More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1455 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1455  RND family efflux transporter MFP subunit  100 
 
 		 345 aa  664    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0454  secretion protein HlyD  31.09 
 
 		 373 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.63564  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1163  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.18 
 
 		 377 aa  153  5e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00317162  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2046  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.22 
 
 		 442 aa  150  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3467  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.94 
 
 		 376 aa  150  4e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00013135  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2000  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.87 
 
 		 360 aa  142  9e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.461729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2367  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.87 
 
 		 360 aa  142  9e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3379  RND family efflux transporter MFP subunit  30.14 
 
 		 409 aa  136  4e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.189038 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0549  secretion protein HlyD  32.38 
 
 		 407 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000105  membrane-fusion protein  32.46 
 
 		 351 aa  129  6e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.860226  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1389  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.21 
 
 		 374 aa  126  6e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000158934  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1748  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.58 
 
 		 388 aa  125  9e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1234  RND family efflux transporter MFP subunit  30.36 
 
 		 359 aa  125  1e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.580475  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4229  RND family efflux transporter MFP subunit  29.31 
 
 		 371 aa  124  3e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0271349  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0392  RND family efflux transporter MFP subunit  36.21 
 
 		 370 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2074  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.53 
 
 		 353 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.104068  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5381  RND family efflux transporter MFP subunit  32.77 
 
 		 364 aa  120  4.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.996751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0703  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.2 
 
 		 355 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1704  RND family efflux transporter MFP subunit  27.43 
 
 		 358 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.271919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1629  RND family efflux transporter MFP subunit  27.43 
 
 		 358 aa  117  3e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.185382  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0206  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.88 
 
 		 386 aa  117  3e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0321  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.7 
 
 		 386 aa  116  5e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2322  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.72 
 
 		 371 aa  115  7.999999999999999e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0437768 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2153  HlyD family secretion protein  32.38 
 
 		 359 aa  115  8.999999999999998e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0856  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.8 
 
 		 370 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1924  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.63 
 
 		 352 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.896235 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3803  RND family efflux transporter MFP subunit  32.09 
 
 		 376 aa  114  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.591559 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3344  secretion protein HlyD  30.99 
 
 		 333 aa  114  3e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.144623 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0583  HlyD family secretion protein  29.7 
 
 		 334 aa  114  3e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0901  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.7 
 
 		 351 aa  114  3e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.470272  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5559  secretion protein HlyD  30.15 
 
 		 366 aa  113  5e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1704  RND family efflux transporter MFP subunit  26.72 
 
 		 354 aa  113  5e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0674  periplasmic linker protein  27.47 
 
 		 358 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4180  RND family efflux transporter MFP subunit  28.83 
 
 		 366 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.249201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3128  secretion protein HlyD  33.15 
 
 		 370 aa  110  3e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000130607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1001  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.36 
 
 		 347 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.612781  normal  0.0455845 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2381  RND family efflux transporter MFP subunit  25.71 
 
 		 357 aa  109  8.000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2275  RND family efflux transporter MFP subunit  26.72 
 
 		 354 aa  109  9.000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0060878  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1439  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.67 
 
 		 380 aa  108  1e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0465471  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2445  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.17 
 
 		 424 aa  107  2e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0377313 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2514  RND family efflux transporter MFP subunit  27.32 
 
 		 354 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000208657  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1830  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.32 
 
 		 354 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000238284  normal  0.23398 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2521  RND family efflux transporter MFP subunit  27.32 
 
 		 354 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.199325  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0505  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.41 
 
 		 349 aa  108  2e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3936  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.25 
 
 		 365 aa  107  3e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00117548 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1879  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.73 
 
 		 363 aa  107  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1554  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.73 
 
 		 363 aa  107  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0484603  hitchhiker  0.00000015248 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2634  RND family efflux transporter MFP subunit  27.32 
 
 		 354 aa  107  4e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.182724  normal  0.987528 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3852  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.43 
 
 		 365 aa  107  4e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3475  secretion protein HlyD-like protein  25.22 
 
 		 373 aa  106  7e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.555415 
 
 
-
 
NC_002950  PG0539  RND family efflux transporter MFP subunit  26.63 
 
 		 350 aa  105  2e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4041  hypothetical protein  31.67 
 
 		 366 aa  104  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0513022 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3874  secretion protein HlyD  33.44 
 
 		 337 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3371  secretion protein HlyD  32.02 
 
