More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0878 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_0878  secretion protein HlyD  100 
 
 		 263 aa  527  1e-149  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0949246  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0618  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  58.08 
 
 		 268 aa  298  5e-80  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0454  secretion protein HlyD  29.54 
 
 		 373 aa  124  1e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.63564  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4180  RND family efflux transporter MFP subunit  30.95 
 
 		 366 aa  119  3e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.249201  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4521  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.24 
 
 		 379 aa  119  6e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5559  secretion protein HlyD  30.67 
 
 		 366 aa  117  3e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1389  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.29 
 
 		 374 aa  110  3e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000158934  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1163  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.28 
 
 		 377 aa  106  4e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00317162  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2949  RND family efflux transporter MFP subunit  27.24 
 
 		 376 aa  104  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0549  secretion protein HlyD  27.8 
 
 		 407 aa  104  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000105  membrane-fusion protein  28.22 
 
 		 351 aa  102  5e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.860226  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0206  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.21 
 
 		 386 aa  102  5e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2000  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.89 
 
 		 360 aa  102  6e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.461729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2367  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.89 
 
 		 360 aa  102  6e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2100  RND family efflux transporter MFP subunit  26.72 
 
 		 379 aa  102  7e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0493506  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.5 
 
 		 377 aa  100  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.69897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1908  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.46 
 
 		 407 aa  100  3e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0321  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.78 
 
 		 386 aa  98.6  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1234  RND family efflux transporter MFP subunit  27.94 
 
 		 359 aa  96.7  3e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.580475  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3852  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.51 
 
 		 365 aa  96.3  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3056  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.76 
 
 		 395 aa  95.9  6e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2074  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.36 
 
 		 353 aa  94  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.104068  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3467  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.03 
 
 		 376 aa  93.2  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00013135  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3936  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.1 
 
 		 365 aa  91.7  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00117548 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2814  RND family efflux transporter MFP subunit  24.43 
 
 		 370 aa  89.4  6e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1847  putative efflux transporter  25.81 
 
 		 421 aa  86.3  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0059  RND family efflux transporter MFP subunit  28.09 
 
 		 411 aa  86.3  5e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4229  RND family efflux transporter MFP subunit  26 
 
 		 371 aa  85.9  6e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0271349  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5381  RND family efflux transporter MFP subunit  27.08 
 
 		 364 aa  84.7  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.996751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3711  RND family efflux transporter MFP subunit  25.9 
 
 		 389 aa  84  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1515  RND family efflux transporter MFP subunit  27.38 
 
 		 405 aa  84  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1161  RND family efflux transporter MFP subunit  23.39 
 
 		 404 aa  82.8  0.000000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0203325  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2408  secretion protein HlyD  22.58 
 
 		 404 aa  82.4  0.000000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000198894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4150  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.47 
 
 		 397 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00923789  hitchhiker  0.000000297953 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2552  secretion protein HlyD  24.33 
 
 		 451 aa  80.5  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.603084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6340  secretion protein HlyD  25.1 
 
 		 369 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.900675  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1739  RND family efflux transporter MFP subunit  25.1 
 
 		 369 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.357806  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4226  RND family efflux transporter MFP subunit  26.55 
 
 		 426 aa  79.7  0.00000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.499264  normal  0.926991 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0567  RND family efflux transporter MFP subunit  25.38 
 
 		 424 aa  79.7  0.00000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1334  putative RND efflux membrane fusion protein precursor  25.71 
 
 		 393 aa  79.7  0.00000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0169276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1133  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.29 
 
 		 391 aa  79.7  0.00000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0793831  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1752  RND family efflux transporter MFP subunit  24.59 
 
 		 369 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0882  hypothetical protein  25.41 
 
 		 338 aa  79  0.00000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2396  secretion protein HlyD  23.98 
 
 		 346 aa  79  0.00000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1385  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.16 
 
 		 380 aa  78.2  0.0000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0605754  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0505  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.95 
 
 		 349 aa  78.2  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3408  RND family efflux transporter MFP subunit  24.9 
 
 		 389 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0128497  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2827  RND family efflux transporter MFP subunit  22.14 
 
 		 352 aa  77.8  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00918161  hitchhiker  0.00100699 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0913  hypothetical protein  25 
 
 		 338 aa  77.8  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5356  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.11 
 
 		 510 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0830  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.5 
 
