More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3537 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_3537  putative component of multidrug efflux pump, mdtA-like protein  100 
 
 
389 aa  781    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1510  secretion protein HlyD  66.84 
 
 
395 aa  519  1e-146  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1266  secretion protein HlyD  66.58 
 
 
411 aa  503  1e-141  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.279661  normal  0.224738 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3971  efflux transporter, RND family, MFP subunit  65.03 
 
 
407 aa  454  1e-127  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0971  efflux transporter, RND family, MFP subunit  57.92 
 
 
416 aa  422  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.39107  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2094  RND family efflux transporter MFP subunit  58.97 
 
 
377 aa  412  1e-114  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0888739  normal  0.0111779 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2856  RND family efflux transporter MFP subunit  57.34 
 
 
417 aa  391  1e-107  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.197237 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1169  RND family efflux transporter MFP subunit  50 
 
 
389 aa  355  8.999999999999999e-97  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.567946  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1596  RND family efflux transporter MFP subunit  44.91 
 
 
398 aa  314  1.9999999999999998e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.566633  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1530  efflux transporter, RND family, MFP subunit  46.46 
 
 
391 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2842  efflux transporter, RND family, MFP subunit  46.17 
 
 
455 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.416467  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3395  efflux transporter, RND family, MFP subunit  45.01 
 
 
389 aa  303  5.000000000000001e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2569  secretion protein HlyD  45.55 
 
 
462 aa  295  7e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.103631 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2558  secretion protein HlyD  45.23 
 
 
451 aa  288  9e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0355119  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2065  secretion protein HlyD  45.53 
 
 
454 aa  287  2e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.309375  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1523  secretion protein HlyD  43.54 
 
 
457 aa  286  4e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.116484 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0732  efflux transporter, RND family, MFP subunit  47.16 
 
 
440 aa  286  4e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3932  multidrug resistance protein mdtA precursor  45.03 
 
 
473 aa  285  7e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.416339 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0736  RND family efflux transporter MFP subunit  41.82 
 
 
387 aa  283  4.0000000000000003e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2902  secretion protein HlyD  44.5 
 
 
464 aa  283  5.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.56576  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0601  secretion protein HlyD  47.23 
 
 
459 aa  280  3e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.251315  normal  0.72194 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2922  RND family efflux transporter MFP subunit  45.27 
 
 
459 aa  279  5e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.363027  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0346  RND family efflux transporter MFP subunit  47.98 
 
 
360 aa  278  8e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.499232  normal  0.99105 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0533  efflux transporter, RND family, MFP subunit  42.55 
 
 
381 aa  278  1e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4296  efflux transporter, RND family, MFP subunit  42.67 
 
 
462 aa  273  4.0000000000000004e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4184  efflux transporter, RND family, MFP subunit  42.67 
 
 
462 aa  273  4.0000000000000004e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.267577  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2202  RND family efflux transporter MFP subunit  42.16 
 
 
407 aa  273  5.000000000000001e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1332  multidrug efflux system subunit MdtA  40.2 
 
 
444 aa  270  5e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.713792  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2684  multidrug efflux system subunit MdtA  40.97 
 
 
411 aa  269  5e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1215  multidrug efflux system subunit MdtA  40.2 
 
 
444 aa  267  2e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2670  multidrug efflux RND membrane fusion protein MexE  43.25 
 
 
426 aa  267  2e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.768547  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2431  RND family efflux transporter MFP subunit  43.57 
 
 
435 aa  267  2e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0638771  normal  0.904192 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2530  RND family efflux transporter MFP subunit  43.25 
 
 
412 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3552  multidrug efflux system subunit MdtA  42.06 
 
 
413 aa  266  4e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2583  RND family efflux transporter MFP subunit  43.25 
 
 
411 aa  266  4e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0404665  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5556  HlyD family secretion protein  42.59 
 
 
460 aa  266  5.999999999999999e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.357056  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31870  putative RND efflux membrane fusion protein precursor  43.95 
 
 
426 aa  266  5.999999999999999e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2144  multidrug efflux RND membrane fusion protein MexE  42.94 
 
 
412 aa  265  7e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.254489  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3170  multidrug efflux RND membrane fusion protein MexE  42.94 
 
 
412 aa  265  7e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0585728  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1643  multidrug efflux RND membrane fusion protein MexE  42.94 
 
 
414 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0226554  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1418  multidrug efflux RND membrane fusion protein MexE  42.94 
 
 
425 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1159  multidrug efflux system subunit MdtA  39.84 
 
 
415 aa  265  1e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3014  multidrug efflux system subunit MdtA  39.84 
 
 
415 aa  265  1e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.105913 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1582  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.31 
 
 
415 aa  264  2e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0117238  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1567  multidrug efflux system subunit MdtA  39.31 
 
 
455 aa  264  2e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.331208 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2708  RND efflux membrane fusion protein precursor  43.66 
 
 
426 aa  264  2e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0286088  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2216  multidrug efflux system subunit MdtA  39.31 
 
 
415 aa  264  2e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01979  multidrug efflux system, subunit A  39.31 
 
