More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5505 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5505  efflux transporter, RND family, MFP subunit  100 
 
 		 375 aa  755    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.37122  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3430  efflux transporter, RND family, MFP subunit  59.56 
 
 		 376 aa  438  9.999999999999999e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.516107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1476  efflux transporter, RND family, MFP subunit  45.43 
 
 		 366 aa  325  6e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.142053  normal  0.195363 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1144  efflux transporter, RND family, MFP subunit  44.05 
 
 		 368 aa  319  5e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000422764  normal  0.160912 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2514  acriflavin resistance protein B  40.21 
 
 		 371 aa  271  2e-71  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.825279  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01965  Secretion protein HlyD  34.4 
 
 		 401 aa  221  1.9999999999999999e-56  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.303602  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0880  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.22 
 
 		 397 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.995952  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0870  acriflavin resistance periplasmic protein  30.06 
 
 		 351 aa  114  4.0000000000000004e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1636  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.97 
 
 		 383 aa  111  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.372421  normal  0.934491 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1146  RND family efflux transporter MFP subunit  29.76 
 
 		 351 aa  111  2.0000000000000002e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3852  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.78 
 
 		 365 aa  109  7.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1783  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.71 
 
 		 354 aa  109  1e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0768  acriflavin resistance periplasmic protein  29.77 
 
 		 348 aa  105  1e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.69171  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2949  RND family efflux transporter MFP subunit  27.38 
 
 		 376 aa  103  4e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.19 
 
 		 377 aa  103  5e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.69897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3735  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.34 
 
 		 362 aa  103  7e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3467  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.4 
 
 		 376 aa  101  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00013135  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2657  cation or acridine efflux membrane fusion protein  26.22 
 
 		 357 aa  100  4e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1999  RND family efflux transporter MFP subunit  25.17 
 
 		 390 aa  100  5e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00132105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3361  RND family efflux transporter MFP subunit  27.78 
 
 		 410 aa  99  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3495  RND family efflux transporter MFP subunit  24.68 
 
 		 365 aa  99  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4229  RND family efflux transporter MFP subunit  25.15 
 
 		 371 aa  98.2  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0271349  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2275  RND family efflux transporter MFP subunit  26.56 
 
 		 354 aa  97.8  3e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0060878  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0829  CzcB family heavy metal efflux protein  27.57 
 
 		 423 aa  97.4  4e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.402667  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2043  RND family efflux transporter MFP subunit  25.95 
 
 		 404 aa  97.1  5e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.148074  normal  0.931139 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1629  RND family efflux transporter MFP subunit  25.96 
 
 		 358 aa  97.1  5e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.185382  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2818  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.53 
 
 		 349 aa  97.1  5e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0044  CzcB family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter membrane fusion protein  25 
 
 		 416 aa  96.3  7e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.597635  hitchhiker  0.00000490268 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0061  RND family efflux transporter MFP subunit  25 
 
 		 416 aa  96.3  7e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204779 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1176  RND family efflux transporter MFP subunit  26.37 
 
 		 421 aa  96.3  7e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.771785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0058  RND family efflux transporter MFP subunit  25 
 
 		 416 aa  96.3  7e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.712877  hitchhiker  0.00429069 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3936  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.79 
 
 		 365 aa  96.3  9e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00117548 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2939  RND family efflux transporter MFP subunit  25 
 
 		 352 aa  95.9  9e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.0067677  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01736  HlyD family secretion protein  24.13 
 
 		 349 aa  95.5  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0058  RND family efflux transporter MFP subunit  25 
 
 		 416 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.847384 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0200  secretion protein HlyD  23.73 
 
 		 365 aa  95.9  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2229  RND family efflux transporter MFP subunit  25.52 
 
 		 405 aa  95.5  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2409  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcB, putative  25.61 
 
 		 404 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.228901  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0539  RND family efflux transporter MFP subunit  27.42 
 
 		 350 aa  94.7  2e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1704  RND family efflux transporter MFP subunit  25.64 
 
 		 358 aa  95.1  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.271919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0175  hypothetical protein  24.78 
 
 		 380 aa  95.1  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.109936  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0537  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.44 
 
 		 400 aa  94.4  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2132  HlyD family secretion protein  26.93 
 
 		 360 aa  94.4  3e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.732379  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3286  RND family efflux transporter MFP subunit  25.61 
 
 		 404 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.522349 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1704  RND family efflux transporter MFP subunit  25.97 
 
 		 354 aa  94.4  3e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2253  secretion protein HlyD  25 
 
 		 398 aa  94  4e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.706134 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3508  secretion protein HlyD  26.85 
 
 		 424 aa  94  4e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00231  membrane fusion protein  27.07 
 
 		 356 aa  93.6  5e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2557  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.92 
 
 		 356 aa  93.6  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000000027885  normal  0.211023 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1649  RND family efflux transporter MFP subunit  26.37 
 
