More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_1011 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_1011  RND family efflux transporter MFP subunit  100 
 
 		 402 aa  796    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1477  efflux transporter, RND family, MFP subunit  47.97 
 
 		 396 aa  299  7e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.153552  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2062  efflux transporter, RND family, MFP subunit  43.75 
 
 		 419 aa  293  4e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0208015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1916  RND family efflux transporter MFP subunit  45.9 
 
 		 401 aa  287  2e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1702  secretion protein HlyD  45.6 
 
 		 398 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.16483  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1581  secretion protein HlyD  49.74 
 
 		 396 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0301644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1940  secretion protein HlyD  40.91 
 
 		 395 aa  257  3e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.345824  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1477  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.41 
 
 		 390 aa  241  2e-62  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2304  RND family efflux transporter MFP subunit  39.25 
 
 		 396 aa  240  2.9999999999999997e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1054  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40 
 
 		 400 aa  230  4e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.153115  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0300  RND family efflux transporter MFP subunit  39.09 
 
 		 407 aa  229  5e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1573  RND family efflux transporter MFP subunit  44.36 
 
 		 399 aa  229  8e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4266  RND family efflux transporter MFP subunit  37.63 
 
 		 407 aa  228  1e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5375  HlyD family secretion protein  36.49 
 
 		 399 aa  225  1e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.288749  normal  0.0889869 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2204  RND family efflux transporter MFP subunit  39.29 
 
 		 411 aa  223  3e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0311908 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0078  putative secretion protein HlyD  37.01 
 
 		 409 aa  223  7e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.36335 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1210  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.68 
 
 		 389 aa  221  1.9999999999999999e-56  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00968103 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5171  secretion protein HlyD  39.79 
 
 		 395 aa  219  7.999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.345793  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3438  putative secretion protein HlyD precursor  35.15 
 
 		 399 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0583205  normal  0.262777 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0326  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.43 
 
 		 438 aa  216  5.9999999999999996e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.856716 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1281  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.84 
 
 		 387 aa  212  9e-54  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000959286  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1507  RND family efflux transporter MFP subunit  36.2 
 
 		 393 aa  211  2e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.679392  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2959  RND family efflux transporter MFP subunit  40.91 
 
 		 393 aa  207  2e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4499  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.74 
 
 		 391 aa  206  8e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.345717  normal  0.0635316 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4367  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.74 
 
 		 391 aa  206  8e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.122634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1419  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.75 
 
 		 387 aa  205  9e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.267588  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2283  RND family efflux transporter MFP subunit  36.07 
 
 		 398 aa  205  1e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.181226  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2069  HlyD family secretion protein  35.45 
 
 		 404 aa  195  1e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.473909 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0218  hypothetical protein  32.9 
 
 		 392 aa  193  4e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1123  secretion protein HlyD  38.44 
 
 		 401 aa  193  4e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.18847  normal  0.38508 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6250  RND family efflux transporter MFP subunit  37.23 
 
 		 388 aa  193  5e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0064  RND family efflux transporter MFP subunit  37.04 
 
 		 522 aa  193  5e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3585  RND family efflux transporter MFP subunit  33.99 
 
 		 389 aa  181  2e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4211  RND family efflux transporter MFP subunit  35.91 
 
 		 398 aa  179  5.999999999999999e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.342556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2658  secretion protein HlyD  43.81 
 
 		 393 aa  148  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.253454  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2749  efflux transporter, RND family, MFP subunit  43.37 
 
 		 393 aa  138  2e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.130988  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2843  efflux transporter, RND family, MFP subunit  43.37 
 
 		 393 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2082  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.52 
 
 		 416 aa  107  5e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2456  hypothetical protein  27.03 
 
 		 431 aa  105  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2455  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.21 
 
 		 391 aa  100  4e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.035635  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1147  RND family efflux transporter MFP subunit  30.17 
 
 		 395 aa  99  1e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2928  RND family efflux transporter MFP subunit  25.27 
 
 		 431 aa  95.9  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00603978  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2586  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.18 
 
 		 388 aa  91.3  3e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000121955  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1713  multidrug resistance efflux pump-like protein  25.07 
 
 		 392 aa  87.8  3e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.254154  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1550  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.53 
 
 		 413 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0505882  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2872  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.37 
 
 		 387 aa  80.5  0.00000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1571  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.99 
 
 		 435 aa  80.9  0.00000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.334008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3476  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.86 
 
