More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2153 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA2153  HlyD family secretion protein  100 
 
 		 359 aa  703    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0206  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.84 
 
 		 386 aa  156  4e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1234  RND family efflux transporter MFP subunit  28.69 
 
 		 359 aa  155  1e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.580475  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0549  secretion protein HlyD  31.11 
 
 		 407 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000105  membrane-fusion protein  29.94 
 
 		 351 aa  139  4.999999999999999e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.860226  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3379  RND family efflux transporter MFP subunit  32.42 
 
 		 409 aa  139  6e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.189038 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1163  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.62 
 
 		 377 aa  139  7.999999999999999e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00317162  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0583  HlyD family secretion protein  32.44 
 
 		 334 aa  137  2e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0505  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.69 
 
 		 349 aa  127  3e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3102  AcrA/AcrE family protein  30.63 
 
 		 337 aa  124  2e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3467  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.07 
 
 		 376 aa  124  3e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00013135  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2794  RND family efflux transporter MFP subunit  29.37 
 
 		 337 aa  123  6e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000190782  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1389  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.71 
 
 		 374 aa  122  7e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000158934  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2774  RND family efflux transporter MFP subunit  29.37 
 
 		 337 aa  122  9e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000348854  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1584  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.37 
 
 		 337 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000223326  hitchhiker  0.000000000135699 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2473  RND family efflux transporter MFP subunit  29.37 
 
 		 340 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000483953  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2869  RND family efflux transporter MFP subunit  29.37 
 
 		 337 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000418866  normal  0.697235 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2000  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.66 
 
 		 360 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.461729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2367  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.66 
 
 		 360 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0980  RND family efflux transporter MFP subunit  32.19 
 
 		 361 aa  122  9.999999999999999e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233971 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0454  secretion protein HlyD  26.1 
 
 		 373 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.63564  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1455  RND family efflux transporter MFP subunit  32.74 
 
 		 345 aa  119  7e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1748  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.68 
 
 		 388 aa  119  7.999999999999999e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1615  RND family efflux transporter MFP subunit  28.62 
 
 		 347 aa  119  9e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000338384  decreased coverage  0.00000142207 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1394  RND family efflux transporter MFP subunit  27.43 
 
 		 337 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000175067  unclonable  0.0000000000192575 
 
 
-
 
NC_002950  PG0539  RND family efflux transporter MFP subunit  27.96 
 
 		 350 aa  117  3e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2046  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.25 
 
 		 442 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1128  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.61 
 
 		 354 aa  115  7.999999999999999e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.180858  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2181  AcrA/AcrE family protein  30.18 
 
 		 331 aa  115  7.999999999999999e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000164809  normal  0.0114896 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1459  RND family efflux transporter MFP subunit  26.84 
 
 		 337 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000143957  unclonable  0.0000312687 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1818  RND family efflux transporter MFP subunit  29.82 
 
 		 352 aa  115  2.0000000000000002e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000224471  normal  0.900766 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2949  RND family efflux transporter MFP subunit  28.75 
 
 		 376 aa  112  9e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.7 
 
 		 377 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.69897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1447  RND family efflux transporter MFP subunit  27 
 
 		 337 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000819965  unclonable  0.000000000091848 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3936  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.53 
 
 		 365 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00117548 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0664  RND family efflux transporter MFP subunit  26.39 
 
 		 342 aa  110  3e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.295272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3852  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.64 
 
 		 365 aa  109  8.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2610  RND family efflux transporter MFP subunit  26.81 
 
 		 362 aa  105  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000256578  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3773  RND family efflux transporter MFP subunit  30.45 
 
 		 384 aa  104  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.265534  normal  0.799504 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3414  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.46 
 
 		 1462 aa  103  5e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3303  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.97 
 
 		 358 aa  103  5e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5381  RND family efflux transporter MFP subunit  31.25 
 
 		 364 aa  103  6e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.996751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2439  RND family efflux transporter MFP subunit  28.43 
 
 		 338 aa  102  9e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000111994  hitchhiker  0.00120392 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3128  secretion protein HlyD  33.12 
 
 		 370 aa  101  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000130607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0059  RND family efflux transporter MFP subunit  31.1 
 
 		 411 aa  101  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0392  RND family efflux transporter MFP subunit  32.98 
 
 		 370 aa  100  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4229  RND family efflux transporter MFP subunit  32.44 
 
 		 371 aa  100  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0271349  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3344  secretion protein HlyD  32.97 
 
 		 333 aa  100  4e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.144623 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5559  secretion protein HlyD  34.67 
 
 		 366 aa  100  5e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16800  putative efflux transmembrane protein  28.42 
 
