More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_2217 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_2217  efflux transporter, RND family, MFP subunit  100 
 
 
356 aa  704    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0743158  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.96 
 
 
377 aa  94.7  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.69897  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1571  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.05 
 
 
435 aa  92  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.334008  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1695  secretion protein HlyD  23.46 
 
 
360 aa  87  4e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0078  putative secretion protein HlyD  28.47 
 
 
409 aa  86.7  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.36335 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2559  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.95 
 
 
349 aa  83.6  0.000000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.99545  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1636  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.5 
 
 
383 aa  82.8  0.000000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.372421  normal  0.934491 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2586  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.7 
 
 
388 aa  81.3  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000121955  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2456  hypothetical protein  25.64 
 
 
431 aa  82  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0487  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.55 
 
 
360 aa  81.6  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2543  secretion protein HlyD  27.1 
 
 
471 aa  80.5  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.467529  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0385  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.65 
 
 
409 aa  79.7  0.00000000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2928  RND family efflux transporter MFP subunit  25.59 
 
 
431 aa  79.7  0.00000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00603978  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2455  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.83 
 
 
391 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.035635  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1161  RND family efflux transporter MFP subunit  27.73 
 
 
404 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0203325  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2954  RND family efflux transporter MFP subunit  28.18 
 
 
364 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000249187  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2100  RND family efflux transporter MFP subunit  28.57 
 
 
379 aa  78.6  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0493506  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1554  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.03 
 
 
363 aa  78.6  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0484603  hitchhiker  0.00000015248 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1879  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.03 
 
 
363 aa  78.6  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0067  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.76 
 
 
453 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3475  secretion protein HlyD-like protein  24.41 
 
 
373 aa  77  0.0000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.555415 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5686  RND family efflux transporter MFP subunit  28.71 
 
 
401 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.214167 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3058  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.18 
 
 
393 aa  75.9  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0768  acriflavin resistance periplasmic protein  25.72 
 
 
348 aa  75.5  0.000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.69171  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3750  secretion protein HlyD  28.38 
 
 
401 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4618  RND family efflux transporter MFP subunit  28.38 
 
 
401 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.343268  normal  0.223248 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004022  membrane-fusion protein  29.43 
 
 
369 aa  75.1  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000160707  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0480  RND family efflux transporter MFP subunit  24.2 
 
 
363 aa  75.1  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2949  RND family efflux transporter MFP subunit  25.83 
 
 
376 aa  73.9  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2704  RND family efflux transporter MFP subunit  28.12 
 
 
538 aa  74.3  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.534684  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2184  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.43 
 
 
537 aa  73.6  0.000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.580159  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3834  RND family efflux transporter MFP subunit  28.97 
 
 
383 aa  73.6  0.000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3851  RND family efflux transporter MFP subunit  28.97 
 
 
383 aa  73.6  0.000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1919  RND family efflux transporter MFP subunit  28.97 
 
 
383 aa  73.6  0.000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0838  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.98 
 
 
432 aa  73.2  0.000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0558  secretion protein HlyD  27.27 
 
 
360 aa  73.2  0.000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.177986  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1057  RND family efflux transporter MFP subunit  28.8 
 
 
373 aa  72.8  0.000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.347653 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1482  RND family efflux transporter MFP subunit  27.78 
 
 
537 aa  72  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0952522  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1815  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.08 
 
 
388 aa  72  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.100454  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0892  RND efflux membrane fusion protein precursor  28.23 
 
 
370 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6991  RND family efflux transporter MFP subunit  28.48 
 
 
472 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.231557 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2663  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.31 
 
 
352 aa  71.6  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0775  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.48 
 
 
479 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0631  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.75 
 
 
432 aa  70.9  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.137352 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1267  RND family efflux transporter MFP subunit  23.42 
 
 
355 aa  71.2  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1146  RND family efflux transporter MFP subunit  26.86 
 
 
351 aa  70.9  0.00000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001980  probable RND efflux membrane fusion protein  25.9 
 
 
367 aa  70.9  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.979341  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0870  acriflavin resistance periplasmic protein  26.86 
 
 
351 aa  71.2  0.00000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3977  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.32 
 
 
512 aa  70.9  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0198  RND family efflux transporter MFP subunit  25.17 
 
 
521 aa  71.2  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0463  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.87 
 
