More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0123 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_0123  RND family efflux transporter MFP subunit  100 
 
 		 417 aa  854    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.713324 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0177  hypothetical protein  58.2 
 
 		 406 aa  451  1.0000000000000001e-126  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2717  efflux transporter, RND family, MFP subunit  56.95 
 
 		 393 aa  442  1e-123  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.374816  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2953  efflux transporter, RND family, MFP subunit  51.44 
 
 		 425 aa  395  1e-109  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.104314 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1276  secretion protein HlyD  49.47 
 
 		 553 aa  375  1e-103  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5686  RND family efflux transporter MFP subunit  40.11 
 
 		 401 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.214167 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3750  secretion protein HlyD  39.49 
 
 		 401 aa  281  2e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4618  RND family efflux transporter MFP subunit  39.49 
 
 		 401 aa  281  2e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.343268  normal  0.223248 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3414  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.55 
 
 		 1462 aa  272  8.000000000000001e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3361  RND efflux system membrane fusion protein  38.74 
 
 		 395 aa  264  2e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0631452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2097  RND family efflux transporter MFP subunit  39.33 
 
 		 391 aa  261  2e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.902105  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1967  RND family efflux transporter MFP subunit  39.04 
 
 		 391 aa  260  3e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0310111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4616  secretion protein HlyD  39.08 
 
 		 414 aa  260  4e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1955  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.2 
 
 		 400 aa  259  8e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.159137  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3608  secretion protein HlyD  37.11 
 
 		 400 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.221607  normal  0.363906 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2372  secretion protein HlyD  35.01 
 
 		 392 aa  250  4e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.753301 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1502  secretion protein HlyD  40.12 
 
 		 478 aa  248  2e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.184777  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6327  RND family efflux transporter MFP subunit  40.12 
 
 		 478 aa  248  2e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0452278  normal  0.980568 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6991  RND family efflux transporter MFP subunit  40.12 
 
 		 472 aa  247  3e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.231557 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1392  RND efflux system membrane fusion protein  37.1 
 
 		 419 aa  245  8e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0449025  normal  0.0986293 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2849  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.78 
 
 		 421 aa  243  3e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0325844 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5203  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.73 
 
 		 455 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.755082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1141  RND efflux system membrane fusion protein  38.02 
 
 		 394 aa  236  6e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.814411  normal  0.55527 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0078  hypothetical protein  34.18 
 
 		 381 aa  233  4.0000000000000004e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1436  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.65 
 
 		 393 aa  231  1e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4651  RND family efflux transporter MFP subunit  35.11 
 
 		 402 aa  231  2e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.611035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4363  RND efflux system membrane fusion protein  36.14 
 
 		 467 aa  229  7e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.234106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5985  RND family efflux transporter MFP subunit  38.32 
 
 		 455 aa  225  1e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5741  RND family efflux transporter MFP subunit  38.32 
 
 		 455 aa  224  2e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.814041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0359  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.09 
 
 		 401 aa  223  6e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7211  RND family efflux transporter MFP subunit  37.46 
 
 		 419 aa  222  8e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2552  secretion protein HlyD  35.16 
 
 		 451 aa  220  3e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.603084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6521  RND family efflux transporter MFP subunit  32.63 
 
 		 410 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.745567  normal  0.0817001 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2071  RND efflux system membrane fusion protein  31.12 
 
 		 407 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.226746  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3820  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.88 
 
 		 437 aa  212  9e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4897  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.88 
 
 		 437 aa  212  9e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.51776 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2584  CzcB subfamily membrane fusion protein  33.82 
 
 		 409 aa  209  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5875  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.65 
 
 		 407 aa  208  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0955286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1749  secretion protein HlyD  30.31 
 
 		 398 aa  205  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.145441 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0567  RND family efflux transporter MFP subunit  33.24 
 
 		 424 aa  205  2e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4313  RND family efflux transporter MFP subunit  38.94 
 
 		 409 aa  203  5e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.583259 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1817  secretion protein HlyD  32.49 
 
 		 405 aa  199  7e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00656691  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2877  RND family efflux transporter MFP subunit  33 
 
 		 435 aa  196  6e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.200442 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3710  RND family efflux transporter MFP subunit  37.46 
 
 		 410 aa  195  1e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02155  putative transport transmembrane protein  33.42 
 
 		 421 aa  194  2e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.58284 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4188  RND family efflux transporter MFP subunit  36.53 
 
 		 410 aa  192  6e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0941549  normal  0.890181 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3225  RND family efflux transporter MFP subunit  36.64 
 
 		 392 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.376119  normal  0.122741 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4074  secretion protein HlyD  36.64 
 
 		 392 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.119469  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4292  RND family efflux transporter MFP subunit  36.64 
 
