More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4394 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_4394  efflux transporter, RND family, MFP subunit  100 
 
 		 414 aa  763    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.440743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3921  RND family efflux transporter MFP subunit  94.18 
 
 		 402 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.316668 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4289  efflux transporter, RND family, MFP subunit  93.63 
 
 		 402 aa  571  1e-161  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0321009 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5104  RND family efflux transporter MFP subunit  78.06 
 
 		 427 aa  485  1e-136  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0428  RND family efflux transporter MFP subunit  72.16 
 
 		 408 aa  419  1e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0182364 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3826  RND family efflux transporter MFP subunit  71.59 
 
 		 385 aa  420  1e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4033  efflux transporter, RND family, MFP subunit  68.48 
 
 		 396 aa  412  1e-114  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1666  efflux transporter, RND family, MFP subunit  68.22 
 
 		 396 aa  409  1e-113  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0854593  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0396  RND family efflux transporter MFP subunit  60.88 
 
 		 413 aa  385  1e-106  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0465  efflux transporter, RND family, MFP subunit  62.6 
 
 		 413 aa  382  1e-105  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.254107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0429  efflux transporter, RND family, MFP subunit  60.88 
 
 		 413 aa  371  1e-101  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1373  RND family efflux transporter MFP subunit  62.18 
 
 		 409 aa  336  3.9999999999999995e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000149577 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1149  RND family efflux transporter MFP subunit  46.77 
 
 		 426 aa  254  3e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3463  HlyD family secretion protein  36.77 
 
 		 378 aa  230  3e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4108  putative secretion protein (HlyD)  43.33 
 
 		 391 aa  227  3e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.331978  normal  0.146318 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3299  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.33 
 
 		 396 aa  208  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.167372 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2374  RND family efflux transporter MFP subunit  35.4 
 
 		 395 aa  207  2e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.347836 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3044  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.05 
 
 		 396 aa  205  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3888  Fis family transcriptional regulator  45 
 
 		 389 aa  205  1e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0700006  normal  0.958295 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1504  RND family efflux transporter MFP subunit  37.83 
 
 		 397 aa  186  4e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0583737 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2854  cation efflux transporter  37.14 
 
 		 386 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.405755  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1439  RND family efflux transporter MFP subunit  37.14 
 
 		 390 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0228236 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3030  secretion protein HlyD  42.86 
 
 		 306 aa  139  6e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0446257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2136  putative transporter lipoprotein transmembrane  36.55 
 
 		 391 aa  137  5e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.123404  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7484  HlyD family secretion protein  32.87 
 
 		 351 aa  134  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.832684  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3611  secretion protein HlyD  42.19 
 
 		 295 aa  134  3e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.711693  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3372  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.96 
 
 		 390 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0461986  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4833  RND family efflux transporter MFP subunit  33.14 
 
 		 392 aa  129  1.0000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0895  secretion protein HlyD  38.65 
 
 		 322 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4022  RND family efflux transporter MFP subunit  33.69 
 
 		 390 aa  128  2.0000000000000002e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.780048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0886  secretion protein HlyD  43.65 
 
 		 306 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.795308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0549  hypothetical protein  42.39 
 
 		 296 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0091  efflux transporter, RND family, MFP subunit  43.01 
 
 		 306 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0918  RND family efflux transporter MFP subunit  41.53 
 
 		 302 aa  127  5e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.523672  normal  0.981132 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5163  efflux transporter, RND family, MFP subunit  42.49 
 
 		 298 aa  127  5e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3605  secretion protein HlyD  42.78 
 
 		 300 aa  127  5e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.550781  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3039  secretion protein HlyD  39.91 
 
 		 301 aa  126  6e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4685  secretion protein HlyD  42.19 
 
 		 312 aa  124  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.543199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1328  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.54 
 
 		 297 aa  124  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5160  secretion protein HlyD  38.04 
 
 		 295 aa  122  8e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.528553  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4105  secretion protein HlyD  33.16 
 
 		 383 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0739298  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1002  secretion protein HlyD  40.85 
 
 		 307 aa  121  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.677003  normal  0.658036 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2928  secretion protein HlyD  32.51 
 
 		 347 aa  119  7e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.7039  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1007  secretion protein HlyD  36.96 
 
 		 317 aa  119  7e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.163323  normal  0.0478945 
 
 
-
 
NC_003296  RS03087  putative cation-efflux system signal peptide protein  34.81 
 
 		 375 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.297372 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4005  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.33 
 
 		 387 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3965  RND family efflux transporter MFP subunit  33.43 
 
 		 362 aa  117  3e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000185194 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0556  HlyD family secretion protein  38.59 
 
 		 308 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.230089 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5614  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.84 
 
