More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1817 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A1817  secretion protein HlyD  100 
 
 		 405 aa  806    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00656691  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1749  secretion protein HlyD  70.95 
 
 		 398 aa  516  1.0000000000000001e-145  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.145441 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5203  efflux transporter, RND family, MFP subunit  50.54 
 
 		 455 aa  363  2e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.755082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1392  RND efflux system membrane fusion protein  49.87 
 
 		 419 aa  361  1e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0449025  normal  0.0986293 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4363  RND efflux system membrane fusion protein  50.71 
 
 		 467 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.234106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6991  RND family efflux transporter MFP subunit  51.58 
 
 		 472 aa  355  5.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.231557 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1502  secretion protein HlyD  51.32 
 
 		 478 aa  354  1e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.184777  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6327  RND family efflux transporter MFP subunit  51.32 
 
 		 478 aa  354  1e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0452278  normal  0.980568 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0359  efflux transporter, RND family, MFP subunit  50.38 
 
 		 401 aa  346  5e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7211  RND family efflux transporter MFP subunit  49.86 
 
 		 419 aa  345  1e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5741  RND family efflux transporter MFP subunit  50.5 
 
 		 455 aa  339  5e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.814041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5985  RND family efflux transporter MFP subunit  50 
 
 		 455 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0078  hypothetical protein  42.45 
 
 		 381 aa  300  2e-80  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3750  secretion protein HlyD  44.32 
 
 		 401 aa  296  5e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4618  RND family efflux transporter MFP subunit  44.32 
 
 		 401 aa  296  5e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.343268  normal  0.223248 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5686  RND family efflux transporter MFP subunit  44.05 
 
 		 401 aa  293  5e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.214167 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3608  secretion protein HlyD  41.45 
 
 		 400 aa  278  1e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.221607  normal  0.363906 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4651  RND family efflux transporter MFP subunit  42.01 
 
 		 402 aa  278  1e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.611035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2097  RND family efflux transporter MFP subunit  44.51 
 
 		 391 aa  276  5e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.902105  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1955  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.11 
 
 		 400 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.159137  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1967  RND family efflux transporter MFP subunit  43.64 
 
 		 391 aa  273  3e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0310111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4616  secretion protein HlyD  39.84 
 
 		 414 aa  265  8.999999999999999e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2071  RND efflux system membrane fusion protein  38.56 
 
 		 407 aa  263  3e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.226746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4897  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.24 
 
 		 437 aa  262  8.999999999999999e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.51776 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3820  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.24 
 
 		 437 aa  262  8.999999999999999e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5875  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.28 
 
 		 407 aa  259  7e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0955286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1436  efflux transporter, RND family, MFP subunit  44.73 
 
 		 393 aa  255  1.0000000000000001e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6521  RND family efflux transporter MFP subunit  38.44 
 
 		 410 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.745567  normal  0.0817001 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3414  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.46 
 
 		 1462 aa  251  2e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1141  RND efflux system membrane fusion protein  43.66 
 
 		 394 aa  250  3e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.814411  normal  0.55527 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0567  RND family efflux transporter MFP subunit  41.86 
 
 		 424 aa  250  4e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2372  secretion protein HlyD  37.47 
 
 		 392 aa  249  8e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.753301 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2584  CzcB subfamily membrane fusion protein  40.18 
 
 		 409 aa  248  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3361  RND efflux system membrane fusion protein  40.23 
 
 		 395 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0631452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2953  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.6 
 
 		 425 aa  243  5e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.104314 
 
 
-
 
NC_003296  RS02155  putative transport transmembrane protein  40.05 
 
 		 421 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.58284 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4313  RND family efflux transporter MFP subunit  40.92 
 
 		 409 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.583259 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4188  RND family efflux transporter MFP subunit  39.95 
 
 		 410 aa  232  9e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0941549  normal  0.890181 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3710  RND family efflux transporter MFP subunit  40 
 
 		 410 aa  230  3e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3225  RND family efflux transporter MFP subunit  39.41 
 
 		 392 aa  226  6e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.376119  normal  0.122741 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4292  RND family efflux transporter MFP subunit  39.41 
 
 		 392 aa  226  8e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4074  secretion protein HlyD  39.41 
 
 		 392 aa  225  9e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.119469  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1727  HlyD family secretion protein  38.67 
 
 		 409 aa  224  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0767982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0123  RND family efflux transporter MFP subunit  32.63 
 
 		 417 aa  218  2e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.713324 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2849  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.25 
 
 		 421 aa  216  5e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0325844 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1276  secretion protein HlyD  33.24 
 
 		 553 aa  212  7.999999999999999e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2717  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.42 
 
