More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_2854 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2854  cation efflux transporter  100 
 
 		 386 aa  737    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.405755  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1439  RND family efflux transporter MFP subunit  98.96 
 
 		 390 aa  728    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0228236 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1504  RND family efflux transporter MFP subunit  89.41 
 
 		 397 aa  629  1e-179  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0583737 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2374  RND family efflux transporter MFP subunit  42.7 
 
 		 395 aa  280  2e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.347836 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3044  efflux transporter, RND family, MFP subunit  46.09 
 
 		 396 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3299  efflux transporter, RND family, MFP subunit  44.13 
 
 		 396 aa  265  8.999999999999999e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.167372 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3463  HlyD family secretion protein  40.38 
 
 		 378 aa  258  1e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1149  RND family efflux transporter MFP subunit  41.29 
 
 		 426 aa  199  5e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5104  RND family efflux transporter MFP subunit  38.48 
 
 		 427 aa  189  5e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3888  Fis family transcriptional regulator  42.21 
 
 		 389 aa  188  1e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0700006  normal  0.958295 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4108  putative secretion protein (HlyD)  41.25 
 
 		 391 aa  185  9e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.331978  normal  0.146318 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0428  RND family efflux transporter MFP subunit  39.43 
 
 		 408 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0182364 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3826  RND family efflux transporter MFP subunit  38.86 
 
 		 385 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4033  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.17 
 
 		 396 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1666  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.17 
 
 		 396 aa  172  9e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0854593  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0396  RND family efflux transporter MFP subunit  35.61 
 
 		 413 aa  169  8e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4289  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.68 
 
 		 402 aa  168  2e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0321009 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3921  RND family efflux transporter MFP subunit  37.39 
 
 		 402 aa  166  5e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.316668 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0429  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.71 
 
 		 413 aa  161  1e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4394  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.57 
 
 		 414 aa  159  7e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.440743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0465  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.15 
 
 		 413 aa  158  1e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.254107  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1373  RND family efflux transporter MFP subunit  36.84 
 
 		 409 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000149577 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0471  secretion protein HlyD  34.38 
 
 		 404 aa  135  9.999999999999999e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0807  RND family efflux transporter MFP subunit  30.85 
 
 		 358 aa  130  5.0000000000000004e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.347683 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0918  RND family efflux transporter MFP subunit  39.17 
 
 		 302 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.523672  normal  0.981132 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4022  RND family efflux transporter MFP subunit  34.54 
 
 		 390 aa  125  1e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.780048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1328  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.5 
 
 		 297 aa  123  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3372  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.82 
 
 		 390 aa  123  6e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0461986  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4663  RND family efflux transporter MFP subunit  35.85 
 
 		 394 aa  122  8e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4833  RND family efflux transporter MFP subunit  32.53 
 
 		 392 aa  119  9e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0091  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.27 
 
 		 306 aa  116  6e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2136  putative transporter lipoprotein transmembrane  36.46 
 
 		 391 aa  113  5e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.123404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2928  secretion protein HlyD  31.69 
 
 		 347 aa  113  5e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.7039  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3024  secretion protein HlyD  32.29 
 
 		 363 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.756641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4105  secretion protein HlyD  33.07 
 
 		 383 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0739298  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0040  secretion protein HlyD  34.81 
 
 		 389 aa  110  4.0000000000000004e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4745  RND family efflux transporter MFP subunit  32.71 
 
 		 393 aa  110  6e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.19985 
 
 
-
 
NC_003296  RS03087  putative cation-efflux system signal peptide protein  36.56 
 
 		 375 aa  107  5e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.297372 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3965  RND family efflux transporter MFP subunit  34.17 
 
 		 362 aa  106  6e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000185194 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3472  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.79 
 
 		 379 aa  105  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.000321827  normal  0.111591 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4544  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.79 
 
 		 379 aa  105  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.80936 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2370  secretion protein HlyD  33.33 
 
 		 405 aa  102  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000467489 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3039  secretion protein HlyD  36.51 
 
 		 301 aa  102  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1617  secretion protein HlyD  29.15 
 
 		 408 aa  101  2e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0160623  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0549  secretion protein HlyD  30.33 
 
 		 407 aa  102  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3605  secretion protein HlyD  37.37 
 
 		 300 aa  101  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.550781  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4685  secretion protein HlyD  37.69 
 
 		 312 aa  101  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.543199  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1671  HlyD family secretion protein  29.71 
 
 		 408 aa  100  5e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00883  macrolide transporter subunit, membrane fusion protein (MFP) component  30.17 
 
 		 371 aa  99.8  7e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1731  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.88 
 
 		 402 aa  99.8  7e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0458  secretion protein HlyD  33.01 
 
