More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_0710 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_0890  hypothetical protein  97.28 
 
 
367 aa  706    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.25677  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0852  hypothetical protein  95.64 
 
 
367 aa  695    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4484  hypothetical protein  96.74 
 
 
368 aa  700    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0119004 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0760  hypothetical protein  95.65 
 
 
368 aa  695    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0709  periplasmic component of efflux system  96.19 
 
 
367 aa  699    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0695  periplasmic component of efflux system  95.65 
 
 
368 aa  692    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0894  hypothetical protein  95.38 
 
 
368 aa  693    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.67953e-37 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0799  hypothetical protein  95.65 
 
 
368 aa  695    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0710  RND family efflux transporter MFP subunit  100 
 
 
367 aa  724    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0962  hypothetical protein  95.91 
 
 
367 aa  698    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0654  RND family efflux transporter MFP subunit  81.2 
 
 
367 aa  605  9.999999999999999e-173  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5576  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.31 
 
 
397 aa  149  6e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3787  RND family efflux transporter MFP subunit  29.77 
 
 
395 aa  147  3e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5428  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.28 
 
 
397 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5050  RND family efflux transporter MFP subunit  30.93 
 
 
394 aa  144  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5374  RND family efflux transporter MFP subunit  31.03 
 
 
397 aa  144  3e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4952  efflux system, periplasmic component  31.03 
 
 
397 aa  144  3e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0478  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.97 
 
 
395 aa  144  3e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5380  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.54 
 
 
397 aa  143  5e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5106  RND family efflux transporter MFP subunit  31.03 
 
 
397 aa  143  6e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5497  RND family efflux transporter MFP subunit  31.03 
 
 
397 aa  143  6e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5347  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.77 
 
 
397 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4937  efflux system, periplasmic component  30.77 
 
 
397 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1793  hypothetical protein  28.87 
 
 
376 aa  109  8.000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.672383  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1361  hypothetical protein  24.44 
 
 
414 aa  92  2e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00937892  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3058  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.34 
 
 
393 aa  89.4  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2072  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.82 
 
 
379 aa  82  0.00000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2928  RND family efflux transporter MFP subunit  27.71 
 
 
431 aa  80.5  0.00000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00603978  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1713  multidrug resistance efflux pump-like protein  26.91 
 
 
392 aa  79.3  0.00000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.254154  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2456  hypothetical protein  26.12 
 
 
431 aa  77.8  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.08 
 
 
377 aa  77  0.0000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.69897  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2949  RND family efflux transporter MFP subunit  24.33 
 
 
376 aa  74.3  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0319  RND family efflux transporter MFP subunit  26.39 
 
 
417 aa  73.9  0.000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2052  hypothetical protein  26.96 
 
 
346 aa  73.6  0.000000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01736  HlyD family secretion protein  25.47 
 
 
349 aa  72.8  0.000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004022  membrane-fusion protein  25.34 
 
 
369 aa  72.4  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000160707  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01444  hypothetical protein  25 
 
 
350 aa  72  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1036  RND family efflux transporter MFP subunit  24.6 
 
 
354 aa  70.5  0.00000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1830  secretion protein HlyD  24.93 
 
 
449 aa  68.2  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223746  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0067  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.7 
 
 
453 aa  66.6  0.0000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2074  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.93 
 
 
353 aa  66.6  0.0000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.104068  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0972  secretion protein HlyD  25.42 
 
 
353 aa  65.5  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0225  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.12 
 
 
347 aa  65.5  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.175978  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3408  RND family efflux transporter MFP subunit  24.3 
 
 
389 aa  65.1  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0128497  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1550  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.54 
 
 
413 aa  65.5  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0505882  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0830  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.86 
 
 
390 aa  64.3  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2100  RND family efflux transporter MFP subunit  23.08 
 
 
379 aa  64.3  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0493506  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2275  RND family efflux transporter MFP subunit  25.42 
 
 
354 aa  63.9  0.000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0060878  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1791  secretion protein HlyD  24.05 
 
 
402 aa  64.3  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2322  secretion protein HlyD  22.87 
 
 
399 aa  63.2  0.000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000756014  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1621  secretion protein HlyD  22.86 
 
