More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4441 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_4441  efflux transporter, RND family, MFP subunit  100 
 
 		 416 aa  809    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3252  RND family efflux transporter MFP subunit  78.19 
 
 		 431 aa  578  1e-164  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0557412 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2439  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.22 
 
 		 379 aa  220  3e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000851177  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0601  secretion protein HlyD  38.33 
 
 		 459 aa  217  2.9999999999999998e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.251315  normal  0.72194 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1596  RND family efflux transporter MFP subunit  37.82 
 
 		 398 aa  214  1.9999999999999998e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.566633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2202  RND family efflux transporter MFP subunit  36.9 
 
 		 407 aa  211  3e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1516  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.87 
 
 		 440 aa  207  4e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0766  HlyD family secretion protein  37.94 
 
 		 392 aa  206  8e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3424  secretion protein HlyD  37.02 
 
 		 412 aa  205  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1651  secretion protein HlyD  35.41 
 
 		 407 aa  205  1e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.986785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2957  secretion protein HlyD  36.06 
 
 		 389 aa  204  3e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0178504  normal  0.933874 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1389  HlyD family secretion protein  37.24 
 
 		 435 aa  200  3.9999999999999996e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.379904  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0816  HlyD family secretion protein  37.24 
 
 		 328 aa  200  5e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2372  RND family efflux transporter MFP subunit  34.76 
 
 		 395 aa  199  6e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1088  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.02 
 
 		 431 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.745056 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0450  RND family efflux transporter MFP subunit  35.1 
 
 		 407 aa  198  2.0000000000000003e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.825026 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5556  HlyD family secretion protein  37.35 
 
 		 460 aa  197  3e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.357056  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0380  secretion protein HlyD  37.13 
 
 		 400 aa  196  7e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4556  RND family efflux transporter MFP subunit  37.99 
 
 		 383 aa  195  1e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.589535  normal  0.76991 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4296  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.74 
 
 		 462 aa  195  1e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4184  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.74 
 
 		 462 aa  195  1e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.267577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31870  putative RND efflux membrane fusion protein precursor  34.41 
 
 		 426 aa  195  1e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0825  RND family efflux transporter MFP subunit  35.52 
 
 		 383 aa  195  1e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03141  putative resistance transmembrane protein  34.44 
 
 		 449 aa  194  2e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.704547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1266  secretion protein HlyD  36.31 
 
 		 411 aa  193  4e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.279661  normal  0.224738 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1169  RND family efflux transporter MFP subunit  33.04 
 
 		 389 aa  193  4e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.567946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1510  secretion protein HlyD  34.73 
 
 		 395 aa  193  4e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2708  RND efflux membrane fusion protein precursor  34.12 
 
 		 426 aa  193  6e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0286088  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1129  secretion protein HlyD  36.22 
 
 		 388 aa  192  7e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0780076 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0939  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.83 
 
 		 435 aa  191  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.961287  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1610  RND family efflux transporter MFP subunit  36.34 
 
 		 394 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.665479  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3527  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.81 
 
 		 446 aa  189  5e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2186  RND family efflux transporter MFP subunit  34.11 
 
 		 435 aa  189  5e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3608  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.76 
 
 		 445 aa  189  5e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.704164  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0732  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.94 
 
 		 440 aa  189  7e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3585  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.82 
 
 		 435 aa  188  1e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1309  HlyD family secretion protein  34.42 
 
 		 388 aa  188  1e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2802  RND family efflux transporter MFP subunit  34.24 
 
 		 430 aa  189  1e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.662741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2670  multidrug efflux RND membrane fusion protein MexE  37.81 
 
 		 426 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.768547  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2803  secretion protein HlyD  35.21 
 
 		 376 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.602838  normal  0.227029 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2530  RND family efflux transporter MFP subunit  37.81 
 
 		 412 aa  187  3e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2583  RND family efflux transporter MFP subunit  37.5 
 
 		 411 aa  187  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0404665  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4661  secretion protein HlyD  32.58 
 
 		 386 aa  186  4e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411044 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4319  RND family efflux transporter MFP subunit  32.86 
 
 		 460 aa  187  4e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0569861 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3327  RND family efflux transporter MFP subunit  37.35 
 
 		 441 aa  187  4e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4151  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.53 
 
 		 451 aa  186  5e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0426406  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14330  Secretion protein HlyD family  34.33 
 
 		 401 aa  186  5e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.774042  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3651  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.35 
 
 		 441 aa  186  5e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1418  multidrug efflux RND membrane fusion protein MexE  37.5 
 
 		 425 aa  186  5e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3170  multidrug efflux RND membrane fusion protein MexE  37.5 
 
 		 412 aa  186  6e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0585728  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2144  multidrug efflux RND membrane fusion protein MexE  37.5 
 
