More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG1361 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG1361  hypothetical protein  100 
 
 
414 aa  828    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00937892  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0478  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.68 
 
 
395 aa  126  9e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5050  RND family efflux transporter MFP subunit  27.4 
 
 
394 aa  116  6e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5428  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.45 
 
 
397 aa  116  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5106  RND family efflux transporter MFP subunit  27.45 
 
 
397 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5497  RND family efflux transporter MFP subunit  27.45 
 
 
397 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5347  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.45 
 
 
397 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5374  RND family efflux transporter MFP subunit  27.45 
 
 
397 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4937  efflux system, periplasmic component  27.45 
 
 
397 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5576  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.88 
 
 
397 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4952  efflux system, periplasmic component  27.45 
 
 
397 aa  114  3e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5380  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.21 
 
 
397 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3787  RND family efflux transporter MFP subunit  26.75 
 
 
395 aa  113  6e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0654  RND family efflux transporter MFP subunit  25.76 
 
 
367 aa  104  3e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0695  periplasmic component of efflux system  25 
 
 
368 aa  101  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4484  hypothetical protein  25.59 
 
 
368 aa  100  4e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0119004 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0710  RND family efflux transporter MFP subunit  25.06 
 
 
367 aa  97.8  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0890  hypothetical protein  24.72 
 
 
367 aa  97.4  4e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.25677  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0894  hypothetical protein  24.47 
 
 
368 aa  97.4  4e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.67953e-37 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0852  hypothetical protein  25.07 
 
 
367 aa  96.7  7e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0962  hypothetical protein  25 
 
 
367 aa  96.7  7e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0760  hypothetical protein  24.47 
 
 
368 aa  95.5  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0709  periplasmic component of efflux system  24.72 
 
 
367 aa  95.1  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0799  hypothetical protein  24.47 
 
 
368 aa  95.5  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2928  RND family efflux transporter MFP subunit  24.19 
 
 
431 aa  91.7  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00603978  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1571  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.18 
 
 
435 aa  91.7  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.334008  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4150  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.37 
 
 
397 aa  90.9  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00923789  hitchhiker  0.000000297953 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2456  hypothetical protein  25.34 
 
 
431 aa  88.2  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2532  secretion protein HlyD  24.58 
 
 
359 aa  84.7  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.19676  normal  0.860631 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2072  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.07 
 
 
379 aa  84.3  0.000000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1943  secretion protein HlyD  24.72 
 
 
523 aa  82  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.354822  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2533  RND family efflux transporter MFP subunit  27.14 
 
 
343 aa  79.7  0.00000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.66716  normal  0.672833 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0319  RND family efflux transporter MFP subunit  24.61 
 
 
417 aa  79  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3848  RND family efflux transporter MFP subunit  24.9 
 
 
361 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.918542  normal  0.711455 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2100  RND family efflux transporter MFP subunit  26.69 
 
 
379 aa  79.3  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0493506  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1863  RND family efflux transporter MFP subunit  25.65 
 
 
393 aa  77.8  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3058  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.28 
 
 
393 aa  75.5  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3271  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.06 
 
 
380 aa  74.3  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.525557  normal  0.197401 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2586  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.87 
 
 
388 aa  74.7  0.000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000121955  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4735  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.89 
 
 
432 aa  73.9  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0659148 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2149  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.5 
 
 
409 aa  73.6  0.000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.111795  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2217  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.12 
 
 
356 aa  72.4  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0743158  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4163  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.07 
 
 
350 aa  72.8  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000250075  normal  0.807389 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2136  CzcB family heavy metal efflux protein  23.62 
 
 
418 aa  72  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2452  RND family efflux transporter MFP subunit  25.83 
 
 
428 aa  72  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.591296 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2825  RND family efflux transporter subunit MFP  24.89 
 
 
500 aa  70.9  0.00000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.708608  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1550  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.78 
 
 
413 aa  70.9  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0505882  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1793  hypothetical protein  23.75 
 
 
376 aa  70.5  0.00000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.672383  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2858  secretion protein HlyD  26.41 
 
 
517 aa  70.1  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2074  chemiosmotic efflux system protein B-like protein  27.08 
 
 
322 aa  68.9  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2064  chemiosmotic efflux system protein B-like protein  27.62 
 
