More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2849 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2849  efflux transporter, RND family, MFP subunit  100 
 
 		 421 aa  847    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0325844 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3414  efflux transporter, RND family, MFP subunit  56.04 
 
 		 1462 aa  418  1e-116  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3750  secretion protein HlyD  41.73 
 
 		 401 aa  294  2e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4618  RND family efflux transporter MFP subunit  41.73 
 
 		 401 aa  294  2e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.343268  normal  0.223248 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3608  secretion protein HlyD  42.47 
 
 		 400 aa  293  6e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.221607  normal  0.363906 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5686  RND family efflux transporter MFP subunit  41.31 
 
 		 401 aa  291  2e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.214167 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1955  efflux transporter, RND family, MFP subunit  43.37 
 
 		 400 aa  286  5.999999999999999e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.159137  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1967  RND family efflux transporter MFP subunit  43.32 
 
 		 391 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0310111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4616  secretion protein HlyD  41.26 
 
 		 414 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2097  RND family efflux transporter MFP subunit  43.32 
 
 		 391 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.902105  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2445  efflux transporter, RND family, MFP subunit  47.4 
 
 		 424 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0377313 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3361  RND efflux system membrane fusion protein  40.5 
 
 		 395 aa  259  6e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0631452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2372  secretion protein HlyD  39.9 
 
 		 392 aa  257  2e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.753301 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4314  efflux transporter, RND family, MFP subunit  43.23 
 
 		 438 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.544766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0123  RND family efflux transporter MFP subunit  35.87 
 
 		 417 aa  251  2e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.713324 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0225  RND family efflux transporter MFP subunit  42.44 
 
 		 461 aa  250  3e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.540049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4164  efflux transporter, RND family, MFP subunit  42.19 
 
 		 438 aa  248  1e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.444201  normal  0.22934 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3855  RND family efflux transporter MFP subunit  41.93 
 
 		 438 aa  247  2e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.336679  normal  0.260987 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1436  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.03 
 
 		 393 aa  244  1.9999999999999999e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2877  RND family efflux transporter MFP subunit  39.75 
 
 		 435 aa  244  3e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.200442 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4651  RND family efflux transporter MFP subunit  40.05 
 
 		 402 aa  243  3.9999999999999997e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.611035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1392  RND efflux system membrane fusion protein  38.29 
 
 		 419 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0449025  normal  0.0986293 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1141  RND efflux system membrane fusion protein  40.22 
 
 		 394 aa  239  5e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.814411  normal  0.55527 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5203  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.66 
 
 		 455 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.755082  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0078  hypothetical protein  38.48 
 
 		 381 aa  233  7.000000000000001e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7211  RND family efflux transporter MFP subunit  37.84 
 
 		 419 aa  231  2e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2717  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.74 
 
 		 393 aa  229  5e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.374816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2692  RND family efflux transporter MFP subunit  40.77 
 
 		 424 aa  229  8e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00769313  normal  0.142754 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0177  hypothetical protein  35 
 
 		 406 aa  229  1e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1502  secretion protein HlyD  38.08 
 
 		 478 aa  228  2e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.184777  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6327  RND family efflux transporter MFP subunit  38.08 
 
 		 478 aa  228  2e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0452278  normal  0.980568 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6991  RND family efflux transporter MFP subunit  38.08 
 
 		 472 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.231557 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5985  RND family efflux transporter MFP subunit  38.36 
 
 		 455 aa  225  9e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2584  CzcB subfamily membrane fusion protein  35.79 
 
 		 409 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5741  RND family efflux transporter MFP subunit  37.81 
 
 		 455 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.814041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2953  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.97 
 
 		 425 aa  218  2e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.104314 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2071  RND efflux system membrane fusion protein  36.32 
 
 		 407 aa  217  4e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.226746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5875  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.32 
 
 		 407 aa  216  8e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0955286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4363  RND efflux system membrane fusion protein  36.99 
 
 		 467 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.234106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6521  RND family efflux transporter MFP subunit  35.23 
 
 		 410 aa  211  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.745567  normal  0.0817001 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1749  secretion protein HlyD  35.44 
 
 		 398 aa  211  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.145441 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0359  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.47 
 
 		 401 aa  210  3e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4188  RND family efflux transporter MFP subunit  37.17 
 
 		 410 aa  210  4e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0941549  normal  0.890181 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3225  RND family efflux transporter MFP subunit  36.48 
 
 		 392 aa  210  4e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.376119  normal  0.122741 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4292  RND family efflux transporter MFP subunit  36.48 
 
 		 392 aa  210  4e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4074  secretion protein HlyD  36.48 
 
 		 392 aa  209  6e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.119469  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2552  secretion protein HlyD  34.41 
 
 		 451 aa  208  1e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.603084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1817  secretion protein HlyD  35.75 
 
 		 405 aa  207  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00656691  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1727  HlyD family secretion protein  35.29 
 
