More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1908 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_1908  efflux transporter, RND family, MFP subunit  100 
 
 		 407 aa  806    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0098  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.65 
 
 		 432 aa  162  7e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.96 
 
 		 377 aa  158  1e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.69897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2100  RND family efflux transporter MFP subunit  34 
 
 		 379 aa  146  5e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0493506  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2949  RND family efflux transporter MFP subunit  30.66 
 
 		 376 aa  145  2e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2322  secretion protein HlyD  33.51 
 
 		 399 aa  130  4.0000000000000003e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000756014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0454  secretion protein HlyD  31.65 
 
 		 373 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.63564  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1847  putative efflux transporter  33.63 
 
 		 421 aa  127  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0031  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.54 
 
 		 392 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000323168  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2370  secretion protein HlyD  32.46 
 
 		 405 aa  125  1e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000467489 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0830  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.61 
 
 		 390 aa  123  5e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1281  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.7 
 
 		 357 aa  122  9.999999999999999e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.036609  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1163  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.51 
 
 		 377 aa  122  1.9999999999999998e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00317162  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4150  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.8 
 
 		 397 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00923789  hitchhiker  0.000000297953 
 
 
-
 
NC_002950  PG0539  RND family efflux transporter MFP subunit  28.57 
 
 		 350 aa  120  4.9999999999999996e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1469  secretion protein HlyD  30.81 
 
 		 421 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.910926 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1839  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.66 
 
 		 420 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2408  secretion protein HlyD  29.48 
 
 		 404 aa  117  5e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000198894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3883  secretion protein HlyD  31.1 
 
 		 424 aa  116  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.135938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1791  secretion protein HlyD  29.33 
 
 		 402 aa  116  6.9999999999999995e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3828  secretion protein HlyD  32.37 
 
 		 430 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1186  RND family efflux transporter MFP subunit  29.1 
 
 		 374 aa  115  1.0000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.425099  normal  0.0297054 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1748  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.61 
 
 		 388 aa  114  3e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0431  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.12 
 
 		 368 aa  114  3e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1456  RND family efflux transporter MFP subunit  30.06 
 
 		 405 aa  114  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4563  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.14 
 
 		 426 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3467  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.97 
 
 		 376 aa  113  5e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00013135  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4226  RND family efflux transporter MFP subunit  32.45 
 
 		 426 aa  113  6e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.499264  normal  0.926991 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0949  RND family efflux transporter MFP subunit  30.86 
 
 		 390 aa  112  8.000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0753  secretion protein HlyD  25.89 
 
 		 370 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2316  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.27 
 
 		 379 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.144925 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2584  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.25 
 
 		 421 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1550  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26 
 
 		 413 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0505882  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0080  RND family efflux transporter MFP subunit  32.23 
 
 		 414 aa  110  3e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.95759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4521  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.85 
 
 		 379 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3522  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.97 
 
 		 421 aa  109  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4180  RND family efflux transporter MFP subunit  32.61 
 
 		 366 aa  109  7.000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.249201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5559  secretion protein HlyD  31.88 
 
 		 366 aa  108  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0521  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.55 
 
 		 394 aa  109  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.583395 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1161  RND family efflux transporter MFP subunit  29.3 
 
 		 404 aa  108  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0203325  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2928  RND family efflux transporter MFP subunit  28.57 
 
 		 431 aa  108  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00603978  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3408  RND family efflux transporter MFP subunit  29.55 
 
 		 389 aa  108  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0128497  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1515  RND family efflux transporter MFP subunit  29.01 
 
 		 405 aa  107  3e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2837  RND family efflux transporter MFP subunit  30.47 
 
 		 406 aa  107  3e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0025637 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3711  RND family efflux transporter MFP subunit  28.06 
 
 		 389 aa  107  4e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0175  hypothetical protein  27.76 
 
 		 380 aa  107  5e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.109936  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1695  secretion protein HlyD  27.12 
 
 		 360 aa  106  7e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0453  secretion protein HlyD family protein  30.59 
 
 		 287 aa  106  9e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1621  secretion protein HlyD  26.37 
 
 		 407 aa  106  9e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3461  secretion protein HlyD  29.82 
 