 		 393 aa  205  2e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.374816  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0177  hypothetical protein  31.98 
 
 		 406 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5198  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.36 
 
 		 366 aa  201  1.9999999999999998e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.197197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2552  secretion protein HlyD  32.81 
 
 		 451 aa  200  3.9999999999999996e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.603084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2877  RND family efflux transporter MFP subunit  32.28 
 
 		 435 aa  176  7e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.200442 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0225  RND family efflux transporter MFP subunit  34.17 
 
 		 461 aa  170  3e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.540049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2445  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.62 
 
 		 424 aa  169  9e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0377313 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4314  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.92 
 
 		 438 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.544766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4164  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.67 
 
 		 438 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.444201  normal  0.22934 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3855  RND family efflux transporter MFP subunit  32.43 
 
 		 438 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.336679  normal  0.260987 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2582  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.49 
 
 		 379 aa  153  4e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000000306136  normal  0.19553 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0257  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.56 
 
 		 376 aa  151  3e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0635655  hitchhiker  0.00588714 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4286  RND family efflux transporter MFP subunit  29.1 
 
 		 361 aa  148  1.0000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.749975  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1161  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.08 
 
 		 376 aa  146  7.0000000000000006e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.444348  normal  0.334679 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2692  RND family efflux transporter MFP subunit  31.59 
 
 		 424 aa  145  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00769313  normal  0.142754 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4014  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.81 
 
 		 362 aa  144  4e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0181773  normal  0.127593 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0460  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.9 
 
 		 380 aa  131  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1700  secretion protein HlyD  30.41 
 
 		 417 aa  127  4.0000000000000003e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.696744  normal  0.370784 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1526  RND family efflux transporter MFP subunit  31.52 
 
 		 423 aa  125  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.692168  normal  0.0164989 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3160  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.87 
 
 		 1460 aa  122  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0948  secretion protein HlyD  28.96 
 
 		 413 aa  116  8.999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.297274  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2615  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.6 
 
 		 380 aa  114  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.909785  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1721  RND family efflux transporter MFP subunit  28.61 
 
 		 431 aa  113  5e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03141  putative resistance transmembrane protein  28.8 
 
 		 449 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.704547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00182  acriflavine resistance protein a precursor  29.88 
 
 		 381 aa  109  8.000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2000  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.92 
 
 		 360 aa  108  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.461729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2367  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.92 
 
 		 360 aa  108  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0225  secretion protein HlyD  29.84 
 
 		 380 aa  106  6e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.34961  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0505  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.3 
 
 		 349 aa  106  6e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3492  RND family efflux transporter MFP subunit  29.44 
 
 		 405 aa  106  8e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.474299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3714  RND family efflux transporter MFP subunit  31.23 
 
 		 408 aa  104  3e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.132208 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0247  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.52 
 
 		 380 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3351  RND family efflux transporter MFP subunit  29.85 
 
 		 367 aa  102  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3965  RND family efflux transporter MFP subunit  31.91 
 
 		 362 aa  102  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000185194 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1361  HlyD family secretion protein  28.97 
 
 		 387 aa  100  3e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.70378  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1776  CmeA  25.07 
 
 		 379 aa  101  3e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000125677  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4642  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.97 
 
 		 383 aa  100  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.195012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4184  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.9 
 
 		 462 aa  100  4e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.267577  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4296  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.9 
 
 		 462 aa  100  4e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31870  putative RND efflux membrane fusion protein precursor  28.25 
 
 		 426 aa  100  5e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0454  secretion protein HlyD  26.96 
 
 		 373 aa  99.8  9e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.63564  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1849  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.22 
 
 		 422 aa  99  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00425578 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1640  CmeA  27.76 
 
 		 386 aa  99.4  1e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1145  hypothetical protein  28.11 
 
 		 371 aa  98.6  2e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2887  RND family efflux transporter MFP subunit  31.25 
 
 		 430 aa  97.8  3e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.303028  normal  0.0961096 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2708  RND efflux membrane fusion protein precursor  27.94 
 
 		 426 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0286088  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3005  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.52 
 
 		 455 aa  97.1  5e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.568711  normal  0.749765 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14330  Secretion protein HlyD family  29.56 
 
 		 401 aa  97.1  6e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.774042  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1752  RND family efflux transporter MFP subunit  29.02 
 
 		 369 aa  96.7  7e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3610  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.03 
 
 		 388 aa  96.3  8e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.479598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1079  secretion protein HlyD  29.05 
 
 		 366 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.984606 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1731  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.82 
 
 		 402 aa  95.9  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01755  hypothetical protein  28.45 
 
 		 378 aa  95.9  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3340  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.21 
 
 		 379 aa  95.9  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>