 		 378 aa  99.8  7e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.217472  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00889  hypothetical protein  30.17 
 
 		 371 aa  99.8  7e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2377  RND family efflux transporter MFP subunit  28.02 
 
 		 609 aa  99.8  8e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.40782  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2764  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.17 
 
 		 371 aa  99.4  9e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.161658  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2451  macrolide transporter subunit MacA  30.17 
 
 		 371 aa  99.4  9e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00913289  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0901  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.1 
 
 		 351 aa  99.4  9e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.470272  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0982  macrolide transporter subunit MacA  30.17 
 
 		 371 aa  99.4  9e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.44834  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0951  macrolide transporter subunit MacA  30.17 
 
 		 371 aa  99.4  9e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0557503  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2718  macrolide transporter subunit MacA  30.17 
 
 		 371 aa  99.4  9e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0161  RND family efflux transporter MFP subunit  32.34 
 
 		 380 aa  98.6  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7484  HlyD family secretion protein  29.61 
 
 		 351 aa  99  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.832684  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5163  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.1 
 
 		 298 aa  99  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0764  RND family efflux transporter MFP subunit  30.72 
 
 		 385 aa  99  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4005  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.52 
 
 		 387 aa  98.2  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2282  macrolide transporter subunit MacA  30.17 
 
 		 371 aa  98.2  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000339116  normal  0.0134871 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2617  secretion protein HlyD  29.69 
 
 		 385 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000106145  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0913  hypothetical protein  29.68 
 
 		 338 aa  97.4  4e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0882  hypothetical protein  29.35 
 
 		 338 aa  97.1  5e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1039  macrolide transporter subunit MacA  28.94 
 
 		 371 aa  96.3  8e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.184306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1395  macrolide transporter subunit MacA  30.17 
 
 		 371 aa  95.1  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.458807  normal  0.0347786 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1281  RND family efflux transporter MFP subunit  31.79 
 
 		 386 aa  95.1  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0104305 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1002  secretion protein HlyD  36.56 
 
 		 307 aa  95.5  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.677003  normal  0.658036 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1921  RND family efflux transporter MFP subunit  30.69 
 
 		 340 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00271277  normal  0.413551 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4041  hypothetical protein  28.57 
 
 		 366 aa  93.6  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0513022 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2849  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.63 
 
 		 421 aa  90.9  3e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0325844 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0549  hypothetical protein  36.96 
 
 		 296 aa  90.9  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2400  secretion protein HlyD  28.53 
 
 		 440 aa  91.3  3e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.705753 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5660  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.75 
 
 		 371 aa  90.5  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.852771  normal  0.84907 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1526  RND family efflux transporter MFP subunit  28.9 
 
 		 423 aa  90.9  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.692168  normal  0.0164989 
 
 
-
 
NC_003296  RS01779  transporter lipoprotein transmembrane  33.24 
 
 		 1405 aa  90.1  5e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2825  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.18 
 
 		 476 aa  90.5  5e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.292175  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2524  RND family efflux transporter MFP subunit  28.99 
 
 		 424 aa  90.1  6e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.283395  normal  0.0763035 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1349  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.34 
 
 		 409 aa  89.7  7e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0580213 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0206  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.3 
 
 		 386 aa  89.4  9e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0890  secretion protein HlyD  33.86 
 
 		 306 aa  89.4  9e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.459513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2968  RND family efflux transporter MFP subunit  30.35 
 
 		 413 aa  89  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0222457 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0556  HlyD family secretion protein  35.38 
 
 		 308 aa  89  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.230089 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2621  secretion protein HlyD  29.84 
 
 		 367 aa  89  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.15044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3030  secretion protein HlyD  36.26 
 
 		 306 aa  89  1e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0446257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1636  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.86 
 
 		 383 aa  89  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.372421  normal  0.934491 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0859  HlyD family secretion protein  26.92 
 
 		 372 aa  89.4  1e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.585057  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0916  HlyD family secretion protein  26.92 
 
 		 372 aa  88.6  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0962  secretion protein HlyD  27.7 
 
 		 405 aa  88.2  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.255558  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4563  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.7 
 
 		 426 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8104  secretion protein HlyD family protein  36.19 
 
 		 354 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1893  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.16 
 
 		 351 aa  87.4  4e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3611  secretion protein HlyD  36.17 
 
 		 295 aa  86.7  7e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.711693  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0695  hypothetical protein  30.99 
 
 		 281 aa  86.3  8e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0886  secretion protein HlyD  35.52 
 
 		 306 aa  86.3  8e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.795308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0883  RND family efflux transporter MFP subunit  28.96 
 
 		 363 aa  85.9  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>