 		 357 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1893  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.38 
 
 		 351 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3024  secretion protein HlyD  32.94 
 
 		 363 aa  116  6e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.756641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0764  RND family efflux transporter MFP subunit  32.56 
 
 		 385 aa  116  8.999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1281  RND family efflux transporter MFP subunit  31.61 
 
 		 386 aa  115  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0104305 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0471  secretion protein HlyD  30.73 
 
 		 404 aa  114  3e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4663  RND family efflux transporter MFP subunit  31.75 
 
 		 394 aa  113  5e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2968  RND family efflux transporter MFP subunit  31.97 
 
 		 413 aa  111  2.0000000000000002e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0222457 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0807  RND family efflux transporter MFP subunit  29.51 
 
 		 358 aa  110  4.0000000000000004e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.347683 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0458  secretion protein HlyD  33.93 
 
 		 378 aa  109  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.217472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0890  secretion protein HlyD  38.46 
 
 		 306 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.459513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2621  secretion protein HlyD  30.97 
 
 		 367 aa  107  3e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.15044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4745  RND family efflux transporter MFP subunit  33.24 
 
 		 393 aa  107  4e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.19985 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0816  RND family efflux transporter MFP subunit  34.19 
 
 		 385 aa  105  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2377  RND family efflux transporter MFP subunit  29.62 
 
 		 609 aa  105  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.40782  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0166  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.98 
 
 		 379 aa  105  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1337  HlyD family secretion protein  40.7 
 
 		 293 aa  105  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4544  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.62 
 
 		 379 aa  103  4e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.80936 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3472  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.62 
 
 		 379 aa  103  4e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.000321827  normal  0.111591 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0908  HlyD family secretion protein  36.99 
 
 		 300 aa  102  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2665  RND family efflux transporter MFP subunit  30.89 
 
 		 386 aa  101  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0040  secretion protein HlyD  31.96 
 
 		 389 aa  101  3e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2411  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.68 
 
 		 410 aa  100  6e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.733291  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3901  RND family efflux transporter MFP subunit  30.91 
 
 		 396 aa  97.1  5e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.843954  normal  0.11743 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1636  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.09 
 
 		 383 aa  96.3  8e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.372421  normal  0.934491 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2519  secretion protein HlyD  31.18 
 
 		 382 aa  95.9  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000015375  normal  0.24357 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5381  RND family efflux transporter MFP subunit  30.23 
 
 		 364 aa  94.4  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.996751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7282  HlyD family secretion protein  28.93 
 
 		 377 aa  93.6  5e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.548499  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1921  RND family efflux transporter MFP subunit  28.53 
 
 		 340 aa  93.2  8e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00271277  normal  0.413551 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3340  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.87 
 
 		 379 aa  92.8  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1044  nodulation protein NolF  34.99 
 
 		 395 aa  92  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.991845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1385  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.44 
 
 		 380 aa  90.9  4e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0605754  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0916  efflux transporter  33.72 
 
 		 396 aa  90.9  4e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.987196  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5660  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.25 
 
 		 371 aa  89.4  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.852771  normal  0.84907 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1099  RND family efflux transporter MFP subunit  31.55 
 
 		 367 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.201717 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0753  secretion protein HlyD  29.41 
 
 		 370 aa  87.8  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0247  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.51 
 
 		 380 aa  87.8  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0067  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.53 
 
 		 453 aa  88.2  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0225  secretion protein HlyD  32.51 
 
 		 380 aa  87  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.34961  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01779  transporter lipoprotein transmembrane  33.53 
 
 		 1405 aa  84.7  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1163  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.83 
 
 		 377 aa  84.3  0.000000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00317162  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1526  RND family efflux transporter MFP subunit  29.79 
 
 		 423 aa  84.3  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.692168  normal  0.0164989 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2370  secretion protein HlyD  28.97 
 
 		 405 aa  84.3  0.000000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000467489 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1021  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.97 
 
 		 390 aa  83.6  0.000000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0159772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4341  RND family efflux transporter MFP subunit  30.91 
 
 		 394 aa  83.6  0.000000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03344  acriflavin resistance protein  28.49 
 
 		 417 aa  82.4  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4710  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.91 
 
 		 383 aa  82.8  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.967203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2020  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.79 
 
 		 414 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.152554 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3408  RND family efflux transporter MFP subunit  28.18 
 
 		 389 aa  82  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0128497  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5087  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.1 
 
 		 357 aa  82  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.156095  normal  0.0832308 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3379  RND family efflux transporter MFP subunit  31.36 
 
 		 409 aa  81.6  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.189038 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1818  RND family efflux transporter MFP subunit  24.85 
 
 		 352 aa  81.3  0.00000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000224471  normal  0.900766 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>