More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0533 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_0533  efflux transporter, RND family, MFP subunit  100 
 
 		 381 aa  746    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1530  efflux transporter, RND family, MFP subunit  50 
 
 		 391 aa  325  7e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1596  RND family efflux transporter MFP subunit  47.99 
 
 		 398 aa  311  1e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.566633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1510  secretion protein HlyD  44.18 
 
 		 395 aa  303  4.0000000000000003e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1266  secretion protein HlyD  43.37 
 
 		 411 aa  298  1e-79  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.279661  normal  0.224738 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0736  RND family efflux transporter MFP subunit  43.98 
 
 		 387 aa  293  3e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1169  RND family efflux transporter MFP subunit  43.49 
 
 		 389 aa  288  8e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.567946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2842  efflux transporter, RND family, MFP subunit  43.73 
 
 		 455 aa  286  4e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.416467  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3932  multidrug resistance protein mdtA precursor  44.35 
 
 		 473 aa  286  5.999999999999999e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.416339 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3395  efflux transporter, RND family, MFP subunit  42.3 
 
 		 389 aa  285  7e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2558  secretion protein HlyD  44.85 
 
 		 451 aa  285  8e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0355119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2569  secretion protein HlyD  44.24 
 
 		 462 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.103631 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3537  putative component of multidrug efflux pump, mdtA-like protein  40.69 
 
 		 389 aa  282  6.000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2094  RND family efflux transporter MFP subunit  44.48 
 
 		 377 aa  278  9e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0888739  normal  0.0111779 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1523  secretion protein HlyD  44.51 
 
 		 457 aa  277  2e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.116484 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2065  secretion protein HlyD  42.28 
 
 		 454 aa  273  3e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.309375  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0971  efflux transporter, RND family, MFP subunit  42.15 
 
 		 416 aa  268  8e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.39107  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2902  secretion protein HlyD  42.48 
 
 		 464 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.56576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2202  RND family efflux transporter MFP subunit  42.39 
 
 		 407 aa  262  8e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0601  secretion protein HlyD  45.06 
 
 		 459 aa  261  2e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.251315  normal  0.72194 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2922  RND family efflux transporter MFP subunit  41.44 
 
 		 459 aa  258  1e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.363027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2856  RND family efflux transporter MFP subunit  43.71 
 
 		 417 aa  251  2e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.197237 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3971  efflux transporter, RND family, MFP subunit  44.34 
 
 		 407 aa  250  3e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1771  RND family efflux transporter MFP subunit  42.69 
 
 		 469 aa  246  4e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.75905 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4184  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.14 
 
 		 462 aa  245  9e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.267577  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4296  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.14 
 
 		 462 aa  245  9e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1172  RND family efflux transporter MFP subunit  42.14 
 
 		 454 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.118061 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1198  RND family efflux transporter MFP subunit  42.14 
 
 		 457 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.495254  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4306  HlyD family secretion protein  41.84 
 
 		 456 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0237047  normal  0.270235 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0346  RND family efflux transporter MFP subunit  43.8 
 
 		 360 aa  243  3e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.499232  normal  0.99105 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0719  secretion protein HlyD  41.84 
 
 		 457 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2104  RND family efflux transporter MFP subunit  41.54 
 
 		 450 aa  243  5e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3552  multidrug efflux system subunit MdtA  40.28 
 
 		 413 aa  241  1e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5556  HlyD family secretion protein  39.64 
 
 		 460 aa  241  1e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.357056  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31870  putative RND efflux membrane fusion protein precursor  42.81 
 
 		 426 aa  241  1e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1643  multidrug efflux RND membrane fusion protein MexE  41.82 
 
 		 414 aa  241  2e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0226554  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2670  multidrug efflux RND membrane fusion protein MexE  41.82 
 
 		 426 aa  241  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.768547  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1418  multidrug efflux RND membrane fusion protein MexE  41.82 
 
 		 425 aa  241  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2144  multidrug efflux RND membrane fusion protein MexE  41.82 
 
 		 412 aa  241  2e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.254489  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2907  RND efflux system membrane fusion protein  41.79 
 
 		 433 aa  240  2e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.484522  normal  0.506514 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2530  RND family efflux transporter MFP subunit  41.82 
 
 		 412 aa  241  2e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3170  multidrug efflux RND membrane fusion protein MexE  41.82 
 
 		 412 aa  241  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0585728  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2866  HlyD family secretion protein  42.12 
 
 		 576 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2583  RND family efflux transporter MFP subunit  41.82 
 
 		 411 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0404665  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03141  putative resistance transmembrane protein  41.74 
 
 		 449 aa  239  4e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.704547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1369  membrane fusion protein MdtA  42.12 
 
 		 445 aa  239  5e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1501  HlyD family secretion protein  42.12 
 
 		 445 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.310778  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1364  membrane fusion protein MdtA  42.12 
 
 		 442 aa  239  8e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.284522  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2708  RND efflux membrane fusion protein precursor  42.22 
 
