protein HlyD  40.69 
 
 		 464 aa  283  6.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.56576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2286  RND family efflux transporter MFP subunit  44.44 
 
 		 423 aa  281  1e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2842  efflux transporter, RND family, MFP subunit  42.34 
 
 		 455 aa  276  8e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.416467  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2922  RND family efflux transporter MFP subunit  45 
 
 		 459 aa  274  2.0000000000000002e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.363027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3395  efflux transporter, RND family, MFP subunit  43.75 
 
 		 389 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14330  Secretion protein HlyD family  44.84 
 
 		 401 aa  273  6e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.774042  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2065  secretion protein HlyD  41.9 
 
 		 454 aa  269  8e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.309375  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1523  secretion protein HlyD  40.78 
 
 		 457 aa  267  4e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.116484 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3932  multidrug resistance protein mdtA precursor  39.49 
 
 		 473 aa  261  2e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.416339 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3537  putative component of multidrug efflux pump, mdtA-like protein  37.93 
 
 		 389 aa  259  1e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1596  RND family efflux transporter MFP subunit  43.5 
 
 		 398 aa  257  4e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.566633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5556  HlyD family secretion protein  39.22 
 
 		 460 aa  256  7e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.357056  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2558  secretion protein HlyD  43.44 
 
 		 451 aa  256  7e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0355119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1169  RND family efflux transporter MFP subunit  43.34 
 
 		 389 aa  251  2e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.567946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1266  secretion protein HlyD  39.08 
 
 		 411 aa  248  2e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.279661  normal  0.224738 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1513  secretion protein HlyD  43.29 
 
 		 404 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.461504  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0971  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.3 
 
 		 416 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.39107  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2094  RND family efflux transporter MFP subunit  39.24 
 
 		 377 aa  242  1e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0888739  normal  0.0111779 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1510  secretion protein HlyD  35.22 
 
 		 395 aa  242  1e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3489  RND family efflux transporter MFP subunit  37.18 
 
 		 381 aa  240  4e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.234911 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>