More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2856 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2856  RND family efflux transporter MFP subunit  100 
 
 		 417 aa  830    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.197237 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0971  efflux transporter, RND family, MFP subunit  67.17 
 
 		 416 aa  496  1e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.39107  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2094  RND family efflux transporter MFP subunit  70.54 
 
 		 377 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0888739  normal  0.0111779 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1266  secretion protein HlyD  58.6 
 
 		 411 aa  406  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.279661  normal  0.224738 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3537  putative component of multidrug efflux pump, mdtA-like protein  57.42 
 
 		 389 aa  401  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1510  secretion protein HlyD  56.79 
 
 		 395 aa  392  1e-108  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3971  efflux transporter, RND family, MFP subunit  53.42 
 
 		 407 aa  352  5.9999999999999994e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1169  RND family efflux transporter MFP subunit  46.09 
 
 		 389 aa  298  2e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.567946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3395  efflux transporter, RND family, MFP subunit  45.99 
 
 		 389 aa  290  3e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1596  RND family efflux transporter MFP subunit  47.22 
 
 		 398 aa  288  2e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.566633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1530  efflux transporter, RND family, MFP subunit  45.75 
 
 		 391 aa  283  5.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2431  RND family efflux transporter MFP subunit  44.92 
 
 		 435 aa  279  5e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0638771  normal  0.904192 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4184  efflux transporter, RND family, MFP subunit  45.62 
 
 		 462 aa  269  7e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.267577  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4296  efflux transporter, RND family, MFP subunit  45.62 
 
 		 462 aa  269  7e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2569  secretion protein HlyD  41.54 
 
 		 462 aa  265  8e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.103631 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0736  RND family efflux transporter MFP subunit  44.48 
 
 		 387 aa  262  8.999999999999999e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28820  secretion protein, HlyD family  45.76 
 
 		 441 aa  261  2e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.20411  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0572  secretion protein HlyD  44.12 
 
 		 498 aa  259  6e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0544292  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2065  secretion protein HlyD  41.34 
 
 		 454 aa  259  6e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.309375  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03141  putative resistance transmembrane protein  45.02 
 
 		 449 aa  258  2e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.704547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2670  multidrug efflux RND membrane fusion protein MexE  45.45 
 
 		 426 aa  257  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.768547  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3932  multidrug resistance protein mdtA precursor  41.76 
 
 		 473 aa  257  2e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.416339 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2530  RND family efflux transporter MFP subunit  45.45 
 
 		 412 aa  257  3e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1523  secretion protein HlyD  42.42 
 
 		 457 aa  256  7e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.116484 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3604  secretion protein HlyD  41.82 
 
 		 422 aa  255  9e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.105186  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2842  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.05 
 
 		 455 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.416467  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2202  RND family efflux transporter MFP subunit  40.36 
 
 		 407 aa  253  3e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1643  multidrug efflux RND membrane fusion protein MexE  44.85 
 
 		 414 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0226554  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1418  multidrug efflux RND membrane fusion protein MexE  44.85 
 
 		 425 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3170  multidrug efflux RND membrane fusion protein MexE  44.85 
 
 		 412 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0585728  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2144  multidrug efflux RND membrane fusion protein MexE  44.85 
 
 		 412 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.254489  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2583  RND family efflux transporter MFP subunit  44.85 
 
 		 411 aa  252  7e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0404665  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2902  secretion protein HlyD  40.57 
 
 		 464 aa  252  8.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.56576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2708  RND efflux membrane fusion protein precursor  42.99 
 
 		 426 aa  250  4e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0286088  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0514  secretion protein HlyD  43.71 
 
 		 523 aa  250  4e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00131685  normal  0.623408 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1369  membrane fusion protein MdtA  44.25 
 
 		 445 aa  248  1e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2558  secretion protein HlyD  41.11 
 
 		 451 aa  248  1e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0355119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1364  membrane fusion protein MdtA  44.25 
 
 		 442 aa  248  1e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.284522  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1501  HlyD family secretion protein  44.25 
 
 		 445 aa  248  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.310778  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1215  multidrug efflux system subunit MdtA  42.05 
 
 		 444 aa  247  3e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2866  HlyD family secretion protein  41.38 
 
 		 576 aa  247  3e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1332  multidrug efflux system subunit MdtA  42.05 
 
 		 444 aa  247  3e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.713792  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3103  multidrug efflux system subunit MdtA  42.05 
 
 		 427 aa  246  4e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31870  putative RND efflux membrane fusion protein precursor  42.39 
 
 		 426 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3585  efflux transporter, RND family, MFP subunit  43.3 
 
 		 435 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2186  RND family efflux transporter MFP subunit  43.3 
 
 		 435 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1951  multidrug efflux RND membrane fusion protein MexE  45.15 
 
 		 438 aa  243  5e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2753  HlyD family secretion protein  39.3 
 
