More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1334 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1334  putative RND efflux membrane fusion protein precursor  100 
 
 		 393 aa  751    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0169276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0380  secretion protein HlyD  53.5 
 
 		 400 aa  328  9e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3424  secretion protein HlyD  45.8 
 
 		 412 aa  290  2e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0970  efflux transporter, RND family, MFP subunit  47.9 
 
 		 375 aa  274  2.0000000000000002e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3581  secretion protein HlyD  46.22 
 
 		 407 aa  268  1e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.434034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1971  secretion protein HlyD  44.38 
 
 		 362 aa  256  4e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1516  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.72 
 
 		 440 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3604  secretion protein HlyD  36.99 
 
 		 422 aa  211  2e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.105186  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2372  RND family efflux transporter MFP subunit  35.89 
 
 		 395 aa  211  2e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2104  RND family efflux transporter MFP subunit  35.9 
 
 		 450 aa  205  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4319  RND family efflux transporter MFP subunit  36.31 
 
 		 460 aa  204  2e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0569861 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3610  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.53 
 
 		 388 aa  203  5e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.479598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1198  RND family efflux transporter MFP subunit  35.05 
 
 		 457 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.495254  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1172  RND family efflux transporter MFP subunit  35.05 
 
 		 454 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.118061 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2957  secretion protein HlyD  35.11 
 
 		 389 aa  201  3e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0178504  normal  0.933874 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4306  HlyD family secretion protein  35.22 
 
 		 456 aa  200  3e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0237047  normal  0.270235 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2742  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.16 
 
 		 462 aa  200  3e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.878273  normal  0.333603 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2447  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.16 
 
 		 462 aa  200  3e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1369  membrane fusion protein MdtA  36.09 
 
 		 445 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2519  RND family efflux transporter MFP subunit  36.16 
 
 		 462 aa  199  5e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0990554 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4151  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.71 
 
 		 451 aa  199  5e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0426406  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0719  secretion protein HlyD  34.79 
 
 		 457 aa  200  5e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4415  RND family efflux transporter MFP subunit  37.7 
 
 		 458 aa  199  6e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.553493  normal  0.934455 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1129  secretion protein HlyD  36.34 
 
 		 388 aa  199  9e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0780076 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4184  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.05 
 
 		 462 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.267577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1364  membrane fusion protein MdtA  36.32 
 
 		 442 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.284522  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4296  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.05 
 
 		 462 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1501  HlyD family secretion protein  36.53 
 
 		 445 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.310778  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2202  RND family efflux transporter MFP subunit  34.63 
 
 		 407 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03141  putative resistance transmembrane protein  36.53 
 
 		 449 aa  197  3e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.704547  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1309  HlyD family secretion protein  35.03 
 
 		 388 aa  197  3e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2866  HlyD family secretion protein  35.25 
 
 		 576 aa  197  3e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2591  RND family efflux transporter MFP subunit  38.54 
 
 		 463 aa  197  3e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.422822  normal  0.340429 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1080  RND family efflux transporter MFP subunit  34.25 
 
 		 463 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1080  RND family efflux transporter MFP subunit  34.45 
 
 		 457 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31870  putative RND efflux membrane fusion protein precursor  35.47 
 
 		 426 aa  196  8.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1651  secretion protein HlyD  32.91 
 
 		 407 aa  195  1e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.986785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2826  secretion protein HlyD  36.98 
 
 		 464 aa  195  1e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.45041 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1771  RND family efflux transporter MFP subunit  37.38 
 
 		 469 aa  195  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.75905 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2708  RND efflux membrane fusion protein precursor  35.47 
 
 		 426 aa  194  2e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0286088  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14330  Secretion protein HlyD family  37.46 
 
 		 401 aa  194  2e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.774042  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1577  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.1 
 
 		 434 aa  194  3e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.321925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2907  RND efflux system membrane fusion protein  36.1 
 
 		 433 aa  193  3e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.484522  normal  0.506514 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0170  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.07 
 
 		 450 aa  193  3e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.736393 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3552  multidrug efflux system subunit MdtA  35.58 
 
 		 413 aa  192  6e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28820  secretion protein, HlyD family  34.14 
 
 		 441 aa  191  2e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.20411  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1266  secretion protein HlyD  36.04 
 
 		 411 aa  191  2e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.279661  normal  0.224738 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3309  RND family efflux transporter MFP subunit  36.57 
 
 		 430 aa  189  5.999999999999999e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.717365 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2431  RND family efflux transporter MFP subunit  35.33 
 
 		 435 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0638771  normal  0.904192 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4441  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.82 
 
 		 416 aa  189  7e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3689  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.07 
 
