More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2069 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2069  HlyD family secretion protein  100 
 
 		 404 aa  766    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.473909 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4266  RND family efflux transporter MFP subunit  59.48 
 
 		 407 aa  394  1e-108  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2304  RND family efflux transporter MFP subunit  53.58 
 
 		 396 aa  350  3e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1940  secretion protein HlyD  48.28 
 
 		 395 aa  324  1e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.345824  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3438  putative secretion protein HlyD precursor  43.46 
 
 		 399 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0583205  normal  0.262777 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5375  HlyD family secretion protein  44.76 
 
 		 399 aa  269  5e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.288749  normal  0.0889869 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0218  hypothetical protein  37.53 
 
 		 392 aa  236  5.0000000000000005e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1419  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.34 
 
 		 387 aa  225  1e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.267588  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1581  secretion protein HlyD  43.11 
 
 		 396 aa  223  4e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0301644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1281  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.93 
 
 		 387 aa  222  9e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000959286  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1054  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.91 
 
 		 400 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.153115  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1210  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.15 
 
 		 389 aa  214  2.9999999999999995e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00968103 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2062  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.31 
 
 		 419 aa  212  7e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0208015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1916  RND family efflux transporter MFP subunit  39.9 
 
 		 401 aa  212  1e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1477  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.75 
 
 		 396 aa  211  2e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.153552  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2204  RND family efflux transporter MFP subunit  41.15 
 
 		 411 aa  210  3e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0311908 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1507  RND family efflux transporter MFP subunit  37.31 
 
 		 393 aa  209  7e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.679392  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1477  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.04 
 
 		 390 aa  209  9e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0326  efflux transporter, RND family, MFP subunit  46.81 
 
 		 438 aa  208  1e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.856716 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1702  secretion protein HlyD  39.3 
 
 		 398 aa  204  2e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.16483  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2283  RND family efflux transporter MFP subunit  37.4 
 
 		 398 aa  204  3e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.181226  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0078  putative secretion protein HlyD  38.35 
 
 		 409 aa  204  3e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.36335 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1573  RND family efflux transporter MFP subunit  39.42 
 
 		 399 aa  199  5e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1123  secretion protein HlyD  38.01 
 
 		 401 aa  197  3e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.18847  normal  0.38508 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2959  RND family efflux transporter MFP subunit  43.58 
 
 		 393 aa  194  2e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5171  secretion protein HlyD  36.32 
 
 		 395 aa  191  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.345793  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0064  RND family efflux transporter MFP subunit  39.33 
 
 		 522 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1011  RND family efflux transporter MFP subunit  34.49 
 
 		 402 aa  190  4e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4367  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.43 
 
 		 391 aa  189  8e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.122634  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4499  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.43 
 
 		 391 aa  189  8e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.345717  normal  0.0635316 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6250  RND family efflux transporter MFP subunit  37.77 
 
 		 388 aa  188  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2843  efflux transporter, RND family, MFP subunit  42.93 
 
 		 393 aa  182  7e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3585  RND family efflux transporter MFP subunit  38.56 
 
 		 389 aa  174  1.9999999999999998e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0300  RND family efflux transporter MFP subunit  37.76 
 
 		 407 aa  170  4e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4211  RND family efflux transporter MFP subunit  37.83 
 
 		 398 aa  163  6e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.342556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2749  efflux transporter, RND family, MFP subunit  51.26 
 
 		 393 aa  157  4e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.130988  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2658  secretion protein HlyD  48.77 
 
 		 393 aa  153  5e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.253454  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2455  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.93 
 
 		 391 aa  121  3e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.035635  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2872  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.19 
 
 		 387 aa  106  8e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1713  multidrug resistance efflux pump-like protein  28.65 
 
 		 392 aa  93.2  8e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.254154  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1147  RND family efflux transporter MFP subunit  31.88 
 
 		 395 aa  89  1e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2586  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.89 
 
 		 388 aa  84.3  0.000000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000121955  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3461  secretion protein HlyD  26.72 
 
 		 384 aa  81.3  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2082  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.83 
 
 		 416 aa  80.5  0.00000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2831  syringolide efflux protein SyfC  28.28 
 
 		 383 aa  80.1  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.580145  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1571  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.21 
 
 		 435 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.334008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2825  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.05 
 
 		 476 aa  77.8  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.292175  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2928  RND family efflux transporter MFP subunit  26.02 
 
 		 431 aa  75.5  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00603978  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2214  secretion protein HlyD  26.03 
 
 		 382 aa  73.6  0.000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2837  RND family efflux transporter MFP subunit  30 
 