 		 354 aa  92.8  9e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.499517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0501  RND family efflux transporter MFP subunit  26.5 
 
 		 430 aa  92.4  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4802  secretion protein HlyD  26.87 
 
 		 424 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.838463  decreased coverage  0.00074061 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1580  RND family efflux transporter MFP subunit  26.58 
 
 		 365 aa  91.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.610408  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2275  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.24 
 
 		 427 aa  92  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.178981 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1216  RND family efflux transporter MFP subunit  23.55 
 
 		 379 aa  91.7  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.152303  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1496  RND family efflux transporter MFP subunit  26.58 
 
 		 365 aa  91.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.24 
 
 		 428 aa  92  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1614  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.85 
 
 		 358 aa  91.7  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1748  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.97 
 
 		 388 aa  91.7  2e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0109  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.91 
 
 		 360 aa  91.7  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0110  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.91 
 
 		 360 aa  91.7  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0892  RND efflux membrane fusion protein precursor  25.25 
 
 		 370 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0364  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.21 
 
 		 362 aa  91.3  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.405995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1209  RND family efflux transporter MFP subunit  26.56 
 
 		 381 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.421019  normal  0.31825 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00481  hypothetical protein  25.33 
 
 		 368 aa  90.5  4e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2115  RND family efflux transporter MFP subunit  25.56 
 
 		 358 aa  90.5  4e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.243289  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1044  RND family efflux transporter MFP subunit  26.27 
 
 		 365 aa  90.1  6e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1201  RND family efflux transporter MFP subunit  26.27 
 
 		 365 aa  90.1  6e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0341767  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0383  RND family efflux transporter MFP subunit  26.27 
 
 		 365 aa  90.1  6e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0078  RND family efflux transporter MFP subunit  26.27 
 
 		 365 aa  90.1  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0031  RND family efflux transporter MFP subunit  26.27 
 
 		 365 aa  90.1  6e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2100  RND family efflux transporter MFP subunit  24.3 
 
 		 379 aa  89.7  7e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0493506  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4352  RND family efflux transporter MFP subunit  28.31 
 
 		 369 aa  89.7  7e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.285703  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1925  HlyD family secretion protein  25.99 
 
 		 354 aa  89.4  9e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2627  secretion protein HlyD  24.57 
 
 		 399 aa  89  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.524182 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1440  secretion protein HlyD  21.47 
 
 		 376 aa  88.2  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1067  secretion protein HlyD  28.34 
 
 		 364 aa  88.2  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.133207 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1036  RND family efflux transporter MFP subunit  26.44 
 
 		 354 aa  88.2  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001980  probable RND efflux membrane fusion protein  25 
 
 		 367 aa  88.6  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.979341  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2521  RND family efflux transporter MFP subunit  25.96 
 
 		 354 aa  87.8  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.199325  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2256  RND family efflux transporter MFP subunit  25.51 
 
 		 404 aa  87.8  3e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5576  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.76 
 
 		 353 aa  87.8  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.110033 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0609  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.47 
 
 		 353 aa  87.8  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.593708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2179  RND family efflux transporter MFP subunit  24.59 
 
 		 361 aa  87.8  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000248395  normal  0.140593 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1830  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.96 
 
 		 354 aa  87.8  3e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000238284  normal  0.23398 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2514  RND family efflux transporter MFP subunit  25.96 
 
 		 354 aa  87.8  3e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000208657  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2634  RND family efflux transporter MFP subunit  25.96 
 
 		 354 aa  87.4  4e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.182724  normal  0.987528 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1830  RND family efflux transporter MFP subunit  25.72 
 
 		 359 aa  87  4e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.495597  normal  0.102007 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2820  RND family efflux transporter MFP subunit  25.4 
 
 		 363 aa  87  4e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0120499  normal  0.368522 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1580  RND family efflux transporter MFP subunit  24.07 
 
 		 365 aa  87  4e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.186167  normal  0.460313 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3456  RND family efflux transporter MFP subunit  26.33 
 
 		 391 aa  87  5e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1186  RND family efflux transporter MFP subunit  23.23 
 
 		 374 aa  87  5e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.425099  normal  0.0297054 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0266  RND family efflux transporter MFP subunit  25.32 
 
 		 375 aa  87  5e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.987776 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3832  RND family efflux transporter MFP subunit  27.48 
 
 		 374 aa  86.7  6e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0376  cation efflux family protein  25.51 
 
 		 422 aa  86.7  6e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1815  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.65 
 
 		 388 aa  86.7  6e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.100454  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2347  RND family efflux transporter MFP subunit  27.48 
 
 		 374 aa  86.7  6e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.161325  hitchhiker  0.00157605 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01077  HlyD family secretion protein  24.31 
 
 		 376 aa  86.7  7e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1044  RND family efflux transporter MFP subunit  26.6 
 
 		 361 aa  86.7  7e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0011899  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1112  secretion protein HlyD  27.65 
 
 		 383 aa  86.3  7e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.941  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>