More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_1943 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010718  Nther_1943  efflux transporter, RND family, MFP subunit  100 
 
 		 450 aa  900    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1938  efflux transporter, RND family, MFP subunit  42.29 
 
 		 462 aa  311  2e-83  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000755017  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05040  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.57 
 
 		 509 aa  134  3e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00959096  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0558  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.04 
 
 		 513 aa  129  8.000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2949  RND family efflux transporter MFP subunit  25.79 
 
 		 376 aa  119  7.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4150  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.21 
 
 		 397 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00923789  hitchhiker  0.000000297953 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3467  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.91 
 
 		 376 aa  113  6e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00013135  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.98 
 
 		 377 aa  112  9e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.69897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2100  RND family efflux transporter MFP subunit  24.93 
 
 		 379 aa  112  1.0000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0493506  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2082  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.94 
 
 		 416 aa  111  3e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0161  RND family efflux transporter MFP subunit  25.24 
 
 		 380 aa  107  4e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2322  secretion protein HlyD  26.17 
 
 		 399 aa  102  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000756014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1571  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.36 
 
 		 435 aa  101  3e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.334008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0764  RND family efflux transporter MFP subunit  23.39 
 
 		 385 aa  101  3e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2370  secretion protein HlyD  26.32 
 
 		 405 aa  98.2  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000467489 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1748  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.74 
 
 		 388 aa  98.6  2e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2020  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.29 
 
 		 414 aa  98.2  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.152554 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2446  secretion protein HlyD  26.8 
 
 		 331 aa  98.2  3e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0391443  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3060  secretion protein HlyD family protein  27.93 
 
 		 353 aa  97.1  7e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1186  RND family efflux transporter MFP subunit  25.06 
 
 		 374 aa  96.7  8e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.425099  normal  0.0297054 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0838  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.3 
 
 		 432 aa  96.7  9e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0206  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.47 
 
 		 386 aa  94.4  3e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0830  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.14 
 
 		 390 aa  94.7  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2682  secretion protein HlyD family protein  27.44 
 
 		 323 aa  91.7  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.430212  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3408  RND family efflux transporter MFP subunit  23.96 
 
 		 389 aa  91.7  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0128497  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2777  secretion protein HlyD family protein  27.44 
 
 		 323 aa  91.7  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.991626  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2823  HlyD family secretion protein  26.01 
 
 		 329 aa  91.3  4e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1721  RND family efflux transporter MFP subunit  21.48 
 
 		 431 aa  90.9  4e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1189  secretion protein HlyD  27.57 
 
 		 323 aa  91.3  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.315896  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0308  secretion protein HlyD  21.41 
 
 		 421 aa  90.9  4e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.742688 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4521  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.23 
 
 		 379 aa  90.5  5e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0225  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.02 
 
 		 347 aa  90.1  7e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.175978  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0412  secretion protein HlyD family protein  27.99 
 
 		 323 aa  89.7  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.604128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0875  secretion protein HlyD family protein  27.91 
 
 		 315 aa  89.7  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.316135 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1649  RND family efflux transporter MFP subunit  23.48 
 
 		 354 aa  89  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.499517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1421  HlyD family secretion protein  23.76 
 
 		 354 aa  88.6  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0100677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4903  secretion protein HlyD family protein  22.87 
 
 		 359 aa  89  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0179  secretion protein HlyD  27.22 
 
 		 334 aa  87.8  3e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.235811  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2514  acriflavin resistance protein B  23.79 
 
 		 371 aa  87.8  4e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.825279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2524  RND family efflux transporter MFP subunit  23.43 
 
 		 424 aa  87.8  4e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.283395  normal  0.0763035 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0098  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.42 
 
 		 432 aa  87.4  5e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1040  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.31 
 
 		 500 aa  87  6e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2381  RND family efflux transporter MFP subunit  22.76 
 
 		 357 aa  86.7  9e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1908  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.55 
 
 		 407 aa  86.3  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3531  secretion protein HlyD  22.68 
 
 		 400 aa  85.9  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3711  RND family efflux transporter MFP subunit  24.1 
 
 		 389 aa  85.9  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4089  HlyD family secretion protein  27.93 
 
 		 324 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1777  secretion protein HlyD family protein  32.39 
 
 		 320 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0865879  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1039  secretion protein HlyD  29.03 
 
 		 427 aa  85.1  0.000000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4261  secretion protein HlyD family protein  25.13 
 
 		 347 aa  85.5  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3463  secretion protein HlyD family protein  28.67 
 
 		 324 aa  84.7  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0488  secretion protein HlyD family protein  29.1 
 
 		 324 aa  84.7  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0175  hypothetical protein  23.13 
 
 		 380 aa  84.7  0.000000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.109936  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0949  RND family efflux transporter MFP subunit  24.17 
 
