More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_2021 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_2021  secretion protein HlyD  100 
 
 		 373 aa  713    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.508004  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1857  efflux transporter, RND family, MFP subunit  94.91 
 
 		 372 aa  574  1.0000000000000001e-163  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1942  efflux transporter, RND family, MFP subunit  95.17 
 
 		 372 aa  568  1e-161  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.547654  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1788  RND family efflux transporter MFP subunit  71.39 
 
 		 383 aa  416  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1651  secretion protein HlyD  43.88 
 
 		 407 aa  293  2e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.986785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2372  RND family efflux transporter MFP subunit  44.12 
 
 		 395 aa  288  1e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1516  efflux transporter, RND family, MFP subunit  45.75 
 
 		 440 aa  277  2e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0450  RND family efflux transporter MFP subunit  44.66 
 
 		 407 aa  276  4e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.825026 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1610  RND family efflux transporter MFP subunit  46.36 
 
 		 394 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.665479  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2499  RND family efflux transporter MFP subunit  43.78 
 
 		 416 aa  263  4e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2439  efflux transporter, RND family, MFP subunit  44.01 
 
 		 379 aa  260  3e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000851177  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0064  efflux transporter, RND family, MFP subunit  46.38 
 
 		 377 aa  258  1e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1266  secretion protein HlyD  40.68 
 
 		 411 aa  251  1e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.279661  normal  0.224738 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1510  secretion protein HlyD  41.03 
 
 		 395 aa  248  1e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0900  efflux transporter, RND family, MFP subunit  42.6 
 
 		 384 aa  241  2e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000108273  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2094  RND family efflux transporter MFP subunit  42.28 
 
 		 377 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0888739  normal  0.0111779 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3395  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.62 
 
 		 389 aa  235  9e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3537  putative component of multidrug efflux pump, mdtA-like protein  40.9 
 
 		 389 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2431  RND family efflux transporter MFP subunit  38.79 
 
 		 435 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0638771  normal  0.904192 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1124  RND family efflux transporter MFP subunit  43.28 
 
 		 408 aa  233  5e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.360909 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0971  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.07 
 
 		 416 aa  224  1e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.39107  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2558  secretion protein HlyD  40.94 
 
 		 451 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0355119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1596  RND family efflux transporter MFP subunit  39.78 
 
 		 398 aa  224  2e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.566633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2902  secretion protein HlyD  40.35 
 
 		 464 aa  222  8e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.56576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03982  membrane fusion protein  38.62 
 
 		 414 aa  220  3e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0346  RND family efflux transporter MFP subunit  39.27 
 
 		 360 aa  220  3.9999999999999997e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.499232  normal  0.99105 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28820  secretion protein, HlyD family  38.97 
 
 		 441 aa  220  3.9999999999999997e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.20411  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3103  multidrug efflux system subunit MdtA  35.62 
 
 		 427 aa  219  7e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2856  RND family efflux transporter MFP subunit  40.9 
 
 		 417 aa  219  7e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.197237 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1332  multidrug efflux system subunit MdtA  35.93 
 
 		 444 aa  219  7e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.713792  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0736  RND family efflux transporter MFP subunit  38.12 
 
 		 387 aa  219  7e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1215  multidrug efflux system subunit MdtA  35.62 
 
 		 444 aa  219  7.999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2521  secretion protein HlyD  36.63 
 
 		 435 aa  218  1e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.770973  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0572  secretion protein HlyD  37.35 
 
 		 498 aa  217  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0544292  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2569  secretion protein HlyD  40.29 
 
 		 462 aa  217  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.103631 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2842  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.13 
 
 		 455 aa  216  4e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.416467  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2065  secretion protein HlyD  40.53 
 
 		 454 aa  216  5.9999999999999996e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.309375  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2708  RND efflux membrane fusion protein precursor  38.07 
 
 		 426 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0286088  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0135  RND family efflux transporter MFP subunit  37.79 
 
 		 386 aa  215  8e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1169  RND family efflux transporter MFP subunit  36.36 
 
 		 389 aa  215  8e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.567946  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03141  putative resistance transmembrane protein  36.61 
 
 		 449 aa  215  9.999999999999999e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.704547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4184  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.98 
 
 		 462 aa  215  9.999999999999999e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.267577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3971  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.1 
 
 		 407 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4296  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.98 
 
 		 462 aa  215  9.999999999999999e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31870  putative RND efflux membrane fusion protein precursor  37.76 
 
 		 426 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2802  RND family efflux transporter MFP subunit  36.26 
 
 		 430 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.662741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1523  secretion protein HlyD  39.16 
 
 		 457 aa  213  3.9999999999999995e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.116484 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2186  RND family efflux transporter MFP subunit  37.5 
 
