More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4041 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_4041  hypothetical protein  100 
 
 
366 aa  729    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0513022 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3749  RND family efflux transporter MFP subunit  48.21 
 
 
340 aa  285  1.0000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0913  hypothetical protein  35.8 
 
 
338 aa  211  1e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0882  hypothetical protein  36.11 
 
 
338 aa  211  1e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2533  RND family efflux transporter MFP subunit  40.06 
 
 
343 aa  206  4e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.66716  normal  0.672833 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2977  RND family efflux transporter MFP subunit  36.39 
 
 
401 aa  174  2.9999999999999996e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.540318  normal  0.494242 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1921  RND family efflux transporter MFP subunit  30.95 
 
 
340 aa  124  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00271277  normal  0.413551 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1695  secretion protein HlyD  29.39 
 
 
360 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1621  secretion protein HlyD  28.42 
 
 
407 aa  114  3e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1339  RND family efflux transporter MFP subunit  27.45 
 
 
384 aa  112  8.000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.611384  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4226  RND family efflux transporter MFP subunit  26.6 
 
 
426 aa  109  9.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.499264  normal  0.926991 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3531  secretion protein HlyD  26.26 
 
 
400 aa  103  4e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445744  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0539  RND family efflux transporter MFP subunit  28.81 
 
 
350 aa  103  5e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2825  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.32 
 
 
476 aa  103  6e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.292175  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0487  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.5 
 
 
360 aa  102  1e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0480  RND family efflux transporter MFP subunit  26.83 
 
 
363 aa  102  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0558  secretion protein HlyD  27.57 
 
 
360 aa  101  2e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.177986  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13141  membrane fusion protein  24.75 
 
 
353 aa  101  2e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1462  RND family efflux transporter MFP subunit  30.39 
 
 
418 aa  101  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2704  RND family efflux transporter MFP subunit  30 
 
 
538 aa  102  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.534684  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13281  membrane fusion protein  24.75 
 
 
353 aa  101  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.403546  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13031  membrane fusion protein  25.08 
 
 
353 aa  100  6e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.560639  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2184  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30 
 
 
537 aa  99.4  9e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.580159  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0463  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.59 
 
 
414 aa  99  1e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0161  RND family efflux transporter MFP subunit  30.03 
 
 
380 aa  98.6  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7982  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.57 
 
 
486 aa  99  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.318672  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2074  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.25 
 
 
353 aa  99.4  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.104068  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0883  RND family efflux transporter MFP subunit  28.25 
 
 
363 aa  99  1e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2275  RND family efflux transporter MFP subunit  26.23 
 
 
354 aa  99  1e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0060878  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2381  RND family efflux transporter MFP subunit  27.18 
 
 
357 aa  98.6  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1704  RND family efflux transporter MFP subunit  23.77 
 
 
354 aa  98.2  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0080  RND family efflux transporter MFP subunit  27.22 
 
 
414 aa  97.4  3e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.95759  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0769  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.41 
 
 
322 aa  97.4  3e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.100875  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1186  RND family efflux transporter MFP subunit  30.84 
 
 
374 aa  97.4  3e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.425099  normal  0.0297054 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2872  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.87 
 
 
387 aa  97.1  4e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1704  RND family efflux transporter MFP subunit  24.07 
 
 
358 aa  97.4  4e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.271919  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1482  RND family efflux transporter MFP subunit  29.19 
 
 
537 aa  97.1  5e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0952522  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1079  secretion protein HlyD  28.67 
 
 
366 aa  96.7  6e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.984606 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1385  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.69 
 
 
380 aa  96.7  6e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0605754  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1815  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.83 
 
 
388 aa  96.3  8e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.100454  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4050  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  28.63 
 
 
517 aa  96.3  8e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0431  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.63 
 
 
368 aa  95.9  9e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1925  HlyD family secretion protein  24.35 
 
 
354 aa  95.9  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1455  RND family efflux transporter MFP subunit  31.67 
 
 
345 aa  95.9  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0747  secretion protein HlyD  25.42 
 
 
357 aa  95.1  1e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.554021  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3044  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.06 
 
 
396 aa  95.5  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2514  RND family efflux transporter MFP subunit  23.48 
 
 
354 aa  95.5  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000208657  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1235  secretion protein HlyD  24.41 
 
 
353 aa  95.5  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.681968  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1636  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.53 
 
