More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3252 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_3252  RND family efflux transporter MFP subunit  100 
 
 		 431 aa  828    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0557412 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4441  efflux transporter, RND family, MFP subunit  78.19 
 
 		 416 aa  593  1e-168  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2439  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.89 
 
 		 379 aa  231  1e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000851177  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1516  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.34 
 
 		 440 aa  226  5.0000000000000005e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3424  secretion protein HlyD  38.46 
 
 		 412 aa  212  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1596  RND family efflux transporter MFP subunit  38.2 
 
 		 398 aa  208  1e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.566633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2957  secretion protein HlyD  37.17 
 
 		 389 aa  208  1e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0178504  normal  0.933874 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0766  HlyD family secretion protein  38.84 
 
 		 392 aa  207  3e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2372  RND family efflux transporter MFP subunit  35.61 
 
 		 395 aa  201  3e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1651  secretion protein HlyD  34.81 
 
 		 407 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.986785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1389  HlyD family secretion protein  37.24 
 
 		 435 aa  199  1.0000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.379904  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1088  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.02 
 
 		 431 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.745056 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4556  RND family efflux transporter MFP subunit  38.46 
 
 		 383 aa  198  2.0000000000000003e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.589535  normal  0.76991 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2202  RND family efflux transporter MFP subunit  35.31 
 
 		 407 aa  196  6e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0816  HlyD family secretion protein  37.78 
 
 		 328 aa  194  2e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0939  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.35 
 
 		 435 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.961287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1169  RND family efflux transporter MFP subunit  33.92 
 
 		 389 aa  193  4e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.567946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0601  secretion protein HlyD  36.97 
 
 		 459 aa  193  6e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.251315  normal  0.72194 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0380  secretion protein HlyD  37.01 
 
 		 400 aa  192  1e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0064  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.9 
 
 		 377 aa  192  1e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1971  secretion protein HlyD  36.13 
 
 		 362 aa  190  2.9999999999999997e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0825  RND family efflux transporter MFP subunit  35 
 
 		 383 aa  190  5e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3395  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.33 
 
 		 389 aa  189  8e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6935  AcrB/AcrD/AcrF family mulitdrug efflux protein  38.97 
 
 		 377 aa  188  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.532768  normal  0.737034 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0450  RND family efflux transporter MFP subunit  34.48 
 
 		 407 aa  189  1e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.825026 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2530  RND family efflux transporter MFP subunit  39.22 
 
 		 412 aa  188  2e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2670  multidrug efflux RND membrane fusion protein MexE  39.22 
 
 		 426 aa  188  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.768547  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3309  RND family efflux transporter MFP subunit  34.38 
 
 		 430 aa  187  2e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.717365 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31870  putative RND efflux membrane fusion protein precursor  33.33 
 
 		 426 aa  187  2e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1610  RND family efflux transporter MFP subunit  35.87 
 
 		 394 aa  187  3e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.665479  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1510  secretion protein HlyD  33.25 
 
 		 395 aa  187  4e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2144  multidrug efflux RND membrane fusion protein MexE  38.92 
 
 		 412 aa  186  5e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.254489  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3170  multidrug efflux RND membrane fusion protein MexE  38.92 
 
 		 412 aa  186  5e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0585728  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1418  multidrug efflux RND membrane fusion protein MexE  38.92 
 
 		 425 aa  186  5e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1643  multidrug efflux RND membrane fusion protein MexE  38.92 
 
 		 414 aa  186  6e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0226554  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2583  RND family efflux transporter MFP subunit  38.92 
 
 		 411 aa  186  6e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0404665  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1129  secretion protein HlyD  36.31 
 
 		 388 aa  186  9e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0780076 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1857  efflux transporter, RND family, MFP subunit  43.66 
 
 		 372 aa  185  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2708  RND efflux membrane fusion protein precursor  33.04 
 
 		 426 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0286088  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2803  secretion protein HlyD  35.4 
 
 		 376 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.602838  normal  0.227029 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5556  HlyD family secretion protein  35.63 
 
 		 460 aa  185  1.0000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.357056  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1266  secretion protein HlyD  34.81 
 
 		 411 aa  184  3e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.279661  normal  0.224738 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1530  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.33 
 
 		 391 aa  184  3e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03141  putative resistance transmembrane protein  32.63 
 
 		 449 aa  183  4.0000000000000006e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.704547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2757  secretion protein HlyD  34.8 
 
 		 376 aa  182  7e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.220243  normal  0.336362 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0971  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.6 
 
 		 416 aa  182  8.000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.39107  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2569  secretion protein HlyD  36.76 
 
 		 462 aa  182  8.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.103631 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4184  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.63 
 
 		 462 aa  182  9.000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.267577  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4296  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.63 
 