 		 435 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2957  secretion protein HlyD  38.84 
 
 		 389 aa  213  5.999999999999999e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0178504  normal  0.933874 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2202  RND family efflux transporter MFP subunit  35.34 
 
 		 407 aa  212  7e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3552  multidrug efflux system subunit MdtA  35.8 
 
 		 413 aa  212  7.999999999999999e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2753  HlyD family secretion protein  36.44 
 
 		 444 aa  212  1e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3585  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.19 
 
 		 435 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1530  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.69 
 
 		 391 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0514  secretion protein HlyD  36.47 
 
 		 523 aa  211  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00131685  normal  0.623408 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2329  RND family efflux transporter MFP subunit  37.19 
 
 		 436 aa  210  3e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.4455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4415  RND family efflux transporter MFP subunit  37.54 
 
 		 458 aa  209  8e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.553493  normal  0.934455 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1364  membrane fusion protein MdtA  36.34 
 
 		 442 aa  208  1e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.284522  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2482  secretion protein HlyD  36.2 
 
 		 434 aa  208  1e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.179732  normal  0.227362 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1369  membrane fusion protein MdtA  36.34 
 
 		 445 aa  208  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1501  HlyD family secretion protein  36.75 
 
 		 445 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.310778  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0732  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.66 
 
 		 440 aa  207  2e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2922  RND family efflux transporter MFP subunit  38.94 
 
 		 459 aa  207  2e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.363027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3581  secretion protein HlyD  38.44 
 
 		 407 aa  207  3e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.434034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4166  RND family efflux transporter MFP subunit  36.24 
 
 		 427 aa  206  4e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3932  multidrug resistance protein mdtA precursor  38.67 
 
 		 473 aa  206  6e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.416339 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3424  secretion protein HlyD  37.2 
 
 		 412 aa  206  7e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0533  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.75 
 
 		 381 aa  205  1e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1771  RND family efflux transporter MFP subunit  35.14 
 
 		 469 aa  204  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.75905 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4389  RND family efflux transporter MFP subunit  37.24 
 
 		 387 aa  205  1e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0818366 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1577  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.63 
 
 		 434 aa  204  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.321925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0601  secretion protein HlyD  37.53 
 
 		 459 aa  204  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.251315  normal  0.72194 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2829  secretion protein HlyD  36.36 
 
 		 433 aa  204  2e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4151  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.93 
 
 		 451 aa  204  3e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0426406  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1206  multidrug efflux system subunit MdtA  34.78 
 
 		 419 aa  203  4e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0570202  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3252  RND family efflux transporter MFP subunit  44.06 
 
 		 431 aa  202  9e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0557412 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1231  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.74 
 
 		 426 aa  201  9.999999999999999e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0170  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.17 
 
 		 450 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.736393 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2907  RND efflux system membrane fusion protein  34.65 
 
 		 433 aa  199  5e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.484522  normal  0.506514 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0838  RND family efflux transporter MFP subunit  36.64 
 
 		 387 aa  199  6e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2447  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.4 
 
 		 462 aa  199  6e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5556  HlyD family secretion protein  36.39 
 
 		 460 aa  199  7e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.357056  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3689  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.77 
 
 		 414 aa  199  7e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01979  multidrug efflux system, subunit A  35.56 
 
 		 415 aa  199  7.999999999999999e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01971  hypothetical protein  35.56 
 
 		 415 aa  199  7.999999999999999e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4306  HlyD family secretion protein  34.04 
 
 		 456 aa  199  9e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0237047  normal  0.270235 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1198  RND family efflux transporter MFP subunit  34.2 
 
 		 457 aa  199  9e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.495254  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1582  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.28 
 
 		 415 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0117238  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1129  secretion protein HlyD  36.19 
 
 		 388 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0780076 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2216  multidrug efflux system subunit MdtA  35.28 
 
 		 415 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3610  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.54 
 
 		 388 aa  198  1.0000000000000001e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.479598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0719  secretion protein HlyD  34.2 
 
 		 457 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1172  RND family efflux transporter MFP subunit  34.2 
 
 		 454 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.118061 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1567  multidrug efflux system subunit MdtA  35.28 
 
 		 455 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.331208 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2684  multidrug efflux system subunit MdtA  34.65 
 
 		 411 aa  197  2.0000000000000003e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4319  RND family efflux transporter MFP subunit  34.34 
 
 		 460 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0569861 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2164  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.65 
 
 		 405 aa  198  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0986  multidrug efflux system subunit MdtA  35.56 
 
 		 415 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.607592 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2366  multidrug efflux system subunit MdtA  35.28 
 
 		 415 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1080  RND family efflux transporter MFP subunit  33.43 
 
 		 463 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>