 
383 aa  95.5  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.372421  normal  0.934491 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1629  RND family efflux transporter MFP subunit  23.78 
 
 
358 aa  95.5  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.185382  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3299  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.69 
 
 
396 aa  94.7  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.167372 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3977  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.19 
 
 
512 aa  95.1  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1830  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.48 
 
 
354 aa  94.7  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000238284  normal  0.23398 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1685  RND family efflux transporter MFP subunit  27.52 
 
 
387 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.261181  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2521  RND family efflux transporter MFP subunit  23.48 
 
 
354 aa  94.7  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.199325  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3828  secretion protein HlyD  27.46 
 
 
430 aa  95.1  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2532  secretion protein HlyD  28.39 
 
 
363 aa  94.7  2e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0703  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.14 
 
 
355 aa  95.1  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0322  RND family efflux transporter MFP subunit  31.23 
 
 
353 aa  95.1  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0619651 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1298  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.32 
 
 
410 aa  94.4  3e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.61066  normal  0.83964 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0901  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.87 
 
 
351 aa  94.4  3e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.470272  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0090  putative multidrug transporter, HlyD family  24.53 
 
 
368 aa  94  3e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5381  RND family efflux transporter MFP subunit  28.49 
 
 
364 aa  94.4  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.996751  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1440  secretion protein HlyD  31.88 
 
 
376 aa  94.4  3e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5358  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.95 
 
 
396 aa  94.4  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1970  secretion protein HlyD  28.05 
 
 
390 aa  94  4e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0699832  normal  0.38447 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001980  probable RND efflux membrane fusion protein  25.33 
 
 
367 aa  94  4e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.979341  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0321  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.56 
 
 
386 aa  94  4e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1857  secretion protein HlyD  25.95 
 
 
390 aa  94  4e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.779454 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1036  RND family efflux transporter MFP subunit  24.54 
 
 
354 aa  94  4e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2634  RND family efflux transporter MFP subunit  23.48 
 
 
354 aa  93.6  5e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.182724  normal  0.987528 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0549  secretion protein HlyD  27.19 
 
 
407 aa  93.6  5e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1781  RND family efflux transporter MFP subunit  27.36 
 
 
368 aa  93.2  6e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.253325  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1469  secretion protein HlyD  24.93 
 
 
421 aa  93.2  6e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.910926 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3379  RND family efflux transporter MFP subunit  36.36 
 
 
409 aa  93.2  6e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.189038 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0200  secretion protein HlyD  26.43 
 
 
365 aa  92.8  7e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1421  HlyD family secretion protein  28.3 
 
 
354 aa  92.8  8e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0100677  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2367  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.93 
 
 
360 aa  92.4  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2000  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.93 
 
 
360 aa  92.4  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.461729  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0105  RND family efflux transporter MFP subunit  23.17 
 
 
348 aa  92  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2479  secretion protein HlyD  32.73 
 
 
504 aa  92.4  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.518843  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1372  secretion protein HlyD  25.93 
 
 
405 aa  92  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.203736  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3700  secretion protein HlyD  33.09 
 
 
381 aa  92.4  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01077  HlyD family secretion protein  23.47 
 
 
376 aa  92.4  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2011  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.23 
 
 
361 aa  91.7  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1847  putative efflux transporter  25.2 
 
 
421 aa  91.3  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3518  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.55 
 
 
376 aa  91.7  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0467  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.15 
 
 
360 aa  91.3  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2557  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.28 
 
 
356 aa  91.7  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000000027885  normal  0.211023 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.08 
 
 
377 aa  92  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.69897  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4111  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.05 
 
 
494 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1334  secretion protein HlyD  25.61 
 
 
410 aa  90.9  3e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1407  secretion protein HlyD  34.68 
 
 
540 aa  90.9  3e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4563  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.23 
 
 
426 aa  90.9  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1713  multidrug resistance efflux pump-like protein  25.48 
 
 
392 aa  90.9  3e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.254154  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3848  RND family efflux transporter MFP subunit  22.76 
 
 
361 aa  90.9  3e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.918542  normal  0.711455 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0753  secretion protein HlyD  28.95 
 
 
370 aa  90.5  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5556  HlyD family secretion protein  28.33 
 
 
460 aa  90.9  4e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.357056  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12131  membrane fusion protein  26.28 
 
 
356 aa  90.9  4e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.502636 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1047  RND family efflux transporter subunit MFP  25.07 
 
 
461 aa  90.5  4e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0423833  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>