More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_1916 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_1916  efflux transporter, RND family, MFP subunit  100 
 
 		 384 aa  721    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3834  RND family efflux transporter MFP subunit  62.53 
 
 		 383 aa  456  1e-127  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3851  RND family efflux transporter MFP subunit  62.53 
 
 		 383 aa  456  1e-127  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1919  RND family efflux transporter MFP subunit  62.53 
 
 		 383 aa  456  1e-127  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2685  RND family efflux transporter MFP subunit  62.01 
 
 		 383 aa  449  1e-125  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.133522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1251  RND family efflux transporter MFP subunit  61.74 
 
 		 383 aa  448  1e-125  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0652431  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1361  RND efflux membrane protein  63.32 
 
 		 383 aa  444  1e-123  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2877  secretion protein HlyD  58.82 
 
 		 383 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1834  RND family efflux transporter MFP subunit  60.37 
 
 		 383 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.41663  normal  0.322468 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0145  RND family efflux transporter MFP subunit  57.44 
 
 		 383 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1046  efflux transporter, RND family, MFP subunit  57.33 
 
 		 378 aa  402  1e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0357289  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1685  efflux transporter, RND family, MFP subunit  59.58 
 
 		 383 aa  403  1e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1045  RND family efflux transporter MFP subunit  57.93 
 
 		 397 aa  384  1e-105  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0871  secretion protein HlyD  51.39 
 
 		 406 aa  355  6.999999999999999e-97  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.75327  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1925  efflux transporter, RND family, MFP subunit  51.52 
 
 		 396 aa  330  2e-89  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.588537  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1326  efflux transporter, RND family, MFP subunit  49.86 
 
 		 398 aa  323  4e-87  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0997151  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1184  secretion protein HlyD  50.25 
 
 		 396 aa  322  9.999999999999999e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1241  RND family efflux transporter MFP subunit  50.27 
 
 		 398 aa  316  4e-85  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2837  RND family efflux transporter MFP subunit  52.3 
 
 		 406 aa  315  9.999999999999999e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0025637 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3253  RND family efflux transporter MFP subunit  53.6 
 
 		 397 aa  299  4e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1673  secretion protein HlyD  44.22 
 
 		 396 aa  290  4e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.801945 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3623  secretion protein HlyD  44.83 
 
 		 398 aa  265  7e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0728465  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0949  RND family efflux transporter MFP subunit  33.24 
 
 		 390 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3303  RND family efflux transporter MFP subunit  34.02 
 
 		 418 aa  145  1e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.3496  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0830  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.4 
 
 		 390 aa  143  4e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3408  RND family efflux transporter MFP subunit  31.02 
 
 		 389 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0128497  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3711  RND family efflux transporter MFP subunit  30.55 
 
 		 389 aa  140  3e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0225  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.12 
 
 		 347 aa  136  8e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.175978  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3301  RND family efflux transporter MFP subunit  34.18 
 
 		 381 aa  120  3.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.446472 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1362  secretion protein HlyD  26.39 
 
 		 381 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.27807  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1281  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.44 
 
 		 357 aa  105  2e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.036609  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3467  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.52 
 
 		 376 aa  101  3e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00013135  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3531  secretion protein HlyD  26.58 
 
 		 400 aa  94  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1695  secretion protein HlyD  28.74 
 
 		 360 aa  93.2  6e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16800  putative efflux transmembrane protein  34.57 
 
 		 367 aa  93.2  6e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0868415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2100  RND family efflux transporter MFP subunit  30.2 
 
 		 379 aa  92.4  1e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0493506  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0225  secretion protein HlyD  35.02 
 
 		 380 aa  90.9  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.34961  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0431  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.92 
 
 		 368 aa  90.5  5e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1159  multidrug efflux system subunit MdtA  28.61 
 
 		 415 aa  90.1  5e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1567  multidrug efflux system subunit MdtA  28.41 
 
 		 455 aa  90.1  5e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.331208 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3014  multidrug efflux system subunit MdtA  28.61 
 
 		 415 aa  90.1  5e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.105913 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1582  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.41 
 
 		 415 aa  90.1  6e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0117238  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2366  multidrug efflux system subunit MdtA  28.61 
 
 		 415 aa  90.1  6e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2216  multidrug efflux system subunit MdtA  28.41 
 
 		 415 aa  90.1  6e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1857  secretion protein HlyD  26.37 
 
 		 390 aa  90.1  7e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779454 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01979  multidrug efflux system, subunit A  28.41 
 
 		 415 aa  89.7  8e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01971  hypothetical protein  28.41 
 
 		 415 aa  89.7  8e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1462  RND efflux membrane fusion protein precursor  33.95 
 
 		 367 aa  89.4  9e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1309  efflux protein  30.84 
 
 		 364 aa  89  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1201  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.18 
 
 		 369 aa  87.8  3e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000118856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3313  RND family efflux transporter MFP subunit  24.18 
 
