More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0939 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0939  efflux transporter, RND family, MFP subunit  100 
 
 		 435 aa  866    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.961287  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1088  efflux transporter, RND family, MFP subunit  89.2 
 
 		 431 aa  686    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.745056 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1389  HlyD family secretion protein  53.41 
 
 		 435 aa  401  9.999999999999999e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.379904  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0766  HlyD family secretion protein  39.07 
 
 		 392 aa  217  2.9999999999999998e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0816  HlyD family secretion protein  40.79 
 
 		 328 aa  211  3e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4441  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.83 
 
 		 416 aa  182  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2757  secretion protein HlyD  35.02 
 
 		 376 aa  178  1e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.220243  normal  0.336362 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2372  RND family efflux transporter MFP subunit  36.16 
 
 		 395 aa  178  2e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1651  secretion protein HlyD  33.63 
 
 		 407 aa  177  3e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.986785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3252  RND family efflux transporter MFP subunit  37.35 
 
 		 431 aa  177  3e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0557412 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2803  secretion protein HlyD  34.78 
 
 		 376 aa  176  6e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.602838  normal  0.227029 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1516  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.74 
 
 		 440 aa  170  5e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0450  RND family efflux transporter MFP subunit  34.51 
 
 		 407 aa  169  6e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.825026 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4556  RND family efflux transporter MFP subunit  34.94 
 
 		 383 aa  169  7e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.589535  normal  0.76991 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2922  RND family efflux transporter MFP subunit  32.87 
 
 		 459 aa  169  8e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.363027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0380  secretion protein HlyD  34.25 
 
 		 400 aa  169  1e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0736  RND family efflux transporter MFP subunit  33.13 
 
 		 387 aa  168  2e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2439  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.33 
 
 		 379 aa  167  2e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000851177  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3424  secretion protein HlyD  33.52 
 
 		 412 aa  166  5e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1610  RND family efflux transporter MFP subunit  33.85 
 
 		 394 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.665479  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1510  secretion protein HlyD  36.34 
 
 		 395 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1266  secretion protein HlyD  33.05 
 
 		 411 aa  164  3e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.279661  normal  0.224738 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2530  RND family efflux transporter MFP subunit  34.19 
 
 		 412 aa  162  9e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2670  multidrug efflux RND membrane fusion protein MexE  34.19 
 
 		 426 aa  162  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.768547  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2094  RND family efflux transporter MFP subunit  35.37 
 
 		 377 aa  162  1e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0888739  normal  0.0111779 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2144  multidrug efflux RND membrane fusion protein MexE  33.87 
 
 		 412 aa  160  3e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.254489  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1643  multidrug efflux RND membrane fusion protein MexE  33.87 
 
 		 414 aa  160  3e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0226554  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3170  multidrug efflux RND membrane fusion protein MexE  33.87 
 
 		 412 aa  160  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0585728  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2583  RND family efflux transporter MFP subunit  33.87 
 
 		 411 aa  160  4e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0404665  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1418  multidrug efflux RND membrane fusion protein MexE  33.87 
 
 		 425 aa  160  4e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1951  multidrug efflux RND membrane fusion protein MexE  34.73 
 
 		 438 aa  159  8e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1971  secretion protein HlyD  33.03 
 
 		 362 aa  159  1e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3581  secretion protein HlyD  32.63 
 
 		 407 aa  156  5.0000000000000005e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.434034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2497  secretion protein HlyD  34.16 
 
 		 376 aa  156  7e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0156219  normal  0.535826 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3395  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.07 
 
 		 389 aa  155  1e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4166  RND family efflux transporter MFP subunit  34.25 
 
 		 427 aa  155  1e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03982  membrane fusion protein  33.02 
 
 		 414 aa  154  2e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3689  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.53 
 
 		 414 aa  154  2.9999999999999998e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2558  secretion protein HlyD  33.97 
 
 		 451 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0355119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1169  RND family efflux transporter MFP subunit  30.12 
 
 		 389 aa  153  5e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.567946  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01979  multidrug efflux system, subunit A  32.2 
 
 		 415 aa  152  1e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1567  multidrug efflux system subunit MdtA  32.2 
 
 		 455 aa  152  1e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.331208 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01971  hypothetical protein  32.2 
 
 		 415 aa  152  1e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1582  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.2 
 
 		 415 aa  152  2e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0117238  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3014  multidrug efflux system subunit MdtA  32.2 
 
 		 415 aa  152  2e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.105913 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28820  secretion protein, HlyD family  30.05 
 
 		 441 aa  151  2e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.20411  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2216  multidrug efflux system subunit MdtA  32.2 
 
 		 415 aa  152  2e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2366  multidrug efflux system subunit MdtA  32.2 
 
