More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00182 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_00182  acriflavine resistance protein a precursor  100 
 
 		 381 aa  770    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3601  secretion protein HlyD  43.68 
 
 		 386 aa  318  7.999999999999999e-86  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.804898  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2050  secretion protein HlyD  46.58 
 
 		 426 aa  309  5e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1011  efflux transporter, RND family, MFP subunit  45.19 
 
 		 395 aa  308  9e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.279031  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0809  secretion protein HlyD  45.04 
 
 		 392 aa  303  3.0000000000000004e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.165865 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4212  efflux transporter, RND family, MFP subunit  43.73 
 
 		 381 aa  301  1e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4251  RND family efflux transporter MFP subunit  43.73 
 
 		 381 aa  301  1e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.397426  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4385  RND family efflux transporter MFP subunit  43.73 
 
 		 381 aa  300  3e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.912914  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3680  secretion protein HlyD family protein  46.18 
 
 		 405 aa  296  4e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3863  RND family efflux transporter MFP subunit  44.53 
 
 		 382 aa  293  4e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003895  membrane fusion protein of RND family multidrug efflux pump  42.18 
 
 		 379 aa  292  5e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00341624  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4693  multidrug resistance protein AcrA/AcrE family  43.5 
 
 		 382 aa  291  1e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0123  efflux transporter, RND family, MFP subunit  42.74 
 
 		 384 aa  290  3e-77  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1127  RND family efflux transporter MFP subunit  43.32 
 
 		 395 aa  288  1e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.295973  unclonable  0.0000000230672 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0777  RND family efflux transporter MFP subunit  42.78 
 
 		 384 aa  288  1e-76  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4061  RND family efflux transporter MFP subunit  42.78 
 
 		 383 aa  287  2e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000265031  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0152  RND family efflux transporter MFP subunit  42.4 
 
 		 385 aa  286  4e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3837  RND family efflux transporter MFP subunit  42.44 
 
 		 382 aa  286  4e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0530  RND family efflux transporter MFP subunit  45.07 
 
 		 394 aa  285  7e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.727313  normal  0.0367065 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3699  RND family efflux transporter MFP subunit  42.94 
 
 		 390 aa  285  7e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3930  RND family efflux transporter MFP subunit  42.44 
 
 		 382 aa  285  7e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4046  RND family efflux transporter MFP subunit  42.59 
 
 		 382 aa  285  7e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0090  RND family efflux transporter MFP subunit  42.18 
 
 		 381 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3923  multidrug efflux system protein  44.84 
 
 		 387 aa  283  5.000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4007  secretion protein HlyD  44.56 
 
 		 386 aa  282  6.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.430649  normal  0.0665893 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4303  efflux transporter, RND family, MFP subunit  44.56 
 
 		 386 aa  282  7.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3493  RND family efflux transporter MFP subunit  43.67 
 
 		 381 aa  281  1e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1849  efflux transporter, RND family, MFP subunit  42.23 
 
 		 422 aa  281  1e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00425578 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1418  secretion protein HlyD  44.38 
 
 		 400 aa  280  2e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3715  RND family efflux transporter MFP subunit  44.32 
 
 		 382 aa  280  3e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.970475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0395  acriflavine resistance protein A  42.26 
 
 		 409 aa  279  7e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2369  efflux transporter, RND family, MFP subunit  43.05 
 
 		 433 aa  278  8e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.137399  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1870  secretion protein HlyD  42.16 
 
 		 428 aa  278  8e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3553  multidrug resistance protein AcrA/AcrE family  42.86 
 
 		 378 aa  278  9e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0553  acriflavine resistance protein A  41.99 
 
 		 409 aa  278  1e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0506  acriflavine resistance protein A  41.99 
 
 		 409 aa  278  1e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.951175  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00414  multidrug efflux system  41.99 
 
 		 397 aa  278  2e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3147  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.99 
 
 		 397 aa  278  2e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.035839  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00419  hypothetical protein  41.99 
 
 		 397 aa  278  2e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3241  efflux transporter, RND family, MFP subunit  43.16 
 
 		 398 aa  278  2e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3153  RND family efflux transporter MFP subunit  41.99 
 
 		 397 aa  278  2e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0539  acriflavine resistance protein A  41.99 
 
 		 397 aa  278  2e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0497  acriflavine resistance protein A  41.99 
 
 		 397 aa  278  2e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5599  secretion protein HlyD  41.64 
 
 		 418 aa  276  3e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5963  RND family efflux transporter MFP subunit  41.64 
 
 		 418 aa  276  3e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0363452 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3399  RND family efflux transporter MFP subunit  40.11 
 
 		 406 aa  276  5e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.852955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2880  multidrug efflux protein  40.64 
 
 		 388 aa  276  6e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.876487 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3207  RND family efflux transporter MFP subunit  40.64 
 
 		 395 aa  275  7e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.474787  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3067  acriflavine resistance protein A  40.64 
 
 		 395 aa  275  7e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.018659  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0441  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.46 
 
