More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_2586 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_2586  efflux transporter, RND family, MFP subunit  100 
 
 
388 aa  766    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000121955  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2456  hypothetical protein  31.36 
 
 
431 aa  139  7.999999999999999e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1762  RND family efflux transporter MFP subunit  28.57 
 
 
421 aa  124  2e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0464275  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2928  RND family efflux transporter MFP subunit  28.84 
 
 
431 aa  124  3e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00603978  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2949  RND family efflux transporter MFP subunit  29.75 
 
 
376 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.39 
 
 
377 aa  117  5e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.69897  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1550  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.57 
 
 
413 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0505882  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0468  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.62 
 
 
445 aa  114  3e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0275  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.13 
 
 
381 aa  108  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1759  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.97 
 
 
457 aa  107  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0739  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.3 
 
 
362 aa  105  1e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.941037  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2872  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.29 
 
 
387 aa  100  3e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2954  RND family efflux transporter MFP subunit  27.06 
 
 
364 aa  98.2  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000249187  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1830  secretion protein HlyD  26.97 
 
 
449 aa  98.2  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223746  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0308  secretion protein HlyD  27.32 
 
 
421 aa  97.8  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.742688 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2082  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.4 
 
 
416 aa  97.4  4e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2455  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.58 
 
 
391 aa  97.4  4e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.035635  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1507  RND family efflux transporter MFP subunit  26.54 
 
 
393 aa  96.3  7e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.679392  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2062  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.95 
 
 
419 aa  94.4  3e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0208015  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1985  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.94 
 
 
429 aa  94.7  3e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0225  RND family efflux transporter MFP subunit  23.16 
 
 
461 aa  93.6  6e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.540049  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1281  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.59 
 
 
387 aa  92.8  9e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000959286  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1936  transporter, putative  25.26 
 
 
349 aa  92.4  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4521  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.61 
 
 
379 aa  92.4  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1011  RND family efflux transporter MFP subunit  24.7 
 
 
402 aa  90.9  3e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5171  secretion protein HlyD  22.58 
 
 
395 aa  89.7  8e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.345793  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2072  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.63 
 
 
379 aa  89  1e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6521  RND family efflux transporter MFP subunit  25.87 
 
 
410 aa  88.6  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.745567  normal  0.0817001 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1147  RND family efflux transporter MFP subunit  24.52 
 
 
395 aa  87.4  3e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1702  secretion protein HlyD  24.37 
 
 
398 aa  87.8  3e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.16483  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1526  RND family efflux transporter MFP subunit  24.77 
 
 
423 aa  87.4  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.692168  normal  0.0164989 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3711  RND family efflux transporter MFP subunit  24.36 
 
 
383 aa  87  5e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2877  RND family efflux transporter MFP subunit  24.38 
 
 
435 aa  85.5  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.200442 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1581  secretion protein HlyD  28.21 
 
 
396 aa  85.9  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0301644  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1477  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.8 
 
 
396 aa  85.5  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.153552  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0300  RND family efflux transporter MFP subunit  28.12 
 
 
407 aa  84.7  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4164  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.29 
 
 
438 aa  84.3  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.444201  normal  0.22934 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02540  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.81 
 
 
481 aa  84.7  0.000000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0229793  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1571  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.94 
 
 
435 aa  84  0.000000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.334008  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3531  secretion protein HlyD  26.15 
 
 
400 aa  84  0.000000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445744  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3855  RND family efflux transporter MFP subunit  23.04 
 
 
438 aa  83.6  0.000000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.336679  normal  0.260987 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0635  macrolide-specific efflux protein macA  25 
 
 
390 aa  83.6  0.000000000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0167041  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1477  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.05 
 
 
390 aa  82.8  0.000000000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3463  HlyD family secretion protein  28.44 
 
 
378 aa  82.8  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0838  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.06 
 
 
432 aa  82  0.00000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1054  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.95 
 
 
400 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.153115  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2831  syringolide efflux protein SyfC  26.24 
 
 
383 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.580145  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5609  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.81 
 
 
414 aa  81.6  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1908  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.05 
 
 
407 aa  82  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1349  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.87 
 
 
409 aa  81.6  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0580213 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4314  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.06 
 
 
438 aa  81.3  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.544766  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4150  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.31 
 
 
397 aa  80.5  0.00000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00923789  hitchhiker  0.000000297953 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0431  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.53 
 