 		 406 aa  71.2  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0025637 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1597  macrolide transporter subunit MacA  24.35 
 
 		 370 aa  71.2  0.00000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2696  macrolide transporter subunit MacA  24.35 
 
 		 370 aa  71.2  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.761507  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0463  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.19 
 
 		 414 aa  70.9  0.00000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2611  macrolide transporter subunit MacA  24.35 
 
 		 370 aa  70.9  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4678  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.95 
 
 		 442 aa  70.5  0.00000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00314415  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1045  RND family efflux transporter MFP subunit  31.27 
 
 		 397 aa  70.5  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2617  secretion protein HlyD  26.74 
 
 		 385 aa  69.7  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000106145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2456  hypothetical protein  26.01 
 
 		 431 aa  68.9  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1281  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.17 
 
 		 357 aa  68.9  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.036609  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0396  RND family efflux transporter MFP subunit  31.27 
 
 		 413 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3235  secretion protein HlyD  27.67 
 
 		 391 aa  67.4  0.0000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.185962  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0838  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.86 
 
 		 432 aa  67  0.0000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0635  RND family efflux transporter MFP subunit  23.33 
 
 		 406 aa  66.6  0.0000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.320707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2116  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.2 
 
 		 393 aa  65.9  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.419105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2533  RND family efflux transporter MFP subunit  33.98 
 
 		 343 aa  66.2  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.66716  normal  0.672833 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4563  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.87 
 
 		 426 aa  66.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1673  secretion protein HlyD  26.25 
 
 		 396 aa  65.1  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.801945 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2072  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.49 
 
 		 379 aa  65.5  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0607  RND family efflux transporter MFP subunit  23.06 
 
 		 406 aa  65.5  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1184  secretion protein HlyD  27.66 
 
 		 396 aa  65.5  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2020  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.8 
 
 		 414 aa  64.7  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.152554 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1462  RND family efflux transporter MFP subunit  28.37 
 
 		 418 aa  63.9  0.000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1361  RND efflux membrane protein  29 
 
 		 383 aa  63.5  0.000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0573  macrolide secretion protein MacA  24.82 
 
 		 455 aa  63.5  0.000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.00000000000123833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0916  efflux transporter  28.86 
 
 		 396 aa  62.4  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.987196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1668  secretion protein HlyD  27.79 
 
 		 409 aa  62.4  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.223118  normal  0.732087 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0563  secretion protein HlyD  24.24 
 
 		 456 aa  62.8  0.00000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1666  RND family efflux transporter MFP subunit  20.24 
 
 		 418 aa  62.8  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1791  macrolide efflux protein MacA  25.46 
 
 		 420 aa  62  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1039  macrolide transporter subunit MacA  23.42 
 
 		 371 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.184306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1748  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.13 
 
 		 388 aa  61.2  0.00000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00883  macrolide transporter subunit, membrane fusion protein (MFP) component  23.42 
 
 		 371 aa  60.8  0.00000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00889  hypothetical protein  23.42 
 
 		 371 aa  60.8  0.00000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2764  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.42 
 
 		 371 aa  60.5  0.00000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.161658  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2451  macrolide transporter subunit MacA  23.42 
 
 		 371 aa  60.5  0.00000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00913289  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0951  macrolide transporter subunit MacA  23.42 
 
 		 371 aa  60.5  0.00000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0557503  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2718  macrolide transporter subunit MacA  23.42 
 
 		 371 aa  60.5  0.00000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0982  macrolide transporter subunit MacA  23.42 
 
 		 371 aa  60.5  0.00000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.44834  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1326  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.98 
 
 		 398 aa  60.1  0.00000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0997151  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2600  secretion protein HlyD  29.11 
 
 		 376 aa  60.1  0.00000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2499  RND family efflux transporter MFP subunit  28.61 
 
 		 416 aa  60.1  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3476  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.79 
 
 		 382 aa  59.7  0.00000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2100  RND family efflux transporter MFP subunit  28.23 
 
 		 379 aa  59.3  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0493506  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3303  RND family efflux transporter MFP subunit  30 
 
 		 418 aa  59.7  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.3496  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2374  RND family efflux transporter MFP subunit  27.41 
 
 		 395 aa  58.9  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.347836 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3834  RND family efflux transporter MFP subunit  29.69 
 
 		 383 aa  59.3  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3851  RND family efflux transporter MFP subunit  29.69 
 
 		 383 aa  59.3  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1919  RND family efflux transporter MFP subunit  29.69 
 
 		 383 aa  59.3  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0644  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.77 
 
 		 425 aa  58.9  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0200148  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0465  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.59 
 
 		 413 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.254107  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>