 		 426 aa  238  9e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0286088  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1577  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.65 
 
 		 434 aa  238  2e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.321925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0732  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.08 
 
 		 440 aa  237  3e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2684  multidrug efflux system subunit MdtA  39.27 
 
 		 411 aa  236  3e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1231  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.5 
 
 		 426 aa  236  4e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1080  RND family efflux transporter MFP subunit  40.95 
 
 		 463 aa  236  6e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1080  RND family efflux transporter MFP subunit  40.95 
 
 		 457 aa  236  6e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1159  multidrug efflux system subunit MdtA  37.78 
 
 		 415 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3014  multidrug efflux system subunit MdtA  37.78 
 
 		 415 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.105913 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0450  RND family efflux transporter MFP subunit  38.55 
 
 		 407 aa  234  1.0000000000000001e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.825026 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01979  multidrug efflux system, subunit A  37.5 
 
 		 415 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01971  hypothetical protein  37.5 
 
 		 415 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0986  multidrug efflux system subunit MdtA  38.62 
 
 		 415 aa  233  3e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.607592 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2366  multidrug efflux system subunit MdtA  37.82 
 
 		 415 aa  233  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03982  membrane fusion protein  37.81 
 
 		 414 aa  233  6e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1582  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.5 
 
 		 415 aa  232  7.000000000000001e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0117238  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1567  multidrug efflux system subunit MdtA  37.5 
 
 		 455 aa  232  7.000000000000001e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.331208 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2216  multidrug efflux system subunit MdtA  37.5 
 
 		 415 aa  232  7.000000000000001e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0572  secretion protein HlyD  41.95 
 
 		 498 aa  232  8.000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0544292  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3604  secretion protein HlyD  37.64 
 
 		 422 aa  231  2e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.105186  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0170  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.67 
 
 		 450 aa  230  3e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.736393 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4166  RND family efflux transporter MFP subunit  37.53 
 
 		 427 aa  230  3e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3689  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.29 
 
 		 414 aa  230  4e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3424  secretion protein HlyD  38.79 
 
 		 412 aa  229  5e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1951  multidrug efflux RND membrane fusion protein MexE  41.52 
 
 		 438 aa  229  5e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2372  RND family efflux transporter MFP subunit  36.53 
 
 		 395 aa  229  6e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0514  secretion protein HlyD  41.16 
 
 		 523 aa  229  7e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00131685  normal  0.623408 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1332  multidrug efflux system subunit MdtA  37.17 
 
 		 444 aa  229  8e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.713792  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1206  multidrug efflux system subunit MdtA  39.48 
 
 		 419 aa  228  1e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0570202  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3103  multidrug efflux system subunit MdtA  40.06 
 
 		 427 aa  227  2e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1215  multidrug efflux system subunit MdtA  37.17 
 
 		 444 aa  227  2e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4319  RND family efflux transporter MFP subunit  40.61 
 
 		 460 aa  228  2e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0569861 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4151  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.87 
 
 		 451 aa  226  4e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0426406  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2966  multidrug efflux system subunit MdtA  37.97 
 
 		 413 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.874422  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3005  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.97 
 
 		 455 aa  224  2e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.568711  normal  0.749765 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4415  RND family efflux transporter MFP subunit  42.6 
 
 		 458 aa  224  3e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.553493  normal  0.934455 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2363  multidrug efflux system subunit MdtA  38.87 
 
 		 413 aa  223  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.67985 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2431  RND family efflux transporter MFP subunit  40.61 
 
 		 435 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0638771  normal  0.904192 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2472  multidrug efflux system subunit MdtA  38.58 
 
 		 413 aa  223  6e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.957345 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1312  multidrug efflux system subunit MdtA  38.24 
 
 		 410 aa  223  6e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.164615  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2312  multidrug efflux system subunit MdtA  38.58 
 
 		 413 aa  222  9e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2256  multidrug efflux system subunit MdtA  38.58 
 
 		 413 aa  222  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1651  secretion protein HlyD  35.38 
 
 		 407 aa  220  3e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.986785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3581  secretion protein HlyD  37.97 
 
 		 407 aa  220  3e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.434034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2356  multidrug efflux system subunit MdtA  38.58 
 
 		 413 aa  220  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.413766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2447  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.37 
 
 		 462 aa  219  5e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2742  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.23 
 
 		 462 aa  219  6e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.878273  normal  0.333603 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0135  RND family efflux transporter MFP subunit  37 
 
 		 386 aa  219  7e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28820  secretion protein, HlyD family  39.82 
 
 		 441 aa  219  8.999999999999998e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.20411  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2519  RND family efflux transporter MFP subunit  38.23 
 
 		 462 aa  218  1e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0990554 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2957  secretion protein HlyD  35.84 
 
 		 389 aa  217  2e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0178504  normal  0.933874 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1549  membrane fusion protein precursor  39 
 
 		 411 aa  216  4e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>