More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0380 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0380  secretion protein HlyD  100 
 
 		 400 aa  786    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1334  putative RND efflux membrane fusion protein precursor  53.04 
 
 		 393 aa  308  8e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0169276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3424  secretion protein HlyD  45.62 
 
 		 412 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3581  secretion protein HlyD  45.86 
 
 		 407 aa  282  8.000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.434034  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0970  efflux transporter, RND family, MFP subunit  46.8 
 
 		 375 aa  274  2.0000000000000002e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1971  secretion protein HlyD  41.33 
 
 		 362 aa  240  2.9999999999999997e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1516  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.68 
 
 		 440 aa  235  1.0000000000000001e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1025  RND family efflux transporter MFP subunit  41.95 
 
 		 437 aa  232  1e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0127798  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4389  RND family efflux transporter MFP subunit  39.17 
 
 		 387 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0818366 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0838  RND family efflux transporter MFP subunit  38.76 
 
 		 387 aa  213  7e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4415  RND family efflux transporter MFP subunit  39.31 
 
 		 458 aa  209  7e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.553493  normal  0.934455 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2372  RND family efflux transporter MFP subunit  36.18 
 
 		 395 aa  206  7e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2447  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.39 
 
 		 462 aa  206  7e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4151  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.74 
 
 		 451 aa  205  1e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0426406  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4184  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.99 
 
 		 462 aa  204  3e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.267577  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4296  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.99 
 
 		 462 aa  204  3e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1651  secretion protein HlyD  35.6 
 
 		 407 aa  202  6e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.986785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4319  RND family efflux transporter MFP subunit  33.76 
 
 		 460 aa  202  7e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0569861 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2439  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.69 
 
 		 379 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000851177  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2519  RND family efflux transporter MFP subunit  36.88 
 
 		 462 aa  201  3e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0990554 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2742  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.88 
 
 		 462 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.878273  normal  0.333603 
 
 
-
 
NC_003296  RS03141  putative resistance transmembrane protein  37.74 
 
 		 449 aa  199  6e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.704547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3395  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.63 
 
 		 389 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2757  secretion protein HlyD  35.82 
 
 		 376 aa  196  6e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.220243  normal  0.336362 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2803  secretion protein HlyD  35.65 
 
 		 376 aa  195  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.602838  normal  0.227029 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1610  RND family efflux transporter MFP subunit  36.01 
 
 		 394 aa  191  2e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.665479  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4556  RND family efflux transporter MFP subunit  35.29 
 
 		 383 aa  191  2e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.589535  normal  0.76991 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4661  secretion protein HlyD  35.67 
 
 		 386 aa  189  7e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411044 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1596  RND family efflux transporter MFP subunit  38.8 
 
 		 398 aa  189  1e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.566633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0346  RND family efflux transporter MFP subunit  37.54 
 
 		 360 aa  188  1e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.499232  normal  0.99105 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1080  RND family efflux transporter MFP subunit  36.01 
 
 		 463 aa  188  1e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1129  secretion protein HlyD  36.47 
 
 		 388 aa  187  2e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0780076 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31870  putative RND efflux membrane fusion protein precursor  35.23 
 
 		 426 aa  187  4e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1771  RND family efflux transporter MFP subunit  36.91 
 
 		 469 aa  186  5e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.75905 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2802  RND family efflux transporter MFP subunit  36.68 
 
 		 430 aa  186  6e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.662741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1169  RND family efflux transporter MFP subunit  35.96 
 
 		 389 aa  186  6e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.567946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2202  RND family efflux transporter MFP subunit  32.65 
 
 		 407 aa  186  8e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1080  RND family efflux transporter MFP subunit  36.16 
 
 		 457 aa  185  9e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3585  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.36 
 
 		 435 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2521  secretion protein HlyD  35.74 
 
 		 435 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.770973  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3689  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.86 
 
 		 414 aa  184  2.0000000000000003e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1309  HlyD family secretion protein  35.38 
 
 		 388 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2329  RND family efflux transporter MFP subunit  36.16 
 
 		 436 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.4455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1951  multidrug efflux RND membrane fusion protein MexE  36.45 
 
 		 438 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3604  secretion protein HlyD  36.13 
 
 		 422 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.105186  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2186  RND family efflux transporter MFP subunit  36.36 
 
 		 435 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3252  RND family efflux transporter MFP subunit  37.76 
 
 		 431 aa  184  3e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0557412 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4441  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.13 
 
 		 416 aa  184  3e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2497  secretion protein HlyD  37.01 
 
 		 376 aa  183  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0156219  normal  0.535826 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14330  Secretion protein HlyD family  34.59 
 
