More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1337 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_1337  HlyD family secretion protein  100 
 
 		 293 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0908  HlyD family secretion protein  74.92 
 
 		 300 aa  430  1e-119  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3611  secretion protein HlyD  44.41 
 
 		 295 aa  199  5e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.711693  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3030  secretion protein HlyD  43.1 
 
 		 306 aa  192  7e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0446257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0556  HlyD family secretion protein  43.4 
 
 		 308 aa  181  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.230089 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0886  secretion protein HlyD  42.63 
 
 		 306 aa  179  4e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.795308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1007  secretion protein HlyD  42.63 
 
 		 317 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.163323  normal  0.0478945 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5160  secretion protein HlyD  41.83 
 
 		 295 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.528553  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0895  secretion protein HlyD  43.03 
 
 		 322 aa  170  3e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1893  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.2 
 
 		 351 aa  169  4e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0091  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.16 
 
 		 306 aa  154  1e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0549  hypothetical protein  39.37 
 
 		 296 aa  152  4e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3039  secretion protein HlyD  39.58 
 
 		 301 aa  150  2e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3605  secretion protein HlyD  37.23 
 
 		 300 aa  143  3e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.550781  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4685  secretion protein HlyD  38.63 
 
 		 312 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.543199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1002  secretion protein HlyD  36.21 
 
 		 307 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.677003  normal  0.658036 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0918  RND family efflux transporter MFP subunit  37.26 
 
 		 302 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.523672  normal  0.981132 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5163  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.89 
 
 		 298 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0890  secretion protein HlyD  34.02 
 
 		 306 aa  122  6e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.459513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1328  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.73 
 
 		 297 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0396  RND family efflux transporter MFP subunit  41.28 
 
 		 413 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0429  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.71 
 
 		 413 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0465  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.7 
 
 		 413 aa  109  5e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.254107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4289  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.48 
 
 		 402 aa  106  6e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0321009 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1373  RND family efflux transporter MFP subunit  39.43 
 
 		 409 aa  105  8e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000149577 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4394  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.7 
 
 		 414 aa  105  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.440743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3921  RND family efflux transporter MFP subunit  40.91 
 
 		 402 aa  105  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.316668 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5104  RND family efflux transporter MFP subunit  39.53 
 
 		 427 aa  105  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3888  Fis family transcriptional regulator  40.72 
 
 		 389 aa  102  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0700006  normal  0.958295 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3826  RND family efflux transporter MFP subunit  35.06 
 
 		 385 aa  93.6  4e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0428  RND family efflux transporter MFP subunit  34.83 
 
 		 408 aa  92.4  7e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0182364 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4033  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.48 
 
 		 396 aa  90.5  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4663  RND family efflux transporter MFP subunit  36.52 
 
 		 394 aa  90.1  3e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1666  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.48 
 
 		 396 aa  90.1  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0854593  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3299  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.92 
 
 		 396 aa  88.6  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.167372 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4108  putative secretion protein (HlyD)  32.94 
 
 		 391 aa  86.3  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.331978  normal  0.146318 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3044  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.75 
 
 		 396 aa  85.1  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1149  RND family efflux transporter MFP subunit  31.79 
 
 		 426 aa  84.3  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2374  RND family efflux transporter MFP subunit  32.16 
 
 		 395 aa  81.3  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.347836 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2854  cation efflux transporter  35.88 
 
 		 386 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.405755  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1439  RND family efflux transporter MFP subunit  35.88 
 
 		 390 aa  79.3  0.00000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0228236 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3372  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.58 
 
 		 390 aa  72.4  0.000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0461986  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1504  RND family efflux transporter MFP subunit  33.53 
 
 		 397 aa  71.6  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0583737 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4022  RND family efflux transporter MFP subunit  32.02 
 
 		 390 aa  70.5  0.00000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.780048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0807  RND family efflux transporter MFP subunit  25.09 
 
 		 358 aa  69.7  0.00000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.347683 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3463  HlyD family secretion protein  28.16 
 
 		 378 aa  69.7  0.00000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4229  RND family efflux transporter MFP subunit  35.1 
 
 		 371 aa  68.9  0.00000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0271349  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2377  RND family efflux transporter MFP subunit  29.41 
 
 		 609 aa  67  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.40782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4833  RND family efflux transporter MFP subunit  31.36 
 
 		 392 aa  66.6  0.0000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3128  secretion protein HlyD  36.6 
 
 		 370 aa  65.9  0.0000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000130607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2372  secretion protein HlyD  30.8 
 
 		 392 aa  65.5  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.753301 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1549  RND family efflux transporter MFP subunit  30.9 
 
