More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3044 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3044  efflux transporter, RND family, MFP subunit  100 
 
 		 396 aa  776    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3299  efflux transporter, RND family, MFP subunit  93.69 
 
 		 396 aa  652    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.167372 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2374  RND family efflux transporter MFP subunit  54.16 
 
 		 395 aa  415  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.347836 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3463  HlyD family secretion protein  54.14 
 
 		 378 aa  390  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1504  RND family efflux transporter MFP subunit  45.81 
 
 		 397 aa  290  3e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0583737 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2854  cation efflux transporter  46.07 
 
 		 386 aa  280  2e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.405755  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1439  RND family efflux transporter MFP subunit  45.79 
 
 		 390 aa  278  1e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0228236 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5104  RND family efflux transporter MFP subunit  36.31 
 
 		 427 aa  205  1e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3921  RND family efflux transporter MFP subunit  38.46 
 
 		 402 aa  203  4e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.316668 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4289  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.46 
 
 		 402 aa  202  6e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0321009 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4108  putative secretion protein (HlyD)  35.71 
 
 		 391 aa  195  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.331978  normal  0.146318 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3826  RND family efflux transporter MFP subunit  34.88 
 
 		 385 aa  194  2e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0428  RND family efflux transporter MFP subunit  34.88 
 
 		 408 aa  191  1e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0182364 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1149  RND family efflux transporter MFP subunit  34.66 
 
 		 426 aa  192  1e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4033  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.86 
 
 		 396 aa  191  1e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1666  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.86 
 
 		 396 aa  191  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0854593  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4394  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.05 
 
 		 414 aa  190  4e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.440743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0396  RND family efflux transporter MFP subunit  32.95 
 
 		 413 aa  181  2e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0465  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.76 
 
 		 413 aa  178  2e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.254107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0429  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.02 
 
 		 413 aa  177  3e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3888  Fis family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 389 aa  175  9.999999999999999e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0700006  normal  0.958295 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1373  RND family efflux transporter MFP subunit  33.43 
 
 		 409 aa  152  7e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000149577 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4685  secretion protein HlyD  42.7 
 
 		 312 aa  135  9e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.543199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3039  secretion protein HlyD  39.46 
 
 		 301 aa  133  3.9999999999999996e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2136  putative transporter lipoprotein transmembrane  31.4 
 
 		 391 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.123404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2928  secretion protein HlyD  29.58 
 
 		 347 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.7039  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4022  RND family efflux transporter MFP subunit  31.14 
 
 		 390 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.780048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1002  secretion protein HlyD  40.54 
 
 		 307 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.677003  normal  0.658036 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3372  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.43 
 
 		 390 aa  130  5.0000000000000004e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0461986  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3605  secretion protein HlyD  40.54 
 
 		 300 aa  129  7.000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.550781  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5163  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.08 
 
 		 298 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0471  secretion protein HlyD  32.46 
 
 		 404 aa  127  3e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1893  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.25 
 
 		 351 aa  124  3e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4833  RND family efflux transporter MFP subunit  29.17 
 
 		 392 aa  124  4e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0549  hypothetical protein  39.34 
 
 		 296 aa  122  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4663  RND family efflux transporter MFP subunit  30 
 
 		 394 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2621  secretion protein HlyD  31.04 
 
 		 367 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.15044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0890  secretion protein HlyD  36.79 
 
 		 306 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.459513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4105  secretion protein HlyD  30.79 
 
 		 383 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0739298  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3024  secretion protein HlyD  31.42 
 
 		 363 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.756641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3965  RND family efflux transporter MFP subunit  30.15 
 
 		 362 aa  113  6e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000185194 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0918  RND family efflux transporter MFP subunit  32.99 
 
 		 302 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.523672  normal  0.981132 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3901  RND family efflux transporter MFP subunit  29.97 
 
 		 396 aa  112  2.0000000000000002e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.843954  normal  0.11743 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0091  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.57 
 
 		 306 aa  110  3e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0807  RND family efflux transporter MFP subunit  30.37 
 
 		 358 aa  110  5e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.347683 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4745  RND family efflux transporter MFP subunit  28.7 
 
 		 393 aa  110  6e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.19985 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0458  secretion protein HlyD  31.13 
 
 		 378 aa  107  4e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.217472  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3472  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.73 
 
 		 379 aa  107  5e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.000321827  normal  0.111591 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4544  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.73 
 
 		 379 aa  107  5e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.80936 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2552  secretion protein HlyD  28.94 
 
 		 451 aa  105  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.603084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1328  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.88 
 