 		 401 aa  183  5.0000000000000004e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.774042  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1577  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.94 
 
 		 434 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.321925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2708  RND efflux membrane fusion protein precursor  34.94 
 
 		 426 aa  182  6e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0286088  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4306  HlyD family secretion protein  36.48 
 
 		 456 aa  182  7e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0237047  normal  0.270235 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2583  RND family efflux transporter MFP subunit  37.06 
 
 		 411 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0404665  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1643  multidrug efflux RND membrane fusion protein MexE  37.06 
 
 		 414 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0226554  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0064  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.47 
 
 		 377 aa  182  9.000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1418  multidrug efflux RND membrane fusion protein MexE  37.06 
 
 		 425 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2670  multidrug efflux RND membrane fusion protein MexE  37.06 
 
 		 426 aa  182  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.768547  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2144  multidrug efflux RND membrane fusion protein MexE  37.06 
 
 		 412 aa  182  1e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.254489  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45910  putative RND efflux membrane fusion protein precursor  35.33 
 
 		 385 aa  181  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.170535  normal  0.980017 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2922  RND family efflux transporter MFP subunit  36.9 
 
 		 459 aa  182  1e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.363027  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3170  multidrug efflux RND membrane fusion protein MexE  37.06 
 
 		 412 aa  182  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0585728  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2530  RND family efflux transporter MFP subunit  36.79 
 
 		 412 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2902  secretion protein HlyD  33.98 
 
 		 464 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.56576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2104  RND family efflux transporter MFP subunit  35.67 
 
 		 450 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2499  RND family efflux transporter MFP subunit  32.99 
 
 		 416 aa  181  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2558  secretion protein HlyD  36.16 
 
 		 451 aa  180  4e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0355119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1364  membrane fusion protein MdtA  34.1 
 
 		 442 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.284522  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0533  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.6 
 
 		 381 aa  179  5.999999999999999e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1172  RND family efflux transporter MFP subunit  35.37 
 
 		 454 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.118061 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0514  secretion protein HlyD  36.25 
 
 		 523 aa  179  7e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00131685  normal  0.623408 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0601  secretion protein HlyD  35.77 
 
 		 459 aa  179  7e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.251315  normal  0.72194 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2569  secretion protein HlyD  37.82 
 
 		 462 aa  179  9e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.103631 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1198  RND family efflux transporter MFP subunit  35.37 
 
 		 457 aa  179  9e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.495254  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2907  RND efflux system membrane fusion protein  33.33 
 
 		 433 aa  178  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.484522  normal  0.506514 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0900  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.78 
 
 		 384 aa  178  2e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000108273  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1530  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.24 
 
 		 391 aa  177  3e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2957  secretion protein HlyD  33.73 
 
 		 389 aa  177  3e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0178504  normal  0.933874 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0719  secretion protein HlyD  35.06 
 
 		 457 aa  177  4e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0450  RND family efflux transporter MFP subunit  30.69 
 
 		 407 aa  177  4e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.825026 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2482  secretion protein HlyD  32.95 
 
 		 434 aa  176  8e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.179732  normal  0.227362 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2866  HlyD family secretion protein  34.46 
 
 		 576 aa  176  8e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0736  RND family efflux transporter MFP subunit  33.06 
 
 		 387 aa  175  9.999999999999999e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3894  RND efflux membrane fusion protein precursor  35.89 
 
 		 385 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1124  RND family efflux transporter MFP subunit  32.25 
 
 		 408 aa  175  9.999999999999999e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.360909 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1369  membrane fusion protein MdtA  33.6 
 
 		 445 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2753  HlyD family secretion protein  33.43 
 
 		 444 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2842  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.93 
 
 		 455 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.416467  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3552  multidrug efflux system subunit MdtA  35.48 
 
 		 413 aa  174  2.9999999999999996e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2901  RND family efflux transporter MFP subunit  32.29 
 
 		 394 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1501  HlyD family secretion protein  33.42 
 
 		 445 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.310778  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2829  secretion protein HlyD  34.77 
 
 		 433 aa  173  3.9999999999999995e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0766  HlyD family secretion protein  35.13 
 
 		 392 aa  173  5e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0572  secretion protein HlyD  34.55 
 
 		 498 aa  171  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0544292  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1788  RND family efflux transporter MFP subunit  36.61 
 
 		 383 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28820  secretion protein, HlyD family  35 
 
 		 441 aa  171  2e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.20411  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1020  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.08 
 
 		 437 aa  170  5e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0732  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.32 
 
 		 440 aa  169  5e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3932  multidrug resistance protein mdtA precursor  34.89 
 
 		 473 aa  169  8e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.416339 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3608  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.23 
 
 		 445 aa  169  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.704164  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>