More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4745 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4745  RND family efflux transporter MFP subunit  100 
 
 		 393 aa  767    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.19985 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0471  secretion protein HlyD  57.82 
 
 		 404 aa  392  1e-108  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0040  secretion protein HlyD  59.34 
 
 		 389 aa  375  1e-102  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1149  RND family efflux transporter MFP subunit  34.08 
 
 		 426 aa  151  2e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1281  RND family efflux transporter MFP subunit  34.74 
 
 		 386 aa  129  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0104305 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1439  RND family efflux transporter MFP subunit  32.82 
 
 		 390 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0228236 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0396  RND family efflux transporter MFP subunit  33.52 
 
 		 413 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0807  RND family efflux transporter MFP subunit  30.64 
 
 		 358 aa  126  7e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.347683 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2854  cation efflux transporter  32.82 
 
 		 386 aa  125  9e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.405755  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0429  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.52 
 
 		 413 aa  125  1e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0465  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.03 
 
 		 413 aa  125  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.254107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2374  RND family efflux transporter MFP subunit  31.11 
 
 		 395 aa  122  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.347836 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5104  RND family efflux transporter MFP subunit  32.83 
 
 		 427 aa  120  3e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1504  RND family efflux transporter MFP subunit  31.6 
 
 		 397 aa  119  7e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0583737 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3463  HlyD family secretion protein  29.73 
 
 		 378 aa  115  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3024  secretion protein HlyD  30.12 
 
 		 363 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.756641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4833  RND family efflux transporter MFP subunit  32.06 
 
 		 392 aa  114  3e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3372  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.85 
 
 		 390 aa  113  5e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0461986  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2400  secretion protein HlyD  30.42 
 
 		 440 aa  113  6e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.705753 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4663  RND family efflux transporter MFP subunit  35.45 
 
 		 394 aa  112  9e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0428  RND family efflux transporter MFP subunit  31.99 
 
 		 408 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0182364 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1373  RND family efflux transporter MFP subunit  33.43 
 
 		 409 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000149577 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3826  RND family efflux transporter MFP subunit  31.64 
 
 		 385 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4022  RND family efflux transporter MFP subunit  34.55 
 
 		 390 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.780048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3888  Fis family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 389 aa  108  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0700006  normal  0.958295 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4616  secretion protein HlyD  28.87 
 
 		 414 aa  107  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7484  HlyD family secretion protein  28.75 
 
 		 351 aa  107  4e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.832684  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3044  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.24 
 
 		 396 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1079  secretion protein HlyD  31.03 
 
 		 366 aa  105  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.984606 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4105  secretion protein HlyD  31.58 
 
 		 383 aa  105  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0739298  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3299  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.65 
 
 		 396 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.167372 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3760  secretion protein HlyD  30.47 
 
 		 362 aa  104  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.196565 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3901  RND family efflux transporter MFP subunit  32.34 
 
 		 396 aa  103  4e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.843954  normal  0.11743 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4033  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.86 
 
 		 396 aa  103  5e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3921  RND family efflux transporter MFP subunit  30.92 
 
 		 402 aa  103  7e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.316668 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4394  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.52 
 
 		 414 aa  103  7e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.440743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2928  secretion protein HlyD  29.5 
 
 		 347 aa  102  9e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.7039  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2411  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.6 
 
 		 410 aa  102  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.733291  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4289  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.64 
 
 		 402 aa  102  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0321009 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1666  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.57 
 
 		 396 aa  102  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0854593  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0793  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.84 
 
 		 390 aa  101  2e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1462  RND efflux membrane fusion protein precursor  30.24 
 
 		 367 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2377  RND family efflux transporter MFP subunit  29.96 
 
 		 609 aa  101  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.40782  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3965  RND family efflux transporter MFP subunit  31.79 
 
 		 362 aa  100  4e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000185194 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4102  RND family efflux transporter MFP subunit  32.18 
 
 		 366 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0091  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.33 
 
 		 306 aa  100  4e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4108  putative secretion protein (HlyD)  28.02 
 
 		 391 aa  100  6e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.331978  normal  0.146318 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0767  RND family efflux transporter MFP subunit  30.11 
 
 		 372 aa  100  6e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00075698  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1516  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.07 
 
 		 366 aa  99  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1955  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.57 
 
 		 400 aa  98.6  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.159137  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4207  RND family efflux transporter MFP subunit  32.07 
 
