More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Moth_2370 on replicon NC_007644
Organism: Moorella thermoacetica ATCC 39073



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007644  Moth_2370  secretion protein HlyD  100 
 
 
405 aa  794    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000467489 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2949  RND family efflux transporter MFP subunit  35.08 
 
 
376 aa  208  2e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.09 
 
 
377 aa  196  6e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.69897  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2100  RND family efflux transporter MFP subunit  35.25 
 
 
379 aa  170  3e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0493506  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4150  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.07 
 
 
397 aa  162  7e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00923789  hitchhiker  0.000000297953 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0098  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.77 
 
 
432 aa  157  3e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4521  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.05 
 
 
379 aa  143  5e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0175  hypothetical protein  31.44 
 
 
380 aa  140  6e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.109936  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2322  secretion protein HlyD  31.34 
 
 
399 aa  138  2e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000756014  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2872  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.06 
 
 
387 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1047  RND family efflux transporter subunit MFP  26.97 
 
 
461 aa  135  9.999999999999999e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0423833  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2973  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.16 
 
 
448 aa  130  3e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1908  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.49 
 
 
407 aa  130  5.0000000000000004e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05040  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.48 
 
 
509 aa  130  5.0000000000000004e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00959096  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2584  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.49 
 
 
421 aa  129  9.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1938  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.7 
 
 
462 aa  128  2.0000000000000002e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000755017  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3522  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.25 
 
 
421 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0838  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.98 
 
 
432 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1621  secretion protein HlyD  28.33 
 
 
407 aa  126  7e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0206  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.77 
 
 
386 aa  125  2e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1349  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.79 
 
 
409 aa  124  3e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0580213 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2543  secretion protein HlyD  26.63 
 
 
471 aa  123  6e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.467529  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1062  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.47 
 
 
448 aa  123  7e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0463  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.13 
 
 
414 aa  122  9.999999999999999e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0067  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.13 
 
 
453 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4563  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.3 
 
 
426 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1672  RND family efflux transporter MFP subunit  26 
 
 
429 aa  120  4.9999999999999996e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0308  secretion protein HlyD  26.59 
 
 
421 aa  120  4.9999999999999996e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.742688 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0949  RND family efflux transporter MFP subunit  30.79 
 
 
390 aa  119  9e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0549  secretion protein HlyD  28.82 
 
 
407 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3531  secretion protein HlyD  27.79 
 
 
400 aa  118  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445744  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0270  putative MacA-like membrane transport protein  28.75 
 
 
417 aa  116  6e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1791  secretion protein HlyD  30.61 
 
 
402 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0644  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.47 
 
 
425 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0200148  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3408  RND family efflux transporter MFP subunit  27.2 
 
 
389 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0128497  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2046  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.62 
 
 
442 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2360  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.11 
 
 
380 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.347608  normal  0.0362221 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0830  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.7 
 
 
390 aa  114  3e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2374  RND family efflux transporter MFP subunit  29.74 
 
 
395 aa  114  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.347836 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0901  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.01 
 
 
351 aa  114  3e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.470272  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1602  RND family efflux transporter MFP subunit  31.91 
 
 
641 aa  114  4.0000000000000004e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1515  RND family efflux transporter MFP subunit  28.61 
 
 
405 aa  113  6e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0105  RND family efflux transporter MFP subunit  25.81 
 
 
348 aa  112  9e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3595  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.76 
 
 
404 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0852698  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3467  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.3 
 
 
376 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00013135  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2777  RND family efflux transporter MFP subunit  28.62 
 
 
489 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000975793  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2381  RND family efflux transporter MFP subunit  25.06 
 
 
357 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2132  HlyD family secretion protein  25.98 
 
 
360 aa  111  3e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.732379  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2865  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.15 
 
 
478 aa  110  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0716848 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1204  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.57 
 
 
471 aa  110  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2000  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.04 
 
 
360 aa  110  5e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.461729  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2367  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.04 
 
 
360 aa  110  5e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0539  RND family efflux transporter MFP subunit  25.25 
 
 
350 aa  110  6e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0319  RND family efflux transporter MFP subunit  28.9 
 
 
417 aa  109  8.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0916  HlyD family secretion protein  28.05 
 