 		 385 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3750  acriflavine resistance protein E  40.46 
 
 		 385 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00329123  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0581  RND family efflux transporter MFP subunit  41.32 
 
 		 417 aa  275  1.0000000000000001e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.669798  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3458  acriflavine resistance protein E  40.46 
 
 		 385 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000310651  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0441  RND family efflux transporter MFP subunit  40.46 
 
 		 385 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.693626 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3560  acriflavine resistance protein E  40.46 
 
 		 385 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0550362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1193  HlyD family secretion protein  42.94 
 
 		 386 aa  273  3e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000622308  normal  0.342064 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6463  RND family efflux transporter MFP subunit  41.11 
 
 		 418 aa  273  3e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.984064  normal  0.35165 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4582  acriflavine resistance protein E  40.46 
 
 		 385 aa  273  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.153462  normal  0.314671 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3648  acriflavine resistance protein E  40.21 
 
 		 385 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.444601  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3704  RND family efflux transporter MFP subunit  40.6 
 
 		 379 aa  273  5.000000000000001e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.596756 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3047  efflux transporter, RND family, MFP subunit  43.05 
 
 		 396 aa  273  5.000000000000001e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.376069  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03123  cytoplasmic membrane lipoprotein  40.21 
 
 		 385 aa  272  7e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03074  hypothetical protein  40.21 
 
 		 385 aa  272  7e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2697  multidrug resistance protein  43.32 
 
 		 400 aa  271  1e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01755  hypothetical protein  42.9 
 
 		 378 aa  271  1e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05530  RND multidrug efflux membrane fusion protein MexA precursor  42.12 
 
 		 383 aa  271  1e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0525  RND multidrug efflux membrane fusion protein MexA precursor  41.85 
 
 		 442 aa  271  2e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.106985  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5940  HlyD family secretion protein  45.13 
 
 		 425 aa  271  2e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.591185  normal  0.295801 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3689  acriflavine resistance protein E  41.71 
 
 		 385 aa  270  4e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.10776 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3582  acriflavine resistance protein E  41.71 
 
 		 385 aa  270  4e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.372723  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0031  RND family efflux transporter MFP subunit  42.55 
 
 		 386 aa  270  4e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000318769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3655  acriflavine resistance protein E  41.71 
 
 		 385 aa  270  4e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.369196 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3492  RND family efflux transporter MFP subunit  41.67 
 
 		 405 aa  269  5e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.474299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0569  RND family efflux transporter MFP subunit  43.56 
 
 		 381 aa  269  5.9999999999999995e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3468  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.3 
 
 		 393 aa  268  1e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.143252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3800  RND family efflux transporter MFP subunit  40.1 
 
 		 404 aa  268  1e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.582867  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2529  RND family efflux transporter MFP subunit  46.02 
 
 		 432 aa  268  2e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.210606 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0943  RND family efflux transporter MFP subunit  42.98 
 
 		 397 aa  267  2e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4090  secretion protein HlyD  43.8 
 
 		 386 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1836  multidrug efflux transport protein EefA  42.93 
 
 		 373 aa  266  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000609578 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0331  RND family efflux transporter MFP subunit  42.13 
 
 		 394 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.109026  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1455  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.49 
 
 		 403 aa  266  4e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0497  RND family efflux transporter MFP subunit  44.38 
 
 		 423 aa  266  4e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.479969  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3367  RND family efflux transporter MFP subunit  42.27 
 
 		 480 aa  266  5e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.324035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2656  RND family efflux transporter MFP subunit  45.72 
 
 		 432 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.444245  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0680  RND family efflux transporter MFP subunit  44.96 
 
 		 420 aa  266  7e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.557778  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0287  acridine efflux pump  41.34 
 
 		 394 aa  265  8e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6607  HlyD family secretion protein  45.72 
 
 		 418 aa  265  8e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.032922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3583  acriflavine resistance protein E  42.66 
 
 		 385 aa  265  8e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2035  secretion protein HlyD  42.63 
 
 		 430 aa  265  1e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.789986  hitchhiker  0.00327746 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0579  acriflavine resistance protein A  45.16 
 
 		 397 aa  264  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0884843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0536  acriflavine resistance protein A  45.16 
 
 		 397 aa  264  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0520  acriflavine resistance protein A  45.16 
 
 		 397 aa  264  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0763854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0131  RND family efflux transporter MFP subunit  40.16 
 
 		 383 aa  264  2e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000302028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0517  acriflavine resistance protein A  45.16 
 
 		 397 aa  264  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0526  acriflavine resistance protein A  45.16 
 
 		 397 aa  264  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6204  RND family efflux transporter MFP subunit  45.43 
 
 		 412 aa  263  3e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.103192  hitchhiker  0.00610274 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2638  RND family efflux transporter MFP subunit  45.43 
 
 		 424 aa  263  4e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1886  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.72 
 
 		 379 aa  263  4e-69  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0158662  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1999  secretion protein HlyD  45.43 
 
 		 424 aa  263  4e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.931394  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>