More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2514 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2514  acriflavin resistance protein B  100 
 
 		 371 aa  744    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.825279  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1144  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.62 
 
 		 368 aa  281  1e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000422764  normal  0.160912 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5505  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.21 
 
 		 375 aa  271  2e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.37122  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3430  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.61 
 
 		 376 aa  263  4.999999999999999e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.516107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1476  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.52 
 
 		 366 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.142053  normal  0.195363 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01965  Secretion protein HlyD  32.18 
 
 		 401 aa  213  3.9999999999999995e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.303602  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0880  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.01 
 
 		 397 aa  136  7.000000000000001e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.995952  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2557  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.51 
 
 		 356 aa  119  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000000027885  normal  0.211023 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2275  RND family efflux transporter MFP subunit  24.52 
 
 		 354 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0060878  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2634  RND family efflux transporter MFP subunit  24.31 
 
 		 354 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.182724  normal  0.987528 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2514  RND family efflux transporter MFP subunit  24.04 
 
 		 354 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000208657  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1176  RND family efflux transporter MFP subunit  25.25 
 
 		 421 aa  108  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.771785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1704  RND family efflux transporter MFP subunit  24.82 
 
 		 354 aa  108  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1830  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.69 
 
 		 354 aa  105  9e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000238284  normal  0.23398 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2521  RND family efflux transporter MFP subunit  23.69 
 
 		 354 aa  105  9e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.199325  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.69 
 
 		 377 aa  105  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.69897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1649  RND family efflux transporter MFP subunit  23.69 
 
 		 354 aa  104  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.499517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1629  RND family efflux transporter MFP subunit  24.47 
 
 		 358 aa  103  6e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.185382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2657  cation or acridine efflux membrane fusion protein  25.42 
 
 		 357 aa  103  7e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1704  RND family efflux transporter MFP subunit  24.47 
 
 		 358 aa  102  8e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.271919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0892  RND efflux membrane fusion protein precursor  25.45 
 
 		 370 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0901  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.21 
 
 		 351 aa  102  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.470272  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0295  secretion protein HlyD  28.48 
 
 		 379 aa  101  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.438063  normal  0.535582 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004022  membrane-fusion protein  27.19 
 
 		 369 aa  101  3e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000160707  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2939  RND family efflux transporter MFP subunit  26.19 
 
 		 352 aa  99.8  6e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.0067677  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1830  RND family efflux transporter MFP subunit  22.92 
 
 		 359 aa  99.4  9e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.495597  normal  0.102007 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0044  CzcB family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter membrane fusion protein  24.91 
 
 		 416 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.597635  hitchhiker  0.00000490268 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0058  RND family efflux transporter MFP subunit  24.91 
 
 		 416 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.712877  hitchhiker  0.00429069 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0061  RND family efflux transporter MFP subunit  24.91 
 
 		 416 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204779 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2820  RND family efflux transporter MFP subunit  21.99 
 
 		 363 aa  97.8  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0120499  normal  0.368522 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1925  HlyD family secretion protein  23 
 
 		 354 aa  97.4  3e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0058  RND family efflux transporter MFP subunit  24.91 
 
 		 416 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.847384 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0609  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.32 
 
 		 353 aa  97.4  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.593708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2381  RND family efflux transporter MFP subunit  24.74 
 
 		 357 aa  96.7  5e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5198  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.63 
 
 		 366 aa  96.7  5e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.197197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2808  membrane fusion protein; cation efflux system protein  26.97 
 
 		 353 aa  95.9  9e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1748  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.98 
 
 		 388 aa  95.9  1e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3852  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.43 
 
 		 365 aa  95.9  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0266  RND family efflux transporter MFP subunit  25.08 
 
 		 375 aa  95.5  1e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.987776 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2912  secretion protein HlyD  26.83 
 
 		 418 aa  95.1  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.62912 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05040  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.03 
 
 		 509 aa  94.7  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00959096  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1783  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.34 
 
 		 354 aa  94.7  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4802  secretion protein HlyD  25.26 
 
 		 424 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.838463  decreased coverage  0.00074061 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1781  RND family efflux transporter MFP subunit  22.3 
 
 		 368 aa  94.4  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.253325  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2043  RND family efflux transporter MFP subunit  23.78 
 
 		 404 aa  94  4e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.148074  normal  0.931139 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1999  RND family efflux transporter MFP subunit  23.2 
 
 		 390 aa  93.6  4e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00132105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3718  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.47 
 
 		 353 aa  94  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.30257  normal  0.0568343 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3208  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.84 
 
 		 357 aa  93.6  5e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0146448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3467  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.21 
 