 
372 aa  108  1e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2355  secretion protein HlyD  27.29 
 
 
509 aa  108  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0694634 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1814  RND family efflux transporter MFP subunit  24.68 
 
 
432 aa  108  1e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0859  HlyD family secretion protein  28.05 
 
 
372 aa  108  1e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.585057  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0031  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.46 
 
 
392 aa  108  2e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000323168  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12131  membrane fusion protein  26.6 
 
 
356 aa  108  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.502636 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1649  RND family efflux transporter MFP subunit  25.81 
 
 
354 aa  108  2e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.499517  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0454  secretion protein HlyD  26.98 
 
 
373 aa  107  3e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.63564  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1704  RND family efflux transporter MFP subunit  24.88 
 
 
354 aa  107  3e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5856  secretion protein HlyD  30.48 
 
 
425 aa  107  4e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.249167  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2192  secretion protein HlyD  24 
 
 
352 aa  107  4e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2954  RND family efflux transporter MFP subunit  27.89 
 
 
364 aa  107  5e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000249187  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3548  RND family efflux transporter MFP subunit  26.7 
 
 
442 aa  107  5e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.489121  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4428  RND family efflux transporter MFP subunit  27.22 
 
 
349 aa  106  6e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1234  RND family efflux transporter MFP subunit  28.83 
 
 
359 aa  106  7e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.580475  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2920  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.67 
 
 
505 aa  106  8e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.214189 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1084  RND family efflux transporter MFP subunit  26.51 
 
 
429 aa  106  8e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4735  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.03 
 
 
432 aa  106  8e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0659148 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3608  secretion protein HlyD  28.41 
 
 
400 aa  106  9e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.221607  normal  0.363906 
 
 
-
 
NC_004310  BR1671  HlyD family secretion protein  28.72 
 
 
408 aa  105  1e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2514  RND family efflux transporter MFP subunit  23.27 
 
 
354 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000208657  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1617  secretion protein HlyD  28.72 
 
 
408 aa  105  1e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0160623  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2275  RND family efflux transporter MFP subunit  22.44 
 
 
354 aa  105  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0060878  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1830  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.95 
 
 
354 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000238284  normal  0.23398 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3323  secretion protein HlyD  28.68 
 
 
459 aa  105  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.665109  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2521  RND family efflux transporter MFP subunit  23.95 
 
 
354 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.199325  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1943  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.71 
 
 
450 aa  104  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1731  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.65 
 
 
402 aa  104  3e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0926  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.19 
 
 
490 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1833  RND family efflux transporter MFP subunit  28.43 
 
 
464 aa  104  3e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.36059  unclonable  0.000000000906287 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1554  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.42 
 
 
363 aa  104  3e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0484603  hitchhiker  0.00000015248 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1879  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.42 
 
 
363 aa  104  3e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2823  HlyD family secretion protein  30.14 
 
 
329 aa  103  4e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1721  RND family efflux transporter MFP subunit  27.16 
 
 
431 aa  103  4e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4288  RND family efflux transporter MFP subunit  26.68 
 
 
349 aa  103  4e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1550  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.87 
 
 
413 aa  103  4e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0505882  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2634  RND family efflux transporter MFP subunit  23.95 
 
 
354 aa  103  4e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.182724  normal  0.987528 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2524  RND family efflux transporter MFP subunit  28.04 
 
 
424 aa  104  4e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.283395  normal  0.0763035 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3265  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.49 
 
 
404 aa  103  4e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0080  RND family efflux transporter MFP subunit  30.92 
 
 
414 aa  103  5e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.95759  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0207  RND family efflux transporter MFP subunit  32.82 
 
 
400 aa  103  5e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000100142 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2552  secretion protein HlyD  26.29 
 
 
451 aa  103  6e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.603084  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3060  secretion protein HlyD family protein  29.24 
 
 
353 aa  103  7e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3412  secretion protein HlyD  29.18 
 
 
443 aa  103  7e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0866166  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0653  RND family efflux transporter MFP subunit  28.46 
 
 
409 aa  103  7e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.356164  normal  0.176029 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0231  RND family efflux transporter MFP subunit  33.44 
 
 
401 aa  103  7e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000683509 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>