More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3248 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3248  RND family efflux transporter MFP subunit  100 
 
 		 375 aa  766    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000122145  hitchhiker  0.000539204 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1741  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.21 
 
 		 381 aa  206  4e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2367  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.85 
 
 		 360 aa  120  3e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2000  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.85 
 
 		 360 aa  120  3e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.461729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0505  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.03 
 
 		 349 aa  107  4e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0583  HlyD family secretion protein  31.39 
 
 		 334 aa  106  8e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0454  secretion protein HlyD  26.22 
 
 		 373 aa  104  3e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.63564  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0664  RND family efflux transporter MFP subunit  25.08 
 
 		 342 aa  101  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.295272  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3936  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.48 
 
 		 365 aa  101  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00117548 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2439  RND family efflux transporter MFP subunit  31.71 
 
 		 338 aa  100  4e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000111994  hitchhiker  0.00120392 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1128  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.96 
 
 		 354 aa  100  5e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.180858  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3852  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.48 
 
 		 365 aa  99.8  8e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1163  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.49 
 
 		 377 aa  97.4  3e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00317162  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2181  AcrA/AcrE family protein  32.07 
 
 		 331 aa  94.7  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000164809  normal  0.0114896 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3467  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.23 
 
 		 376 aa  94.4  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00013135  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000105  membrane-fusion protein  25.64 
 
 		 351 aa  94.4  3e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.860226  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2396  secretion protein HlyD  32.95 
 
 		 346 aa  94  4e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0392  RND family efflux transporter MFP subunit  29.57 
 
 		 370 aa  93.6  6e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0549  secretion protein HlyD  28.53 
 
 		 407 aa  92.8  9e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1615  RND family efflux transporter MFP subunit  29.9 
 
 		 347 aa  90.1  5e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000338384  decreased coverage  0.00000142207 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1748  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.49 
 
 		 388 aa  89.4  9e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2100  RND family efflux transporter MFP subunit  26.55 
 
 		 379 aa  89.4  9e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0493506  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3344  secretion protein HlyD  29.31 
 
 		 333 aa  88.2  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.144623 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2559  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.28 
 
 		 349 aa  87.4  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.99545  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2046  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.05 
 
 		 442 aa  87.8  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2153  HlyD family secretion protein  32.63 
 
 		 359 aa  87.4  4e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2473  RND family efflux transporter MFP subunit  23.81 
 
 		 340 aa  86.3  7e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000483953  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1621  secretion protein HlyD  25.47 
 
 		 407 aa  85.5  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3303  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.88 
 
 		 358 aa  83.2  0.000000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2794  RND family efflux transporter MFP subunit  28.5 
 
 		 337 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000190782  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2610  RND family efflux transporter MFP subunit  27.94 
 
 		 362 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000256578  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2827  RND family efflux transporter MFP subunit  24.8 
 
 		 352 aa  82  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00918161  hitchhiker  0.00100699 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25 
 
 		 377 aa  82  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.69897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4943  RND efflux membrane fusion protein precursor  30.53 
 
 		 375 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4229  RND family efflux transporter MFP subunit  31.31 
 
 		 371 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0271349  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1584  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.02 
 
 		 337 aa  80.5  0.00000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000223326  hitchhiker  0.000000000135699 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56880  putative membrane fusion protein  30.67 
 
 		 376 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2213  secretion protein HlyD  26.44 
 
 		 407 aa  80.5  0.00000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1394  RND family efflux transporter MFP subunit  29.61 
 
 		 337 aa  80.1  0.00000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000175067  unclonable  0.0000000000192575 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1447  RND family efflux transporter MFP subunit  29.61 
 
 		 337 aa  80.1  0.00000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000819965  unclonable  0.000000000091848 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3761  secretion protein HlyD  26.93 
 
 		 364 aa  79.7  0.00000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1209  RND family efflux transporter MFP subunit  27.8 
 
 		 381 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.421019  normal  0.31825 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2774  RND family efflux transporter MFP subunit  25.22 
 
 		 337 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000348854  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2869  RND family efflux transporter MFP subunit  28.02 
 
 		 337 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000418866  normal  0.697235 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2825  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.3 
 
 		 476 aa  79  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.292175  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1455  RND family efflux transporter MFP subunit  31.16 
 
 		 345 aa  79.3  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3743  RND family efflux transporter MFP subunit  32.49 
 
 		 374 aa  78.6  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0916  efflux transporter  24.23 
 
 		 396 aa  77.8  0.0000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.987196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3128  secretion protein HlyD  33.52 
 
 		 370 aa  77.4  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000130607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0161  RND family efflux transporter MFP subunit  27.27 
 
