More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1281 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_1281  RND family efflux transporter MFP subunit  100 
 
 		 386 aa  756    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0104305 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4105  secretion protein HlyD  39.6 
 
 		 383 aa  179  8e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0739298  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3024  secretion protein HlyD  36.98 
 
 		 363 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.756641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4833  RND family efflux transporter MFP subunit  38.49 
 
 		 392 aa  168  2e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4022  RND family efflux transporter MFP subunit  38.73 
 
 		 390 aa  167  2.9999999999999998e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.780048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2968  RND family efflux transporter MFP subunit  32.94 
 
 		 413 aa  167  4e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0222457 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0807  RND family efflux transporter MFP subunit  36.87 
 
 		 358 aa  166  5e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.347683 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3372  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.73 
 
 		 390 aa  165  1.0000000000000001e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0461986  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2136  putative transporter lipoprotein transmembrane  37.58 
 
 		 391 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.123404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3965  RND family efflux transporter MFP subunit  36.9 
 
 		 362 aa  163  5.0000000000000005e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000185194 
 
 
-
 
NC_003296  RS03087  putative cation-efflux system signal peptide protein  36.42 
 
 		 375 aa  162  7e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.297372 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2411  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.2 
 
 		 410 aa  159  8e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.733291  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0458  secretion protein HlyD  35.71 
 
 		 378 aa  155  9e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.217472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3901  RND family efflux transporter MFP subunit  35.41 
 
 		 396 aa  152  7e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.843954  normal  0.11743 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5614  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.37 
 
 		 357 aa  152  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4663  RND family efflux transporter MFP subunit  38.16 
 
 		 394 aa  152  1e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0396  RND family efflux transporter MFP subunit  32.47 
 
 		 413 aa  149  6e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7484  HlyD family secretion protein  33.43 
 
 		 351 aa  149  7e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.832684  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0429  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.47 
 
 		 413 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0465  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.18 
 
 		 413 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.254107  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4544  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.92 
 
 		 379 aa  145  1e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.80936 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3472  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.92 
 
 		 379 aa  145  1e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.000321827  normal  0.111591 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2621  secretion protein HlyD  34 
 
 		 367 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.15044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4108  putative secretion protein (HlyD)  31.91 
 
 		 391 aa  137  4e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.331978  normal  0.146318 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7282  HlyD family secretion protein  27.96 
 
 		 377 aa  136  6.0000000000000005e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.548499  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01779  transporter lipoprotein transmembrane  33.43 
 
 		 1405 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0040  secretion protein HlyD  36.25 
 
 		 389 aa  135  9.999999999999999e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1373  RND family efflux transporter MFP subunit  34.15 
 
 		 409 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000149577 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4745  RND family efflux transporter MFP subunit  34.74 
 
 		 393 aa  129  6e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.19985 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0471  secretion protein HlyD  32.28 
 
 		 404 aa  129  9.000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2377  RND family efflux transporter MFP subunit  32.95 
 
 		 609 aa  125  1e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.40782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2374  RND family efflux transporter MFP subunit  29.3 
 
 		 395 aa  124  4e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.347836 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5104  RND family efflux transporter MFP subunit  29.29 
 
 		 427 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5660  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.66 
 
 		 371 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.852771  normal  0.84907 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3463  HlyD family secretion protein  29.78 
 
 		 378 aa  116  5e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4394  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.2 
 
 		 414 aa  117  5e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.440743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4289  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.24 
 
 		 402 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0321009 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1149  RND family efflux transporter MFP subunit  31.04 
 
 		 426 aa  115  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3921  RND family efflux transporter MFP subunit  29.94 
 
 		 402 aa  114  3e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.316668 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3888  Fis family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 389 aa  113  4.0000000000000004e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0700006  normal  0.958295 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5381  RND family efflux transporter MFP subunit  28.53 
 
 		 364 aa  111  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.996751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1163  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.68 
 
 		 377 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00317162  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2000  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.15 
 
 		 360 aa  106  8e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.461729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2367  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.15 
 
 		 360 aa  106  8e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004022  membrane-fusion protein  29.22 
 
 		 369 aa  104  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000160707  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6756  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.43 
 
 		 411 aa  105  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.425768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0618  RND family efflux transporter MFP subunit  27.95 
 
 		 387 aa  104  3e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1629  RND family efflux transporter MFP subunit  26.17 
 
 		 358 aa  104  3e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.185382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1704  RND family efflux transporter MFP subunit  26.17 
 
 		 358 aa  103  3e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.271919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4033  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.97 
 
 		 396 aa  103  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1334  putative RND efflux membrane fusion protein precursor  30.82 
 