 
407 aa  63.5  0.000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6521  RND family efflux transporter MFP subunit  23.03 
 
 
410 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.745567  normal  0.0817001 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0035  RND family efflux transporter MFP subunit  23.96 
 
 
360 aa  61.2  0.00000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000302663  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4438  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.08 
 
 
363 aa  61.6  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0321  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.33 
 
 
386 aa  62  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2663  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.86 
 
 
352 aa  62  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0438  hypothetical protein  22.03 
 
 
352 aa  60.8  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000000466929  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4163  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.91 
 
 
350 aa  61.2  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000250075  normal  0.807389 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4563  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.07 
 
 
426 aa  60.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2543  secretion protein HlyD  22.81 
 
 
471 aa  60.5  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.467529  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5875  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.26 
 
 
407 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0955286  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0463  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.53 
 
 
414 aa  60.8  0.00000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4521  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.08 
 
 
379 aa  60.1  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0527  RND family efflux transporter MFP subunit  24.25 
 
 
376 aa  60.5  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3712  RND family efflux transporter MFP subunit  22.68 
 
 
450 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.40893 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0987  secretion protein HlyD  23.94 
 
 
419 aa  60.1  0.00000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1704  RND family efflux transporter MFP subunit  24.58 
 
 
354 aa  60.1  0.00000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2217  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.23 
 
 
356 aa  60.1  0.00000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0743158  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2381  RND family efflux transporter MFP subunit  23.26 
 
 
357 aa  59.7  0.00000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1177  RND family efflux transporter MFP subunit  23 
 
 
417 aa  59.7  0.00000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2117  secretion protein HlyD  22.19 
 
 
428 aa  59.7  0.00000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.893928 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2514  RND family efflux transporter MFP subunit  23.75 
 
 
354 aa  59.3  0.00000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000208657  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0949  RND family efflux transporter MFP subunit  22.43 
 
 
390 aa  58.9  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01077  HlyD family secretion protein  23.68 
 
 
376 aa  58.9  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2071  RND efflux system membrane fusion protein  22.33 
 
 
407 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.226746  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2514  acriflavin resistance protein B  25.5 
 
 
371 aa  59.3  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.825279  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1450  RND family efflux transporter MFP subunit  24.46 
 
 
622 aa  59.3  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.125039  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2521  RND family efflux transporter MFP subunit  23.75 
 
 
354 aa  58.9  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.199325  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1830  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.75 
 
 
354 aa  58.9  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000238284  normal  0.23398 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2586  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.91 
 
 
388 aa  58.5  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000121955  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3707  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.73 
 
 
354 aa  58.2  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1147  RND family efflux transporter MFP subunit  26.28 
 
 
395 aa  58.5  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4180  RND family efflux transporter MFP subunit  22.36 
 
 
366 aa  58.2  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.249201  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2858  secretion protein HlyD  23.68 
 
 
517 aa  57.8  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3265  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.09 
 
 
404 aa  57.8  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2615  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.18 
 
 
380 aa  57.8  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.909785  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2634  RND family efflux transporter MFP subunit  24.08 
 
 
354 aa  57.8  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.182724  normal  0.987528 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2370  secretion protein HlyD  23.68 
 
 
405 aa  57  0.0000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000467489 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1438  secretion protein HlyD  23.24 
 
 
442 aa  57  0.0000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.16508 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1385  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.25 
 
 
380 aa  57  0.0000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0605754  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3233  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.91 
 
 
361 aa  57  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1520  RND family efflux transporter MFP subunit  22.83 
 
 
370 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.289277 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1925  HlyD family secretion protein  24.58 
 
 
354 aa  56.6  0.0000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0225  secretion protein HlyD  22.22 
 
 
380 aa  56.6  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.34961  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2584  CzcB subfamily membrane fusion protein  22.37 
 
 
409 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05040  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26 
 
 
509 aa  56.6  0.0000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00959096  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3711  RND family efflux transporter MFP subunit  23.53 
 
 
389 aa  56.6  0.0000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0986  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.21 
 
 
405 aa  56.2  0.0000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.831389 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1163  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.05 
 
 
377 aa  56.2  0.0000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00317162  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0454  secretion protein HlyD  22.86 
 
 
373 aa  56.2  0.0000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.63564  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>