 		 412 aa  186  6e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.254489  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2329  RND family efflux transporter MFP subunit  33.64 
 
 		 436 aa  186  6e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.4455  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1643  multidrug efflux RND membrane fusion protein MexE  37.5 
 
 		 414 aa  186  7e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0226554  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1951  multidrug efflux RND membrane fusion protein MexE  38.44 
 
 		 438 aa  186  7e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2842  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.35 
 
 		 455 aa  186  7e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.416467  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3005  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.87 
 
 		 455 aa  186  9e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.568711  normal  0.749765 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1334  putative RND efflux membrane fusion protein precursor  38.8 
 
 		 393 aa  186  9e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0169276  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0064  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.1 
 
 		 377 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2757  secretion protein HlyD  34.46 
 
 		 376 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.220243  normal  0.336362 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3309  RND family efflux transporter MFP subunit  33.64 
 
 		 430 aa  184  2.0000000000000003e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.717365 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0736  RND family efflux transporter MFP subunit  33.98 
 
 		 387 aa  185  2.0000000000000003e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0346  RND family efflux transporter MFP subunit  36.36 
 
 		 360 aa  183  4.0000000000000006e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.499232  normal  0.99105 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2256  RND family efflux transporter MFP subunit  36.36 
 
 		 538 aa  183  5.0000000000000004e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0589481 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3537  putative component of multidrug efflux pump, mdtA-like protein  32.66 
 
 		 389 aa  183  6e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1530  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.59 
 
 		 391 aa  182  8.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2569  secretion protein HlyD  36.56 
 
 		 462 aa  182  8.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.103631 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4389  RND family efflux transporter MFP subunit  33.43 
 
 		 387 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0818366 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28820  secretion protein, HlyD family  35.45 
 
 		 441 aa  182  9.000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.20411  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1124  RND family efflux transporter MFP subunit  34.36 
 
 		 408 aa  181  1e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.360909 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1971  secretion protein HlyD  35.6 
 
 		 362 aa  182  1e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0533  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.51 
 
 		 381 aa  182  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4415  RND family efflux transporter MFP subunit  33.23 
 
 		 458 aa  181  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.553493  normal  0.934455 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3395  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.04 
 
 		 389 aa  181  2e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0838  RND family efflux transporter MFP subunit  33.33 
 
 		 387 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2907  RND efflux system membrane fusion protein  32.34 
 
 		 433 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.484522  normal  0.506514 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4306  HlyD family secretion protein  33.14 
 
 		 456 aa  179  7e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0237047  normal  0.270235 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3581  secretion protein HlyD  35.82 
 
 		 407 aa  179  8e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.434034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0572  secretion protein HlyD  33.23 
 
 		 498 aa  179  9e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0544292  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2902  secretion protein HlyD  36.25 
 
 		 464 aa  179  9e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.56576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2742  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.81 
 
 		 462 aa  179  1e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.878273  normal  0.333603 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2482  secretion protein HlyD  32.42 
 
 		 434 aa  179  1e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.179732  normal  0.227362 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2521  secretion protein HlyD  31.27 
 
 		 435 aa  179  1e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.770973  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2447  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.93 
 
 		 462 aa  179  1e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2519  RND family efflux transporter MFP subunit  32.81 
 
 		 462 aa  177  2e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0990554 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1080  RND family efflux transporter MFP subunit  32 
 
 		 463 aa  178  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6935  AcrB/AcrD/AcrF family mulitdrug efflux protein  37.31 
 
 		 377 aa  178  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.532768  normal  0.737034 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2753  HlyD family secretion protein  32.94 
 
 		 444 aa  177  3e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1577  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.34 
 
 		 434 aa  177  3e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.321925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1080  RND family efflux transporter MFP subunit  31.98 
 
 		 457 aa  177  4e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1172  RND family efflux transporter MFP subunit  32.85 
 
 		 454 aa  177  4e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.118061 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0900  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.4 
 
 		 384 aa  177  4e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000108273  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2094  RND family efflux transporter MFP subunit  36.51 
 
 		 377 aa  176  7e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0888739  normal  0.0111779 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3932  multidrug resistance protein mdtA precursor  35.12 
 
 		 473 aa  176  9e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.416339 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0910  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.34 
 
 		 393 aa  176  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1771  RND family efflux transporter MFP subunit  32.34 
 
 		 469 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.75905 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4472  RND family efflux transporter MFP subunit  36.94 
 
 		 447 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0821721 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2922  RND family efflux transporter MFP subunit  33.64 
 
 		 459 aa  175  1.9999999999999998e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.363027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0170  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.33 
 
 		 450 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.736393 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2065  secretion protein HlyD  34.18 
 
 		 454 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.309375  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1198  RND family efflux transporter MFP subunit  32.56 
 
 		 457 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.495254  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>