 
414 aa  70.5  0.00000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1281  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.27 
 
 
387 aa  70.5  0.00000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000959286  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5959  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.42 
 
 
383 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.42426  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1502  secretion protein HlyD  28.48 
 
 
478 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.184777  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2283  RND family efflux transporter MFP subunit  24.77 
 
 
398 aa  70.5  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.181226  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6327  RND family efflux transporter MFP subunit  28.48 
 
 
478 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0452278  normal  0.980568 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1001  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.32 
 
 
347 aa  70.1  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.612781  normal  0.0455845 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2264  secretion protein HlyD  27.69 
 
 
546 aa  69.7  0.00000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0654  RND family efflux transporter MFP subunit  26.51 
 
 
367 aa  69.7  0.00000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2685  RND family efflux transporter MFP subunit  28.33 
 
 
383 aa  69.7  0.00000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.133522  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2920  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.14 
 
 
505 aa  69.7  0.00000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.214189 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0471  secretion protein HlyD  28.05 
 
 
404 aa  69.7  0.00000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0431  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.34 
 
 
368 aa  69.3  0.00000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1361  hypothetical protein  23.35 
 
 
414 aa  68.9  0.0000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00937892  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6009  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.13 
 
 
356 aa  68.9  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.359632  normal  0.895367 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3585  RND family efflux transporter MFP subunit  28.64 
 
 
389 aa  68.9  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1672  RND family efflux transporter MFP subunit  23.29 
 
 
429 aa  69.3  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1550  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.66 
 
 
413 aa  68.9  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0505882  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0859  HlyD family secretion protein  27.33 
 
 
372 aa  68.6  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.585057  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4226  RND family efflux transporter MFP subunit  26.1 
 
 
426 aa  68.2  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.499264  normal  0.926991 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0916  HlyD family secretion protein  27.33 
 
 
372 aa  68.2  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00481  hypothetical protein  25.18 
 
 
368 aa  68.2  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1361  RND efflux membrane protein  30.19 
 
 
383 aa  68.6  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3707  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.37 
 
 
354 aa  68.6  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0663  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25 
 
 
453 aa  68.2  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4041  hypothetical protein  27.01 
 
 
366 aa  68.6  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0513022 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2818  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.86 
 
 
349 aa  67.8  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3522  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.63 
 
 
421 aa  67.4  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5741  RND family efflux transporter MFP subunit  27.14 
 
 
455 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.814041  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0962  secretion protein HlyD  26.6 
 
 
405 aa  67.8  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.255558  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1580  RND family efflux transporter MFP subunit  28.94 
 
 
365 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.186167  normal  0.460313 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0919  AcrA/AcrE family efflux protein  25 
 
 
377 aa  67.8  0.0000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5985  RND family efflux transporter MFP subunit  27.07 
 
 
455 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2408  secretion protein HlyD  24.38 
 
 
404 aa  67.4  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000198894  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2584  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.63 
 
 
421 aa  67.4  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0930  RND family efflux transporter MFP subunit  26.13 
 
 
366 aa  67.4  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2553  hypothetical protein  25.34 
 
 
368 aa  67  0.0000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000355433  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1916  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.62 
 
 
384 aa  67  0.0000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2808  membrane fusion protein; cation efflux system protein  23.31 
 
 
353 aa  67  0.0000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2052  hypothetical protein  24.46 
 
 
346 aa  66.6  0.0000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1251  RND family efflux transporter MFP subunit  27.86 
 
 
383 aa  66.2  0.0000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0652431  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3608  secretion protein HlyD  25.17 
 
 
400 aa  66.6  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.221607  normal  0.363906 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1169  membrane-fusion protein  24.93 
 
 
377 aa  66.2  0.0000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0146013  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1992  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.04 
 
 
580 aa  66.2  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.491967  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0972  secretion protein HlyD  24.73 
 
 
353 aa  65.9  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1965  secretion protein HlyD  26.41 
 
 
388 aa  65.9  0.000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.455875 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1870  secretion protein HlyD  28.07 
 
 
427 aa  65.9  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3883  secretion protein HlyD  25.9 
 
 
424 aa  65.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.135938  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4651  RND family efflux transporter MFP subunit  28.57 
 
 
402 aa  65.5  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.611035  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0207  RND family efflux transporter MFP subunit  31.1 
 
 
400 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000100142 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>