 		 444 aa  241  2e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2521  secretion protein HlyD  41.43 
 
 		 435 aa  241  2e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.770973  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2684  multidrug efflux system subunit MdtA  42.11 
 
 		 411 aa  240  2.9999999999999997e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2329  RND family efflux transporter MFP subunit  41.88 
 
 		 436 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.4455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2802  RND family efflux transporter MFP subunit  42.6 
 
 		 430 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.662741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0533  efflux transporter, RND family, MFP subunit  43.08 
 
 		 381 aa  240  4e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2922  RND family efflux transporter MFP subunit  42.99 
 
 		 459 aa  238  1e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.363027  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1198  RND family efflux transporter MFP subunit  41.59 
 
 		 457 aa  238  1e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.495254  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3552  multidrug efflux system subunit MdtA  40 
 
 		 413 aa  238  2e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1172  RND family efflux transporter MFP subunit  41.59 
 
 		 454 aa  238  2e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.118061 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0732  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.68 
 
 		 440 aa  238  2e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4166  RND family efflux transporter MFP subunit  40 
 
 		 427 aa  236  4e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0719  secretion protein HlyD  41.3 
 
 		 457 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1771  RND family efflux transporter MFP subunit  41.32 
 
 		 469 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.75905 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4306  HlyD family secretion protein  41 
 
 		 456 aa  236  7e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0237047  normal  0.270235 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4319  RND family efflux transporter MFP subunit  38.26 
 
 		 460 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0569861 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2482  secretion protein HlyD  40.91 
 
 		 434 aa  233  3e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.179732  normal  0.227362 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1080  RND family efflux transporter MFP subunit  40.71 
 
 		 457 aa  234  3e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1080  RND family efflux transporter MFP subunit  40.71 
 
 		 463 aa  233  6e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2447  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.11 
 
 		 462 aa  231  1e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3610  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.7 
 
 		 388 aa  231  2e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.479598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2104  RND family efflux transporter MFP subunit  39.82 
 
 		 450 aa  231  3e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1206  multidrug efflux system subunit MdtA  37.24 
 
 		 419 aa  230  4e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0570202  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2742  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36 
 
 		 462 aa  229  6e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.878273  normal  0.333603 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4415  RND family efflux transporter MFP subunit  41.39 
 
 		 458 aa  229  6e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.553493  normal  0.934455 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2519  RND family efflux transporter MFP subunit  36 
 
 		 462 aa  229  9e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0990554 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4151  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.39 
 
 		 451 aa  228  1e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0426406  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2907  RND efflux system membrane fusion protein  41.27 
 
 		 433 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.484522  normal  0.506514 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1577  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.3 
 
 		 434 aa  224  2e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.321925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0986  multidrug efflux system subunit MdtA  38.84 
 
 		 415 aa  223  3e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.607592 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2366  multidrug efflux system subunit MdtA  38.27 
 
 		 415 aa  223  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1312  multidrug efflux system subunit MdtA  38.18 
 
 		 410 aa  223  6e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.164615  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2966  multidrug efflux system subunit MdtA  37.89 
 
 		 413 aa  222  9e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.874422  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1567  multidrug efflux system subunit MdtA  38.53 
 
 		 455 aa  222  9e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.331208 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1582  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.53 
 
 		 415 aa  222  9.999999999999999e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0117238  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1513  secretion protein HlyD  41.74 
 
 		 404 aa  222  9.999999999999999e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.461504  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2216  multidrug efflux system subunit MdtA  38.53 
 
 		 415 aa  222  9.999999999999999e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01979  multidrug efflux system, subunit A  38.23 
 
 		 415 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0170  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.44 
 
 		 450 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.736393 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01971  hypothetical protein  38.23 
 
 		 415 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1159  multidrug efflux system subunit MdtA  38.23 
 
 		 415 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3014  multidrug efflux system subunit MdtA  38.23 
 
 		 415 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.105913 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2829  secretion protein HlyD  40.36 
 
 		 433 aa  220  3e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5556  HlyD family secretion protein  38.87 
 
 		 460 aa  220  3.9999999999999997e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.357056  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03982  membrane fusion protein  37.12 
 
 		 414 aa  220  3.9999999999999997e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3005  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.35 
 
 		 455 aa  219  5e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.568711  normal  0.749765 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0346  RND family efflux transporter MFP subunit  41.59 
 
 		 360 aa  219  7e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.499232  normal  0.99105 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2702  multidrug efflux system subunit MdtA  39.88 
 
 		 411 aa  219  8.999999999999998e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1231  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40 
 
 		 426 aa  216  8e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3689  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.55 
 
 		 414 aa  216  8e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1516  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.4 
 
 		 440 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1651  secretion protein HlyD  37.83 
 
 		 407 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.986785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2472  multidrug efflux system subunit MdtA  39.52 
 
 		 413 aa  212  7.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.957345 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>