More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4556 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_4556  RND family efflux transporter MFP subunit  100 
 
 		 383 aa  752    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.589535  normal  0.76991 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2757  secretion protein HlyD  45.5 
 
 		 376 aa  300  4e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.220243  normal  0.336362 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2803  secretion protein HlyD  47.65 
 
 		 376 aa  297  2e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.602838  normal  0.227029 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2497  secretion protein HlyD  45.33 
 
 		 376 aa  278  1e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0156219  normal  0.535826 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1651  secretion protein HlyD  39.17 
 
 		 407 aa  231  2e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.986785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2957  secretion protein HlyD  36.07 
 
 		 389 aa  229  7e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0178504  normal  0.933874 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1610  RND family efflux transporter MFP subunit  40.24 
 
 		 394 aa  225  1e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.665479  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2372  RND family efflux transporter MFP subunit  37.77 
 
 		 395 aa  224  2e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0450  RND family efflux transporter MFP subunit  39.76 
 
 		 407 aa  222  7e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.825026 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1516  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.21 
 
 		 440 aa  215  9e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2439  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.64 
 
 		 379 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000851177  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3424  secretion protein HlyD  36.91 
 
 		 412 aa  203  4e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3395  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.65 
 
 		 389 aa  202  6e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2202  RND family efflux transporter MFP subunit  32.98 
 
 		 407 aa  199  9e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0064  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.44 
 
 		 377 aa  195  1e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1523  secretion protein HlyD  35.26 
 
 		 457 aa  192  7e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.116484 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2094  RND family efflux transporter MFP subunit  37.27 
 
 		 377 aa  191  1e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0888739  normal  0.0111779 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3581  secretion protein HlyD  36.71 
 
 		 407 aa  191  2.9999999999999997e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.434034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1169  RND family efflux transporter MFP subunit  32.9 
 
 		 389 aa  190  5e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.567946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1971  secretion protein HlyD  34.1 
 
 		 362 aa  189  5.999999999999999e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2482  secretion protein HlyD  34.38 
 
 		 434 aa  188  1e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.179732  normal  0.227362 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0971  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.96 
 
 		 416 aa  189  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.39107  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2558  secretion protein HlyD  36.59 
 
 		 451 aa  188  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0355119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2499  RND family efflux transporter MFP subunit  34.59 
 
 		 416 aa  186  4e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3537  putative component of multidrug efflux pump, mdtA-like protein  32.54 
 
 		 389 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1596  RND family efflux transporter MFP subunit  33.51 
 
 		 398 aa  184  2.0000000000000003e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.566633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3252  RND family efflux transporter MFP subunit  38.72 
 
 		 431 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0557412 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0838  RND family efflux transporter MFP subunit  34.99 
 
 		 387 aa  182  7e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1513  secretion protein HlyD  38.46 
 
 		 404 aa  182  9.000000000000001e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.461504  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0135  RND family efflux transporter MFP subunit  33.85 
 
 		 386 aa  182  1e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0736  RND family efflux transporter MFP subunit  32.97 
 
 		 387 aa  182  1e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4441  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.91 
 
 		 416 aa  181  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2065  secretion protein HlyD  35.62 
 
 		 454 aa  181  2e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.309375  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1530  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.52 
 
 		 391 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03982  membrane fusion protein  34.93 
 
 		 414 aa  181  2e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4415  RND family efflux transporter MFP subunit  35.53 
 
 		 458 aa  181  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.553493  normal  0.934455 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4389  RND family efflux transporter MFP subunit  35.05 
 
 		 387 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0818366 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0380  secretion protein HlyD  34.66 
 
 		 400 aa  180  4e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2569  secretion protein HlyD  35.09 
 
 		 462 aa  180  4e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.103631 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2753  HlyD family secretion protein  33.67 
 
 		 444 aa  180  4.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2922  RND family efflux transporter MFP subunit  33.93 
 
 		 459 aa  179  7e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.363027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0601  secretion protein HlyD  33.25 
 
 		 459 aa  179  9e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.251315  normal  0.72194 
 
 
-
 
NC_003296  RS03141  putative resistance transmembrane protein  34.51 
 
 		 449 aa  178  1e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.704547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4166  RND family efflux transporter MFP subunit  33.42 
 
 		 427 aa  178  1e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2038  RND family efflux transporter MFP subunit  36.15 
 
 		 482 aa  177  2e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0373239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2902  secretion protein HlyD  35.2 
 
 		 464 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.56576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3689  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.32 
 
 		 414 aa  177  2e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1788  RND family efflux transporter MFP subunit  36.89 
 
 		 383 aa  177  2e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2842  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.03 
 
 		 455 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.416467  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2742  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.2 
 
