More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5660 on replicon NC_012853
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012853  Rleg_5660  efflux transporter, RND family, MFP subunit  100 
 
 		 371 aa  734    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.852771  normal  0.84907 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7282  HlyD family secretion protein  70.48 
 
 		 377 aa  524  1e-147  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.548499  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5614  efflux transporter, RND family, MFP subunit  48.62 
 
 		 357 aa  281  1e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7484  HlyD family secretion protein  44.73 
 
 		 351 aa  276  6e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.832684  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03087  putative cation-efflux system signal peptide protein  46.22 
 
 		 375 aa  270  2e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.297372 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2968  RND family efflux transporter MFP subunit  47.87 
 
 		 413 aa  263  3e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0222457 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4105  secretion protein HlyD  46.02 
 
 		 383 aa  249  6e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0739298  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2621  secretion protein HlyD  42.9 
 
 		 367 aa  228  2e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.15044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0458  secretion protein HlyD  41.54 
 
 		 378 aa  226  6e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.217472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3372  efflux transporter, RND family, MFP subunit  42.48 
 
 		 390 aa  222  8e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0461986  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4022  RND family efflux transporter MFP subunit  41.89 
 
 		 390 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.780048  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2411  efflux transporter, RND family, MFP subunit  42.15 
 
 		 410 aa  220  3e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.733291  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3965  RND family efflux transporter MFP subunit  41.41 
 
 		 362 aa  220  3e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000185194 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2136  putative transporter lipoprotein transmembrane  40.91 
 
 		 391 aa  219  6e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.123404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3901  RND family efflux transporter MFP subunit  41.19 
 
 		 396 aa  216  5.9999999999999996e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.843954  normal  0.11743 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4663  RND family efflux transporter MFP subunit  42.53 
 
 		 394 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4833  RND family efflux transporter MFP subunit  39.26 
 
 		 392 aa  213  4.9999999999999996e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4544  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.85 
 
 		 379 aa  193  3e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.80936 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3472  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.85 
 
 		 379 aa  193  3e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.000321827  normal  0.111591 
 
 
-
 
NC_003296  RS01779  transporter lipoprotein transmembrane  40.82 
 
 		 1405 aa  186  5e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2400  secretion protein HlyD  29.68 
 
 		 440 aa  149  8e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.705753 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2353  RND family efflux transporter MFP subunit  30.59 
 
 		 442 aa  137  3.0000000000000003e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2084  RND efflux membrane fusion protein  33.04 
 
 		 427 aa  135  9.999999999999999e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1281  RND family efflux transporter MFP subunit  29.31 
 
 		 386 aa  121  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0104305 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3024  secretion protein HlyD  32.42 
 
 		 363 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.756641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4108  putative secretion protein (HlyD)  31.58 
 
 		 391 aa  115  8.999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.331978  normal  0.146318 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0429  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.66 
 
 		 413 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0396  RND family efflux transporter MFP subunit  30.18 
 
 		 413 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3463  HlyD family secretion protein  29.46 
 
 		 378 aa  107  5e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0465  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.23 
 
 		 413 aa  106  5e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.254107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1288  RND family efflux transporter MFP subunit  31.71 
 
 		 365 aa  107  5e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1580  RND family efflux transporter MFP subunit  31.94 
 
 		 365 aa  104  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.610408  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0212  secretion protein HlyD  27.17 
 
 		 364 aa  105  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.59943 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1496  RND family efflux transporter MFP subunit  31.94 
 
 		 365 aa  104  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1044  RND family efflux transporter MFP subunit  31.94 
 
 		 365 aa  103  4e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0031  RND family efflux transporter MFP subunit  31.94 
 
 		 365 aa  103  4e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1201  RND family efflux transporter MFP subunit  31.94 
 
 		 365 aa  103  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0341767  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0078  RND family efflux transporter MFP subunit  31.94 
 
 		 365 aa  103  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0383  RND family efflux transporter MFP subunit  31.94 
 
 		 365 aa  103  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0247  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.62 
 
 		 380 aa  102  7e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4297  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.86 
 
 		 397 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.430357  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2374  RND family efflux transporter MFP subunit  26.86 
 
 		 395 aa  100  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.347836 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1421  HlyD family secretion protein  28.66 
 
 		 354 aa  100  4e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0100677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0225  secretion protein HlyD  30.77 
 
 		 380 aa  99.4  9e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.34961  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0450  RND family efflux transporter MFP subunit  29.58 
 
 		 407 aa  99.4  9e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.825026 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2192  secretion protein HlyD  27.69 
 
 		 352 aa  98.6  1e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2275  RND family efflux transporter MFP subunit  28.75 
 
 		 354 aa  97.1  5e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0060878  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0870  acriflavin resistance periplasmic protein  27.9 
 
 		 351 aa  96.7  6e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3700  secretion protein HlyD  28.98 
 
 		 381 aa  95.9  9e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1504  RND family efflux transporter MFP subunit  27.76 
 