 		 392 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1727  HlyD family secretion protein  36.34 
 
 		 409 aa  189  5e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0767982  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5198  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.03 
 
 		 366 aa  172  1e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.197197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4314  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.13 
 
 		 438 aa  172  1e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.544766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0225  RND family efflux transporter MFP subunit  31.2 
 
 		 461 aa  168  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.540049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4164  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.88 
 
 		 438 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.444201  normal  0.22934 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3855  RND family efflux transporter MFP subunit  31.64 
 
 		 438 aa  164  3e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.336679  normal  0.260987 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2445  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.81 
 
 		 424 aa  159  7e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0377313 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2692  RND family efflux transporter MFP subunit  30.48 
 
 		 424 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00769313  normal  0.142754 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1526  RND family efflux transporter MFP subunit  30.4 
 
 		 423 aa  143  6e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.692168  normal  0.0164989 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0257  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.74 
 
 		 376 aa  128  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0635655  hitchhiker  0.00588714 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1161  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.72 
 
 		 376 aa  127  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.444348  normal  0.334679 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2615  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.12 
 
 		 380 aa  121  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.909785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2582  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.46 
 
 		 379 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000000306136  normal  0.19553 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4286  RND family efflux transporter MFP subunit  27.72 
 
 		 361 aa  117  3e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.749975  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0460  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.41 
 
 		 380 aa  112  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2447  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.94 
 
 		 462 aa  108  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3552  multidrug efflux system subunit MdtA  27.35 
 
 		 413 aa  108  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1159  multidrug efflux system subunit MdtA  26.07 
 
 		 415 aa  107  3e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2742  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.69 
 
 		 462 aa  107  3e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.878273  normal  0.333603 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3014  multidrug efflux system subunit MdtA  26.07 
 
 		 415 aa  107  3e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.105913 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3700  secretion protein HlyD  25.58 
 
 		 381 aa  107  4e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3604  secretion protein HlyD  25.94 
 
 		 422 aa  107  4e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.105186  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2519  RND family efflux transporter MFP subunit  24.69 
 
 		 462 aa  107  4e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0990554 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01979  multidrug efflux system, subunit A  26.07 
 
 		 415 aa  107  6e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01971  hypothetical protein  26.07 
 
 		 415 aa  107  6e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2366  multidrug efflux system subunit MdtA  26.07 
 
 		 415 aa  106  7e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1582  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.07 
 
 		 415 aa  105  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0117238  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2216  multidrug efflux system subunit MdtA  26.07 
 
 		 415 aa  105  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2639  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.44 
 
 		 436 aa  105  1e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1567  multidrug efflux system subunit MdtA  26.07 
 
 		 455 aa  104  3e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.331208 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0091  RND family efflux transporter MFP subunit  25.28 
 
 		 394 aa  104  3e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.666427  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1186  RND family efflux transporter MFP subunit  26.72 
 
 		 374 aa  104  3e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.425099  normal  0.0297054 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1704  RND family efflux transporter MFP subunit  26.65 
 
 		 361 aa  103  4e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000249801  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0200  secretion protein HlyD  25.86 
 
 		 365 aa  103  6e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2684  multidrug efflux system subunit MdtA  25.77 
 
 		 411 aa  103  6e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0986  multidrug efflux system subunit MdtA  25.77 
 
 		 415 aa  103  7e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.607592 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31870  putative RND efflux membrane fusion protein precursor  25.85 
 
 		 426 aa  103  7e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4415  RND family efflux transporter MFP subunit  25.39 
 
 		 458 aa  103  8e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.553493  normal  0.934455 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1206  multidrug efflux system subunit MdtA  25.94 
 
 		 419 aa  102  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0570202  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3735  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.46 
 
 		 362 aa  102  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1439  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.96 
 
 		 380 aa  101  2e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0465471  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0703  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.21 
 
 		 355 aa  101  3e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4151  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.76 
 
 		 451 aa  100  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0426406  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2708  RND efflux membrane fusion protein precursor  25.23 
 
 		 426 aa  100  4e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0286088  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0505  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.24 
 
 		 349 aa  100  4e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4319  RND family efflux transporter MFP subunit  26.07 
 
 		 460 aa  100  5e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0569861 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0527  RND family efflux transporter MFP subunit  28.82 
 
 		 376 aa  100  7e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2954  RND family efflux transporter MFP subunit  26.2 
 
 		 364 aa  99.4  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000249187  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4150  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.83 
 
 		 397 aa  99  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00923789  hitchhiker  0.000000297953 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3140  secretion protein HlyD  29.04 
 
 		 360 aa  98.2  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.203317  normal  0.359518 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1215  multidrug efflux system subunit MdtA  24.85 
 
 		 444 aa  98.2  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>