 		 366 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.647045 
 
 
-
 
NC_003296  RS03087  putative cation-efflux system signal peptide protein  30.82 
 
 		 375 aa  98.2  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.297372 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1122  RND family efflux transporter MFP subunit  31.49 
 
 		 366 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16800  putative efflux transmembrane protein  29.55 
 
 		 367 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0868415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2214  putative component of multidrug efflux system  31.09 
 
 		 368 aa  97.1  5e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.082194  normal  0.474627 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1462  RND family efflux transporter MFP subunit  29.89 
 
 		 418 aa  96.7  6e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2353  RND family efflux transporter MFP subunit  28.7 
 
 		 442 aa  95.9  1e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3204  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.13 
 
 		 368 aa  95.5  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2532  secretion protein HlyD  33.33 
 
 		 359 aa  95.5  1e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.19676  normal  0.860631 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1828  secretion protein HlyD  30.08 
 
 		 406 aa  95.9  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01940  putative RND efflux membrane fusion protein precursor  27.38 
 
 		 383 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.34804 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0458  secretion protein HlyD  29.7 
 
 		 378 aa  93.6  5e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.217472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0234  RND efflux membrane fusion protein precursor  27.38 
 
 		 367 aa  93.6  5e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1704  RND family efflux transporter MFP subunit  26.92 
 
 		 358 aa  93.6  6e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.271919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1385  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.67 
 
 		 380 aa  92.8  9e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0605754  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0753  secretion protein HlyD  27.72 
 
 		 370 aa  92.8  9e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2136  putative transporter lipoprotein transmembrane  30.38 
 
 		 391 aa  92.8  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.123404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.22 
 
 		 377 aa  91.3  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.69897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1660  RND family efflux transporter MFP subunit  27.76 
 
 		 361 aa  92  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2968  RND family efflux transporter MFP subunit  30.84 
 
 		 413 aa  91.7  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0222457 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5035  HlyD family secretion protein  27.71 
 
 		 396 aa  91.3  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.611497 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1451  RND family efflux transporter MFP subunit  28.75 
 
 		 369 aa  91.7  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.513769  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1629  RND family efflux transporter MFP subunit  26.6 
 
 		 358 aa  92  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.185382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1704  RND family efflux transporter MFP subunit  27.42 
 
 		 354 aa  90.9  3e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2557  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.47 
 
 		 356 aa  90.5  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000000027885  normal  0.211023 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2552  secretion protein HlyD  27.58 
 
 		 451 aa  90.5  4e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.603084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0344  secretion protein HlyD  27.7 
 
 		 372 aa  90.1  6e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.525441 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2275  RND family efflux transporter MFP subunit  26.82 
 
 		 354 aa  90.1  6e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0060878  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2666  RND family efflux transporter MFP subunit  25.9 
 
 		 387 aa  89.7  8e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1943  secretion protein HlyD  31.08 
 
 		 523 aa  89.7  8e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.354822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1660  RND family efflux transporter MFP subunit  26.63 
 
 		 369 aa  89.7  8e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2849  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.58 
 
 		 421 aa  89.7  8e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0325844 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0859  HlyD family secretion protein  28.66 
 
 		 372 aa  89.7  9e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.585057  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1925  HlyD family secretion protein  26.77 
 
 		 354 aa  89.7  9e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3340  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.09 
 
 		 379 aa  89  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0916  HlyD family secretion protein  28.66 
 
 		 372 aa  89  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1372  secretion protein HlyD  31.96 
 
 		 405 aa  89  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.203736  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1640  CmeA  27.76 
 
 		 386 aa  89.4  1e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3470  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.3 
 
 		 379 aa  88.6  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.430372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5614  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.27 
 
 		 357 aa  88.6  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5193  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.78 
 
 		 372 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0429  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.14 
 
 		 361 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3608  secretion protein HlyD  28.75 
 
 		 400 aa  88.6  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.221607  normal  0.363906 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4651  RND family efflux transporter MFP subunit  28.57 
 
 		 402 aa  89  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.611035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2084  RND efflux membrane fusion protein  29.57 
 
 		 427 aa  87.8  3e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1649  RND family efflux transporter MFP subunit  27.8 
 
 		 354 aa  88.2  3e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.499517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3411  secretion protein HlyD  29.55 
 
 		 363 aa  87.8  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.591463  normal  0.695679 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3351  RND family efflux transporter MFP subunit  29.31 
 
 		 367 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2192  secretion protein HlyD  25.22 
 
 		 352 aa  87.8  3e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1830  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.82 
 
 		 354 aa  87.8  3e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000238284  normal  0.23398 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>