 		 390 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0664  RND family efflux transporter MFP subunit  23.46 
 
 		 342 aa  77.8  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.295272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3265  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.98 
 
 		 404 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2213  secretion protein HlyD  24.9 
 
 		 407 aa  77  0.0000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1456  RND family efflux transporter MFP subunit  21.56 
 
 		 405 aa  77  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0986  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.98 
 
 		 405 aa  77  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.831389 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3414  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.89 
 
 		 1462 aa  77  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3883  secretion protein HlyD  25 
 
 		 424 aa  76.3  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.135938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0225  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.08 
 
 		 347 aa  75.9  0.0000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.175978  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3379  RND family efflux transporter MFP subunit  26.22 
 
 		 409 aa  75.9  0.0000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.189038 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0041  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.1 
 
 		 378 aa  74.7  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89791  normal  0.261432 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1808  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.73 
 
 		 510 aa  75.1  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.034543  normal  0.527092 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5035  HlyD family secretion protein  24.9 
 
 		 396 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.611497 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3248  RND family efflux transporter MFP subunit  24.9 
 
 		 375 aa  74.7  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000122145  hitchhiker  0.000539204 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0503  secretion protein HlyD  24.71 
 
 		 390 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1455  RND family efflux transporter MFP subunit  25.36 
 
 		 345 aa  73.9  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2322  secretion protein HlyD  25.34 
 
 		 399 aa  73.9  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000756014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1748  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.59 
 
 		 388 aa  74.3  0.000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0175  hypothetical protein  28.8 
 
 		 380 aa  73.9  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.109936  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0237  RND family efflux transporter MFP subunit  24.17 
 
 		 397 aa  73.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0200  secretion protein HlyD  22.73 
 
 		 365 aa  73.6  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2289  RND family efflux transporter MFP subunit  23.66 
 
 		 371 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.412391  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2514  acriflavin resistance protein B  27.53 
 
 		 371 aa  73.6  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.825279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1354  HlyD family secretion protein  28.74 
 
 		 364 aa  73.2  0.000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000336467  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3735  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.51 
 
 		 362 aa  73.2  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4943  RND efflux membrane fusion protein precursor  24.81 
 
 		 375 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1502  secretion protein HlyD  23.79 
 
 		 478 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.184777  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0820  secretion protein HlyD family protein  22.39 
 
 		 342 aa  73.2  0.000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.495738  hitchhiker  0.000581546 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6327  RND family efflux transporter MFP subunit  23.79 
 
 		 478 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0452278  normal  0.980568 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0827  RND family efflux transporter MFP subunit  24.9 
 
 		 374 aa  72.8  0.000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.308781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1660  RND family efflux transporter MFP subunit  23.57 
 
 		 369 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2520  RND family efflux transporter MFP subunit  25.61 
 
 		 406 aa  72.8  0.000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0583  HlyD family secretion protein  26.47 
 
 		 334 aa  72.4  0.000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14330  Secretion protein HlyD family  28.91 
 
 		 401 aa  72.8  0.000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.774042  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1791  secretion protein HlyD  25.7 
 
 		 402 aa  72.8  0.000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56880  putative membrane fusion protein  25.19 
 
 		 376 aa  72.4  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1520  RND family efflux transporter MFP subunit  24.24 
 
 		 370 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.289277 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1309  efflux protein  24.8 
 
 		 364 aa  72.4  0.000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.94 
 
 		 428 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0829  CzcB family heavy metal efflux protein  24.9 
 
 		 423 aa  72  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.402667  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0161  RND family efflux transporter MFP subunit  26.51 
 
 		 380 aa  71.6  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3128  secretion protein HlyD  23.32 
 
 		 370 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000130607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05040  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.33 
 
 		 509 aa  71.6  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00959096  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1462  RND efflux membrane fusion protein precursor  24.28 
 
 		 367 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1178  RND family efflux transporter MFP subunit  27.27 
 
 		 390 aa  72  0.00000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6991  RND family efflux transporter MFP subunit  23.42 
 
 		 472 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.231557 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1839  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.34 
 
 		 420 aa  71.2  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16800  putative efflux transmembrane protein  24.28 
 
 		 367 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0868415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1349  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.7 
 
 		 409 aa  71.2  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0580213 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3351  RND family efflux transporter MFP subunit  24.34 
 
 		 367 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>