 
322 aa  69.3  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1407  secretion protein HlyD  25.47 
 
 
540 aa  68.9  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3531  secretion protein HlyD  26.03 
 
 
400 aa  68.6  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445744  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0801  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.66 
 
 
403 aa  68.2  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2040  RND family mulitdrug efflux protein  25.82 
 
 
358 aa  68.2  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.428821  normal  0.886334 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1602  RND family efflux transporter MFP subunit  26.7 
 
 
641 aa  67.8  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0748  putative PAS/PAC sensor protein  24.6 
 
 
607 aa  67.4  0.0000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2825  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.07 
 
 
476 aa  67.4  0.0000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.292175  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0468  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.15 
 
 
445 aa  66.6  0.0000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1985  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.35 
 
 
429 aa  66.6  0.0000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1762  RND family efflux transporter MFP subunit  24.94 
 
 
421 aa  66.6  0.0000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0464275  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2352  chemiosmotic efflux system C protein B  29.51 
 
 
322 aa  66.2  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1166  secretion protein HlyD  25.86 
 
 
412 aa  65.9  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.912906  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3522  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.04 
 
 
421 aa  66.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1713  multidrug resistance efflux pump-like protein  21.33 
 
 
392 aa  66.2  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.254154  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0820  HlyD family secretion protein  25.13 
 
 
405 aa  65.1  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24 
 
 
428 aa  65.1  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3461  secretion protein HlyD  23.88 
 
 
384 aa  65.5  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0558  secretion protein HlyD  22.47 
 
 
360 aa  65.1  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.177986  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4710  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.72 
 
 
383 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.967203  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2584  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.04 
 
 
421 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3445  RND family efflux transporter MFP subunit  23.54 
 
 
401 aa  64.3  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.655677  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4858  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.44 
 
 
388 aa  64.7  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.368814  normal  0.345614 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2977  RND family efflux transporter MFP subunit  23.62 
 
 
401 aa  64.7  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.540318  normal  0.494242 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0695  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.62 
 
 
353 aa  64.7  0.000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0829  CzcB family heavy metal efflux protein  22.91 
 
 
423 aa  63.9  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.402667  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4341  RND family efflux transporter MFP subunit  25 
 
 
394 aa  64.3  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1685  RND family efflux transporter MFP subunit  22.7 
 
 
387 aa  63.9  0.000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.261181  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3828  secretion protein HlyD  25.81 
 
 
430 aa  63.9  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2229  RND family efflux transporter MFP subunit  22.68 
 
 
405 aa  63.9  0.000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3197  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.23 
 
 
387 aa  63.5  0.000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.822347  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2861  secretion protein HlyD  25.37 
 
 
489 aa  63.9  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0800  RND family efflux transporter MFP subunit  24.87 
 
 
416 aa  63.5  0.000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000642362  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2627  secretion protein HlyD  20.87 
 
 
399 aa  63.5  0.000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.524182 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3470  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.96 
 
 
379 aa  63.5  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.430372  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0270  putative MacA-like membrane transport protein  25.55 
 
 
417 aa  63.5  0.000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3758  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.35 
 
 
379 aa  63.2  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3773  RND family efflux transporter MFP subunit  23.01 
 
 
384 aa  63.2  0.000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.265534  normal  0.799504 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0906  secretion protein HlyD  23.42 
 
 
449 aa  63.2  0.000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.101628  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0986  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.55 
 
 
405 aa  63.2  0.000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.831389 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0770  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.55 
 
 
399 aa  62.8  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0433625  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2184  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.7 
 
 
537 aa  62.8  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.580159  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3973  RND family efflux transporter MFP subunit  24.79 
 
 
473 aa  62.8  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.181102 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2532  secretion protein HlyD  24.3 
 
 
363 aa  62.8  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2514  RND family efflux transporter MFP subunit  24.32 
 
 
354 aa  61.6  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000208657  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0080  RND family efflux transporter MFP subunit  25.6 
 
 
414 aa  62.4  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.95759  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2479  secretion protein HlyD  25 
 
 
504 aa  62  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.518843  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2663  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25 
 
 
352 aa  62  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2383  RND family efflux transporter MFP subunit  25.41 
 
 
530 aa  62  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.182874  normal  0.0987183 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3265  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.11 
 
 
404 aa  61.6  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>