More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0303 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0303  efflux transporter, RND family, MFP subunit  100 
 
 		 377 aa  719    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.158537  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2316  efflux transporter, RND family, MFP subunit  47.44 
 
 		 379 aa  299  7e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.144925 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2818  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.83 
 
 		 349 aa  115  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1234  RND family efflux transporter MFP subunit  26.76 
 
 		 359 aa  113  5e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.580475  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0212  secretion protein HlyD  25.73 
 
 		 364 aa  112  9e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.59943 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0308  secretion protein HlyD  27.38 
 
 		 421 aa  107  4e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.742688 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1908  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.1 
 
 		 407 aa  107  4e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1439  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.44 
 
 		 380 aa  103  7e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0465471  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2229  RND family efflux transporter MFP subunit  27.66 
 
 		 405 aa  103  7e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1921  RND family efflux transporter MFP subunit  28.01 
 
 		 340 aa  100  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00271277  normal  0.413551 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3700  secretion protein HlyD  31.33 
 
 		 381 aa  100  3e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0753  secretion protein HlyD  28.28 
 
 		 370 aa  100  5e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1783  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.09 
 
 		 354 aa  100  5e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2559  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.13 
 
 		 349 aa  99.4  8e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.99545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1385  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.75 
 
 		 380 aa  98.2  2e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0605754  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0901  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.71 
 
 		 351 aa  98.2  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.470272  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000105  membrane-fusion protein  29.62 
 
 		 351 aa  96.7  5e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.860226  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2781  RND family efflux transporter MFP subunit  25.97 
 
 		 372 aa  96.7  6e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00032103  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0364  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.42 
 
 		 362 aa  96.3  8e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.405995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3395  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.67 
 
 		 389 aa  95.9  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3208  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.52 
 
 		 357 aa  95.1  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0146448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0766  HlyD family secretion protein  27.76 
 
 		 392 aa  94.4  3e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1163  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.79 
 
 		 377 aa  94  4e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00317162  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0942  acriflavine resistance protein E  24.11 
 
 		 374 aa  94  4e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2786  RND family efflux transporter MFP subunit  28.76 
 
 		 372 aa  93.6  5e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000125206  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2949  RND family efflux transporter MFP subunit  23.8 
 
 		 376 aa  93.2  7e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1080  MacA  22.87 
 
 		 394 aa  92  1e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6340  secretion protein HlyD  27.38 
 
 		 369 aa  92  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.900675  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1739  RND family efflux transporter MFP subunit  27.38 
 
 		 369 aa  92  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.357806  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0438  hypothetical protein  29.01 
 
 		 352 aa  91.7  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000000466929  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0321  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.98 
 
 		 386 aa  91.3  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0535  secretion protein HlyD  22.6 
 
 		 366 aa  91.3  2e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2657  cation or acridine efflux membrane fusion protein  23.33 
 
 		 357 aa  91.7  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2939  RND family efflux transporter MFP subunit  22.34 
 
 		 352 aa  91.7  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.0067677  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3169  RND family efflux transporter MFP subunit  29.41 
 
 		 369 aa  90.9  3e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000222351  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0767  RND family efflux transporter MFP subunit  25.34 
 
 		 372 aa  90.9  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00075698  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2074  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.12 
 
 		 353 aa  90.5  4e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.104068  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4151  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.27 
 
 		 451 aa  90.9  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0426406  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3313  RND family efflux transporter MFP subunit  29.41 
 
 		 369 aa  90.5  4e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000984298  normal  0.15916 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3170  RND family efflux transporter MFP subunit  29.41 
 
 		 369 aa  90.5  4e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000721535  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0161  RND family efflux transporter MFP subunit  29.88 
 
 		 380 aa  90.5  4e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1201  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.41 
 
 		 369 aa  90.5  5e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000118856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0062  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.03 
 
 		 358 aa  90.1  5e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0123174  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1455  RND family efflux transporter MFP subunit  28.84 
 
 		 345 aa  90.1  6e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.4 
 
 		 377 aa  90.1  6e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.69897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2922  RND family efflux transporter MFP subunit  26.63 
 
 		 459 aa  89.7  7e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.363027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3803  RND family efflux transporter MFP subunit  25.95 
 
 		 376 aa  89.4  8e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.591559 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4415  RND family efflux transporter MFP subunit  27.63 
 
 		 458 aa  89.7  8e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.553493  normal  0.934455 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3483  HlyD family secretion protein  27.57 
 
 		 369 aa  89  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0816  HlyD family secretion protein  27.05 
 
 		 328 aa  88.2  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1621  secretion protein HlyD  29.43 
 