 		 370 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.165029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1989  RND family efflux transporter MFP subunit  28.09 
 
 		 379 aa  104  2e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3927  RND family efflux transporter MFP subunit  26.55 
 
 		 392 aa  103  3e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4184  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.49 
 
 		 462 aa  104  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.267577  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4296  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.49 
 
 		 462 aa  104  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0091  RND family efflux transporter MFP subunit  29.57 
 
 		 394 aa  103  3e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.666427  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4085  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.56 
 
 		 342 aa  103  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4150  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.46 
 
 		 397 aa  103  4e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00923789  hitchhiker  0.000000297953 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1194  acriflavin resistance periplasmic protein  28.86 
 
 		 380 aa  103  5e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1999  RND family efflux transporter MFP subunit  26.69 
 
 		 390 aa  103  6e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00132105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4052  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.45 
 
 		 343 aa  102  7e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.048346  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2827  RND family efflux transporter MFP subunit  30.98 
 
 		 352 aa  102  8e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00918161  hitchhiker  0.00100699 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2100  RND family efflux transporter MFP subunit  29.56 
 
 		 379 aa  102  8e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0493506  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1925  HlyD family secretion protein  27.01 
 
 		 354 aa  101  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1440  secretion protein HlyD  28.57 
 
 		 376 aa  102  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2738  putative RND efflux membrane fusion protein  29.65 
 
 		 371 aa  102  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.254191  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_003296  RS03141  putative resistance transmembrane protein  29.39 
 
 		 449 aa  101  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.704547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3351  RND family efflux transporter MFP subunit  30.53 
 
 		 367 aa  101  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3743  RND family efflux transporter MFP subunit  33.23 
 
 		 374 aa  99.8  6e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4616  secretion protein HlyD  28.06 
 
 		 414 aa  99.8  6e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3942  cell wall surface anchor family protein  31.65 
 
 		 343 aa  99.4  8e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0664  RND family efflux transporter MFP subunit  24.84 
 
 		 342 aa  99  1e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.295272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5198  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.18 
 
 		 366 aa  98.6  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.197197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1737  secretion protein HlyD  26.65 
 
 		 360 aa  97.8  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000190652  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01736  HlyD family secretion protein  26.84 
 
 		 349 aa  98.6  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2514  acriflavin resistance protein B  24.66 
 
 		 371 aa  98.2  2e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.825279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0753  secretion protein HlyD  29.21 
 
 		 370 aa  97.4  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3700  secretion protein HlyD  27.36 
 
 		 381 aa  97.4  3e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3430  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.92 
 
 		 376 aa  97.4  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.516107  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2132  HlyD family secretion protein  26.37 
 
 		 360 aa  97.4  4e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.732379  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4492  secretion protein HlyD  28.4 
 
 		 382 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0226833 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0671  secretion protein HlyD  27.96 
 
 		 432 aa  96.7  5e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6009  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.9 
 
 		 356 aa  96.3  7e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.359632  normal  0.895367 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0535  secretion protein HlyD  25.21 
 
 		 366 aa  95.9  8e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1649  RND family efflux transporter MFP subunit  26.22 
 
 		 354 aa  95.9  8e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.499517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1783  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.05 
 
 		 354 aa  95.9  9e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2820  RND family efflux transporter MFP subunit  26.67 
 
 		 363 aa  95.9  9e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0120499  normal  0.368522 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1715  acriflavin resistance periplasmic protein  28.61 
 
 		 357 aa  95.9  9e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000921401  normal  0.0591325 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2370  secretion protein HlyD  28.21 
 
 		 405 aa  95.5  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000467489 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3608  secretion protein HlyD  26.6 
 
 		 400 aa  95.1  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.221607  normal  0.363906 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3761  secretion protein HlyD  32.42 
 
 		 364 aa  95.1  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2192  secretion protein HlyD  25.07 
 
 		 352 aa  95.9  1e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1281  RND family efflux transporter MFP subunit  27.5 
 
 		 386 aa  95.9  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0104305 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1830  RND family efflux transporter MFP subunit  25.81 
 
 		 359 aa  95.1  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.495597  normal  0.102007 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1209  RND family efflux transporter MFP subunit  28.87 
 
 		 381 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.421019  normal  0.31825 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3495  RND family efflux transporter MFP subunit  26.27 
 
 		 365 aa  95.1  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1741  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.1 
 
 		 381 aa  94.4  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>