 		 462 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.878273  normal  0.333603 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3894  RND efflux membrane fusion protein precursor  34.32 
 
 		 385 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2519  RND family efflux transporter MFP subunit  34.2 
 
 		 462 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0990554 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5556  HlyD family secretion protein  31.11 
 
 		 460 aa  174  2.9999999999999996e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.357056  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3456  RND family efflux transporter MFP subunit  33.24 
 
 		 391 aa  174  2.9999999999999996e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4319  RND family efflux transporter MFP subunit  33.64 
 
 		 460 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0569861 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4151  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.59 
 
 		 451 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0426406  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0346  RND family efflux transporter MFP subunit  32.66 
 
 		 360 aa  172  6.999999999999999e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.499232  normal  0.99105 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45910  putative RND efflux membrane fusion protein precursor  32.7 
 
 		 385 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.170535  normal  0.980017 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2702  multidrug efflux system subunit MdtA  33.33 
 
 		 411 aa  172  1e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3932  multidrug resistance protein mdtA precursor  35.23 
 
 		 473 aa  171  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.416339 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0970  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.65 
 
 		 375 aa  171  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1510  secretion protein HlyD  29.89 
 
 		 395 aa  171  3e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0900  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.84 
 
 		 384 aa  170  3e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000108273  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2447  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.76 
 
 		 462 aa  170  4e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28820  secretion protein, HlyD family  33.49 
 
 		 441 aa  170  5e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.20411  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2826  secretion protein HlyD  30.26 
 
 		 464 aa  169  8e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.45041 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0514  secretion protein HlyD  32.23 
 
 		 523 aa  169  9e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00131685  normal  0.623408 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1643  multidrug efflux RND membrane fusion protein MexE  32.63 
 
 		 414 aa  168  1e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0226554  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2670  multidrug efflux RND membrane fusion protein MexE  32.63 
 
 		 426 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.768547  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4661  secretion protein HlyD  32.12 
 
 		 386 aa  167  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411044 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1418  multidrug efflux RND membrane fusion protein MexE  32.63 
 
 		 425 aa  168  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1206  multidrug efflux system subunit MdtA  32.93 
 
 		 419 aa  167  2e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0570202  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3604  secretion protein HlyD  30.73 
 
 		 422 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.105186  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4184  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.73 
 
 		 462 aa  167  4e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.267577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3170  multidrug efflux RND membrane fusion protein MexE  32.61 
 
 		 412 aa  167  4e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0585728  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1266  secretion protein HlyD  31.1 
 
 		 411 aa  167  4e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.279661  normal  0.224738 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1951  multidrug efflux RND membrane fusion protein MexE  33.78 
 
 		 438 aa  167  4e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2144  multidrug efflux RND membrane fusion protein MexE  32.61 
 
 		 412 aa  167  4e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.254489  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4296  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.73 
 
 		 462 aa  167  4e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2583  RND family efflux transporter MFP subunit  32.61 
 
 		 411 aa  166  5e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0404665  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1129  secretion protein HlyD  35.09 
 
 		 388 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0780076 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2530  RND family efflux transporter MFP subunit  32.61 
 
 		 412 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2907  RND efflux system membrane fusion protein  29.44 
 
 		 433 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.484522  normal  0.506514 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3495  RND family efflux transporter MFP subunit  31.45 
 
 		 365 aa  166  6.9999999999999995e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1577  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.68 
 
 		 434 aa  166  9e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.321925  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1309  HlyD family secretion protein  32.98 
 
 		 388 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0572  secretion protein HlyD  30.47 
 
 		 498 aa  164  3e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0544292  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2802  RND family efflux transporter MFP subunit  33.72 
 
 		 430 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.662741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2829  secretion protein HlyD  32.98 
 
 		 433 aa  163  5.0000000000000005e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2866  HlyD family secretion protein  32.32 
 
 		 576 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3971  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.01 
 
 		 407 aa  162  9e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3585  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.92 
 
 		 435 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14330  Secretion protein HlyD family  30.42 
 
 		 401 aa  162  1e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.774042  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2312  multidrug efflux system subunit MdtA  32.89 
 
 		 413 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2684  multidrug efflux system subunit MdtA  30.67 
 
 		 411 aa  162  1e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0732  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.23 
 
 		 440 aa  161  2e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1501  HlyD family secretion protein  31.15 
 
 		 445 aa  161  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.310778  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2431  RND family efflux transporter MFP subunit  31.42 
 
 		 435 aa  161  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0638771  normal  0.904192 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1369  membrane fusion protein MdtA  31.15 
 
 		 445 aa  161  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3610  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.55 
 
 		 388 aa  161  2e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.479598  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>