 		 390 aa  84.3  0.000000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1830  RND family efflux transporter MFP subunit  23.01 
 
 		 359 aa  84.3  0.000000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.495597  normal  0.102007 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1339  RND family efflux transporter MFP subunit  26.52 
 
 		 384 aa  84  0.000000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.611384  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0880  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.82 
 
 		 397 aa  84.3  0.000000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.995952  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1921  RND family efflux transporter MFP subunit  21.45 
 
 		 340 aa  84  0.000000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00271277  normal  0.413551 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0807  secretion protein HlyD family protein  29.17 
 
 		 310 aa  83.6  0.000000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2820  RND family efflux transporter MFP subunit  22.13 
 
 		 363 aa  83.6  0.000000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0120499  normal  0.368522 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3639  secretion protein HlyD family protein  28.67 
 
 		 324 aa  83.6  0.000000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0031  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.99 
 
 		 392 aa  83.2  0.000000000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000323168  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20080  hypothetical protein  25.56 
 
 		 323 aa  83.6  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02540  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.74 
 
 		 481 aa  82.8  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0229793  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3464  secretion protein HlyD  25.43 
 
 		 335 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1389  efflux transporter, RND family, MFP subunit  20.23 
 
 		 374 aa  82.8  0.00000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000158934  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0653  secretion protein HlyD family protein  27.05 
 
 		 357 aa  82.8  0.00000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1757  secretion protein HlyD  23.22 
 
 		 448 aa  82.8  0.00000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.071428 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1504  RND family efflux transporter MFP subunit  26.19 
 
 		 397 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0583737 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1728  hypothetical protein  25.56 
 
 		 323 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0534587  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1439  RND family efflux transporter MFP subunit  27.81 
 
 		 390 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0228236 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1420  secretion protein HlyD family protein  27.04 
 
 		 332 aa  82  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0583  secretion protein HlyD family protein  27.97 
 
 		 324 aa  82  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1575  RND membrane fusion protein AcrA  22.99 
 
 		 448 aa  82.4  0.00000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.853878 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1815  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.71 
 
 		 388 aa  82  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.100454  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2557  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.25 
 
 		 356 aa  82.4  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000000027885  normal  0.211023 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2355  secretion protein HlyD  25.48 
 
 		 509 aa  82  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0694634 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0506  secretion protein HlyD family protein  27.27 
 
 		 324 aa  81.6  0.00000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1026  secretion protein HlyD family protein  27.6 
 
 		 326 aa  81.6  0.00000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2530  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.95 
 
 		 430 aa  81.6  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.559583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2854  cation efflux transporter  27.81 
 
 		 386 aa  81.3  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.405755  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1497  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.63 
 
 		 407 aa  81.6  0.00000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.30393  hitchhiker  0.00778895 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1870  secretion protein HlyD  23.95 
 
 		 427 aa  81.6  0.00000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2293  RND family efflux transporter MFP subunit  23.85 
 
 		 371 aa  81.3  0.00000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2193  multidrug resistance protein MdtN  29.54 
 
 		 350 aa  80.9  0.00000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3379  RND family efflux transporter MFP subunit  25.27 
 
 		 409 aa  80.9  0.00000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.189038 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1781  RND family efflux transporter MFP subunit  21.82 
 
 		 368 aa  80.5  0.00000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.253325  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1925  secretion protein HlyD family protein  26.16 
 
 		 328 aa  80.5  0.00000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0178624 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1629  RND family efflux transporter MFP subunit  22.67 
 
 		 358 aa  80.5  0.00000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.185382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0527  secretion protein HlyD family protein  26.92 
 
 		 324 aa  80.1  0.00000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0568004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0531  secretion protein HlyD family protein  26.92 
 
 		 324 aa  80.1  0.00000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0058  RND family efflux transporter MFP subunit  21.43 
 
 		 416 aa  80.1  0.00000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.847384 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5332  secretion protein HlyD family protein  26.01 
 
 		 347 aa  79.7  0.00000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.588118 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2136  CzcB family heavy metal efflux protein  21.86 
 
 		 418 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02378  cation transporter transmembrane protein  24.23 
 
 		 382 aa  79.3  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.571869  normal  0.441465 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1999  RND family efflux transporter MFP subunit  19.55 
 
 		 390 aa  79.3  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00132105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0478  HlyD family secretion protein  26.13 
 
 		 322 aa  79  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.161841 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0653  RND family efflux transporter MFP subunit  23.78 
 
 		 409 aa  79.3  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.356164  normal  0.176029 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2456  hypothetical protein  23.39 
 
 		 431 aa  79.7  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1267  RND family efflux transporter MFP subunit  29.08 
 
 		 355 aa  79.3  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>