More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_4022 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_3372  efflux transporter, RND family, MFP subunit  98.97 
 
 		 390 aa  749    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0461986  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4022  RND family efflux transporter MFP subunit  100 
 
 		 390 aa  759    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.780048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4663  RND family efflux transporter MFP subunit  75.98 
 
 		 394 aa  446  1.0000000000000001e-124  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4833  RND family efflux transporter MFP subunit  65.37 
 
 		 392 aa  416  9.999999999999999e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2411  efflux transporter, RND family, MFP subunit  60.11 
 
 		 410 aa  372  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.733291  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3901  RND family efflux transporter MFP subunit  62.97 
 
 		 396 aa  374  1e-102  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.843954  normal  0.11743 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4105  secretion protein HlyD  59.37 
 
 		 383 aa  369  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0739298  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2136  putative transporter lipoprotein transmembrane  57.86 
 
 		 391 aa  345  1e-93  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.123404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0458  secretion protein HlyD  55.06 
 
 		 378 aa  315  9.999999999999999e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.217472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3965  RND family efflux transporter MFP subunit  54.18 
 
 		 362 aa  311  1e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000185194 
 
 
-
 
NC_003296  RS01779  transporter lipoprotein transmembrane  50.15 
 
 		 1405 aa  267  2e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3472  efflux transporter, RND family, MFP subunit  48.58 
 
 		 379 aa  264  2e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.000321827  normal  0.111591 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4544  efflux transporter, RND family, MFP subunit  48.58 
 
 		 379 aa  264  2e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.80936 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2621  secretion protein HlyD  44.62 
 
 		 367 aa  256  4e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.15044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5614  efflux transporter, RND family, MFP subunit  43.75 
 
 		 357 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7484  HlyD family secretion protein  43.41 
 
 		 351 aa  253  5.000000000000001e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.832684  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7282  HlyD family secretion protein  39.73 
 
 		 377 aa  247  3e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.548499  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2968  RND family efflux transporter MFP subunit  42.69 
 
 		 413 aa  243  5e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0222457 
 
 
-
 
NC_003296  RS03087  putative cation-efflux system signal peptide protein  44.35 
 
 		 375 aa  241  2e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.297372 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5660  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.69 
 
 		 371 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.852771  normal  0.84907 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2400  secretion protein HlyD  38.07 
 
 		 440 aa  208  1e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.705753 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3024  secretion protein HlyD  37.11 
 
 		 363 aa  196  9e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.756641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1281  RND family efflux transporter MFP subunit  38.69 
 
 		 386 aa  179  1e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0104305 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2084  RND efflux membrane fusion protein  37.57 
 
 		 427 aa  177  3e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2353  RND family efflux transporter MFP subunit  35.63 
 
 		 442 aa  171  2e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4108  putative secretion protein (HlyD)  36.84 
 
 		 391 aa  171  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.331978  normal  0.146318 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2374  RND family efflux transporter MFP subunit  31.75 
 
 		 395 aa  159  9e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.347836 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5104  RND family efflux transporter MFP subunit  34.65 
 
 		 427 aa  158  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0396  RND family efflux transporter MFP subunit  32.84 
 
 		 413 aa  157  2e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3463  HlyD family secretion protein  31.4 
 
 		 378 aa  157  4e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0429  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.65 
 
 		 413 aa  156  7e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0465  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.13 
 
 		 413 aa  152  8e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.254107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1149  RND family efflux transporter MFP subunit  31.08 
 
 		 426 aa  152  1e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4289  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.19 
 
 		 402 aa  151  2e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0321009 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3921  RND family efflux transporter MFP subunit  33.9 
 
 		 402 aa  149  6e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.316668 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3826  RND family efflux transporter MFP subunit  33.53 
 
 		 385 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2854  cation efflux transporter  34.82 
 
 		 386 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.405755  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0428  RND family efflux transporter MFP subunit  33.24 
 
 		 408 aa  146  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0182364 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4394  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.47 
 
 		 414 aa  146  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.440743  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3299  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.71 
 
 		 396 aa  145  9e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.167372 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1439  RND family efflux transporter MFP subunit  35.28 
 
 		 390 aa  145  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0228236 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3044  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.14 
 
 		 396 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3888  Fis family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 389 aa  142  9.999999999999999e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0700006  normal  0.958295 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1504  RND family efflux transporter MFP subunit  31.76 
 
 		 397 aa  139  8.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0583737 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1373  RND family efflux transporter MFP subunit  33.54 
 
 		 409 aa  137  4e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000149577 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4033  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.06 
 
 		 396 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0454  secretion protein HlyD  26.77 
 
 		 373 aa  135  9.999999999999999e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.63564  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1666  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.76 
 