 		 384 aa  105  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3832  RND family efflux transporter MFP subunit  26.17 
 
 		 374 aa  105  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0308  secretion protein HlyD  27.17 
 
 		 421 aa  105  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.742688 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0768  acriflavin resistance periplasmic protein  25.45 
 
 		 348 aa  105  1e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.69171  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1713  multidrug resistance efflux pump-like protein  28.06 
 
 		 392 aa  105  1e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.254154  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2347  RND family efflux transporter MFP subunit  26.17 
 
 		 374 aa  105  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.161325  hitchhiker  0.00157605 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3939  RND family efflux transporter MFP subunit  29.97 
 
 		 367 aa  105  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.407918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1398  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.64 
 
 		 504 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.463842 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0878  secretion protein HlyD  28.46 
 
 		 263 aa  105  2e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0949246  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3412  secretion protein HlyD  33.13 
 
 		 443 aa  105  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0866166  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3265  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.86 
 
 		 404 aa  105  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1938  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.12 
 
 		 462 aa  105  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000755017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0319  RND family efflux transporter MFP subunit  27.41 
 
 		 417 aa  104  3e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2046  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.74 
 
 		 442 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0225  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.76 
 
 		 347 aa  103  4e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.175978  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2825  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.59 
 
 		 476 aa  103  4e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.292175  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0382  RND family efflux transporter MFP subunit  27.86 
 
 		 396 aa  103  8e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.410142  normal  0.745706 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1389  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.08 
 
 		 374 aa  102  9e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000158934  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3362  RND family efflux transporter MFP subunit  28.61 
 
 		 358 aa  102  9e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0275  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.15 
 
 		 381 aa  102  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0270  putative MacA-like membrane transport protein  27.03 
 
 		 417 aa  102  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2530  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.45 
 
 		 430 aa  102  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.559583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2374  RND family efflux transporter MFP subunit  27.75 
 
 		 395 aa  102  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.347836 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2020  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.1 
 
 		 414 aa  102  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.152554 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0644  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.42 
 
 		 425 aa  102  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0200148  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0558  secretion protein HlyD  29.89 
 
 		 360 aa  101  2e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.177986  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1340  secretion protein HlyD  28.34 
 
 		 424 aa  102  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3561  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.84 
 
 		 420 aa  101  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.306068  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5358  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.71 
 
 		 396 aa  101  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0303  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.78 
 
 		 377 aa  100  3e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.158537  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3379  RND family efflux transporter MFP subunit  31 
 
 		 409 aa  100  3e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.189038 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2455  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.18 
 
 		 391 aa  101  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.035635  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0962  secretion protein HlyD  31.55 
 
 		 405 aa  100  7e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.255558  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1497  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.7 
 
 		 407 aa  99.8  7e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.30393  hitchhiker  0.00778895 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2954  RND family efflux transporter MFP subunit  27.58 
 
 		 364 aa  99.8  8e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000249187  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05040  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.65 
 
 		 509 aa  99.4  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00959096  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0618  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  28.4 
 
 		 268 aa  99.4  1e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4229  RND family efflux transporter MFP subunit  30.17 
 
 		 371 aa  98.2  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0271349  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1965  secretion protein HlyD  26.76 
 
 		 388 aa  98.2  2e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.455875 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0067  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.18 
 
 		 453 aa  98.2  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1571  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.51 
 
 		 435 aa  98.2  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.334008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0549  secretion protein HlyD  29.3 
 
 		 407 aa  97.8  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000105  membrane-fusion protein  27.73 
 
 		 351 aa  97.8  3e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.860226  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1916  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29 
 
 		 384 aa  97.8  3e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0836  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.93 
 
 		 363 aa  97.4  4e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0935853  normal  0.864756 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3214  putative efflux protein  26.87 
 
 		 367 aa  97.4  4e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4014  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.56 
 
 		 362 aa  97.1  5e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0181773  normal  0.127593 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0775  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.36 
 
 		 479 aa  96.7  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3463  HlyD family secretion protein  28.07 
 
 		 378 aa  97.1  6e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3303  RND family efflux transporter MFP subunit  29.39 
 
 		 418 aa  97.1  6e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.3496  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0206  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.15 
 
 		 386 aa  97.1  6e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>