 
368 aa  80.9  0.00000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1080  MacA  23.82 
 
 
394 aa  80.5  0.00000000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2069  HlyD family secretion protein  22.63 
 
 
404 aa  80.5  0.00000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.473909 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2283  RND family efflux transporter MFP subunit  28.21 
 
 
398 aa  80.1  0.00000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.181226  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2204  RND family efflux transporter MFP subunit  29.44 
 
 
411 aa  80.1  0.00000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0311908 
 
 
-
 
NC_002950  PG0539  RND family efflux transporter MFP subunit  24.15 
 
 
350 aa  79  0.0000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2370  secretion protein HlyD  26.54 
 
 
405 aa  79.3  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000467489 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15871  membrane fusion protein  28.84 
 
 
357 aa  79.3  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1967  RND family efflux transporter MFP subunit  24.85 
 
 
391 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0310111  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1007  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.23 
 
 
398 aa  78.2  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0753  secretion protein HlyD  24.61 
 
 
370 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1419  efflux transporter, RND family, MFP subunit  20.99 
 
 
387 aa  78.6  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.267588  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2374  RND family efflux transporter MFP subunit  21.99 
 
 
395 aa  78.6  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.347836 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3271  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.51 
 
 
380 aa  78.6  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.525557  normal  0.197401 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1573  RND family efflux transporter MFP subunit  28.99 
 
 
399 aa  78.2  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1259  RND family efflux transporter MFP subunit  27.73 
 
 
415 aa  77.8  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0709  macrolide-specific efflux protein macA  25.41 
 
 
390 aa  77.8  0.0000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1857  secretion protein HlyD  23.17 
 
 
390 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.779454 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1123  secretion protein HlyD  22.19 
 
 
401 aa  77.8  0.0000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.18847  normal  0.38508 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1064  macrolide-specific efflux protein macA  25.34 
 
 
390 aa  77.8  0.0000000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0267322  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1532  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.93 
 
 
415 aa  77.4  0.0000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2097  RND family efflux transporter MFP subunit  24.56 
 
 
391 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.902105  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1739  RND family efflux transporter MFP subunit  21.37 
 
 
366 aa  77.4  0.0000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2617  secretion protein HlyD  28.12 
 
 
385 aa  77  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000106145  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2322  secretion protein HlyD  26.76 
 
 
399 aa  77  0.0000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000756014  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0257  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.79 
 
 
376 aa  75.9  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0635655  hitchhiker  0.00588714 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0950  secretion protein HlyD  25.66 
 
 
384 aa  75.9  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.57805  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6991  RND family efflux transporter MFP subunit  22.87 
 
 
472 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.231557 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0883  RND family efflux transporter MFP subunit  25.45 
 
 
363 aa  75.9  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4651  RND family efflux transporter MFP subunit  24.1 
 
 
402 aa  75.9  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.611035  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0283  RND family efflux transporter MFP subunit  23.39 
 
 
416 aa  75.1  0.000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2692  RND family efflux transporter MFP subunit  22.31 
 
 
424 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00769313  normal  0.142754 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0747  secretion protein HlyD  27.59 
 
 
357 aa  75.1  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.554021  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2217  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.07 
 
 
356 aa  74.7  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0743158  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1502  secretion protein HlyD  22.87 
 
 
478 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.184777  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0177  hypothetical protein  27.79 
 
 
509 aa  75.1  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6327  RND family efflux transporter MFP subunit  22.87 
 
 
478 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0452278  normal  0.980568 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2393  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.68 
 
 
369 aa  74.7  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.355185  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3585  RND family efflux transporter MFP subunit  26.37 
 
 
389 aa  74.7  0.000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0322  RND family efflux transporter MFP subunit  25 
 
 
353 aa  73.9  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0619651 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2071  RND efflux system membrane fusion protein  25 
 
 
407 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.226746  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0942  acriflavine resistance protein E  24.03 
 
 
374 aa  73.6  0.000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2381  RND family efflux transporter MFP subunit  22.8 
 
 
357 aa  73.2  0.000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0770  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.35 
 
 
399 aa  73.2  0.000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0433625  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1210  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.83 
 
 
389 aa  73.2  0.000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00968103 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3939  RND family efflux transporter MFP subunit  24.06 
 
 
367 aa  73.2  0.000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.407918  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0467  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.68 
 
 
360 aa  73.2  0.000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1634  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.82 
 
 
417 aa  72.8  0.000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>