 		 297 aa  105  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4041  hypothetical protein  30.06 
 
 		 366 aa  103  7e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0513022 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0206  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.88 
 
 		 386 aa  102  1e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0753  secretion protein HlyD  29.71 
 
 		 370 aa  100  6e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0764  RND family efflux transporter MFP subunit  27.23 
 
 		 385 aa  100  6e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1281  RND family efflux transporter MFP subunit  27.9 
 
 		 386 aa  99.4  9e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0104305 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0549  secretion protein HlyD  27.06 
 
 		 407 aa  99.4  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2377  RND family efflux transporter MFP subunit  32.91 
 
 		 609 aa  99  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.40782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5614  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.53 
 
 		 357 aa  96.7  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0040  secretion protein HlyD  28.06 
 
 		 389 aa  95.9  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16800  putative efflux transmembrane protein  28.19 
 
 		 367 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0868415  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2411  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.01 
 
 		 410 aa  95.1  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.733291  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3611  secretion protein HlyD  34.97 
 
 		 295 aa  94.7  3e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.711693  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1462  RND efflux membrane fusion protein precursor  27.89 
 
 		 367 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2968  RND family efflux transporter MFP subunit  29.39 
 
 		 413 aa  94.4  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0222457 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0161  RND family efflux transporter MFP subunit  26.22 
 
 		 380 aa  94.4  3e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4563  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.18 
 
 		 426 aa  94  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3030  secretion protein HlyD  33.88 
 
 		 306 aa  93.6  5e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0446257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1186  RND family efflux transporter MFP subunit  26.52 
 
 		 374 aa  93.6  5e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.425099  normal  0.0297054 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.48 
 
 		 377 aa  92.8  9e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.69897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0886  secretion protein HlyD  34.44 
 
 		 306 aa  91.3  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.795308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0895  secretion protein HlyD  30.7 
 
 		 322 aa  90.1  6e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7484  HlyD family secretion protein  26.02 
 
 		 351 aa  90.1  6e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.832684  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0067  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.83 
 
 		 453 aa  90.1  6e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2973  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.79 
 
 		 448 aa  90.1  7e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0505  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.47 
 
 		 349 aa  89.7  8e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5160  secretion protein HlyD  29.32 
 
 		 295 aa  89.7  8e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.528553  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0949  RND family efflux transporter MFP subunit  29.55 
 
 		 390 aa  89.4  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2865  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.12 
 
 		 478 aa  89.4  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0716848 
 
 
-
 
NC_003296  RS02378  cation transporter transmembrane protein  28.17 
 
 		 382 aa  89  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.571869  normal  0.441465 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0635  RND family efflux transporter MFP subunit  27.06 
 
 		 406 aa  89  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.320707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0607  RND family efflux transporter MFP subunit  27.06 
 
 		 406 aa  89.4  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2949  RND family efflux transporter MFP subunit  24.93 
 
 		 376 aa  88.6  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0908  HlyD family secretion protein  34.5 
 
 		 300 aa  88.2  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3531  secretion protein HlyD  28.49 
 
 		 400 aa  87.8  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2777  RND family efflux transporter MFP subunit  30 
 
 		 489 aa  87.8  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000975793  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2452  RND family efflux transporter MFP subunit  28.15 
 
 		 428 aa  87.4  4e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.591296 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1943  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.49 
 
 		 450 aa  87.4  4e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2370  secretion protein HlyD  28.81 
 
 		 405 aa  87.4  4e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000467489 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2665  RND family efflux transporter MFP subunit  28.34 
 
 		 386 aa  87  5e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4005  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.78 
 
 		 387 aa  87  5e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3711  RND family efflux transporter MFP subunit  28.11 
 
 		 389 aa  87  5e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1526  RND family efflux transporter MFP subunit  28.12 
 
 		 423 aa  86.7  7e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.692168  normal  0.0164989 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1122  RND family efflux transporter MFP subunit  28.48 
 
 		 366 aa  86.7  7e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1748  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.96 
 
 		 388 aa  86.3  9e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1007  secretion protein HlyD  29.37 
 
 		 317 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.163323  normal  0.0478945 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2046  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.94 
 
 		 442 aa  85.5  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1337  HlyD family secretion protein  32.75 
 
 		 293 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2400  secretion protein HlyD  24.93 
 
 		 440 aa  85.1  0.000000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.705753 
 
 
-
 
NC_003296  RS03087  putative cation-efflux system signal peptide protein  28.65 
 
 		 375 aa  84.7  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.297372 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>