More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_1942 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011145  AnaeK_1857  efflux transporter, RND family, MFP subunit  98.12 
 
 		 372 aa  697    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1942  efflux transporter, RND family, MFP subunit  100 
 
 		 372 aa  708    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.547654  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2021  secretion protein HlyD  95.17 
 
 		 373 aa  560  1e-158  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.508004  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1788  RND family efflux transporter MFP subunit  72.54 
 
 		 383 aa  420  1e-116  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1651  secretion protein HlyD  44.27 
 
 		 407 aa  295  8e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.986785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2372  RND family efflux transporter MFP subunit  42.44 
 
 		 395 aa  291  1e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1516  efflux transporter, RND family, MFP subunit  45.48 
 
 		 440 aa  276  5e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2499  RND family efflux transporter MFP subunit  45.4 
 
 		 416 aa  272  8.000000000000001e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0450  RND family efflux transporter MFP subunit  44.48 
 
 		 407 aa  271  1e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.825026 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1610  RND family efflux transporter MFP subunit  46.81 
 
 		 394 aa  269  5e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.665479  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0064  efflux transporter, RND family, MFP subunit  46.77 
 
 		 377 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2439  efflux transporter, RND family, MFP subunit  43.45 
 
 		 379 aa  258  1e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000851177  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1266  secretion protein HlyD  41.34 
 
 		 411 aa  248  1e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.279661  normal  0.224738 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1510  secretion protein HlyD  40.41 
 
 		 395 aa  247  2e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0900  efflux transporter, RND family, MFP subunit  42.4 
 
 		 384 aa  248  2e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000108273  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3395  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.52 
 
 		 389 aa  240  4e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3537  putative component of multidrug efflux pump, mdtA-like protein  40 
 
 		 389 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2094  RND family efflux transporter MFP subunit  43.04 
 
 		 377 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0888739  normal  0.0111779 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1124  RND family efflux transporter MFP subunit  43.28 
 
 		 408 aa  231  1e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.360909 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2431  RND family efflux transporter MFP subunit  38.9 
 
 		 435 aa  232  1e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0638771  normal  0.904192 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2558  secretion protein HlyD  41.82 
 
 		 451 aa  229  4e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0355119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2902  secretion protein HlyD  41.18 
 
 		 464 aa  228  1e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.56576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03982  membrane fusion protein  38.48 
 
 		 414 aa  225  1e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1596  RND family efflux transporter MFP subunit  39.47 
 
 		 398 aa  224  2e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.566633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0971  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.87 
 
 		 416 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.39107  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0736  RND family efflux transporter MFP subunit  38.42 
 
 		 387 aa  220  3e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2842  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.61 
 
 		 455 aa  220  3e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.416467  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1169  RND family efflux transporter MFP subunit  37.27 
 
 		 389 aa  220  3e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.567946  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28820  secretion protein, HlyD family  39.07 
 
 		 441 aa  219  3.9999999999999997e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.20411  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03141  putative resistance transmembrane protein  36.9 
 
 		 449 aa  218  1e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.704547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0135  RND family efflux transporter MFP subunit  38.37 
 
 		 386 aa  218  1e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4184  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.24 
 
 		 462 aa  218  1e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.267577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2065  secretion protein HlyD  40.83 
 
 		 454 aa  218  1e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.309375  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4296  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.24 
 
 		 462 aa  218  1e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2569  secretion protein HlyD  40.88 
 
 		 462 aa  218  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.103631 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0346  RND family efflux transporter MFP subunit  38.62 
 
 		 360 aa  217  2.9999999999999998e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.499232  normal  0.99105 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3971  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.43 
 
 		 407 aa  216  5.9999999999999996e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0572  secretion protein HlyD  38.32 
 
 		 498 aa  215  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0544292  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2521  secretion protein HlyD  36.89 
 
 		 435 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.770973  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3932  multidrug resistance protein mdtA precursor  39.59 
 
 		 473 aa  211  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.416339 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1523  secretion protein HlyD  39.16 
 
 		 457 aa  211  2e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.116484 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1332  multidrug efflux system subunit MdtA  34.54 
 
 		 444 aa  211  2e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.713792  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3103  multidrug efflux system subunit MdtA  34.54 
 
 		 427 aa  211  2e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1215  multidrug efflux system subunit MdtA  34.54 
 
 		 444 aa  211  2e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31870  putative RND efflux membrane fusion protein precursor  36.9 
 
 		 426 aa  211  2e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2802  RND family efflux transporter MFP subunit  37.21 
 
 		 430 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.662741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2708  RND efflux membrane fusion protein precursor  36.9 
 
 		 426 aa  210  3e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0286088  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2957  secretion protein HlyD  39.26 
 
