More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1144 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1144  efflux transporter, RND family, MFP subunit  100 
 
 		 368 aa  746    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000422764  normal  0.160912 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1476  efflux transporter, RND family, MFP subunit  48.63 
 
 		 366 aa  339  5.9999999999999996e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.142053  normal  0.195363 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5505  efflux transporter, RND family, MFP subunit  44.05 
 
 		 375 aa  319  5e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.37122  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3430  efflux transporter, RND family, MFP subunit  42.94 
 
 		 376 aa  281  9e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.516107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2514  acriflavin resistance protein B  41.62 
 
 		 371 aa  281  1e-74  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.825279  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01965  Secretion protein HlyD  33.7 
 
 		 401 aa  214  1.9999999999999998e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.303602  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0880  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.36 
 
 		 397 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.995952  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0870  acriflavin resistance periplasmic protein  29.34 
 
 		 351 aa  111  2.0000000000000002e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1146  RND family efflux transporter MFP subunit  29.34 
 
 		 351 aa  110  3e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1649  RND family efflux transporter MFP subunit  29.51 
 
 		 354 aa  108  1e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.499517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1704  RND family efflux transporter MFP subunit  27.08 
 
 		 358 aa  108  2e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.271919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1629  RND family efflux transporter MFP subunit  27.81 
 
 		 358 aa  107  3e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.185382  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0200  secretion protein HlyD  25.76 
 
 		 365 aa  105  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2657  cation or acridine efflux membrane fusion protein  28.33 
 
 		 357 aa  103  3e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1704  RND family efflux transporter MFP subunit  27.73 
 
 		 354 aa  100  4e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3495  RND family efflux transporter MFP subunit  25.09 
 
 		 365 aa  99.8  7e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3735  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.68 
 
 		 362 aa  99.4  8e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0308  secretion protein HlyD  27.69 
 
 		 421 aa  99.4  9e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.742688 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2275  RND family efflux transporter MFP subunit  26.63 
 
 		 354 aa  99  1e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0060878  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3852  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.19 
 
 		 365 aa  99  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1613  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.05 
 
 		 346 aa  99  1e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2253  secretion protein HlyD  26.01 
 
 		 398 aa  99  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.706134 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1209  RND family efflux transporter MFP subunit  26.54 
 
 		 381 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.421019  normal  0.31825 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2381  RND family efflux transporter MFP subunit  28.34 
 
 		 357 aa  97.4  3e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0175  hypothetical protein  27.9 
 
 		 380 aa  97.8  3e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.109936  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0266  RND family efflux transporter MFP subunit  24.6 
 
 		 375 aa  97.8  3e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.987776 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2627  secretion protein HlyD  27.99 
 
 		 399 aa  97.1  4e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.524182 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0372  RND family efflux transporter MFP subunit  26.16 
 
 		 372 aa  96.7  6e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2820  RND family efflux transporter MFP subunit  27.18 
 
 		 363 aa  96.7  6e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0120499  normal  0.368522 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1830  RND family efflux transporter MFP subunit  25.33 
 
 		 359 aa  96.3  7e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.495597  normal  0.102007 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1925  HlyD family secretion protein  26.25 
 
 		 354 aa  95.5  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4327  HlyD family secretion protein  26.16 
 
 		 372 aa  95.9  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.82 
 
 		 377 aa  95.5  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.69897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3467  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.94 
 
 		 376 aa  95.5  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00013135  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2557  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.16 
 
 		 356 aa  95.5  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000000027885  normal  0.211023 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0779  RND family efflux transporter MFP subunit  27.84 
 
 		 415 aa  94.7  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.521132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2949  RND family efflux transporter MFP subunit  26.3 
 
 		 376 aa  94.4  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0539  RND family efflux transporter MFP subunit  29.63 
 
 		 350 aa  93.6  5e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1783  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.22 
 
 		 354 aa  93.2  7e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0892  RND efflux membrane fusion protein precursor  25.64 
 
 		 370 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2338  RND family efflux transporter MFP subunit  25.94 
 
 		 459 aa  92.8  1e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.205065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2229  RND family efflux transporter MFP subunit  27.62 
 
 		 405 aa  91.3  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1636  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.93 
 
 		 383 aa  91.7  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.372421  normal  0.934491 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00481  hypothetical protein  25.67 
 
 		 368 aa  91.3  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1700  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.31 
 
 		 346 aa  90.9  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.116912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2036  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.31 
 
 		 346 aa  90.9  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0261077  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1830  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.58 
 
 		 354 aa  90.1  5e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000238284  normal  0.23398 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2521  RND family efflux transporter MFP subunit  24.58 
 
 		 354 aa  90.1  5e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.199325  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2514  RND family efflux transporter MFP subunit  24.58 
 
 		 354 aa  90.5  5e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000208657  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1715  acriflavin resistance periplasmic protein  29 
 