 		 369 aa  87.8  3e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000984298  normal  0.15916 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3170  RND family efflux transporter MFP subunit  24.18 
 
 		 369 aa  87.8  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000721535  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3169  RND family efflux transporter MFP subunit  24.18 
 
 		 369 aa  87  4e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000222351  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1079  secretion protein HlyD  31.95 
 
 		 366 aa  87  5e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.984606 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0986  multidrug efflux system subunit MdtA  28.41 
 
 		 415 aa  87  5e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.607592 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0382  RND family efflux transporter MFP subunit  26.37 
 
 		 396 aa  86.7  6e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.410142  normal  0.745706 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0247  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.1 
 
 		 380 aa  86.3  7e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1815  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.6 
 
 		 388 aa  86.3  9e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.100454  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2451  macrolide transporter subunit MacA  25.82 
 
 		 371 aa  85.5  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00913289  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0951  macrolide transporter subunit MacA  25.82 
 
 		 371 aa  85.5  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0557503  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3461  secretion protein HlyD  29.61 
 
 		 384 aa  85.9  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0982  macrolide transporter subunit MacA  25.82 
 
 		 371 aa  85.5  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.44834  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2718  macrolide transporter subunit MacA  25.82 
 
 		 371 aa  85.5  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2132  HlyD family secretion protein  31.21 
 
 		 360 aa  85.1  0.000000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.732379  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1451  RND family efflux transporter MFP subunit  27.99 
 
 		 369 aa  85.1  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.513769  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4297  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.57 
 
 		 397 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.430357  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2214  putative component of multidrug efflux system  29.13 
 
 		 368 aa  84.7  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.082194  normal  0.474627 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14330  Secretion protein HlyD family  26.49 
 
 		 401 aa  85.5  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.774042  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2282  macrolide transporter subunit MacA  25.82 
 
 		 371 aa  84.3  0.000000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000339116  normal  0.0134871 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3604  secretion protein HlyD  27.51 
 
 		 422 aa  84  0.000000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.105186  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1462  RND family efflux transporter MFP subunit  30.3 
 
 		 418 aa  84  0.000000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00883  macrolide transporter subunit, membrane fusion protein (MFP) component  25.55 
 
 		 371 aa  84  0.000000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00889  hypothetical protein  25.55 
 
 		 371 aa  84  0.000000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1039  macrolide transporter subunit MacA  25.82 
 
 		 371 aa  83.6  0.000000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.184306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4415  RND family efflux transporter MFP subunit  27.22 
 
 		 458 aa  83.2  0.000000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.553493  normal  0.934455 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3235  secretion protein HlyD  26.85 
 
 		 391 aa  83.2  0.000000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.185962  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1908  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.41 
 
 		 407 aa  82.8  0.000000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0558  secretion protein HlyD  28.98 
 
 		 360 aa  82.4  0.00000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.177986  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1526  RND family efflux transporter MFP subunit  29.28 
 
 		 423 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.692168  normal  0.0164989 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3523  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.99 
 
 		 438 aa  82.4  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.51854  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2552  secretion protein HlyD  26.55 
 
 		 451 aa  82  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.603084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1502  secretion protein HlyD  27.13 
 
 		 478 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.184777  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1039  macrolide transporter subunit MacA  26.1 
 
 		 372 aa  82.4  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.303516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1059  macrolide transporter subunit MacA  26.23 
 
 		 372 aa  82.8  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.75011  normal  0.992508 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0942  macrolide transporter subunit MacA  26.1 
 
 		 372 aa  82.4  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6327  RND family efflux transporter MFP subunit  27.13 
 
 		 478 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0452278  normal  0.980568 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6991  RND family efflux transporter MFP subunit  26.81 
 
 		 472 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.231557 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2764  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.27 
 
 		 371 aa  80.9  0.00000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.161658  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1209  RND family efflux transporter MFP subunit  26.74 
 
 		 381 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.421019  normal  0.31825 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0859  HlyD family secretion protein  28.32 
 
 		 372 aa  80.9  0.00000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.585057  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1122  RND family efflux transporter MFP subunit  32.92 
 
 		 366 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1685  RND family efflux transporter MFP subunit  28.21 
 
 		 387 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.261181  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0916  HlyD family secretion protein  28.32 
 
 		 372 aa  80.9  0.00000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3537  putative component of multidrug efflux pump, mdtA-like protein  26.24 
 
 		 389 aa  80.5  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0487  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.01 
 
 		 360 aa  80.5  0.00000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1496  RND family efflux transporter MFP subunit  28.02 
 
 		 365 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1288  RND family efflux transporter MFP subunit  27.82 
 
 		 365 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1580  RND family efflux transporter MFP subunit  28.02 
 
 		 365 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.610408  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1044  RND family efflux transporter MFP subunit  28.02 
 
 		 365 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1201  RND family efflux transporter MFP subunit  28.02 
 
 		 365 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0341767  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>