 		 380 aa  77  0.0000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1459  RND family efflux transporter MFP subunit  29.05 
 
 		 337 aa  77.4  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000143957  unclonable  0.0000312687 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2949  RND family efflux transporter MFP subunit  24.27 
 
 		 376 aa  77.4  0.0000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2849  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.4 
 
 		 421 aa  77  0.0000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0325844 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1916  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.93 
 
 		 388 aa  77  0.0000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.631291  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0059  RND family efflux transporter MFP subunit  31.46 
 
 		 411 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0644  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.15 
 
 		 425 aa  77  0.0000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0200148  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3102  AcrA/AcrE family protein  29.61 
 
 		 337 aa  76.6  0.0000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1389  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.31 
 
 		 374 aa  76.6  0.0000000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000158934  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2074  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.08 
 
 		 353 aa  76.6  0.0000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.104068  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1186  RND family efflux transporter MFP subunit  25.57 
 
 		 374 aa  76.3  0.0000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.425099  normal  0.0297054 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0980  RND family efflux transporter MFP subunit  28.09 
 
 		 361 aa  75.9  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233971 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05040  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.37 
 
 		 509 aa  75.5  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00959096  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0753  secretion protein HlyD  25.28 
 
 		 370 aa  75.1  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02155  putative transport transmembrane protein  29.15 
 
 		 421 aa  74.3  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.58284 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1234  RND family efflux transporter MFP subunit  24.84 
 
 		 359 aa  74.7  0.000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.580475  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0878  secretion protein HlyD  24.9 
 
 		 263 aa  74.7  0.000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0949246  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1791  secretion protein HlyD  23.74 
 
 		 402 aa  74.3  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0321  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.69 
 
 		 386 aa  74.3  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2377  RND family efflux transporter MFP subunit  26.73 
 
 		 609 aa  74.3  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.40782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3379  RND family efflux transporter MFP subunit  27.62 
 
 		 409 aa  74.3  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.189038 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3711  RND family efflux transporter MFP subunit  24.02 
 
 		 389 aa  74.3  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3081  RND family efflux transporter MFP subunit  29.53 
 
 		 371 aa  73.6  0.000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.153012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0671  secretion protein HlyD  25.77 
 
 		 432 aa  73.6  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0438  hypothetical protein  24.46 
 
 		 352 aa  73.6  0.000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000000466929  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1752  RND family efflux transporter MFP subunit  25.76 
 
 		 369 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1385  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.96 
 
 		 380 aa  72.4  0.00000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0605754  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2237  secretion protein HlyD  30.62 
 
 		 377 aa  72.8  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3024  secretion protein HlyD  29.81 
 
 		 363 aa  72.4  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.756641  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0986  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.22 
 
 		 405 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.831389 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6340  secretion protein HlyD  25.76 
 
 		 369 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.900675  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1739  RND family efflux transporter MFP subunit  25.76 
 
 		 369 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.357806  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2781  RND family efflux transporter MFP subunit  23.69 
 
 		 372 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00032103  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0463  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.15 
 
 		 414 aa  70.9  0.00000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0206  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.78 
 
 		 386 aa  71.2  0.00000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1267  RND family efflux transporter MFP subunit  21.73 
 
 		 355 aa  71.2  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004022  membrane-fusion protein  23.97 
 
 		 369 aa  70.5  0.00000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000160707  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1963  putative secretion protein, HlyD family  23.08 
 
 		 390 aa  70.5  0.00000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000072673  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1309  efflux protein  24.78 
 
 		 364 aa  70.9  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1700  secretion protein HlyD  23.82 
 
 		 417 aa  70.5  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.696744  normal  0.370784 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2818  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.65 
 
 		 349 aa  70.5  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0285  RND family efflux transporter MFP subunit  23.8 
 
 		 401 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.140483  hitchhiker  0.000000766037 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5559  secretion protein HlyD  24.61 
 
 		 366 aa  70.5  0.00000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2481  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.05 
 
 		 367 aa  70.1  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0883  RND family efflux transporter MFP subunit  28.08 
 
 		 363 aa  70.1  0.00000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1573  RND family efflux transporter MFP subunit  30 
 
 		 399 aa  70.1  0.00000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2688  RND family efflux transporter MFP subunit  30.37 
 
 		 353 aa  70.1  0.00000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000000261317  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3265  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.35 
 
 		 404 aa  69.7  0.00000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1440  secretion protein HlyD  23.69 
 
 		 376 aa  69.7  0.00000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4180  RND family efflux transporter MFP subunit  23.99 
 
 		 366 aa  68.9  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.249201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4663  RND family efflux transporter MFP subunit  30.17 
 
 		 394 aa  69.3  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>