 		 407 aa  87.8  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0431  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.65 
 
 		 368 aa  87.8  3e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1660  RND family efflux transporter MFP subunit  27.38 
 
 		 369 aa  87.8  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3832  RND family efflux transporter MFP subunit  26.59 
 
 		 374 aa  87.4  4e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2347  RND family efflux transporter MFP subunit  26.59 
 
 		 374 aa  87.4  4e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.161325  hitchhiker  0.00157605 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1752  RND family efflux transporter MFP subunit  27.08 
 
 		 369 aa  87  5e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2611  macrolide transporter subunit MacA  25.4 
 
 		 370 aa  87  5e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4297  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.9 
 
 		 397 aa  86.7  6e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.430357  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2757  secretion protein HlyD  26.94 
 
 		 376 aa  86.7  6e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.220243  normal  0.336362 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31870  putative RND efflux membrane fusion protein precursor  25.24 
 
 		 426 aa  86.7  6e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0059  RND family efflux transporter MFP subunit  29.17 
 
 		 411 aa  86.7  7e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1951  multidrug efflux RND membrane fusion protein MexE  31.78 
 
 		 438 aa  86.3  7e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4699  RND family efflux transporter MFP subunit  25.46 
 
 		 405 aa  86.3  7e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1389  efflux transporter, RND family, MFP subunit  20.73 
 
 		 374 aa  86.3  8e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000158934  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1088  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.08 
 
 		 431 aa  86.3  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.745056 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2202  RND family efflux transporter MFP subunit  24.66 
 
 		 407 aa  86.3  8e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0170  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.28 
 
 		 450 aa  86.3  8e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.736393 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01736  HlyD family secretion protein  26.37 
 
 		 349 aa  86.3  9e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2764  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.92 
 
 		 371 aa  85.5  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.161658  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2696  macrolide transporter subunit MacA  25.08 
 
 		 370 aa  85.5  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.761507  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2103  RND family efflux transporter MFP subunit  26.44 
 
 		 403 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0796794  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3096  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.84 
 
 		 396 aa  85.5  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.219805 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1597  macrolide transporter subunit MacA  25.08 
 
 		 370 aa  85.5  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5230  RND family efflux transporter MFP subunit  25.2 
 
 		 405 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0639393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4441  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.07 
 
 		 416 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05040  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.98 
 
 		 509 aa  85.5  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00959096  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1084  RND family efflux transporter MFP subunit  27.7 
 
 		 370 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0120074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1150  RND family efflux transporter MFP subunit  27.7 
 
 		 373 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000335121  normal  0.257402 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1256  membrane fusion protein (MFP) family auxiliary transport protein  22.33 
 
 		 397 aa  85.5  0.000000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00883  macrolide transporter subunit, membrane fusion protein (MFP) component  24.92 
 
 		 371 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4918  RND family efflux transporter MFP subunit  24.87 
 
 		 405 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.890764  normal  0.731397 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0982  macrolide transporter subunit MacA  24.92 
 
 		 371 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.44834  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00889  hypothetical protein  24.92 
 
 		 371 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004022  membrane-fusion protein  26.8 
 
 		 369 aa  85.1  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000160707  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2670  multidrug efflux RND membrane fusion protein MexE  29.75 
 
 		 426 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.768547  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2451  macrolide transporter subunit MacA  24.92 
 
 		 371 aa  85.1  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00913289  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0951  macrolide transporter subunit MacA  24.92 
 
 		 371 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0557503  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2718  macrolide transporter subunit MacA  24.92 
 
 		 371 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0635  macrolide-specific efflux protein macA  21.79 
 
 		 390 aa  84.7  0.000000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0167041  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3014  secretion protein HlyD  24.87 
 
 		 405 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3467  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.12 
 
 		 376 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00013135  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5352  RND family efflux transporter MFP subunit  24.87 
 
 		 405 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.730017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3379  RND family efflux transporter MFP subunit  30.69 
 
 		 409 aa  84.7  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.189038 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3456  RND family efflux transporter MFP subunit  27.57 
 
 		 391 aa  84.7  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3735  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.33 
 
 		 362 aa  84  0.000000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2282  macrolide transporter subunit MacA  24.92 
 
 		 371 aa  84  0.000000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000339116  normal  0.0134871 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3689  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.96 
 
 		 414 aa  84  0.000000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1660  RND family efflux transporter MFP subunit  27.08 
 
 		 361 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2684  multidrug efflux system subunit MdtA  25.61 
 
 		 411 aa  83.6  0.000000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1084  RND family efflux transporter MFP subunit  27.03 
 
 		 370 aa  83.6  0.000000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.143794  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>