 		 397 aa  95.9  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0583737 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0807  RND family efflux transporter MFP subunit  29.54 
 
 		 358 aa  95.1  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.347683 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3888  Fis family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 389 aa  94.7  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0700006  normal  0.958295 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1209  RND family efflux transporter MFP subunit  27.93 
 
 		 381 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.421019  normal  0.31825 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1146  RND family efflux transporter MFP subunit  27.62 
 
 		 351 aa  94.4  3e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1830  RND family efflux transporter MFP subunit  29.45 
 
 		 359 aa  94.4  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.495597  normal  0.102007 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2854  cation efflux transporter  30.21 
 
 		 386 aa  93.6  5e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.405755  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5087  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.46 
 
 		 357 aa  93.6  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.156095  normal  0.0832308 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0753  secretion protein HlyD  27.54 
 
 		 370 aa  93.2  6e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1704  RND family efflux transporter MFP subunit  27.41 
 
 		 354 aa  92.8  7e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1925  HlyD family secretion protein  28.66 
 
 		 354 aa  92.8  8e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2634  RND family efflux transporter MFP subunit  27.5 
 
 		 354 aa  92.8  8e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.182724  normal  0.987528 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2521  RND family efflux transporter MFP subunit  27.19 
 
 		 354 aa  92.4  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.199325  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1830  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.19 
 
 		 354 aa  92.4  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000238284  normal  0.23398 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3826  RND family efflux transporter MFP subunit  28.28 
 
 		 385 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1988  RND family efflux transporter MFP subunit  29.77 
 
 		 362 aa  91.7  2e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1640  CmeA  25 
 
 		 386 aa  91.3  2e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1629  RND family efflux transporter MFP subunit  27.64 
 
 		 358 aa  91.3  3e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.185382  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1650  secretion protein HlyD  30.56 
 
 		 397 aa  90.5  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1704  RND family efflux transporter MFP subunit  27.64 
 
 		 358 aa  90.5  4e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.271919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2381  RND family efflux transporter MFP subunit  25.08 
 
 		 357 aa  90.5  4e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2514  RND family efflux transporter MFP subunit  26.88 
 
 		 354 aa  90.9  4e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000208657  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1325  RND family efflux transporter MFP subunit  28.4 
 
 		 370 aa  90.5  5e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.784041  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1636  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.07 
 
 		 383 aa  90.1  6e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.372421  normal  0.934491 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1666  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.7 
 
 		 396 aa  89.7  8e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0854593  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1149  RND family efflux transporter MFP subunit  27.25 
 
 		 426 aa  89.4  9e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1439  RND family efflux transporter MFP subunit  29.62 
 
 		 390 aa  89  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0228236 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1610  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.09 
 
 		 372 aa  89  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5104  RND family efflux transporter MFP subunit  28.06 
 
 		 427 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1809  secretion protein HlyD  30 
 
 		 397 aa  89  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1649  RND family efflux transporter MFP subunit  27.74 
 
 		 354 aa  89  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.499517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1373  RND family efflux transporter MFP subunit  28.7 
 
 		 409 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000149577 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0428  RND family efflux transporter MFP subunit  27.41 
 
 		 408 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0182364 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2377  RND family efflux transporter MFP subunit  27.33 
 
 		 609 aa  88.2  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.40782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2820  RND family efflux transporter MFP subunit  28.98 
 
 		 363 aa  87.4  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0120499  normal  0.368522 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0119  CmeA  23.08 
 
 		 373 aa  87  4e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0200  secretion protein HlyD  25.69 
 
 		 365 aa  86.7  6e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4033  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28 
 
 		 396 aa  86.7  6e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1749  secretion protein HlyD  28.79 
 
 		 398 aa  86.7  6e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.145441 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1067  secretion protein HlyD  26.61 
 
 		 364 aa  86.7  6e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.133207 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001980  probable RND efflux membrane fusion protein  26.51 
 
 		 367 aa  86.7  7e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.979341  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3650  secretion protein HlyD  29.29 
 
 		 397 aa  86.7  7e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.521212 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0471  secretion protein HlyD  29.13 
 
 		 404 aa  86.3  7e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1781  RND family efflux transporter MFP subunit  28.75 
 
 		 368 aa  86.7  7e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.253325  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2922  RND family efflux transporter MFP subunit  25.82 
 
 		 459 aa  86.3  7e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.363027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1255  RND family efflux transporter MFP subunit  26.78 
 
 		 391 aa  86.3  7e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.518513 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1312  RND family efflux transporter MFP subunit  28.75 
 
 		 371 aa  86.3  8e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3414  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.44 
 
 		 1462 aa  86.3  8e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3927  RND family efflux transporter MFP subunit  26.97 
 
 		 392 aa  85.5  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3608  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.28 
 
 		 445 aa  85.9  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.704164  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0980  RND family efflux transporter MFP subunit  26.86 
 
 		 361 aa  85.5  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233971 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>