 		 357 aa  90.1  5e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000921401  normal  0.0591325 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4802  secretion protein HlyD  25.85 
 
 		 424 aa  90.1  6e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.838463  decreased coverage  0.00074061 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3268  HlyD family secretion protein  25.08 
 
 		 372 aa  89.7  6e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2043  RND family efflux transporter MFP subunit  25.6 
 
 		 404 aa  90.1  6e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.148074  normal  0.931139 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2192  secretion protein HlyD  24 
 
 		 352 aa  90.1  6e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2939  RND family efflux transporter MFP subunit  24.92 
 
 		 352 aa  89.4  8e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.0067677  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1815  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.33 
 
 		 388 aa  89  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.100454  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2136  CzcB family heavy metal efflux protein  25.76 
 
 		 418 aa  88.2  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1739  RND family efflux transporter MFP subunit  24.68 
 
 		 366 aa  88.2  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1921  RND family efflux transporter MFP subunit  26.32 
 
 		 340 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00271277  normal  0.413551 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2275  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.33 
 
 		 427 aa  87.8  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.178981 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6991  RND family efflux transporter MFP subunit  24.43 
 
 		 472 aa  87  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.231557 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1999  RND family efflux transporter MFP subunit  24.04 
 
 		 390 aa  87  4e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00132105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1339  RND family efflux transporter MFP subunit  27.03 
 
 		 384 aa  87.4  4e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.611384  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1421  HlyD family secretion protein  27.24 
 
 		 354 aa  87  4e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0100677  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0376  cation efflux family protein  26.19 
 
 		 422 aa  87  5e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2634  RND family efflux transporter MFP subunit  23.41 
 
 		 354 aa  87  5e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.182724  normal  0.987528 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4149  RND family efflux transporter MFP subunit  24.51 
 
 		 372 aa  87  5e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.815582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4492  secretion protein HlyD  25.63 
 
 		 382 aa  86.7  6e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0226833 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1781  RND family efflux transporter MFP subunit  25.25 
 
 		 368 aa  86.7  6e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.253325  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2367  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.77 
 
 		 360 aa  86.3  7e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0706  secretion protein HlyD  26.37 
 
 		 366 aa  86.3  7e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000331728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1216  RND family efflux transporter MFP subunit  24.48 
 
 		 379 aa  86.7  7e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.152303  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1067  secretion protein HlyD  25.41 
 
 		 364 aa  86.3  7e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.133207 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2000  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.77 
 
 		 360 aa  86.3  7e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.461729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3208  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.92 
 
 		 357 aa  86.3  8e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0146448  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1047  RND family efflux transporter subunit MFP  24.94 
 
 		 461 aa  86.3  8e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0423833  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3700  secretion protein HlyD  25 
 
 		 381 aa  86.3  9e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0364  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.43 
 
 		 362 aa  85.9  9e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.405995  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2409  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcB, putative  25.26 
 
 		 404 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.228901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1177  RND family efflux transporter MFP subunit  24.92 
 
 		 417 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1681  RND family efflux transporter MFP subunit  27.44 
 
 		 434 aa  85.9  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0776882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01077  HlyD family secretion protein  25.7 
 
 		 376 aa  85.9  0.000000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0438  hypothetical protein  25.76 
 
 		 352 aa  85.1  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000000466929  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0044  CzcB family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter membrane fusion protein  24.05 
 
 		 416 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.597635  hitchhiker  0.00000490268 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0901  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.15 
 
 		 351 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.470272  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3286  RND family efflux transporter MFP subunit  25.26 
 
 		 404 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.522349 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0061  RND family efflux transporter MFP subunit  24.05 
 
 		 416 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204779 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01736  HlyD family secretion protein  24.75 
 
 		 349 aa  85.5  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001980  probable RND efflux membrane fusion protein  25.16 
 
 		 367 aa  84.7  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.979341  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0816  RND family efflux transporter MFP subunit  24.24 
 
 		 385 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2282  secretion protein HlyD  26.8 
 
 		 467 aa  85.1  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1502  secretion protein HlyD  24.1 
 
 		 478 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.184777  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.81 
 
 		 428 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4229  RND family efflux transporter MFP subunit  25.54 
 
 		 371 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0271349  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0058  RND family efflux transporter MFP subunit  24.05 
 
 		 416 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.712877  hitchhiker  0.00429069 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6327  RND family efflux transporter MFP subunit  24.1 
 
 		 478 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0452278  normal  0.980568 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0946  RND family efflux transporter MFP subunit  25.46 
 
 		 382 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3361  RND family efflux transporter MFP subunit  24.39 
 
 		 410 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0295  secretion protein HlyD  26.61 
 
 		 379 aa  84  0.000000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.438063  normal  0.535582 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0058  RND family efflux transporter MFP subunit  24.05 
 
 		 416 aa  84  0.000000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.847384 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>