 		 415 aa  151  2e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1596  RND family efflux transporter MFP subunit  31.51 
 
 		 398 aa  151  2e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.566633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1159  multidrug efflux system subunit MdtA  32.2 
 
 		 415 aa  152  2e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0986  multidrug efflux system subunit MdtA  32.2 
 
 		 415 aa  151  3e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.607592 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1206  multidrug efflux system subunit MdtA  28.79 
 
 		 419 aa  150  5e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0570202  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2902  secretion protein HlyD  33.97 
 
 		 464 aa  150  5e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.56576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3932  multidrug resistance protein mdtA precursor  31.82 
 
 		 473 aa  150  6e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.416339 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1488  RND family efflux transporter MFP subunit  32.19 
 
 		 411 aa  149  9e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1549  membrane fusion protein precursor  33.05 
 
 		 411 aa  149  9e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2842  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.88 
 
 		 455 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.416467  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0971  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.24 
 
 		 416 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.39107  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4389  RND family efflux transporter MFP subunit  30.43 
 
 		 387 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0818366 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2878  RND family efflux transporter MFP subunit  33.22 
 
 		 396 aa  144  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.247459  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2684  multidrug efflux system subunit MdtA  31.89 
 
 		 411 aa  144  2e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0838  RND family efflux transporter MFP subunit  29.5 
 
 		 387 aa  144  4e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03141  putative resistance transmembrane protein  31.83 
 
 		 449 aa  143  5e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.704547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1523  secretion protein HlyD  32.37 
 
 		 457 aa  143  5e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.116484 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3552  multidrug efflux system subunit MdtA  29.48 
 
 		 413 aa  143  6e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2569  secretion protein HlyD  32.69 
 
 		 462 aa  143  7e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.103631 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1788  RND family efflux transporter MFP subunit  34.38 
 
 		 383 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3604  secretion protein HlyD  30.27 
 
 		 422 aa  142  9.999999999999999e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.105186  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0064  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.26 
 
 		 377 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2431  RND family efflux transporter MFP subunit  29.71 
 
 		 435 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0638771  normal  0.904192 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5556  HlyD family secretion protein  32.7 
 
 		 460 aa  141  1.9999999999999998e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.357056  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1562  RND family efflux transporter MFP subunit  33.13 
 
 		 371 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2957  secretion protein HlyD  29.32 
 
 		 389 aa  140  3e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0178504  normal  0.933874 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0601  secretion protein HlyD  32.93 
 
 		 459 aa  140  3e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.251315  normal  0.72194 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2856  RND family efflux transporter MFP subunit  35.03 
 
 		 417 aa  141  3e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.197237 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2907  RND efflux system membrane fusion protein  30.96 
 
 		 433 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.484522  normal  0.506514 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3096  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.64 
 
 		 396 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.219805 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1129  secretion protein HlyD  31.4 
 
 		 388 aa  140  6e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0780076 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3608  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.38 
 
 		 445 aa  140  6e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.704164  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4184  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.79 
 
 		 462 aa  139  7.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.267577  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4296  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.79 
 
 		 462 aa  139  7.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1577  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.79 
 
 		 434 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.321925  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3353  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.54 
 
 		 396 aa  138  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.462389  normal  0.0123154 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3537  putative component of multidrug efflux pump, mdtA-like protein  32.81 
 
 		 389 aa  138  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0533  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.28 
 
 		 381 aa  138  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2702  multidrug efflux system subunit MdtA  28.17 
 
 		 411 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1513  secretion protein HlyD  32.67 
 
 		 404 aa  137  4e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.461504  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2065  secretion protein HlyD  31.42 
 
 		 454 aa  137  4e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.309375  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1080  RND family efflux transporter MFP subunit  30.06 
 
 		 463 aa  137  4e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2286  RND family efflux transporter MFP subunit  32.28 
 
 		 423 aa  137  4e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1364  membrane fusion protein MdtA  29.58 
 
 		 442 aa  137  4e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.284522  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1334  putative RND efflux membrane fusion protein precursor  31.7 
 
 		 393 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0169276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1080  RND family efflux transporter MFP subunit  30.06 
 
 		 457 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2753  HlyD family secretion protein  31.2 
 
 		 444 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1501  HlyD family secretion protein  29.3 
 
 		 445 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.310778  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3971  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.71 
 
 		 407 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0900  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.19 
 
 		 384 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000108273  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1309  HlyD family secretion protein  30.56 
 
 		 388 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1172  RND family efflux transporter MFP subunit  29.51 
 
 		 454 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.118061 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1198  RND family efflux transporter MFP subunit  29.51 
 
 		 457 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.495254  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>