 		 402 aa  63.9  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3686  RND family efflux transporter MFP subunit  31.34 
 
 		 440 aa  62.8  0.000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.98045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3024  secretion protein HlyD  25.32 
 
 		 363 aa  62.8  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.756641  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2074  chemiosmotic efflux system protein B-like protein  29.41 
 
 		 322 aa  62.4  0.000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2064  chemiosmotic efflux system protein B-like protein  29.41 
 
 		 322 aa  62.4  0.000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2411  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.41 
 
 		 410 aa  62  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.733291  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0458  secretion protein HlyD  28.57 
 
 		 378 aa  61.6  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.217472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2928  secretion protein HlyD  26.88 
 
 		 347 aa  60.5  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.7039  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4745  RND family efflux transporter MFP subunit  28.16 
 
 		 393 aa  60.8  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.19985 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3130  secretion protein HlyD  30.5 
 
 		 473 aa  60.5  0.00000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.308652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0454  secretion protein HlyD  25.34 
 
 		 373 aa  60.1  0.00000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.63564  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0392  RND family efflux transporter MFP subunit  30.92 
 
 		 370 aa  59.7  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.14 
 
 		 377 aa  58.9  0.00000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.69897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1281  RND family efflux transporter MFP subunit  29.31 
 
 		 386 aa  59.3  0.00000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0104305 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2136  putative transporter lipoprotein transmembrane  29.07 
 
 		 391 aa  58.9  0.00000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.123404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5381  RND family efflux transporter MFP subunit  34.9 
 
 		 364 aa  58.5  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.996751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4832  RND family efflux transporter MFP subunit  31.89 
 
 		 472 aa  58.9  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0873289 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3760  secretion protein HlyD  25.87 
 
 		 362 aa  58.2  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.196565 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0505  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.33 
 
 		 349 aa  57.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4592  RND family efflux transporter MFP subunit  32.97 
 
 		 477 aa  57.8  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.246658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2192  secretion protein HlyD  24.9 
 
 		 352 aa  57  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5614  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.01 
 
 		 357 aa  57  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4405  secretion protein HlyD  32.43 
 
 		 550 aa  56.6  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.164815  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3248  RND family efflux transporter MFP subunit  31.55 
 
 		 375 aa  57  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000122145  hitchhiker  0.000539204 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1700  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.75 
 
 		 346 aa  56.2  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.116912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3973  RND family efflux transporter MFP subunit  32.62 
 
 		 473 aa  56.6  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.181102 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2036  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.75 
 
 		 346 aa  56.2  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0261077  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0471  secretion protein HlyD  29.1 
 
 		 404 aa  56.6  0.0000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0040  secretion protein HlyD  28.41 
 
 		 389 aa  56.2  0.0000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1649  RND family efflux transporter MFP subunit  26.39 
 
 		 354 aa  56.2  0.0000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.499517  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2352  chemiosmotic efflux system C protein B  28.87 
 
 		 322 aa  55.8  0.0000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2275  RND family efflux transporter MFP subunit  25.57 
 
 		 354 aa  55.8  0.0000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0060878  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0864  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.57 
 
 		 345 aa  55.5  0.0000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1715  putative cation efflux system transmembrane protein  30.32 
 
 		 500 aa  55.1  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0232855  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0816  RND family efflux transporter MFP subunit  32.97 
 
 		 385 aa  55.1  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2949  RND family efflux transporter MFP subunit  28.99 
 
 		 376 aa  55.5  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0686  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.61 
 
 		 380 aa  55.1  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00268178 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2514  RND family efflux transporter MFP subunit  25.23 
 
 		 354 aa  55.5  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000208657  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2439  RND family efflux transporter MFP subunit  21.64 
 
 		 338 aa  55.5  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000111994  hitchhiker  0.00120392 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2634  RND family efflux transporter MFP subunit  25.23 
 
 		 354 aa  54.7  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.182724  normal  0.987528 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2521  RND family efflux transporter MFP subunit  25.69 
 
 		 354 aa  54.7  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.199325  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2564  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.39 
 
 		 509 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.430144 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1020  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.88 
 
 		 508 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.590428 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2184  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.8 
 
 		 537 aa  54.3  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.580159  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1704  RND family efflux transporter MFP subunit  25.75 
 
 		 354 aa  55.1  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1830  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.69 
 
 		 354 aa  54.7  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000238284  normal  0.23398 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3707  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.55 
 
 		 354 aa  54.3  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1456  secretion protein HlyD  33.52 
 
 		 330 aa  53.9  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.134538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1615  RND family efflux transporter MFP subunit  20 
 
 		 347 aa  54.3  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000338384  decreased coverage  0.00000142207 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>