 		 409 aa  207  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0767982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1526  RND family efflux transporter MFP subunit  38.18 
 
 		 423 aa  206  5e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.692168  normal  0.0164989 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4313  RND family efflux transporter MFP subunit  36.13 
 
 		 409 aa  206  5e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.583259 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3710  RND family efflux transporter MFP subunit  36.13 
 
 		 410 aa  205  1e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1276  secretion protein HlyD  33.05 
 
 		 553 aa  204  2e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4897  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.32 
 
 		 437 aa  196  7e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.51776 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3820  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.32 
 
 		 437 aa  196  7e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02155  putative transport transmembrane protein  36.11 
 
 		 421 aa  183  5.0000000000000004e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.58284 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5198  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.69 
 
 		 366 aa  181  2.9999999999999997e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.197197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0567  RND family efflux transporter MFP subunit  36.03 
 
 		 424 aa  179  8e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2615  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.35 
 
 		 380 aa  132  9e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.909785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4286  RND family efflux transporter MFP subunit  27.27 
 
 		 361 aa  129  1.0000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.749975  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0257  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.94 
 
 		 376 aa  124  4e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0635655  hitchhiker  0.00588714 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0460  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.14 
 
 		 380 aa  123  5e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3160  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.34 
 
 		 1460 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2582  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.08 
 
 		 379 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000000306136  normal  0.19553 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1161  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.08 
 
 		 376 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.444348  normal  0.334679 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2008  RND efflux system membrane fusion protein  28.26 
 
 		 446 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0541376  normal  0.0158749 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1721  RND family efflux transporter MFP subunit  26.61 
 
 		 431 aa  108  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4748  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.85 
 
 		 409 aa  104  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.376199  normal  0.100184 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14330  Secretion protein HlyD family  29.43 
 
 		 401 aa  105  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.774042  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0975  RND family efflux transporter MFP subunit  27.03 
 
 		 382 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0109715 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0753  secretion protein HlyD  28.61 
 
 		 370 aa  103  8e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1007  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.52 
 
 		 398 aa  102  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4014  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.66 
 
 		 362 aa  101  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0181773  normal  0.127593 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2588  RND family efflux transporter MFP subunit  25.55 
 
 		 360 aa  100  6e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000707575  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1704  RND family efflux transporter MFP subunit  24.85 
 
 		 361 aa  99  1e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000249801  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0105  RND family efflux transporter MFP subunit  29.43 
 
 		 348 aa  98.6  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2550  RND family efflux transporter MFP subunit  25.27 
 
 		 360 aa  98.2  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000229958  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1796  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.27 
 
 		 360 aa  98.2  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000436323  hitchhiker  0.00000011193 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1700  secretion protein HlyD  22.99 
 
 		 417 aa  98.6  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.696744  normal  0.370784 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1124  RND family efflux transporter MFP subunit  27.06 
 
 		 408 aa  98.2  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.360909 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0770  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.15 
 
 		 399 aa  97.4  4e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0433625  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2338  RND family efflux transporter MFP subunit  25.3 
 
 		 360 aa  97.4  4e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00136978  hitchhiker  0.0000141161 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2410  RND family efflux transporter MFP subunit  25.3 
 
 		 360 aa  97.4  4e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000315716  hitchhiker  0.00636413 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2665  RND family efflux transporter MFP subunit  25.27 
 
 		 360 aa  97.4  4e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000267288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2046  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.31 
 
 		 442 aa  97.1  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1523  secretion protein HlyD  27.11 
 
 		 457 aa  97.1  5e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.116484 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3014  multidrug efflux system subunit MdtA  24.36 
 
 		 415 aa  96.3  8e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.105913 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1159  multidrug efflux system subunit MdtA  24.36 
 
 		 415 aa  96.3  8e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1658  RND family efflux transporter MFP subunit  24.78 
 
 		 360 aa  96.3  9e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000232607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0450  RND family efflux transporter MFP subunit  27.03 
 
 		 407 aa  96.3  9e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.825026 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01979  multidrug efflux system, subunit A  24.36 
 
 		 415 aa  95.9  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1582  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.36 
 
 		 415 aa  95.9  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0117238  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01971  hypothetical protein  24.36 
 
 		 415 aa  95.9  1e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0454  secretion protein HlyD  24.62 
 
 		 373 aa  96.3  1e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.63564  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1567  multidrug efflux system subunit MdtA  24.36 
 
 		 455 aa  95.9  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.331208 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2216  multidrug efflux system subunit MdtA  24.36 
 
 		 415 aa  95.9  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2366  multidrug efflux system subunit MdtA  24.08 
 
 		 415 aa  95.1  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1881  HlyD family-like protein  25.94 
 
 		 360 aa  94.7  3e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0986  multidrug efflux system subunit MdtA  24.36 
 
 		 415 aa  94.7  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.607592 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3700  secretion protein HlyD  26.51 
 
 		 381 aa  93.6  5e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>