 		 414 aa  187  3e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2802  RND family efflux transporter MFP subunit  32.85 
 
 		 430 aa  187  3e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.662741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0900  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.63 
 
 		 384 aa  187  4e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000108273  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1025  RND family efflux transporter MFP subunit  32.62 
 
 		 437 aa  186  5e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0127798  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0135  RND family efflux transporter MFP subunit  33.42 
 
 		 386 aa  185  9e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1206  multidrug efflux system subunit MdtA  35.65 
 
 		 419 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0570202  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0450  RND family efflux transporter MFP subunit  34.76 
 
 		 407 aa  185  1.0000000000000001e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.825026 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1610  RND family efflux transporter MFP subunit  35.84 
 
 		 394 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.665479  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0736  RND family efflux transporter MFP subunit  34.48 
 
 		 387 aa  184  2.0000000000000003e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2684  multidrug efflux system subunit MdtA  35.35 
 
 		 411 aa  184  2.0000000000000003e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1513  secretion protein HlyD  39.94 
 
 		 404 aa  184  3e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.461504  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0601  secretion protein HlyD  37.32 
 
 		 459 aa  184  3e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.251315  normal  0.72194 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2562  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.52 
 
 		 416 aa  183  4.0000000000000006e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0757424  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2499  RND family efflux transporter MFP subunit  36.47 
 
 		 416 aa  183  4.0000000000000006e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2966  multidrug efflux system subunit MdtA  33.64 
 
 		 413 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.874422  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2439  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.15 
 
 		 379 aa  182  8.000000000000001e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000851177  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0533  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.09 
 
 		 381 aa  181  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1549  membrane fusion protein precursor  34.84 
 
 		 411 aa  180  4e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2521  secretion protein HlyD  31.9 
 
 		 435 aa  179  7e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.770973  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0346  RND family efflux transporter MFP subunit  38.62 
 
 		 360 aa  179  8e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.499232  normal  0.99105 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3395  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.15 
 
 		 389 aa  179  1e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03982  membrane fusion protein  35.15 
 
 		 414 aa  177  2e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1083  RND family efflux transporter MFP subunit  36.08 
 
 		 359 aa  177  2e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0380532  normal  0.959663 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2329  RND family efflux transporter MFP subunit  32.51 
 
 		 436 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.4455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0572  secretion protein HlyD  36.08 
 
 		 498 aa  177  3e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0544292  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1488  RND family efflux transporter MFP subunit  34.84 
 
 		 411 aa  177  3e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1857  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.94 
 
 		 372 aa  176  5e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1124  RND family efflux transporter MFP subunit  31.12 
 
 		 408 aa  176  7e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.360909 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4389  RND family efflux transporter MFP subunit  35.21 
 
 		 387 aa  176  7e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0818366 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1510  secretion protein HlyD  33.87 
 
 		 395 aa  176  7e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3608  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.17 
 
 		 445 aa  175  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.704164  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1942  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.64 
 
 		 372 aa  175  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.547654  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1332  multidrug efflux system subunit MdtA  34.86 
 
 		 444 aa  175  9.999999999999999e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.713792  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1312  multidrug efflux system subunit MdtA  32.42 
 
 		 410 aa  175  9.999999999999999e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.164615  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1215  multidrug efflux system subunit MdtA  34.36 
 
 		 444 aa  175  9.999999999999999e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3103  multidrug efflux system subunit MdtA  34.86 
 
 		 427 aa  175  1.9999999999999998e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3585  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.51 
 
 		 435 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2038  RND family efflux transporter MFP subunit  36.57 
 
 		 482 aa  174  2.9999999999999996e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0373239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2186  RND family efflux transporter MFP subunit  32.51 
 
 		 435 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0838  RND family efflux transporter MFP subunit  35.51 
 
 		 387 aa  173  5e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3252  RND family efflux transporter MFP subunit  38.84 
 
 		 431 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0557412 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3971  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.12 
 
 		 407 aa  173  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2757  secretion protein HlyD  32.44 
 
 		 376 aa  172  1e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.220243  normal  0.336362 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2753  HlyD family secretion protein  31.84 
 
 		 444 aa  171  2e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3005  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.02 
 
 		 455 aa  171  2e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.568711  normal  0.749765 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3096  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.89 
 
 		 396 aa  170  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.219805 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0514  secretion protein HlyD  31.92 
 
 		 523 aa  170  4e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00131685  normal  0.623408 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01979  multidrug efflux system, subunit A  32.18 
 
 		 415 aa  170  5e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01971  hypothetical protein  32.18 
 
 		 415 aa  170  5e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1169  RND family efflux transporter MFP subunit  33.51 
 
 		 389 aa  169  6e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.567946  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>