 		 382 aa  79  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2825  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.07 
 
 		 476 aa  76.6  0.0000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.292175  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1101  RND family efflux transporter MFP subunit  24.73 
 
 		 414 aa  76.3  0.0000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.402678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3461  secretion protein HlyD  25.78 
 
 		 384 aa  75.5  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4678  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25 
 
 		 442 aa  75.5  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00314415  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3711  RND family efflux transporter MFP subunit  25.94 
 
 		 383 aa  75.1  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0748  putative PAS/PAC sensor protein  25.59 
 
 		 607 aa  73.9  0.000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2837  RND family efflux transporter MFP subunit  27.73 
 
 		 406 aa  73.6  0.000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0025637 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0166  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.94 
 
 		 379 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1462  RND family efflux transporter MFP subunit  26.42 
 
 		 418 aa  72  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0607  RND family efflux transporter MFP subunit  23.8 
 
 		 406 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1985  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.36 
 
 		 429 aa  70.5  0.00000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0871  secretion protein HlyD  25.53 
 
 		 406 aa  70.1  0.00000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.75327  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1184  secretion protein HlyD  26.78 
 
 		 396 aa  70.1  0.00000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2584  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.17 
 
 		 421 aa  70.1  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2072  efflux transporter, RND family, MFP subunit  17.89 
 
 		 379 aa  69.7  0.00000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3522  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.17 
 
 		 421 aa  69.7  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1671  HlyD family secretion protein  24.18 
 
 		 408 aa  69.3  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1617  secretion protein HlyD  24.18 
 
 		 408 aa  68.9  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0160623  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2374  RND family efflux transporter MFP subunit  24.11 
 
 		 395 aa  68.9  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.347836 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0635  RND family efflux transporter MFP subunit  23.54 
 
 		 406 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.320707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1241  RND family efflux transporter MFP subunit  26.49 
 
 		 398 aa  67.8  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3463  HlyD family secretion protein  29.17 
 
 		 378 aa  67.4  0.0000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1833  RND family efflux transporter MFP subunit  22.74 
 
 		 464 aa  67  0.0000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.36059  unclonable  0.000000000906287 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4563  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.7 
 
 		 426 aa  66.6  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4005  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.04 
 
 		 387 aa  66.2  0.0000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3235  secretion protein HlyD  26.57 
 
 		 391 aa  66.2  0.0000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.185962  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0321  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.42 
 
 		 386 aa  65.9  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2949  RND family efflux transporter MFP subunit  25.07 
 
 		 376 aa  66.2  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1045  RND family efflux transporter MFP subunit  28.87 
 
 		 397 aa  65.5  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2877  secretion protein HlyD  24.66 
 
 		 383 aa  65.5  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3197  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.59 
 
 		 387 aa  65.1  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.822347  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1361  RND efflux membrane protein  28.46 
 
 		 383 aa  64.7  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2519  secretion protein HlyD  27.22 
 
 		 382 aa  64.3  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000015375  normal  0.24357 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0950  secretion protein HlyD  26.63 
 
 		 384 aa  64.3  0.000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.57805  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2831  syringolide efflux protein SyfC  26.01 
 
 		 383 aa  63.5  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.580145  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1759  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.91 
 
 		 457 aa  63.2  0.000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1046  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.06 
 
 		 378 aa  63.5  0.000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0357289  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4663  RND family efflux transporter MFP subunit  31.09 
 
 		 394 aa  62.8  0.000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1047  RND family efflux transporter subunit MFP  23.61 
 
 		 461 aa  62.8  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0423833  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2367  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.57 
 
 		 360 aa  62.8  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0563  secretion protein HlyD  20.92 
 
 		 456 aa  62.8  0.00000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0463  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.24 
 
 		 414 aa  62.4  0.00000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2000  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.57 
 
 		 360 aa  62.8  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.461729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2074  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.76 
 
 		 353 aa  62  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.104068  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2543  secretion protein HlyD  25.57 
 
 		 471 aa  62  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.467529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3531  secretion protein HlyD  23.67 
 
 		 400 aa  62  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445744  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3758  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.15 
 
 		 379 aa  61.6  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1326  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.4 
 
 		 398 aa  61.2  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0997151  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1731  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.1 
 
 		 402 aa  60.8  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.63 
 
 		 377 aa  60.5  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.69897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1007  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.84 
 
 		 398 aa  60.5  0.00000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0782  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.56 
 
 		 428 aa  60.1  0.00000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00204407  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>