 		 393 aa  103  4e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0169276  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1666  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.67 
 
 		 396 aa  102  9e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0854593  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01444  hypothetical protein  28.49 
 
 		 350 aa  102  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3467  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.74 
 
 		 376 aa  102  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00013135  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1504  RND family efflux transporter MFP subunit  34.1 
 
 		 397 aa  101  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0583737 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3826  RND family efflux transporter MFP subunit  29.08 
 
 		 385 aa  101  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1660  RND family efflux transporter MFP subunit  29.63 
 
 		 369 aa  101  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0062  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.88 
 
 		 358 aa  100  4e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0123174  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1704  RND family efflux transporter MFP subunit  25.56 
 
 		 354 aa  100  5e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0644  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.25 
 
 		 425 aa  100  6e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0200148  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2484  secretion protein HlyD  30.46 
 
 		 369 aa  99.8  7e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00634188  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3299  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.51 
 
 		 396 aa  99.8  8e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.167372 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0428  RND family efflux transporter MFP subunit  30.32 
 
 		 408 aa  99.4  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0182364 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2928  secretion protein HlyD  28.12 
 
 		 347 aa  98.6  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.7039  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2400  secretion protein HlyD  28.42 
 
 		 440 aa  98.2  2e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.705753 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2903  RND family efflux transporter MFP subunit  32.11 
 
 		 383 aa  98.2  2e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2854  cation efflux transporter  32.65 
 
 		 386 aa  97.8  3e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.405755  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0266  RND family efflux transporter MFP subunit  29.02 
 
 		 375 aa  97.4  3e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.987776 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1439  RND family efflux transporter MFP subunit  32.65 
 
 		 390 aa  97.4  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0228236 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2275  RND family efflux transporter MFP subunit  24.52 
 
 		 354 aa  97.4  4e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0060878  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0454  secretion protein HlyD  24.22 
 
 		 373 aa  96.7  6e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.63564  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0091  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.51 
 
 		 306 aa  96.7  6e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0753  secretion protein HlyD  27.95 
 
 		 370 aa  96.3  7e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2514  RND family efflux transporter MFP subunit  26.23 
 
 		 354 aa  96.3  8e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000208657  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3579  putative transmembrane multidrug efflux system transmembrane protein  29.97 
 
 		 414 aa  96.3  9e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0438  hypothetical protein  27.91 
 
 		 352 aa  95.5  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000000466929  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1830  RND family efflux transporter MFP subunit  25.61 
 
 		 359 aa  95.9  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.495597  normal  0.102007 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3735  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.21 
 
 		 362 aa  95.5  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3044  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.54 
 
 		 396 aa  95.1  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0930  RND family efflux transporter MFP subunit  31.61 
 
 		 366 aa  94.7  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2046  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.19 
 
 		 442 aa  95.5  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1455  RND family efflux transporter MFP subunit  28.06 
 
 		 345 aa  95.5  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1067  secretion protein HlyD  25.99 
 
 		 364 aa  95.1  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.133207 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1925  HlyD family secretion protein  25.57 
 
 		 354 aa  94.4  3e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1186  RND family efflux transporter MFP subunit  29.89 
 
 		 374 aa  94.4  3e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.425099  normal  0.0297054 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1021  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.28 
 
 		 390 aa  94.7  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0159772  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5088  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.81 
 
 		 361 aa  94  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.857117  normal  0.0828727 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2243  RND family efflux transporter MFP subunit  30.12 
 
 		 376 aa  94  4e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6340  secretion protein HlyD  27.85 
 
 		 369 aa  94  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.900675  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1781  RND family efflux transporter MFP subunit  24.05 
 
 		 368 aa  94  4e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.253325  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1739  RND family efflux transporter MFP subunit  27.85 
 
 		 369 aa  94  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.357806  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0539  RND family efflux transporter MFP subunit  27.02 
 
 		 350 aa  93.6  5e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1830  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.9 
 
 		 354 aa  93.6  5e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000238284  normal  0.23398 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2521  RND family efflux transporter MFP subunit  25.9 
 
 		 354 aa  93.6  5e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.199325  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1660  RND family efflux transporter MFP subunit  28.77 
 
 		 361 aa  94  5e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1649  RND family efflux transporter MFP subunit  24.6 
 
 		 354 aa  93.6  6e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.499517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2426  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.89 
 
 		 365 aa  93.6  6e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.54628  hitchhiker  0.0000000883837 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0764  RND family efflux transporter MFP subunit  27.54 
 
 		 385 aa  93.6  6e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1421  HlyD family secretion protein  26.64 
 
 		 354 aa  93.2  7e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0100677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1613  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.58 
 
 		 346 aa  92.8  8e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>