 		 396 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0854593  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0471  secretion protein HlyD  33.54 
 
 		 404 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0807  RND family efflux transporter MFP subunit  31.97 
 
 		 358 aa  125  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.347683 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0040  secretion protein HlyD  32.8 
 
 		 389 aa  123  5e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2377  RND family efflux transporter MFP subunit  29.68 
 
 		 609 aa  123  5e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.40782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4745  RND family efflux transporter MFP subunit  34.26 
 
 		 393 aa  122  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.19985 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0753  secretion protein HlyD  35.37 
 
 		 370 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2367  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.17 
 
 		 360 aa  120  4.9999999999999996e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2000  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.17 
 
 		 360 aa  120  4.9999999999999996e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.461729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1163  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.47 
 
 		 377 aa  120  6e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00317162  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2949  RND family efflux transporter MFP subunit  30.56 
 
 		 376 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2928  secretion protein HlyD  30.36 
 
 		 347 aa  116  5e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.7039  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0505  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.16 
 
 		 349 aa  117  5e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5381  RND family efflux transporter MFP subunit  33.14 
 
 		 364 aa  115  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.996751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2192  secretion protein HlyD  27.3 
 
 		 352 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.71 
 
 		 377 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.69897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1749  secretion protein HlyD  29.82 
 
 		 398 aa  110  6e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.145441 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3750  secretion protein HlyD  30.18 
 
 		 401 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4618  RND family efflux transporter MFP subunit  30.18 
 
 		 401 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.343268  normal  0.223248 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4005  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.7 
 
 		 387 aa  109  8.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7211  RND family efflux transporter MFP subunit  30.86 
 
 		 419 aa  108  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1349  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.64 
 
 		 409 aa  108  1e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0580213 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2275  RND family efflux transporter MFP subunit  26.59 
 
 		 354 aa  107  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0060878  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3467  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.54 
 
 		 376 aa  108  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00013135  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4229  RND family efflux transporter MFP subunit  29.21 
 
 		 371 aa  107  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0271349  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0225  secretion protein HlyD  32.45 
 
 		 380 aa  107  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.34961  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0859  HlyD family secretion protein  28.14 
 
 		 372 aa  107  5e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.585057  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0916  HlyD family secretion protein  28.14 
 
 		 372 aa  107  5e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0664  RND family efflux transporter MFP subunit  27.56 
 
 		 342 aa  106  6e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.295272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1392  RND efflux system membrane fusion protein  28.57 
 
 		 419 aa  106  6e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0449025  normal  0.0986293 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5686  RND family efflux transporter MFP subunit  29.74 
 
 		 401 aa  106  6e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.214167 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5203  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.57 
 
 		 455 aa  106  7e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.755082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1186  RND family efflux transporter MFP subunit  31.4 
 
 		 374 aa  106  9e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.425099  normal  0.0297054 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0583  HlyD family secretion protein  29.87 
 
 		 334 aa  105  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2372  secretion protein HlyD  30.49 
 
 		 392 aa  105  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.753301 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2849  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.9 
 
 		 421 aa  104  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0325844 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1629  RND family efflux transporter MFP subunit  26.55 
 
 		 358 aa  104  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.185382  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0247  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.23 
 
 		 380 aa  104  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1704  RND family efflux transporter MFP subunit  26.98 
 
 		 358 aa  104  3e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.271919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2370  secretion protein HlyD  31.77 
 
 		 405 aa  103  4e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000467489 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2381  RND family efflux transporter MFP subunit  26.15 
 
 		 357 aa  103  4e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1748  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.71 
 
 		 388 aa  103  6e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2654  RND family efflux transporter MFP subunit  31.01 
 
 		 366 aa  103  7e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.217565 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3700  secretion protein HlyD  30.4 
 
 		 381 aa  102  9e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2229  RND family efflux transporter MFP subunit  27.66 
 
 		 405 aa  101  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4616  secretion protein HlyD  30.42 
 
 		 414 aa  101  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1704  RND family efflux transporter MFP subunit  26.19 
 
 		 354 aa  101  3e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3608  secretion protein HlyD  28.44 
 
 		 400 aa  100  4e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.221607  normal  0.363906 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2663  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.81 
 
 		 352 aa  99.8  7e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003895  membrane fusion protein of RND family multidrug efflux pump  27.57 
 
 		 379 aa  99.8  8e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00341624  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2514  RND family efflux transporter MFP subunit  26.99 
 
 		 354 aa  99.8  8e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000208657  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5087  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.64 
 
 		 357 aa  99.8  8e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.156095  normal  0.0832308 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2361  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.48 
 
 		 372 aa  99.4  9e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.320362 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>