 		 367 aa  100  5e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0868415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2688  RND family efflux transporter MFP subunit  26.71 
 
 		 353 aa  99.8  6e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000000261317  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4180  RND family efflux transporter MFP subunit  33.33 
 
 		 366 aa  99.4  8e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.249201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1462  RND efflux membrane fusion protein precursor  28.42 
 
 		 367 aa  99.4  8e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1908  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.32 
 
 		 407 aa  98.2  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2396  secretion protein HlyD  31.71 
 
 		 346 aa  98.2  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2100  RND family efflux transporter MFP subunit  29.67 
 
 		 379 aa  96.3  7e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0493506  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1281  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.83 
 
 		 357 aa  96.3  8e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.036609  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1440  secretion protein HlyD  30.58 
 
 		 376 aa  95.9  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00705  cation efflux system protein  30.63 
 
 		 371 aa  95.1  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.333087  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4697  RND family efflux transporter MFP subunit  31.21 
 
 		 319 aa  94.7  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.715091  normal  0.20048 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3168  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.87 
 
 		 430 aa  95.1  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.479459  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3351  RND family efflux transporter MFP subunit  27.3 
 
 		 367 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5087  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.8 
 
 		 357 aa  94  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.156095  normal  0.0832308 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3758  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.89 
 
 		 379 aa  94  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3470  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.22 
 
 		 379 aa  94  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.430372  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0177  hypothetical protein  27.68 
 
 		 406 aa  93.2  6e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3720  RND family efflux pump membrane fusion protein  29.66 
 
 		 333 aa  92.8  7e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0718738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2657  cation or acridine efflux membrane fusion protein  25.67 
 
 		 357 aa  93.2  7e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2922  RND family efflux transporter MFP subunit  31.36 
 
 		 459 aa  92.8  8e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.363027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3060  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.6 
 
 		 424 aa  92.8  8e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0321  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.47 
 
 		 386 aa  92  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2972  secretion protein HlyD  32.6 
 
 		 429 aa  92.4  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3248  RND family efflux transporter MFP subunit  27.39 
 
 		 375 aa  92  1e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000122145  hitchhiker  0.000539204 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4150  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.06 
 
 		 397 aa  91.7  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00923789  hitchhiker  0.000000297953 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1520  RND family efflux transporter MFP subunit  29.06 
 
 		 370 aa  91.3  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.289277 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2074  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.47 
 
 		 353 aa  91.7  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.104068  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14330  Secretion protein HlyD family  28.88 
 
 		 401 aa  91.3  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.774042  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1393  RND family efflux transporter MFP subunit  30.03 
 
 		 336 aa  90.9  3e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.283245  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2370  secretion protein HlyD  28.45 
 
 		 405 aa  90.5  4e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000467489 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3761  secretion protein HlyD  31.36 
 
 		 364 aa  90.5  4e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0212  secretion protein HlyD  24.28 
 
 		 364 aa  90.5  4e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.59943 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0653  RND family efflux transporter MFP subunit  28.22 
 
 		 409 aa  90.5  4e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.356164  normal  0.176029 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0110  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.02 
 
 		 360 aa  90.1  6e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0109  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.02 
 
 		 360 aa  90.1  6e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2552  secretion protein HlyD  27.59 
 
 		 451 aa  89.7  6e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.603084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0200  secretion protein HlyD  25.27 
 
 		 365 aa  89.4  8e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0859  HlyD family secretion protein  28.07 
 
 		 372 aa  89.7  8e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.585057  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0916  HlyD family secretion protein  28.07 
 
 		 372 aa  89  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3743  RND family efflux transporter MFP subunit  29.32 
 
 		 374 aa  89  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1311  HlyD family secretion protein  27.85 
 
 		 357 aa  88.6  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3608  secretion protein HlyD  27.83 
 
 		 400 aa  88.2  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.221607  normal  0.363906 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1549  RND family efflux transporter MFP subunit  29.19 
 
 		 402 aa  88.2  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0618  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  25.39 
 
 		 268 aa  88.2  2e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0830  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.02 
 
 		 390 aa  88.6  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1036  RND family efflux transporter MFP subunit  23.77 
 
 		 354 aa  88.2  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2338  RND family efflux transporter MFP subunit  25.9 
 
 		 360 aa  88.2  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00136978  hitchhiker  0.0000141161 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2410  RND family efflux transporter MFP subunit  25.9 
 
 		 360 aa  88.2  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000315716  hitchhiker  0.00636413 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1658  RND family efflux transporter MFP subunit  25.9 
 
 		 360 aa  87.8  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000232607  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3556  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.96 
 
 		 433 aa  88.6  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2615  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.82 
 
 		 380 aa  87.4  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.909785  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>