 		 462 aa  182  9.000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1951  multidrug efflux RND membrane fusion protein MexE  39.58 
 
 		 438 aa  182  1e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2094  RND family efflux transporter MFP subunit  38.17 
 
 		 377 aa  181  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0888739  normal  0.0111779 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2482  secretion protein HlyD  32.1 
 
 		 434 aa  181  2e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.179732  normal  0.227362 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1942  efflux transporter, RND family, MFP subunit  43.07 
 
 		 372 aa  181  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.547654  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3608  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.93 
 
 		 445 aa  181  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.704164  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3527  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.35 
 
 		 446 aa  181  2e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2842  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.41 
 
 		 455 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.416467  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3581  secretion protein HlyD  36.39 
 
 		 407 aa  180  4e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.434034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1334  putative RND efflux membrane fusion protein precursor  38.32 
 
 		 393 aa  180  4e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0169276  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0732  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.16 
 
 		 440 aa  179  9e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0533  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.35 
 
 		 381 aa  179  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1309  HlyD family secretion protein  34.22 
 
 		 388 aa  177  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2753  HlyD family secretion protein  33.25 
 
 		 444 aa  178  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4661  secretion protein HlyD  31.49 
 
 		 386 aa  178  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411044 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3327  RND family efflux transporter MFP subunit  37.35 
 
 		 441 aa  178  2e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3651  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.35 
 
 		 441 aa  178  2e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3005  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.43 
 
 		 455 aa  178  2e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.568711  normal  0.749765 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0736  RND family efflux transporter MFP subunit  35.24 
 
 		 387 aa  178  2e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0346  RND family efflux transporter MFP subunit  36.09 
 
 		 360 aa  177  3e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.499232  normal  0.99105 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2497  secretion protein HlyD  36.23 
 
 		 376 aa  177  5e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0156219  normal  0.535826 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28820  secretion protein, HlyD family  34.69 
 
 		 441 aa  176  7e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.20411  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4166  RND family efflux transporter MFP subunit  32.58 
 
 		 427 aa  176  8e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2922  RND family efflux transporter MFP subunit  34.25 
 
 		 459 aa  176  8e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.363027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2021  secretion protein HlyD  43.66 
 
 		 373 aa  175  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.508004  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2902  secretion protein HlyD  35.94 
 
 		 464 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.56576  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14330  Secretion protein HlyD family  33.62 
 
 		 401 aa  174  1.9999999999999998e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.774042  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4151  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.04 
 
 		 451 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0426406  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3604  secretion protein HlyD  33.14 
 
 		 422 aa  175  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.105186  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4319  RND family efflux transporter MFP subunit  30.28 
 
 		 460 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0569861 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4389  RND family efflux transporter MFP subunit  32.95 
 
 		 387 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0818366 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4415  RND family efflux transporter MFP subunit  32.12 
 
 		 458 aa  173  5.999999999999999e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.553493  normal  0.934455 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2186  RND family efflux transporter MFP subunit  33.33 
 
 		 435 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3585  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.56 
 
 		 435 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2256  RND family efflux transporter MFP subunit  35.31 
 
 		 538 aa  171  2e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0589481 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1124  RND family efflux transporter MFP subunit  34.83 
 
 		 408 aa  171  2e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.360909 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0970  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.47 
 
 		 375 aa  171  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2802  RND family efflux transporter MFP subunit  34.56 
 
 		 430 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.662741  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2966  multidrug efflux system subunit MdtA  29.63 
 
 		 413 aa  171  3e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.874422  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1312  multidrug efflux system subunit MdtA  30.1 
 
 		 410 aa  171  3e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.164615  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2742  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.54 
 
 		 462 aa  170  3e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.878273  normal  0.333603 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2065  secretion protein HlyD  35 
 
 		 454 aa  171  3e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.309375  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3932  multidrug resistance protein mdtA precursor  34.04 
 
 		 473 aa  171  3e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.416339 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2329  RND family efflux transporter MFP subunit  32.92 
 
 		 436 aa  170  4e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.4455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0135  RND family efflux transporter MFP subunit  34.57 
 
 		 386 aa  170  4e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2038  RND family efflux transporter MFP subunit  37.08 
 
 		 482 aa  170  5e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0373239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2521  secretion protein HlyD  32.75 
 
 		 435 aa  169  6e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.770973  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4306  HlyD family secretion protein  31.62 
 
 		 456 aa  169  6e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0237047  normal  0.270235 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2519  RND family efflux transporter MFP subunit  32.54 
 
 		 462 aa  169  7e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0990554 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2558  secretion protein HlyD  33.75 
 
 		 451 aa  169  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0355119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0838  RND family efflux transporter MFP subunit  33.13 
 
 		 387 aa  169  1e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3537  putative component of multidrug efflux pump, mdtA-like protein  33.43 
 
 		 389 aa  169  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>