 
415 aa  263  3e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3103  multidrug efflux system subunit MdtA  40.68 
 
 
427 aa  263  3e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01971  hypothetical protein  39.31 
 
 
415 aa  263  3e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03141  putative resistance transmembrane protein  45.67 
 
 
449 aa  263  4e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.704547  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2866  HlyD family secretion protein  40.25 
 
 
576 aa  263  4e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2366  multidrug efflux system subunit MdtA  39.47 
 
 
415 aa  263  4e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2447  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.73 
 
 
462 aa  262  6.999999999999999e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0986  multidrug efflux system subunit MdtA  39.12 
 
 
415 aa  262  8e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.607592 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1312  multidrug efflux system subunit MdtA  40.3 
 
 
410 aa  260  3e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.164615  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03982  membrane fusion protein  43.45 
 
 
414 aa  258  9e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2966  multidrug efflux system subunit MdtA  40 
 
 
413 aa  258  1e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.874422  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1369  membrane fusion protein MdtA  44.02 
 
 
445 aa  258  1e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1231  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.41 
 
 
426 aa  257  2e-67  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0572  secretion protein HlyD  45.17 
 
 
498 aa  257  2e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0544292  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1501  HlyD family secretion protein  44.61 
 
 
445 aa  257  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.310778  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1364  membrane fusion protein MdtA  43.73 
 
 
442 aa  257  3e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.284522  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1172  RND family efflux transporter MFP subunit  43.98 
 
 
454 aa  256  4e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.118061 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0719  secretion protein HlyD  43.98 
 
 
457 aa  256  4e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1198  RND family efflux transporter MFP subunit  43.98 
 
 
457 aa  256  4e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.495254  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2519  RND family efflux transporter MFP subunit  37.4 
 
 
462 aa  256  6e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0990554 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2802  RND family efflux transporter MFP subunit  43.4 
 
 
430 aa  256  7e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.662741  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2742  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.4 
 
 
462 aa  256  7e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.878273  normal  0.333603 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28820  secretion protein, HlyD family  43.94 
 
 
441 aa  255  9e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.20411  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1206  multidrug efflux system subunit MdtA  37.15 
 
 
419 aa  255  1.0000000000000001e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0570202  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2104  RND family efflux transporter MFP subunit  43.98 
 
 
450 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1951  multidrug efflux RND membrane fusion protein MexE  43.25 
 
 
438 aa  253  3e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3585  efflux transporter, RND family, MFP subunit  44.07 
 
 
435 aa  252  1e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0514  secretion protein HlyD  43.69 
 
 
523 aa  251  1e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00131685  normal  0.623408 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1080  RND family efflux transporter MFP subunit  43.67 
 
 
457 aa  250  2e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3689  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.67 
 
 
414 aa  250  2e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2482  secretion protein HlyD  40.46 
 
 
434 aa  250  3e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.179732  normal  0.227362 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2329  RND family efflux transporter MFP subunit  43.47 
 
 
436 aa  250  3e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.4455  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2186  RND family efflux transporter MFP subunit  43.16 
 
 
435 aa  250  4e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1080  RND family efflux transporter MFP subunit  43.67 
 
 
463 aa  249  6e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4306  HlyD family secretion protein  42.43 
 
 
456 aa  249  8e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0237047  normal  0.270235 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2521  secretion protein HlyD  40.9 
 
 
435 aa  248  1e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.770973  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3610  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.13 
 
 
388 aa  248  1e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.479598  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3604  secretion protein HlyD  38.92 
 
 
422 aa  248  2e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.105186  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1771  RND family efflux transporter MFP subunit  42.81 
 
 
469 aa  248  2e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.75905 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2753  HlyD family secretion protein  38.89 
 
 
444 aa  246  6.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4166  RND family efflux transporter MFP subunit  39.95 
 
 
427 aa  244  1.9999999999999999e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3005  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.99 
 
 
455 aa  244  1.9999999999999999e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.568711  normal  0.749765 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2907  RND efflux system membrane fusion protein  43.44 
 
 
433 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.484522  normal  0.506514 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2826  secretion protein HlyD  39.73 
 
 
464 aa  244  3e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.45041 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4319  RND family efflux transporter MFP subunit  37.6 
 
 
460 aa  244  3e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0569861 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2702  multidrug efflux system subunit MdtA  39.14 
 
 
411 aa  242  6e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1124  RND family efflux transporter MFP subunit  39.57 
 
 
408 aa  241  1e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.360909 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4151  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.87 
 
 
451 aa  241  1e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0426406  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1577  efflux transporter, RND family, MFP subunit  42.5 
 
 
434 aa  241  2e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.321925  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2472  multidrug efflux system subunit MdtA  41.21 
 
 
413 aa  239  9e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.957345 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2312  multidrug efflux system subunit MdtA  42.25 
 
 
413 aa  238  9e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2363  multidrug efflux system subunit MdtA  41.5 
 
 
413 aa  238  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.67985 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2256  multidrug efflux system subunit MdtA  41.21 
 
 
413 aa  238  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>