 		 376 aa  93.6  5e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00013135  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0870  acriflavin resistance periplasmic protein  27.19 
 
 		 351 aa  93.6  6e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1146  RND family efflux transporter MFP subunit  27.19 
 
 		 351 aa  93.2  7e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15871  membrane fusion protein  26.87 
 
 		 357 aa  92  1e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1455  RND family efflux transporter MFP subunit  24.66 
 
 		 345 aa  92  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0539  RND family efflux transporter MFP subunit  23.62 
 
 		 350 aa  91.7  2e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2293  RND family efflux transporter MFP subunit  22.64 
 
 		 371 aa  92  2e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0157  hypothetical protein  22.95 
 
 		 366 aa  91.7  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0176  RND family efflux transporter MFP subunit  23.23 
 
 		 353 aa  91.3  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.371241 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2949  RND family efflux transporter MFP subunit  24.46 
 
 		 376 aa  91.3  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1421  HlyD family secretion protein  24.08 
 
 		 354 aa  92  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0100677  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2814  RND family efflux transporter MFP subunit  24.33 
 
 		 370 aa  91.3  3e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4163  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.66 
 
 		 350 aa  91.3  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000250075  normal  0.807389 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0747  secretion protein HlyD  27.12 
 
 		 357 aa  90.5  4e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.554021  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0520  secretion protein HlyD  26.09 
 
 		 356 aa  90.5  4e-17  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3495  RND family efflux transporter MFP subunit  22.11 
 
 		 365 aa  90.5  4e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2192  secretion protein HlyD  24.65 
 
 		 352 aa  90.5  4e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3128  secretion protein HlyD  23.42 
 
 		 370 aa  90.1  5e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000130607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3169  RND family efflux transporter MFP subunit  25.59 
 
 		 369 aa  90.1  5e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000222351  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3170  RND family efflux transporter MFP subunit  25.72 
 
 		 369 aa  90.5  5e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000721535  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1389  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.33 
 
 		 374 aa  90.1  5e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000158934  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3695  RND family efflux transporter MFP subunit  23.28 
 
 		 360 aa  89.4  9e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.101272  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3379  RND family efflux transporter MFP subunit  34.64 
 
 		 409 aa  89.4  9e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.189038 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01922  RND efflux membrane fusion protein  23.84 
 
 		 318 aa  89.4  9e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0392  RND family efflux transporter MFP subunit  25.2 
 
 		 370 aa  89  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.32 
 
 		 428 aa  89  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2229  RND family efflux transporter MFP subunit  24.73 
 
 		 405 aa  89  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3361  RND family efflux transporter MFP subunit  23.95 
 
 		 410 aa  88.6  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3936  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.48 
 
 		 365 aa  88.6  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00117548 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3313  RND family efflux transporter MFP subunit  25 
 
 		 369 aa  88.6  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000984298  normal  0.15916 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1943  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.79 
 
 		 450 aa  87.8  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1201  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.4 
 
 		 369 aa  88.6  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000118856  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2275  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.66 
 
 		 427 aa  88.6  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.178981 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0438  hypothetical protein  24.75 
 
 		 352 aa  87.8  3e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000000466929  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3622  secretion protein HlyD  25 
 
 		 397 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.106281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0467  RND family efflux transporter MFP subunit  25.25 
 
 		 360 aa  87.8  3e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.949455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5559  secretion protein HlyD  24.11 
 
 		 366 aa  87.8  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1610  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.96 
 
 		 372 aa  87.4  3e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0537  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.99 
 
 		 400 aa  87.4  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0664  RND family efflux transporter MFP subunit  28.19 
 
 		 342 aa  87.8  3e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.295272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2732  RND family efflux transporter MFP subunit  29.43 
 
 		 361 aa  87.4  4e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0844309  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2000  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.67 
 
 		 360 aa  87.4  4e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.461729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2367  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.67 
 
 		 360 aa  87.4  4e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01077  HlyD family secretion protein  23.72 
 
 		 376 aa  87  5e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6214  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.92 
 
 		 424 aa  87  5e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0308  secretion protein HlyD  26.03 
 
 		 421 aa  86.7  6e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.742688 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1615  RND family efflux transporter MFP subunit  27.23 
 
 		 347 aa  86.7  6e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000338384  decreased coverage  0.00000142207 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3204  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.74 
 
 		 368 aa  86.3  7e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0376  cation efflux family protein  22.84 
 
 		 422 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1515  RND family efflux transporter MFP subunit  24.24 
 
 		 405 aa  85.5  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2434  RND family efflux transporter MFP subunit  22.97 
 
 		 383 aa  85.5  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.671436  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3297  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.18 
 
 		 336 aa  85.5  0.000000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000138483  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>