 		 389 aa  210  3e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0178504  normal  0.933874 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2186  RND family efflux transporter MFP subunit  37.24 
 
 		 435 aa  210  3e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2753  HlyD family secretion protein  36.44 
 
 		 444 aa  210  4e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0514  secretion protein HlyD  36.34 
 
 		 523 aa  210  4e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00131685  normal  0.623408 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0601  secretion protein HlyD  38.54 
 
 		 459 aa  209  4e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.251315  normal  0.72194 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2329  RND family efflux transporter MFP subunit  36.34 
 
 		 436 aa  209  4e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.4455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4415  RND family efflux transporter MFP subunit  37.24 
 
 		 458 aa  209  5e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.553493  normal  0.934455 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3585  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.16 
 
 		 435 aa  209  6e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1530  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.88 
 
 		 391 aa  209  6e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1364  membrane fusion protein MdtA  37.18 
 
 		 442 aa  208  1e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.284522  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3552  multidrug efflux system subunit MdtA  33.52 
 
 		 413 aa  207  2e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1369  membrane fusion protein MdtA  37.18 
 
 		 445 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1501  HlyD family secretion protein  37.61 
 
 		 445 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.310778  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2856  RND family efflux transporter MFP subunit  39.4 
 
 		 417 aa  207  2e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.197237 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2922  RND family efflux transporter MFP subunit  38.94 
 
 		 459 aa  207  3e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.363027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3581  secretion protein HlyD  38.14 
 
 		 407 aa  207  3e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.434034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2202  RND family efflux transporter MFP subunit  35.59 
 
 		 407 aa  206  4e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2482  secretion protein HlyD  35.18 
 
 		 434 aa  206  7e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.179732  normal  0.227362 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1206  multidrug efflux system subunit MdtA  34.92 
 
 		 419 aa  205  1e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0570202  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3424  secretion protein HlyD  36.34 
 
 		 412 aa  204  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0533  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.22 
 
 		 381 aa  204  3e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4389  RND family efflux transporter MFP subunit  36.94 
 
 		 387 aa  203  5e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0818366 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1129  secretion protein HlyD  36.56 
 
 		 388 aa  202  6e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0780076 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4151  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.43 
 
 		 451 aa  202  6e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0426406  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2164  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.41 
 
 		 405 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1577  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.63 
 
 		 434 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.321925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4166  RND family efflux transporter MFP subunit  34.15 
 
 		 427 aa  202  9.999999999999999e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3252  RND family efflux transporter MFP subunit  43.16 
 
 		 431 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0557412 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0732  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.15 
 
 		 440 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2447  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.09 
 
 		 462 aa  200  3e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4319  RND family efflux transporter MFP subunit  34.64 
 
 		 460 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0569861 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0170  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.65 
 
 		 450 aa  199  7e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.736393 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4661  secretion protein HlyD  33.53 
 
 		 386 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411044 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2866  HlyD family secretion protein  36.72 
 
 		 576 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5556  HlyD family secretion protein  36.42 
 
 		 460 aa  198  1.0000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.357056  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1334  putative RND efflux membrane fusion protein precursor  39.56 
 
 		 393 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0169276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2038  RND family efflux transporter MFP subunit  40.53 
 
 		 482 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0373239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2907  RND efflux system membrane fusion protein  35.14 
 
 		 433 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.484522  normal  0.506514 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2803  secretion protein HlyD  36.42 
 
 		 376 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.602838  normal  0.227029 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3610  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.81 
 
 		 388 aa  197  2.0000000000000003e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.479598  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1231  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.52 
 
 		 426 aa  197  2.0000000000000003e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2966  multidrug efflux system subunit MdtA  34.04 
 
 		 413 aa  197  3e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.874422  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2684  multidrug efflux system subunit MdtA  35.15 
 
 		 411 aa  196  4.0000000000000005e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14330  Secretion protein HlyD family  37.58 
 
 		 401 aa  196  4.0000000000000005e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.774042  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0838  RND family efflux transporter MFP subunit  36.04 
 
 		 387 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2742  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.69 
 
 		 462 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.878273  normal  0.333603 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2519  RND family efflux transporter MFP subunit  34.69 
 
 		 462 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0990554 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1771  RND family efflux transporter MFP subunit  34.43 
 
 		 469 aa  196  6e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.75905 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3689  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.05 
 
 		 414 aa  196  6e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01979  multidrug efflux system, subunit A  35.59 
 
 		 415 aa  196  7e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1309  HlyD family secretion protein  35.75 
 
 		 388 aa  196  7e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01971  hypothetical protein  35.59 
 
 		 415 aa  196  7e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2826  secretion protein HlyD  38.44 
 
 		 464 aa  195  1e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.45041 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>